/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151651.0.fna -queryname NC_0151651.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151651.0.fna -queryname NC_0151651.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151651.0.fna -queryname NC_0151651.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151641.1.fna -queryname NC_0151641.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151641.1.fna -queryname NC_0151641.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151641.1.fna -queryname NC_0151641.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151641.1.AOI.fna -queryname NC_0151641.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151641.1.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151641.1.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -queryname NC_0151641.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -table NC_0151641.1.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151661.2.fna -queryname NC_0151661.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151661.2.fna -queryname NC_0151661.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151661.2.fna -queryname NC_0151661.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151681.3.fna -queryname NC_0151681.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151681.3.fna -queryname NC_0151681.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result/NC_0151681.3.fna -queryname NC_0151681.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_salanitronis.result