/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919861.0.fna -queryname NZ_GL8919861.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919861.0.fna -queryname NZ_GL8919861.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919861.0.fna -queryname NZ_GL8919861.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919801.9.fna -queryname NZ_GL8919801.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919801.9.fna -queryname NZ_GL8919801.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919801.9.fna -queryname NZ_GL8919801.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000341.99.fna -queryname NZ_BBXL010000341.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000341.99.fna -queryname NZ_BBXL010000341.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000341.99.fna -queryname NZ_BBXL010000341.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000311.100.fna -queryname NZ_BBXL010000311.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000311.100.fna -queryname NZ_BBXL010000311.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000311.100.fna -queryname NZ_BBXL010000311.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000211.101.fna -queryname NZ_BBXL010000211.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000211.101.fna -queryname NZ_BBXL010000211.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000211.101.fna -queryname NZ_BBXL010000211.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000171.102.fna -queryname NZ_BBXL010000171.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000171.102.fna -queryname NZ_BBXL010000171.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000171.102.fna -queryname NZ_BBXL010000171.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000141.103.fna -queryname NZ_BBXL010000141.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000141.103.fna -queryname NZ_BBXL010000141.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000141.103.fna -queryname NZ_BBXL010000141.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000451.104.fna -queryname NZ_BBXL010000451.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000451.104.fna -queryname NZ_BBXL010000451.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000451.104.fna -queryname NZ_BBXL010000451.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000021.105.fna -queryname NZ_BBXL010000021.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000021.105.fna -queryname NZ_BBXL010000021.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000021.105.fna -queryname NZ_BBXL010000021.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000431.106.fna -queryname NZ_BBXL010000431.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000431.106.fna -queryname NZ_BBXL010000431.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000431.106.fna -queryname NZ_BBXL010000431.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000161.107.fna -queryname NZ_BBXL010000161.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000161.107.fna -queryname NZ_BBXL010000161.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000161.107.fna -queryname NZ_BBXL010000161.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000421.108.fna -queryname NZ_BBXL010000421.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000421.108.fna -queryname NZ_BBXL010000421.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000421.108.fna -queryname NZ_BBXL010000421.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919811.10.fna -queryname NZ_GL8919811.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919811.10.fna -queryname NZ_GL8919811.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919811.10.fna -queryname NZ_GL8919811.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000401.109.fna -queryname NZ_BBXL010000401.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000401.109.fna -queryname NZ_BBXL010000401.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000401.109.fna -queryname NZ_BBXL010000401.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000271.110.fna -queryname NZ_BBXL010000271.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000271.110.fna -queryname NZ_BBXL010000271.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000271.110.fna -queryname NZ_BBXL010000271.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000351.111.fna -queryname NZ_BBXL010000351.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000351.111.fna -queryname NZ_BBXL010000351.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000351.111.fna -queryname NZ_BBXL010000351.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000371.112.fna -queryname NZ_BBXL010000371.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000371.112.fna -queryname NZ_BBXL010000371.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000371.112.fna -queryname NZ_BBXL010000371.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000011.113.fna -queryname NZ_BBXL010000011.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000011.113.fna -queryname NZ_BBXL010000011.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000011.113.fna -queryname NZ_BBXL010000011.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000041.114.fna -queryname NZ_BBXL010000041.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000041.114.fna -queryname NZ_BBXL010000041.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000041.114.fna -queryname NZ_BBXL010000041.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000041.114.AOI.fna -queryname NZ_BBXL010000041.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000041.114.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000041.114.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_BBXL010000041.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_BBXL010000041.114.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000031.115.fna -queryname NZ_BBXL010000031.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000031.115.fna -queryname NZ_BBXL010000031.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000031.115.fna -queryname NZ_BBXL010000031.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000201.116.fna -queryname NZ_BBXL010000201.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000201.116.fna -queryname NZ_BBXL010000201.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000201.116.fna -queryname NZ_BBXL010000201.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000331.117.fna -queryname NZ_BBXL010000331.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000331.117.fna -queryname NZ_BBXL010000331.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000331.117.fna -queryname NZ_BBXL010000331.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000151.118.fna -queryname NZ_BBXL010000151.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000151.118.fna -queryname NZ_BBXL010000151.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000151.118.fna -queryname NZ_BBXL010000151.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919831.11.fna -queryname NZ_GL8919831.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919831.11.fna -queryname NZ_GL8919831.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919831.11.fna -queryname NZ_GL8919831.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919831.11.AOI.fna -queryname NZ_GL8919831.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919831.11.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919831.11.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_GL8919831.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_GL8919831.11.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000081.119.fna -queryname NZ_BBXL010000081.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000081.119.fna -queryname NZ_BBXL010000081.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000081.119.fna -queryname NZ_BBXL010000081.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000241.120.fna -queryname NZ_BBXL010000241.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000241.120.fna -queryname NZ_BBXL010000241.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000241.120.fna -queryname NZ_BBXL010000241.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000501.121.fna -queryname NZ_BBXL010000501.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000501.121.fna -queryname NZ_BBXL010000501.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000501.121.fna -queryname NZ_BBXL010000501.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000221.122.fna -queryname NZ_BBXL010000221.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000221.122.fna -queryname NZ_BBXL010000221.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000221.122.fna -queryname NZ_BBXL010000221.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000111.123.fna -queryname NZ_BBXL010000111.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000111.123.fna -queryname NZ_BBXL010000111.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000111.123.fna -queryname NZ_BBXL010000111.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000321.124.fna -queryname NZ_BBXL010000321.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000321.124.fna -queryname NZ_BBXL010000321.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000321.124.fna -queryname NZ_BBXL010000321.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000231.125.fna -queryname NZ_BBXL010000231.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000231.125.fna -queryname NZ_BBXL010000231.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000231.125.fna -queryname NZ_BBXL010000231.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000051.126.fna -queryname NZ_BBXL010000051.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000051.126.fna -queryname NZ_BBXL010000051.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000051.126.fna -queryname NZ_BBXL010000051.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000091.127.fna -queryname NZ_BBXL010000091.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000091.127.fna -queryname NZ_BBXL010000091.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000091.127.fna -queryname NZ_BBXL010000091.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000301.128.fna -queryname NZ_BBXL010000301.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000301.128.fna -queryname NZ_BBXL010000301.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000301.128.fna -queryname NZ_BBXL010000301.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919851.12.fna -queryname NZ_GL8919851.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919851.12.fna -queryname NZ_GL8919851.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919851.12.fna -queryname NZ_GL8919851.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000361.129.fna -queryname NZ_BBXL010000361.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000361.129.fna -queryname NZ_BBXL010000361.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000361.129.fna -queryname NZ_BBXL010000361.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000471.130.fna -queryname NZ_BBXL010000471.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000471.130.fna -queryname NZ_BBXL010000471.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000471.130.fna -queryname NZ_BBXL010000471.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000441.131.fna -queryname NZ_BBXL010000441.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000441.131.fna -queryname NZ_BBXL010000441.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000441.131.fna -queryname NZ_BBXL010000441.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000391.132.fna -queryname NZ_BBXL010000391.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000391.132.fna -queryname NZ_BBXL010000391.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000391.132.fna -queryname NZ_BBXL010000391.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000061.133.fna -queryname NZ_BBXL010000061.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000061.133.fna -queryname NZ_BBXL010000061.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000061.133.fna -queryname NZ_BBXL010000061.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000101.134.fna -queryname NZ_BBXL010000101.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000101.134.fna -queryname NZ_BBXL010000101.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000101.134.fna -queryname NZ_BBXL010000101.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000291.135.fna -queryname NZ_BBXL010000291.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000291.135.fna -queryname NZ_BBXL010000291.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000291.135.fna -queryname NZ_BBXL010000291.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000281.136.fna -queryname NZ_BBXL010000281.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000281.136.fna -queryname NZ_BBXL010000281.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000281.136.fna -queryname NZ_BBXL010000281.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000411.137.fna -queryname NZ_BBXL010000411.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000411.137.fna -queryname NZ_BBXL010000411.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000411.137.fna -queryname NZ_BBXL010000411.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000261.138.fna -queryname NZ_BBXL010000261.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000261.138.fna -queryname NZ_BBXL010000261.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000261.138.fna -queryname NZ_BBXL010000261.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919871.13.fna -queryname NZ_GL8919871.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919871.13.fna -queryname NZ_GL8919871.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919871.13.fna -queryname NZ_GL8919871.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000071.139.fna -queryname NZ_BBXL010000071.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000071.139.fna -queryname NZ_BBXL010000071.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000071.139.fna -queryname NZ_BBXL010000071.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000461.140.fna -queryname NZ_BBXL010000461.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000461.140.fna -queryname NZ_BBXL010000461.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000461.140.fna -queryname NZ_BBXL010000461.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000181.141.fna -queryname NZ_BBXL010000181.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000181.141.fna -queryname NZ_BBXL010000181.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000181.141.fna -queryname NZ_BBXL010000181.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000191.142.fna -queryname NZ_BBXL010000191.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000191.142.fna -queryname NZ_BBXL010000191.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000191.142.fna -queryname NZ_BBXL010000191.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000251.143.fna -queryname NZ_BBXL010000251.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000251.143.fna -queryname NZ_BBXL010000251.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000251.143.fna -queryname NZ_BBXL010000251.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000381.144.fna -queryname NZ_BBXL010000381.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000381.144.fna -queryname NZ_BBXL010000381.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000381.144.fna -queryname NZ_BBXL010000381.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000121.145.fna -queryname NZ_BBXL010000121.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000121.145.fna -queryname NZ_BBXL010000121.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000121.145.fna -queryname NZ_BBXL010000121.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000131.146.fna -queryname NZ_BBXL010000131.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000131.146.fna -queryname NZ_BBXL010000131.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000131.146.fna -queryname NZ_BBXL010000131.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000481.147.fna -queryname NZ_BBXL010000481.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000481.147.fna -queryname NZ_BBXL010000481.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000481.147.fna -queryname NZ_BBXL010000481.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000071.148.fna -queryname NZ_QICL010000071.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000071.148.fna -queryname NZ_QICL010000071.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000071.148.fna -queryname NZ_QICL010000071.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919921.14.fna -queryname NZ_GL8919921.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919921.14.fna -queryname NZ_GL8919921.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919921.14.fna -queryname NZ_GL8919921.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000261.149.fna -queryname NZ_QICL010000261.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000261.149.fna -queryname NZ_QICL010000261.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000261.149.fna -queryname NZ_QICL010000261.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000461.150.fna -queryname NZ_QICL010000461.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000461.150.fna -queryname NZ_QICL010000461.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000461.150.fna -queryname NZ_QICL010000461.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000231.151.fna -queryname NZ_QICL010000231.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000231.151.fna -queryname NZ_QICL010000231.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000231.151.fna -queryname NZ_QICL010000231.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000361.152.fna -queryname NZ_QICL010000361.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000361.152.fna -queryname NZ_QICL010000361.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000361.152.fna -queryname NZ_QICL010000361.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000631.153.fna -queryname NZ_QICL010000631.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000631.153.fna -queryname NZ_QICL010000631.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000631.153.fna -queryname NZ_QICL010000631.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000121.154.fna -queryname NZ_QICL010000121.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000121.154.fna -queryname NZ_QICL010000121.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000121.154.fna -queryname NZ_QICL010000121.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000381.155.fna -queryname NZ_QICL010000381.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000381.155.fna -queryname NZ_QICL010000381.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000381.155.fna -queryname NZ_QICL010000381.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000491.156.fna -queryname NZ_QICL010000491.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000491.156.fna -queryname NZ_QICL010000491.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000491.156.fna -queryname NZ_QICL010000491.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000371.157.fna -queryname NZ_QICL010000371.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000371.157.fna -queryname NZ_QICL010000371.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000371.157.fna -queryname NZ_QICL010000371.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000551.158.fna -queryname NZ_QICL010000551.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000551.158.fna -queryname NZ_QICL010000551.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000551.158.fna -queryname NZ_QICL010000551.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919961.15.fna -queryname NZ_GL8919961.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919961.15.fna -queryname NZ_GL8919961.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919961.15.fna -queryname NZ_GL8919961.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000451.159.fna -queryname NZ_QICL010000451.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000451.159.fna -queryname NZ_QICL010000451.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000451.159.fna -queryname NZ_QICL010000451.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000051.160.fna -queryname NZ_QICL010000051.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000051.160.fna -queryname NZ_QICL010000051.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000051.160.fna -queryname NZ_QICL010000051.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000541.161.fna -queryname NZ_QICL010000541.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000541.161.fna -queryname NZ_QICL010000541.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000541.161.fna -queryname NZ_QICL010000541.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000301.162.fna -queryname NZ_QICL010000301.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000301.162.fna -queryname NZ_QICL010000301.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000301.162.fna -queryname NZ_QICL010000301.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000171.163.fna -queryname NZ_QICL010000171.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000171.163.fna -queryname NZ_QICL010000171.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000171.163.fna -queryname NZ_QICL010000171.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000021.164.fna -queryname NZ_QICL010000021.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000021.164.fna -queryname NZ_QICL010000021.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000021.164.fna -queryname NZ_QICL010000021.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000561.165.fna -queryname NZ_QICL010000561.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000561.165.fna -queryname NZ_QICL010000561.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000561.165.fna -queryname NZ_QICL010000561.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000581.166.fna -queryname NZ_QICL010000581.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000581.166.fna -queryname NZ_QICL010000581.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000581.166.fna -queryname NZ_QICL010000581.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000161.167.fna -queryname NZ_QICL010000161.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000161.167.fna -queryname NZ_QICL010000161.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000161.167.fna -queryname NZ_QICL010000161.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000291.168.fna -queryname NZ_QICL010000291.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000291.168.fna -queryname NZ_QICL010000291.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000291.168.fna -queryname NZ_QICL010000291.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919941.16.fna -queryname NZ_GL8919941.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919941.16.fna -queryname NZ_GL8919941.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919941.16.fna -queryname NZ_GL8919941.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000311.169.fna -queryname NZ_QICL010000311.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000311.169.fna -queryname NZ_QICL010000311.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000311.169.fna -queryname NZ_QICL010000311.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000341.170.fna -queryname NZ_QICL010000341.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000341.170.fna -queryname NZ_QICL010000341.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000341.170.fna -queryname NZ_QICL010000341.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000201.171.fna -queryname NZ_QICL010000201.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000201.171.fna -queryname NZ_QICL010000201.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000201.171.fna -queryname NZ_QICL010000201.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000391.172.fna -queryname NZ_QICL010000391.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000391.172.fna -queryname NZ_QICL010000391.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000391.172.fna -queryname NZ_QICL010000391.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000431.173.fna -queryname NZ_QICL010000431.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000431.173.fna -queryname NZ_QICL010000431.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000431.173.fna -queryname NZ_QICL010000431.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000191.174.fna -queryname NZ_QICL010000191.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000191.174.fna -queryname NZ_QICL010000191.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000191.174.fna -queryname NZ_QICL010000191.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000481.175.fna -queryname NZ_QICL010000481.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000481.175.fna -queryname NZ_QICL010000481.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000481.175.fna -queryname NZ_QICL010000481.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000471.176.fna -queryname NZ_QICL010000471.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000471.176.fna -queryname NZ_QICL010000471.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000471.176.fna -queryname NZ_QICL010000471.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000651.177.fna -queryname NZ_QICL010000651.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000651.177.fna -queryname NZ_QICL010000651.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000651.177.fna -queryname NZ_QICL010000651.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000211.178.fna -queryname NZ_QICL010000211.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000211.178.fna -queryname NZ_QICL010000211.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000211.178.fna -queryname NZ_QICL010000211.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919791.17.fna -queryname NZ_GL8919791.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919791.17.fna -queryname NZ_GL8919791.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919791.17.fna -queryname NZ_GL8919791.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000331.179.fna -queryname NZ_QICL010000331.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000331.179.fna -queryname NZ_QICL010000331.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000331.179.fna -queryname NZ_QICL010000331.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000321.180.fna -queryname NZ_QICL010000321.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000321.180.fna -queryname NZ_QICL010000321.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000321.180.fna -queryname NZ_QICL010000321.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000351.181.fna -queryname NZ_QICL010000351.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000351.181.fna -queryname NZ_QICL010000351.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000351.181.fna -queryname NZ_QICL010000351.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000421.182.fna -queryname NZ_QICL010000421.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000421.182.fna -queryname NZ_QICL010000421.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000421.182.fna -queryname NZ_QICL010000421.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000281.183.fna -queryname NZ_QICL010000281.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000281.183.fna -queryname NZ_QICL010000281.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000281.183.fna -queryname NZ_QICL010000281.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000511.184.fna -queryname NZ_QICL010000511.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000511.184.fna -queryname NZ_QICL010000511.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000511.184.fna -queryname NZ_QICL010000511.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000041.185.fna -queryname NZ_QICL010000041.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000041.185.fna -queryname NZ_QICL010000041.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000041.185.fna -queryname NZ_QICL010000041.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000531.186.fna -queryname NZ_QICL010000531.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000531.186.fna -queryname NZ_QICL010000531.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000531.186.fna -queryname NZ_QICL010000531.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000401.187.fna -queryname NZ_QICL010000401.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000401.187.fna -queryname NZ_QICL010000401.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000401.187.fna -queryname NZ_QICL010000401.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000221.188.fna -queryname NZ_QICL010000221.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000221.188.fna -queryname NZ_QICL010000221.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000221.188.fna -queryname NZ_QICL010000221.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919911.18.fna -queryname NZ_GL8919911.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919911.18.fna -queryname NZ_GL8919911.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919911.18.fna -queryname NZ_GL8919911.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000441.189.fna -queryname NZ_QICL010000441.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000441.189.fna -queryname NZ_QICL010000441.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000441.189.fna -queryname NZ_QICL010000441.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000601.190.fna -queryname NZ_QICL010000601.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000601.190.fna -queryname NZ_QICL010000601.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000601.190.fna -queryname NZ_QICL010000601.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000521.191.fna -queryname NZ_QICL010000521.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000521.191.fna -queryname NZ_QICL010000521.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000521.191.fna -queryname NZ_QICL010000521.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000271.192.fna -queryname NZ_QICL010000271.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000271.192.fna -queryname NZ_QICL010000271.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000271.192.fna -queryname NZ_QICL010000271.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000031.193.fna -queryname NZ_QICL010000031.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000031.193.fna -queryname NZ_QICL010000031.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000031.193.fna -queryname NZ_QICL010000031.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000031.193.AOI.fna -queryname NZ_QICL010000031.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000031.193.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000031.193.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_QICL010000031.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_QICL010000031.193.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000061.194.fna -queryname NZ_QICL010000061.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000061.194.fna -queryname NZ_QICL010000061.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000061.194.fna -queryname NZ_QICL010000061.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000181.195.fna -queryname NZ_QICL010000181.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000181.195.fna -queryname NZ_QICL010000181.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000181.195.fna -queryname NZ_QICL010000181.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000501.196.fna -queryname NZ_QICL010000501.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000501.196.fna -queryname NZ_QICL010000501.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000501.196.fna -queryname NZ_QICL010000501.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000241.197.fna -queryname NZ_QICL010000241.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000241.197.fna -queryname NZ_QICL010000241.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000241.197.fna -queryname NZ_QICL010000241.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000621.198.fna -queryname NZ_QICL010000621.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000621.198.fna -queryname NZ_QICL010000621.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000621.198.fna -queryname NZ_QICL010000621.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919841.1.fna -queryname NZ_GL8919841.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919841.1.fna -queryname NZ_GL8919841.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919841.1.fna -queryname NZ_GL8919841.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920131.19.fna -queryname NZ_GL8920131.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920131.19.fna -queryname NZ_GL8920131.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920131.19.fna -queryname NZ_GL8920131.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000081.199.fna -queryname NZ_QICL010000081.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000081.199.fna -queryname NZ_QICL010000081.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000081.199.fna -queryname NZ_QICL010000081.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000091.200.fna -queryname NZ_QICL010000091.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000091.200.fna -queryname NZ_QICL010000091.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000091.200.fna -queryname NZ_QICL010000091.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000411.201.fna -queryname NZ_QICL010000411.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000411.201.fna -queryname NZ_QICL010000411.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000411.201.fna -queryname NZ_QICL010000411.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000111.202.fna -queryname NZ_QICL010000111.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000111.202.fna -queryname NZ_QICL010000111.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000111.202.fna -queryname NZ_QICL010000111.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000151.203.fna -queryname NZ_QICL010000151.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000151.203.fna -queryname NZ_QICL010000151.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000151.203.fna -queryname NZ_QICL010000151.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000591.204.fna -queryname NZ_QICL010000591.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000591.204.fna -queryname NZ_QICL010000591.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000591.204.fna -queryname NZ_QICL010000591.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000101.205.fna -queryname NZ_QICL010000101.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000101.205.fna -queryname NZ_QICL010000101.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000101.205.fna -queryname NZ_QICL010000101.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000131.206.fna -queryname NZ_QICL010000131.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000131.206.fna -queryname NZ_QICL010000131.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000131.206.fna -queryname NZ_QICL010000131.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000251.207.fna -queryname NZ_QICL010000251.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000251.207.fna -queryname NZ_QICL010000251.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000251.207.fna -queryname NZ_QICL010000251.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000611.208.fna -queryname NZ_QICL010000611.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000611.208.fna -queryname NZ_QICL010000611.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000611.208.fna -queryname NZ_QICL010000611.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920061.20.fna -queryname NZ_GL8920061.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920061.20.fna -queryname NZ_GL8920061.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920061.20.fna -queryname NZ_GL8920061.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000141.209.fna -queryname NZ_QICL010000141.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000141.209.fna -queryname NZ_QICL010000141.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000141.209.fna -queryname NZ_QICL010000141.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000011.210.fna -queryname NZ_QICL010000011.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000011.210.fna -queryname NZ_QICL010000011.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000011.210.fna -queryname NZ_QICL010000011.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000571.211.fna -queryname NZ_QICL010000571.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000571.211.fna -queryname NZ_QICL010000571.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000571.211.fna -queryname NZ_QICL010000571.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000641.212.fna -queryname NZ_QICL010000641.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000641.212.fna -queryname NZ_QICL010000641.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_QICL010000641.212.fna -queryname NZ_QICL010000641.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000211.213.fna -queryname NZ_SOML010000211.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000211.213.fna -queryname NZ_SOML010000211.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000211.213.fna -queryname NZ_SOML010000211.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000071.214.fna -queryname NZ_SOML010000071.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000071.214.fna -queryname NZ_SOML010000071.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000071.214.fna -queryname NZ_SOML010000071.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000091.215.fna -queryname NZ_SOML010000091.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000091.215.fna -queryname NZ_SOML010000091.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000091.215.fna -queryname NZ_SOML010000091.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000091.215.AOI.fna -queryname NZ_SOML010000091.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000091.215.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000091.215.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_SOML010000091.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_SOML010000091.215.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000031.216.fna -queryname NZ_SOML010000031.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000031.216.fna -queryname NZ_SOML010000031.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000031.216.fna -queryname NZ_SOML010000031.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000201.217.fna -queryname NZ_SOML010000201.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000201.217.fna -queryname NZ_SOML010000201.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000201.217.fna -queryname NZ_SOML010000201.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000041.218.fna -queryname NZ_SOML010000041.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000041.218.fna -queryname NZ_SOML010000041.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000041.218.fna -queryname NZ_SOML010000041.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920161.21.fna -queryname NZ_GL8920161.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920161.21.fna -queryname NZ_GL8920161.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920161.21.fna -queryname NZ_GL8920161.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000141.219.fna -queryname NZ_SOML010000141.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000141.219.fna -queryname NZ_SOML010000141.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000141.219.fna -queryname NZ_SOML010000141.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000141.219.AOI.fna -queryname NZ_SOML010000141.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000141.219.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000141.219.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_SOML010000141.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_SOML010000141.219.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000171.220.fna -queryname NZ_SOML010000171.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000171.220.fna -queryname NZ_SOML010000171.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000171.220.fna -queryname NZ_SOML010000171.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000061.221.fna -queryname NZ_SOML010000061.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000061.221.fna -queryname NZ_SOML010000061.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000061.221.fna -queryname NZ_SOML010000061.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000101.222.fna -queryname NZ_SOML010000101.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000101.222.fna -queryname NZ_SOML010000101.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000101.222.fna -queryname NZ_SOML010000101.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000111.223.fna -queryname NZ_SOML010000111.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000111.223.fna -queryname NZ_SOML010000111.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000111.223.fna -queryname NZ_SOML010000111.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000011.224.fna -queryname NZ_SOML010000011.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000011.224.fna -queryname NZ_SOML010000011.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000011.224.fna -queryname NZ_SOML010000011.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000021.225.fna -queryname NZ_SOML010000021.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000021.225.fna -queryname NZ_SOML010000021.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000021.225.fna -queryname NZ_SOML010000021.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000081.226.fna -queryname NZ_SOML010000081.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000081.226.fna -queryname NZ_SOML010000081.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000081.226.fna -queryname NZ_SOML010000081.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000051.227.fna -queryname NZ_SOML010000051.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000051.227.fna -queryname NZ_SOML010000051.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000051.227.fna -queryname NZ_SOML010000051.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000191.228.fna -queryname NZ_SOML010000191.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000191.228.fna -queryname NZ_SOML010000191.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000191.228.fna -queryname NZ_SOML010000191.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920081.22.fna -queryname NZ_GL8920081.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920081.22.fna -queryname NZ_GL8920081.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920081.22.fna -queryname NZ_GL8920081.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000161.229.fna -queryname NZ_SOML010000161.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000161.229.fna -queryname NZ_SOML010000161.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000161.229.fna -queryname NZ_SOML010000161.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000131.230.fna -queryname NZ_SOML010000131.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000131.230.fna -queryname NZ_SOML010000131.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000131.230.fna -queryname NZ_SOML010000131.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000221.231.fna -queryname NZ_SOML010000221.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000221.231.fna -queryname NZ_SOML010000221.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000221.231.fna -queryname NZ_SOML010000221.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000151.232.fna -queryname NZ_SOML010000151.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000151.232.fna -queryname NZ_SOML010000151.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000151.232.fna -queryname NZ_SOML010000151.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000121.233.fna -queryname NZ_SOML010000121.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000121.233.fna -queryname NZ_SOML010000121.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000121.233.fna -queryname NZ_SOML010000121.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000181.234.fna -queryname NZ_SOML010000181.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000181.234.fna -queryname NZ_SOML010000181.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SOML010000181.234.fna -queryname NZ_SOML010000181.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000041.235.fna -queryname NZ_SPPK010000041.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000041.235.fna -queryname NZ_SPPK010000041.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000041.235.fna -queryname NZ_SPPK010000041.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000141.236.fna -queryname NZ_SPPK010000141.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000141.236.fna -queryname NZ_SPPK010000141.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000141.236.fna -queryname NZ_SPPK010000141.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000151.237.fna -queryname NZ_SPPK010000151.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000151.237.fna -queryname NZ_SPPK010000151.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000151.237.fna -queryname NZ_SPPK010000151.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000091.238.fna -queryname NZ_SPPK010000091.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000091.238.fna -queryname NZ_SPPK010000091.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000091.238.fna -queryname NZ_SPPK010000091.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920071.23.fna -queryname NZ_GL8920071.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920071.23.fna -queryname NZ_GL8920071.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920071.23.fna -queryname NZ_GL8920071.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000071.239.fna -queryname NZ_SPPK010000071.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000071.239.fna -queryname NZ_SPPK010000071.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000071.239.fna -queryname NZ_SPPK010000071.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000051.240.fna -queryname NZ_SPPK010000051.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000051.240.fna -queryname NZ_SPPK010000051.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000051.240.fna -queryname NZ_SPPK010000051.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000111.241.fna -queryname NZ_SPPK010000111.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000111.241.fna -queryname NZ_SPPK010000111.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000111.241.fna -queryname NZ_SPPK010000111.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000081.242.fna -queryname NZ_SPPK010000081.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000081.242.fna -queryname NZ_SPPK010000081.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000081.242.fna -queryname NZ_SPPK010000081.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000121.243.fna -queryname NZ_SPPK010000121.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000121.243.fna -queryname NZ_SPPK010000121.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000121.243.fna -queryname NZ_SPPK010000121.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000011.244.fna -queryname NZ_SPPK010000011.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000011.244.fna -queryname NZ_SPPK010000011.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000011.244.fna -queryname NZ_SPPK010000011.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000011.244.AOI.fna -queryname NZ_SPPK010000011.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000011.244.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000011.244.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_SPPK010000011.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_SPPK010000011.244.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000131.245.fna -queryname NZ_SPPK010000131.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000131.245.fna -queryname NZ_SPPK010000131.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000131.245.fna -queryname NZ_SPPK010000131.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000031.246.fna -queryname NZ_SPPK010000031.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000031.246.fna -queryname NZ_SPPK010000031.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000031.246.fna -queryname NZ_SPPK010000031.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000101.247.fna -queryname NZ_SPPK010000101.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000101.247.fna -queryname NZ_SPPK010000101.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000101.247.fna -queryname NZ_SPPK010000101.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000061.248.fna -queryname NZ_SPPK010000061.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000061.248.fna -queryname NZ_SPPK010000061.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000061.248.fna -queryname NZ_SPPK010000061.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920041.24.fna -queryname NZ_GL8920041.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920041.24.fna -queryname NZ_GL8920041.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920041.24.fna -queryname NZ_GL8920041.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000021.249.fna -queryname NZ_SPPK010000021.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000021.249.fna -queryname NZ_SPPK010000021.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000021.249.fna -queryname NZ_SPPK010000021.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000021.249.AOI.fna -queryname NZ_SPPK010000021.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000021.249.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_SPPK010000021.249.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_SPPK010000021.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_SPPK010000021.249.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6052051.250.fna -queryname NZ_LT6052051.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6052051.250.fna -queryname NZ_LT6052051.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6052051.250.fna -queryname NZ_LT6052051.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6052051.250.AOI.fna -queryname NZ_LT6052051.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6052051.250.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6052051.250.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_LT6052051.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_LT6052051.250.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6083281.251.fna -queryname NZ_LT6083281.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6083281.251.fna -queryname NZ_LT6083281.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6083281.251.fna -queryname NZ_LT6083281.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6083281.251.AOI.fna -queryname NZ_LT6083281.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6083281.251.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LT6083281.251.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_LT6083281.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_LT6083281.251.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000131.252.fna -queryname NZ_FQUC010000131.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000131.252.fna -queryname NZ_FQUC010000131.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000131.252.fna -queryname NZ_FQUC010000131.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000031.253.fna -queryname NZ_FQUC010000031.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000031.253.fna -queryname NZ_FQUC010000031.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000031.253.fna -queryname NZ_FQUC010000031.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000201.254.fna -queryname NZ_FQUC010000201.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000201.254.fna -queryname NZ_FQUC010000201.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000201.254.fna -queryname NZ_FQUC010000201.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000351.255.fna -queryname NZ_FQUC010000351.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000351.255.fna -queryname NZ_FQUC010000351.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000351.255.fna -queryname NZ_FQUC010000351.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000181.256.fna -queryname NZ_FQUC010000181.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000181.256.fna -queryname NZ_FQUC010000181.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000181.256.fna -queryname NZ_FQUC010000181.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000041.257.fna -queryname NZ_FQUC010000041.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000041.257.fna -queryname NZ_FQUC010000041.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000041.257.fna -queryname NZ_FQUC010000041.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000171.258.fna -queryname NZ_FQUC010000171.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000171.258.fna -queryname NZ_FQUC010000171.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000171.258.fna -queryname NZ_FQUC010000171.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920111.25.fna -queryname NZ_GL8920111.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920111.25.fna -queryname NZ_GL8920111.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920111.25.fna -queryname NZ_GL8920111.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000271.259.fna -queryname NZ_FQUC010000271.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000271.259.fna -queryname NZ_FQUC010000271.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000271.259.fna -queryname NZ_FQUC010000271.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000261.260.fna -queryname NZ_FQUC010000261.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000261.260.fna -queryname NZ_FQUC010000261.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000261.260.fna -queryname NZ_FQUC010000261.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000071.261.fna -queryname NZ_FQUC010000071.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000071.261.fna -queryname NZ_FQUC010000071.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000071.261.fna -queryname NZ_FQUC010000071.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000061.262.fna -queryname NZ_FQUC010000061.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000061.262.fna -queryname NZ_FQUC010000061.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000061.262.fna -queryname NZ_FQUC010000061.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000311.263.fna -queryname NZ_FQUC010000311.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000311.263.fna -queryname NZ_FQUC010000311.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000311.263.fna -queryname NZ_FQUC010000311.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000221.264.fna -queryname NZ_FQUC010000221.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000221.264.fna -queryname NZ_FQUC010000221.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000221.264.fna -queryname NZ_FQUC010000221.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000091.265.fna -queryname NZ_FQUC010000091.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000091.265.fna -queryname NZ_FQUC010000091.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000091.265.fna -queryname NZ_FQUC010000091.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000251.266.fna -queryname NZ_FQUC010000251.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000251.266.fna -queryname NZ_FQUC010000251.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000251.266.fna -queryname NZ_FQUC010000251.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000151.267.fna -queryname NZ_FQUC010000151.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000151.267.fna -queryname NZ_FQUC010000151.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000151.267.fna -queryname NZ_FQUC010000151.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000191.268.fna -queryname NZ_FQUC010000191.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000191.268.fna -queryname NZ_FQUC010000191.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000191.268.fna -queryname NZ_FQUC010000191.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920171.26.fna -queryname NZ_GL8920171.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920171.26.fna -queryname NZ_GL8920171.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920171.26.fna -queryname NZ_GL8920171.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000011.269.fna -queryname NZ_FQUC010000011.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000011.269.fna -queryname NZ_FQUC010000011.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000011.269.fna -queryname NZ_FQUC010000011.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000101.270.fna -queryname NZ_FQUC010000101.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000101.270.fna -queryname NZ_FQUC010000101.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000101.270.fna -queryname NZ_FQUC010000101.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000331.271.fna -queryname NZ_FQUC010000331.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000331.271.fna -queryname NZ_FQUC010000331.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000331.271.fna -queryname NZ_FQUC010000331.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000111.272.fna -queryname NZ_FQUC010000111.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000111.272.fna -queryname NZ_FQUC010000111.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000111.272.fna -queryname NZ_FQUC010000111.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000301.273.fna -queryname NZ_FQUC010000301.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000301.273.fna -queryname NZ_FQUC010000301.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000301.273.fna -queryname NZ_FQUC010000301.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000211.274.fna -queryname NZ_FQUC010000211.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000211.274.fna -queryname NZ_FQUC010000211.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000211.274.fna -queryname NZ_FQUC010000211.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000281.275.fna -queryname NZ_FQUC010000281.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000281.275.fna -queryname NZ_FQUC010000281.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000281.275.fna -queryname NZ_FQUC010000281.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000241.276.fna -queryname NZ_FQUC010000241.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000241.276.fna -queryname NZ_FQUC010000241.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000241.276.fna -queryname NZ_FQUC010000241.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000231.277.fna -queryname NZ_FQUC010000231.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000231.277.fna -queryname NZ_FQUC010000231.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000231.277.fna -queryname NZ_FQUC010000231.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000141.278.fna -queryname NZ_FQUC010000141.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000141.278.fna -queryname NZ_FQUC010000141.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000141.278.fna -queryname NZ_FQUC010000141.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920121.27.fna -queryname NZ_GL8920121.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920121.27.fna -queryname NZ_GL8920121.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920121.27.fna -queryname NZ_GL8920121.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000341.279.fna -queryname NZ_FQUC010000341.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000341.279.fna -queryname NZ_FQUC010000341.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000341.279.fna -queryname NZ_FQUC010000341.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000161.280.fna -queryname NZ_FQUC010000161.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000161.280.fna -queryname NZ_FQUC010000161.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000161.280.fna -queryname NZ_FQUC010000161.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000081.281.fna -queryname NZ_FQUC010000081.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000081.281.fna -queryname NZ_FQUC010000081.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000081.281.fna -queryname NZ_FQUC010000081.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000081.281.AOI.fna -queryname NZ_FQUC010000081.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000081.281.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000081.281.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_FQUC010000081.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_FQUC010000081.281.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000121.282.fna -queryname NZ_FQUC010000121.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000121.282.fna -queryname NZ_FQUC010000121.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000121.282.fna -queryname NZ_FQUC010000121.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000021.283.fna -queryname NZ_FQUC010000021.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000021.283.fna -queryname NZ_FQUC010000021.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000021.283.fna -queryname NZ_FQUC010000021.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000051.284.fna -queryname NZ_FQUC010000051.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000051.284.fna -queryname NZ_FQUC010000051.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000051.284.fna -queryname NZ_FQUC010000051.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000291.285.fna -queryname NZ_FQUC010000291.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000291.285.fna -queryname NZ_FQUC010000291.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000291.285.fna -queryname NZ_FQUC010000291.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000321.286.fna -queryname NZ_FQUC010000321.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000321.286.fna -queryname NZ_FQUC010000321.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_FQUC010000321.286.fna -queryname NZ_FQUC010000321.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000151.287.fna -queryname NZ_OEPV010000151.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000151.287.fna -queryname NZ_OEPV010000151.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000151.287.fna -queryname NZ_OEPV010000151.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000081.288.fna -queryname NZ_OEPV010000081.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000081.288.fna -queryname NZ_OEPV010000081.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000081.288.fna -queryname NZ_OEPV010000081.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920091.28.fna -queryname NZ_GL8920091.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920091.28.fna -queryname NZ_GL8920091.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920091.28.fna -queryname NZ_GL8920091.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000111.289.fna -queryname NZ_OEPV010000111.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000111.289.fna -queryname NZ_OEPV010000111.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000111.289.fna -queryname NZ_OEPV010000111.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000211.290.fna -queryname NZ_OEPV010000211.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000211.290.fna -queryname NZ_OEPV010000211.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000211.290.fna -queryname NZ_OEPV010000211.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000041.291.fna -queryname NZ_OEPV010000041.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000041.291.fna -queryname NZ_OEPV010000041.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000041.291.fna -queryname NZ_OEPV010000041.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000071.292.fna -queryname NZ_OEPV010000071.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000071.292.fna -queryname NZ_OEPV010000071.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000071.292.fna -queryname NZ_OEPV010000071.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000191.293.fna -queryname NZ_OEPV010000191.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000191.293.fna -queryname NZ_OEPV010000191.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000191.293.fna -queryname NZ_OEPV010000191.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000131.294.fna -queryname NZ_OEPV010000131.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000131.294.fna -queryname NZ_OEPV010000131.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000131.294.fna -queryname NZ_OEPV010000131.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000011.295.fna -queryname NZ_OEPV010000011.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000011.295.fna -queryname NZ_OEPV010000011.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000011.295.fna -queryname NZ_OEPV010000011.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000201.296.fna -queryname NZ_OEPV010000201.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000201.296.fna -queryname NZ_OEPV010000201.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000201.296.fna -queryname NZ_OEPV010000201.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000141.297.fna -queryname NZ_OEPV010000141.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000141.297.fna -queryname NZ_OEPV010000141.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000141.297.fna -queryname NZ_OEPV010000141.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000091.298.fna -queryname NZ_OEPV010000091.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000091.298.fna -queryname NZ_OEPV010000091.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000091.298.fna -queryname NZ_OEPV010000091.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919901.2.fna -queryname NZ_GL8919901.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919901.2.fna -queryname NZ_GL8919901.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919901.2.fna -queryname NZ_GL8919901.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920101.29.fna -queryname NZ_GL8920101.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920101.29.fna -queryname NZ_GL8920101.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920101.29.fna -queryname NZ_GL8920101.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000161.299.fna -queryname NZ_OEPV010000161.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000161.299.fna -queryname NZ_OEPV010000161.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000161.299.fna -queryname NZ_OEPV010000161.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000121.300.fna -queryname NZ_OEPV010000121.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000121.300.fna -queryname NZ_OEPV010000121.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000121.300.fna -queryname NZ_OEPV010000121.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000061.301.fna -queryname NZ_OEPV010000061.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000061.301.fna -queryname NZ_OEPV010000061.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000061.301.fna -queryname NZ_OEPV010000061.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000061.301.AOI.fna -queryname NZ_OEPV010000061.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000061.301.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000061.301.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_OEPV010000061.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_OEPV010000061.301.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000171.302.fna -queryname NZ_OEPV010000171.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000171.302.fna -queryname NZ_OEPV010000171.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000171.302.fna -queryname NZ_OEPV010000171.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000101.303.fna -queryname NZ_OEPV010000101.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000101.303.fna -queryname NZ_OEPV010000101.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000101.303.fna -queryname NZ_OEPV010000101.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000021.304.fna -queryname NZ_OEPV010000021.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000021.304.fna -queryname NZ_OEPV010000021.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000021.304.fna -queryname NZ_OEPV010000021.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000021.304.AOI.fna -queryname NZ_OEPV010000021.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000021.304.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000021.304.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_OEPV010000021.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_OEPV010000021.304.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000031.305.fna -queryname NZ_OEPV010000031.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000031.305.fna -queryname NZ_OEPV010000031.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000031.305.fna -queryname NZ_OEPV010000031.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000181.306.fna -queryname NZ_OEPV010000181.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000181.306.fna -queryname NZ_OEPV010000181.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000181.306.fna -queryname NZ_OEPV010000181.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000051.307.fna -queryname NZ_OEPV010000051.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000051.307.fna -queryname NZ_OEPV010000051.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_OEPV010000051.307.fna -queryname NZ_OEPV010000051.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920051.30.fna -queryname NZ_GL8920051.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920051.30.fna -queryname NZ_GL8920051.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920051.30.fna -queryname NZ_GL8920051.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920051.30.AOI.fna -queryname NZ_GL8920051.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920051.30.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920051.30.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_GL8920051.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_GL8920051.30.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920141.31.fna -queryname NZ_GL8920141.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920141.31.fna -queryname NZ_GL8920141.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920141.31.fna -queryname NZ_GL8920141.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920181.32.fna -queryname NZ_GL8920181.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920181.32.fna -queryname NZ_GL8920181.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920181.32.fna -queryname NZ_GL8920181.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920151.33.fna -queryname NZ_GL8920151.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920151.33.fna -queryname NZ_GL8920151.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8920151.33.fna -queryname NZ_GL8920151.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056951.34.fna -queryname NZ_KB9056951.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056951.34.fna -queryname NZ_KB9056951.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056951.34.fna -queryname NZ_KB9056951.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056951.34.AOI.fna -queryname NZ_KB9056951.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056951.34.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056951.34.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_KB9056951.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_KB9056951.34.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057091.35.fna -queryname NZ_KB9057091.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057091.35.fna -queryname NZ_KB9057091.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057091.35.fna -queryname NZ_KB9057091.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057171.36.fna -queryname NZ_KB9057171.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057171.36.fna -queryname NZ_KB9057171.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057171.36.fna -queryname NZ_KB9057171.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057191.37.fna -queryname NZ_KB9057191.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057191.37.fna -queryname NZ_KB9057191.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057191.37.fna -queryname NZ_KB9057191.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056971.38.fna -queryname NZ_KB9056971.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056971.38.fna -queryname NZ_KB9056971.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056971.38.fna -queryname NZ_KB9056971.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919881.3.fna -queryname NZ_GL8919881.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919881.3.fna -queryname NZ_GL8919881.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919881.3.fna -queryname NZ_GL8919881.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057031.39.fna -queryname NZ_KB9057031.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057031.39.fna -queryname NZ_KB9057031.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057031.39.fna -queryname NZ_KB9057031.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057061.40.fna -queryname NZ_KB9057061.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057061.40.fna -queryname NZ_KB9057061.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057061.40.fna -queryname NZ_KB9057061.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057231.41.fna -queryname NZ_KB9057231.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057231.41.fna -queryname NZ_KB9057231.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057231.41.fna -queryname NZ_KB9057231.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057161.42.fna -queryname NZ_KB9057161.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057161.42.fna -queryname NZ_KB9057161.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057161.42.fna -queryname NZ_KB9057161.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057051.43.fna -queryname NZ_KB9057051.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057051.43.fna -queryname NZ_KB9057051.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057051.43.fna -queryname NZ_KB9057051.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057021.44.fna -queryname NZ_KB9057021.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057021.44.fna -queryname NZ_KB9057021.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057021.44.fna -queryname NZ_KB9057021.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056991.45.fna -queryname NZ_KB9056991.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056991.45.fna -queryname NZ_KB9056991.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056991.45.fna -queryname NZ_KB9056991.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056981.46.fna -queryname NZ_KB9056981.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056981.46.fna -queryname NZ_KB9056981.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056981.46.fna -queryname NZ_KB9056981.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057211.47.fna -queryname NZ_KB9057211.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057211.47.fna -queryname NZ_KB9057211.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057211.47.fna -queryname NZ_KB9057211.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057221.48.fna -queryname NZ_KB9057221.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057221.48.fna -queryname NZ_KB9057221.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057221.48.fna -queryname NZ_KB9057221.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919931.4.fna -queryname NZ_GL8919931.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919931.4.fna -queryname NZ_GL8919931.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919931.4.fna -queryname NZ_GL8919931.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057181.49.fna -queryname NZ_KB9057181.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057181.49.fna -queryname NZ_KB9057181.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057181.49.fna -queryname NZ_KB9057181.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057081.50.fna -queryname NZ_KB9057081.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057081.50.fna -queryname NZ_KB9057081.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057081.50.fna -queryname NZ_KB9057081.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057011.51.fna -queryname NZ_KB9057011.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057011.51.fna -queryname NZ_KB9057011.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057011.51.fna -queryname NZ_KB9057011.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057111.52.fna -queryname NZ_KB9057111.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057111.52.fna -queryname NZ_KB9057111.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057111.52.fna -queryname NZ_KB9057111.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057121.53.fna -queryname NZ_KB9057121.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057121.53.fna -queryname NZ_KB9057121.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057121.53.fna -queryname NZ_KB9057121.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057201.54.fna -queryname NZ_KB9057201.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057201.54.fna -queryname NZ_KB9057201.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057201.54.fna -queryname NZ_KB9057201.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057041.55.fna -queryname NZ_KB9057041.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057041.55.fna -queryname NZ_KB9057041.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057041.55.fna -queryname NZ_KB9057041.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057101.56.fna -queryname NZ_KB9057101.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057101.56.fna -queryname NZ_KB9057101.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057101.56.fna -queryname NZ_KB9057101.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056921.57.fna -queryname NZ_KB9056921.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056921.57.fna -queryname NZ_KB9056921.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056921.57.fna -queryname NZ_KB9056921.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056921.57.AOI.fna -queryname NZ_KB9056921.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056921.57.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056921.57.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_KB9056921.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_KB9056921.57.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056931.58.fna -queryname NZ_KB9056931.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056931.58.fna -queryname NZ_KB9056931.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056931.58.fna -queryname NZ_KB9056931.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919821.5.fna -queryname NZ_GL8919821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919821.5.fna -queryname NZ_GL8919821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919821.5.fna -queryname NZ_GL8919821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056961.59.fna -queryname NZ_KB9056961.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056961.59.fna -queryname NZ_KB9056961.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056961.59.fna -queryname NZ_KB9056961.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057151.60.fna -queryname NZ_KB9057151.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057151.60.fna -queryname NZ_KB9057151.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057151.60.fna -queryname NZ_KB9057151.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057001.61.fna -queryname NZ_KB9057001.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057001.61.fna -queryname NZ_KB9057001.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057001.61.fna -queryname NZ_KB9057001.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057071.62.fna -queryname NZ_KB9057071.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057071.62.fna -queryname NZ_KB9057071.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057071.62.fna -queryname NZ_KB9057071.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056941.63.fna -queryname NZ_KB9056941.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056941.63.fna -queryname NZ_KB9056941.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9056941.63.fna -queryname NZ_KB9056941.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057141.64.fna -queryname NZ_KB9057141.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057141.64.fna -queryname NZ_KB9057141.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057141.64.fna -queryname NZ_KB9057141.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057131.65.fna -queryname NZ_KB9057131.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057131.65.fna -queryname NZ_KB9057131.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KB9057131.65.fna -queryname NZ_KB9057131.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000091.66.fna -queryname NZ_AUFL010000091.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000091.66.fna -queryname NZ_AUFL010000091.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000091.66.fna -queryname NZ_AUFL010000091.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000191.67.fna -queryname NZ_AUFL010000191.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000191.67.fna -queryname NZ_AUFL010000191.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000191.67.fna -queryname NZ_AUFL010000191.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000191.67.AOI.fna -queryname NZ_AUFL010000191.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000191.67.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000191.67.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_AUFL010000191.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_AUFL010000191.67.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000311.68.fna -queryname NZ_AUFL010000311.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000311.68.fna -queryname NZ_AUFL010000311.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000311.68.fna -queryname NZ_AUFL010000311.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919951.6.fna -queryname NZ_GL8919951.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919951.6.fna -queryname NZ_GL8919951.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919951.6.fna -queryname NZ_GL8919951.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000171.69.fna -queryname NZ_AUFL010000171.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000171.69.fna -queryname NZ_AUFL010000171.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000171.69.fna -queryname NZ_AUFL010000171.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000181.70.fna -queryname NZ_AUFL010000181.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000181.70.fna -queryname NZ_AUFL010000181.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000181.70.fna -queryname NZ_AUFL010000181.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000291.71.fna -queryname NZ_AUFL010000291.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000291.71.fna -queryname NZ_AUFL010000291.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000291.71.fna -queryname NZ_AUFL010000291.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000151.72.fna -queryname NZ_AUFL010000151.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000151.72.fna -queryname NZ_AUFL010000151.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000151.72.fna -queryname NZ_AUFL010000151.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000081.73.fna -queryname NZ_AUFL010000081.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000081.73.fna -queryname NZ_AUFL010000081.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000081.73.fna -queryname NZ_AUFL010000081.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000041.74.fna -queryname NZ_AUFL010000041.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000041.74.fna -queryname NZ_AUFL010000041.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000041.74.fna -queryname NZ_AUFL010000041.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000271.75.fna -queryname NZ_AUFL010000271.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000271.75.fna -queryname NZ_AUFL010000271.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000271.75.fna -queryname NZ_AUFL010000271.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000231.76.fna -queryname NZ_AUFL010000231.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000231.76.fna -queryname NZ_AUFL010000231.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000231.76.fna -queryname NZ_AUFL010000231.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000221.77.fna -queryname NZ_AUFL010000221.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000221.77.fna -queryname NZ_AUFL010000221.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000221.77.fna -queryname NZ_AUFL010000221.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000101.78.fna -queryname NZ_AUFL010000101.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000101.78.fna -queryname NZ_AUFL010000101.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000101.78.fna -queryname NZ_AUFL010000101.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919891.7.fna -queryname NZ_GL8919891.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919891.7.fna -queryname NZ_GL8919891.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919891.7.fna -queryname NZ_GL8919891.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000321.79.fna -queryname NZ_AUFL010000321.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000321.79.fna -queryname NZ_AUFL010000321.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000321.79.fna -queryname NZ_AUFL010000321.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000131.80.fna -queryname NZ_AUFL010000131.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000131.80.fna -queryname NZ_AUFL010000131.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000131.80.fna -queryname NZ_AUFL010000131.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000331.81.fna -queryname NZ_AUFL010000331.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000331.81.fna -queryname NZ_AUFL010000331.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000331.81.fna -queryname NZ_AUFL010000331.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KE3845291.82.fna -queryname NZ_KE3845291.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KE3845291.82.fna -queryname NZ_KE3845291.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KE3845291.82.fna -queryname NZ_KE3845291.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000161.83.fna -queryname NZ_AUFL010000161.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000161.83.fna -queryname NZ_AUFL010000161.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000161.83.fna -queryname NZ_AUFL010000161.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000121.84.fna -queryname NZ_AUFL010000121.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000121.84.fna -queryname NZ_AUFL010000121.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000121.84.fna -queryname NZ_AUFL010000121.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000261.85.fna -queryname NZ_AUFL010000261.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000261.85.fna -queryname NZ_AUFL010000261.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000261.85.fna -queryname NZ_AUFL010000261.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000111.86.fna -queryname NZ_AUFL010000111.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000111.86.fna -queryname NZ_AUFL010000111.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000111.86.fna -queryname NZ_AUFL010000111.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000211.87.fna -queryname NZ_AUFL010000211.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000211.87.fna -queryname NZ_AUFL010000211.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000211.87.fna -queryname NZ_AUFL010000211.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KE3845301.88.fna -queryname NZ_KE3845301.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KE3845301.88.fna -queryname NZ_KE3845301.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_KE3845301.88.fna -queryname NZ_KE3845301.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919971.8.fna -queryname NZ_GL8919971.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919971.8.fna -queryname NZ_GL8919971.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_GL8919971.8.fna -queryname NZ_GL8919971.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000341.89.fna -queryname NZ_AUFL010000341.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000341.89.fna -queryname NZ_AUFL010000341.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000341.89.fna -queryname NZ_AUFL010000341.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000301.90.fna -queryname NZ_AUFL010000301.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000301.90.fna -queryname NZ_AUFL010000301.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000301.90.fna -queryname NZ_AUFL010000301.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000251.91.fna -queryname NZ_AUFL010000251.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000251.91.fna -queryname NZ_AUFL010000251.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000251.91.fna -queryname NZ_AUFL010000251.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000051.92.fna -queryname NZ_AUFL010000051.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000051.92.fna -queryname NZ_AUFL010000051.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000051.92.fna -queryname NZ_AUFL010000051.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000201.93.fna -queryname NZ_AUFL010000201.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000201.93.fna -queryname NZ_AUFL010000201.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000201.93.fna -queryname NZ_AUFL010000201.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000281.94.fna -queryname NZ_AUFL010000281.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000281.94.fna -queryname NZ_AUFL010000281.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000281.94.fna -queryname NZ_AUFL010000281.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000141.95.fna -queryname NZ_AUFL010000141.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000141.95.fna -queryname NZ_AUFL010000141.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000141.95.fna -queryname NZ_AUFL010000141.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000241.96.fna -queryname NZ_AUFL010000241.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000241.96.fna -queryname NZ_AUFL010000241.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_AUFL010000241.96.fna -queryname NZ_AUFL010000241.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LN5155321.97.fna -queryname NZ_LN5155321.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LN5155321.97.fna -queryname NZ_LN5155321.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LN5155321.97.fna -queryname NZ_LN5155321.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LN5155321.97.AOI.fna -queryname NZ_LN5155321.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LN5155321.97.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_LN5155321.97.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -queryname NZ_LN5155321.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -table NZ_LN5155321.97.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000491.98.fna -queryname NZ_BBXL010000491.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000491.98.fna -queryname NZ_BBXL010000491.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result/NZ_BBXL010000491.98.fna -queryname NZ_BBXL010000491.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Dysgonomonadaceae//Dysgonomonadaceae.result