/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000061.0.fna -queryname NZ_QENZ010000061.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000061.0.fna -queryname NZ_QENZ010000061.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000061.0.fna -queryname NZ_QENZ010000061.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000061.0.AOI.fna -queryname NZ_QENZ010000061.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000061.0.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000061.0.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -queryname NZ_QENZ010000061.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -table NZ_QENZ010000061.0.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000081.1.fna -queryname NZ_QENZ010000081.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000081.1.fna -queryname NZ_QENZ010000081.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000081.1.fna -queryname NZ_QENZ010000081.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000111.2.fna -queryname NZ_QENZ010000111.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000111.2.fna -queryname NZ_QENZ010000111.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000111.2.fna -queryname NZ_QENZ010000111.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000051.3.fna -queryname NZ_QENZ010000051.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000051.3.fna -queryname NZ_QENZ010000051.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000051.3.fna -queryname NZ_QENZ010000051.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000041.4.fna -queryname NZ_QENZ010000041.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000041.4.fna -queryname NZ_QENZ010000041.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000041.4.fna -queryname NZ_QENZ010000041.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000101.5.fna -queryname NZ_QENZ010000101.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000101.5.fna -queryname NZ_QENZ010000101.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000101.5.fna -queryname NZ_QENZ010000101.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000091.6.fna -queryname NZ_QENZ010000091.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000091.6.fna -queryname NZ_QENZ010000091.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000091.6.fna -queryname NZ_QENZ010000091.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000071.7.fna -queryname NZ_QENZ010000071.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000071.7.fna -queryname NZ_QENZ010000071.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000071.7.fna -queryname NZ_QENZ010000071.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000031.8.fna -queryname NZ_QENZ010000031.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000031.8.fna -queryname NZ_QENZ010000031.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result/NZ_QENZ010000031.8.fna -queryname NZ_QENZ010000031.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Balneicellaceae//Balneicellaceae.result