/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152041.0.fna -queryname NZ_JH8152041.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152041.0.fna -queryname NZ_JH8152041.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152041.0.fna -queryname NZ_JH8152041.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407801.9.fna -queryname NZ_KI4407801.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407801.9.fna -queryname NZ_KI4407801.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407801.9.fna -queryname NZ_KI4407801.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408081.10.fna -queryname NZ_KI4408081.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408081.10.fna -queryname NZ_KI4408081.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408081.10.fna -queryname NZ_KI4408081.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407831.11.fna -queryname NZ_KI4407831.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407831.11.fna -queryname NZ_KI4407831.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407831.11.fna -queryname NZ_KI4407831.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408041.12.fna -queryname NZ_KI4408041.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408041.12.fna -queryname NZ_KI4408041.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408041.12.fna -queryname NZ_KI4408041.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407881.13.fna -queryname NZ_KI4407881.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407881.13.fna -queryname NZ_KI4407881.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407881.13.fna -queryname NZ_KI4407881.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407991.14.fna -queryname NZ_KI4407991.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407991.14.fna -queryname NZ_KI4407991.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407991.14.fna -queryname NZ_KI4407991.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408151.15.fna -queryname NZ_KI4408151.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408151.15.fna -queryname NZ_KI4408151.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408151.15.fna -queryname NZ_KI4408151.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408021.16.fna -queryname NZ_KI4408021.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408021.16.fna -queryname NZ_KI4408021.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408021.16.fna -queryname NZ_KI4408021.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407951.17.fna -queryname NZ_KI4407951.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407951.17.fna -queryname NZ_KI4407951.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407951.17.fna -queryname NZ_KI4407951.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407961.18.fna -queryname NZ_KI4407961.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407961.18.fna -queryname NZ_KI4407961.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407961.18.fna -queryname NZ_KI4407961.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152061.1.fna -queryname NZ_JH8152061.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152061.1.fna -queryname NZ_JH8152061.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152061.1.fna -queryname NZ_JH8152061.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152061.1.AOI.fna -queryname NZ_JH8152061.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152061.1.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152061.1.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -queryname NZ_JH8152061.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -table NZ_JH8152061.1.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407941.19.fna -queryname NZ_KI4407941.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407941.19.fna -queryname NZ_KI4407941.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407941.19.fna -queryname NZ_KI4407941.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407921.20.fna -queryname NZ_KI4407921.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407921.20.fna -queryname NZ_KI4407921.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407921.20.fna -queryname NZ_KI4407921.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408011.21.fna -queryname NZ_KI4408011.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408011.21.fna -queryname NZ_KI4408011.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408011.21.fna -queryname NZ_KI4408011.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407971.22.fna -queryname NZ_KI4407971.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407971.22.fna -queryname NZ_KI4407971.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407971.22.fna -queryname NZ_KI4407971.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408031.23.fna -queryname NZ_KI4408031.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408031.23.fna -queryname NZ_KI4408031.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408031.23.fna -queryname NZ_KI4408031.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408341.24.fna -queryname NZ_KI4408341.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408341.24.fna -queryname NZ_KI4408341.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408341.24.fna -queryname NZ_KI4408341.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407981.25.fna -queryname NZ_KI4407981.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407981.25.fna -queryname NZ_KI4407981.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407981.25.fna -queryname NZ_KI4407981.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408191.26.fna -queryname NZ_KI4408191.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408191.26.fna -queryname NZ_KI4408191.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408191.26.fna -queryname NZ_KI4408191.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408321.27.fna -queryname NZ_KI4408321.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408321.27.fna -queryname NZ_KI4408321.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408321.27.fna -queryname NZ_KI4408321.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408111.28.fna -queryname NZ_KI4408111.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408111.28.fna -queryname NZ_KI4408111.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408111.28.fna -queryname NZ_KI4408111.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152051.2.fna -queryname NZ_JH8152051.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152051.2.fna -queryname NZ_JH8152051.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152051.2.fna -queryname NZ_JH8152051.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152051.2.AOI.fna -queryname NZ_JH8152051.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152051.2.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152051.2.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -queryname NZ_JH8152051.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -table NZ_JH8152051.2.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408101.29.fna -queryname NZ_KI4408101.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408101.29.fna -queryname NZ_KI4408101.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408101.29.fna -queryname NZ_KI4408101.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407931.30.fna -queryname NZ_KI4407931.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407931.30.fna -queryname NZ_KI4407931.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407931.30.fna -queryname NZ_KI4407931.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407841.31.fna -queryname NZ_KI4407841.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407841.31.fna -queryname NZ_KI4407841.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407841.31.fna -queryname NZ_KI4407841.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407911.32.fna -queryname NZ_KI4407911.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407911.32.fna -queryname NZ_KI4407911.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407911.32.fna -queryname NZ_KI4407911.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407851.33.fna -queryname NZ_KI4407851.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407851.33.fna -queryname NZ_KI4407851.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407851.33.fna -queryname NZ_KI4407851.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407811.34.fna -queryname NZ_KI4407811.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407811.34.fna -queryname NZ_KI4407811.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407811.34.fna -queryname NZ_KI4407811.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408121.35.fna -queryname NZ_KI4408121.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408121.35.fna -queryname NZ_KI4408121.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408121.35.fna -queryname NZ_KI4408121.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407861.36.fna -queryname NZ_KI4407861.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407861.36.fna -queryname NZ_KI4407861.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407861.36.fna -queryname NZ_KI4407861.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407901.37.fna -queryname NZ_KI4407901.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407901.37.fna -queryname NZ_KI4407901.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407901.37.fna -queryname NZ_KI4407901.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408221.38.fna -queryname NZ_KI4408221.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408221.38.fna -queryname NZ_KI4408221.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408221.38.fna -queryname NZ_KI4408221.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152031.3.fna -queryname NZ_JH8152031.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152031.3.fna -queryname NZ_JH8152031.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152031.3.fna -queryname NZ_JH8152031.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408351.39.fna -queryname NZ_KI4408351.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408351.39.fna -queryname NZ_KI4408351.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408351.39.fna -queryname NZ_KI4408351.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407871.40.fna -queryname NZ_KI4407871.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407871.40.fna -queryname NZ_KI4407871.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407871.40.fna -queryname NZ_KI4407871.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407871.40.AOI.fna -queryname NZ_KI4407871.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407871.40.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407871.40.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -queryname NZ_KI4407871.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -table NZ_KI4407871.40.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_CP0070341.41.fna -queryname NZ_CP0070341.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_CP0070341.41.fna -queryname NZ_CP0070341.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_CP0070341.41.fna -queryname NZ_CP0070341.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_CP0070341.41.AOI.fna -queryname NZ_CP0070341.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_CP0070341.41.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_CP0070341.41.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -queryname NZ_CP0070341.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -table NZ_CP0070341.41.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152071.4.fna -queryname NZ_JH8152071.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152071.4.fna -queryname NZ_JH8152071.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_JH8152071.4.fna -queryname NZ_JH8152071.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407821.5.fna -queryname NZ_KI4407821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407821.5.fna -queryname NZ_KI4407821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407821.5.fna -queryname NZ_KI4407821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407791.6.fna -queryname NZ_KI4407791.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407791.6.fna -queryname NZ_KI4407791.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407791.6.fna -queryname NZ_KI4407791.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407781.7.fna -queryname NZ_KI4407781.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407781.7.fna -queryname NZ_KI4407781.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4407781.7.fna -queryname NZ_KI4407781.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408331.8.fna -queryname NZ_KI4408331.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408331.8.fna -queryname NZ_KI4408331.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result/NZ_KI4408331.8.fna -queryname NZ_KI4408331.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Barnesiellaceae//Barnesiellaceae.result