/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000081.1011.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000081.1011.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000081.1011.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000081.1011.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000081.1011.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000081.1011.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000121.1020.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000121.1020.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000231.1043.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000231.1043.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000231.1043.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000231.1043.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000231.1043.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000231.1043.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000031.1046.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000311.1052.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000311.1052.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000311.1052.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000311.1052.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000311.1052.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000311.1052.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000051.1056.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000051.1056.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000051.1056.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000051.1056.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000051.1056.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000051.1056.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000331.1061.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000331.1061.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000331.1061.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000331.1061.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000331.1061.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000331.1061.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000021.1064.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000021.1064.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000021.1064.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000021.1064.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000021.1064.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000021.1064.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000081.1066.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000081.1066.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000081.1066.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000081.1066.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000081.1066.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000081.1066.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000071.1070.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000071.1070.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000071.1070.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000071.1070.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000071.1070.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTX010000071.1070.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000081.1084.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000081.1084.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000081.1084.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000081.1084.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000081.1084.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000081.1084.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000161.1089.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000161.1089.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000161.1089.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000161.1089.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000161.1089.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000161.1089.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000191.1101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000351.1103.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000351.1103.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000351.1103.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000351.1103.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000351.1103.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000351.1103.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000111.1111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000111.1111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000111.1111.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000111.1111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000111.1111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000111.1111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000111.1111.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000111.1111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000031.1113.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000131.1120.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000131.1120.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000131.1120.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000131.1120.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000131.1120.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRTO010000131.1120.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000351.1137.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000351.1137.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000351.1137.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000351.1137.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000351.1137.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000351.1137.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000231.1138.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000231.1138.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000231.1138.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000231.1138.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000231.1138.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000231.1138.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000321.1163.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000321.1163.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000321.1163.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000321.1163.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000321.1163.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000321.1163.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000121.1165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000121.1165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000121.1165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000121.1165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000121.1165.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000121.1165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000251.1170.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000251.1170.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000251.1170.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000251.1170.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000251.1170.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000251.1170.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000131.1176.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000131.1176.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000131.1176.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000131.1176.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000131.1176.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000131.1176.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000181.1182.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000181.1182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000181.1182.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000181.1182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000181.1182.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000181.1182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000311.1183.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000311.1183.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRUQ010000011.1196.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000061.1213.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000011.1215.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000031.1219.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000031.1219.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000031.1219.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000031.1219.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000031.1219.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000031.1219.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000031.1219.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000031.1219.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000071.1224.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000071.1224.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000071.1224.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000071.1224.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000071.1224.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000071.1224.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000081.1231.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000081.1231.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000081.1231.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000081.1231.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000081.1231.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRVZ010000081.1231.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000561.124.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000561.124.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000561.124.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000561.124.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000561.124.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000561.124.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000331.127.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000331.127.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000331.127.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000331.127.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000331.127.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000331.127.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000221.1282.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000221.1282.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000221.1282.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000221.1282.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000221.1282.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000221.1282.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000391.1287.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000391.1287.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000391.1287.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000391.1287.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000391.1287.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000391.1287.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000041.1288.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000041.1288.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000041.1288.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000041.1288.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000041.1288.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000041.1288.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000311.1290.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000311.1290.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000311.1290.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000311.1290.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000311.1290.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000311.1290.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000101.1298.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000101.1298.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000101.1298.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000101.1298.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000101.1298.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000101.1298.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000011.1302.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000361.1305.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000361.1305.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000361.1305.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000361.1305.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000361.1305.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000361.1305.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000341.1312.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000341.1312.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000341.1312.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000341.1312.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000341.1312.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000341.1312.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000321.1322.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSDC010000321.1322.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000301.1343.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000301.1343.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000301.1343.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000301.1343.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000301.1343.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000301.1343.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000021.1348.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000211.1350.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000211.1350.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000211.1350.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000211.1350.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000211.1350.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000211.1350.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000111.1359.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000111.1359.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000111.1359.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000111.1359.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000111.1359.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000111.1359.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000041.1360.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000131.1370.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000131.1370.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000131.1370.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000131.1370.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000131.1370.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000131.1370.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000131.1370.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRZQ010000131.1370.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000011.1387.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000011.1387.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000011.1387.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000011.1387.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000011.1387.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000011.1387.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000081.1388.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000081.1388.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000081.1388.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000081.1388.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000081.1388.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000081.1388.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000071.1405.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000071.1405.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000071.1405.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000071.1405.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000071.1405.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000071.1405.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000051.1411.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000131.1414.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000131.1414.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000131.1414.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000131.1414.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000131.1414.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000131.1414.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000031.1428.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000031.1428.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000031.1428.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000031.1428.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000031.1428.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000031.1428.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000031.1428.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000031.1428.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000361.1432.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000361.1432.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000361.1432.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000361.1432.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000361.1432.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSBL010000361.1432.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450201.144.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000161.1461.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000161.1461.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000161.1461.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000161.1461.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000161.1461.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000161.1461.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000291.1462.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000291.1462.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000291.1462.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000291.1462.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000291.1462.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000291.1462.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000111.1474.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000111.1474.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000111.1474.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000111.1474.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000111.1474.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000111.1474.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000031.1483.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000041.1486.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450251.148.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000051.1494.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000051.1494.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000051.1494.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000051.1494.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000051.1494.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000051.1494.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000051.1494.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000051.1494.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000151.1497.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000151.1497.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000151.1497.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000151.1497.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000151.1497.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSOU010000151.1497.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645551.14.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645551.14.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645551.14.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645551.14.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645551.14.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645551.14.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000121.1514.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000121.1514.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000121.1514.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000121.1514.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000121.1514.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000121.1514.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450311.151.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450311.151.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450311.151.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450311.151.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450311.151.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450311.151.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000371.1532.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000371.1532.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000371.1532.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000371.1532.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000371.1532.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000371.1532.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000411.1534.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000411.1534.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000411.1534.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000411.1534.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000411.1534.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000411.1534.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000211.1536.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000211.1536.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000211.1536.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000211.1536.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000211.1536.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000211.1536.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000091.1540.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000091.1540.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000091.1540.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000091.1540.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000091.1540.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000091.1540.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000331.1557.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000331.1557.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000041.1562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000351.1564.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000351.1564.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000351.1564.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000351.1564.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000351.1564.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000351.1564.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450241.156.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450261.157.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450261.157.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450261.157.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450261.157.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450261.157.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450261.157.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450261.157.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_GL9450261.157.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000461.1587.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000461.1587.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000461.1587.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000461.1587.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000461.1587.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSGM010000461.1587.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645801.15.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645801.15.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645801.15.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645801.15.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645801.15.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645801.15.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645801.15.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645801.15.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000091.1605.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000091.1605.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000091.1605.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000091.1605.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000091.1605.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000091.1605.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000091.1605.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000091.1605.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000171.1616.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000171.1616.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000171.1616.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000171.1616.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000171.1616.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000171.1616.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242271.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000111.1620.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000111.1620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000111.1620.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000111.1620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000111.1620.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000111.1620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000291.1626.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000291.1626.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000291.1626.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000291.1626.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000291.1626.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000291.1626.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000011.1633.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000011.1633.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000011.1633.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000011.1633.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000011.1633.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000011.1633.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000151.1639.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000151.1639.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000151.1639.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000151.1639.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000151.1639.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000151.1639.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000371.1644.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000371.1644.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000371.1644.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000371.1644.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000371.1644.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000371.1644.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSIX010000221.1653.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242261.165.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000281.1664.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000281.1664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000281.1664.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000281.1664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000281.1664.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000281.1664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000211.1676.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000211.1676.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000211.1676.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000211.1676.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000211.1676.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000211.1676.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000211.1676.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000211.1676.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000301.1677.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000301.1677.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000301.1677.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000301.1677.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000301.1677.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000301.1677.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000161.1679.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000161.1679.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000161.1679.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000161.1679.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000161.1679.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000161.1679.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000351.1689.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000351.1689.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000351.1689.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000351.1689.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000351.1689.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000351.1689.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000151.1693.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000151.1693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000151.1693.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000151.1693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000151.1693.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000151.1693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000361.1694.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000361.1694.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000361.1694.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000361.1694.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000361.1694.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000361.1694.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000071.1708.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000251.1713.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000251.1713.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000251.1713.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000251.1713.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000251.1713.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSJT010000251.1713.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242311.171.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242311.171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000331.1725.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000331.1725.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000331.1725.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000331.1725.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000331.1725.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000331.1725.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242461.172.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242461.172.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242461.172.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242461.172.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242461.172.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242461.172.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000021.1729.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000021.1729.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000021.1729.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000021.1729.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000021.1729.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000021.1729.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000071.1753.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000071.1753.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000071.1753.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000071.1753.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000071.1753.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000071.1753.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000231.1757.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000231.1757.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000391.1764.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000391.1764.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000391.1764.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000391.1764.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000391.1764.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000391.1764.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242451.176.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242451.176.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242451.176.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242451.176.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242451.176.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242451.176.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000251.1770.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000251.1770.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000251.1770.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000251.1770.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000251.1770.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000251.1770.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000081.1771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000131.1784.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000131.1784.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000131.1784.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000131.1784.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000131.1784.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRJR010000131.1784.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242431.178.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242431.178.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242431.178.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242431.178.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242431.178.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242431.178.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242431.178.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242431.178.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000081.1795.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000121.1796.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000121.1796.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000121.1796.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000121.1796.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000121.1796.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000121.1796.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000221.1798.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000221.1798.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000221.1798.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000221.1798.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000221.1798.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000221.1798.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000311.1802.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000311.1802.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000311.1802.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000311.1802.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000311.1802.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000311.1802.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000061.1805.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000061.1805.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000061.1805.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000061.1805.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000061.1805.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000061.1805.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242441.180.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242441.180.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242441.180.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242441.180.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242441.180.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242441.180.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000251.1810.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000251.1810.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000251.1810.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000251.1810.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000251.1810.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000251.1810.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000091.1818.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000091.1818.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000091.1818.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000091.1818.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000091.1818.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000091.1818.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242411.182.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242481.183.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242481.183.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242481.183.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242481.183.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242481.183.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242481.183.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000281.1839.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRKX010000281.1839.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000071.1850.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000071.1850.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000071.1850.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000071.1850.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000071.1850.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000071.1850.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000161.1855.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000161.1855.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000161.1855.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000161.1855.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000161.1855.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000161.1855.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000161.1855.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000161.1855.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000221.1856.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000221.1856.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000221.1856.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000221.1856.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000221.1856.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000221.1856.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000061.1864.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242421.186.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242421.186.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242421.186.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242421.186.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242421.186.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JH7242421.186.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000091.1879.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000051.1899.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000051.1899.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000051.1899.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000051.1899.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000051.1899.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RAZL010000051.1899.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000091.1904.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000091.1904.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000091.1904.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000091.1904.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000091.1904.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000091.1904.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000101.1907.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000101.1907.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000101.1907.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000101.1907.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000101.1907.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000101.1907.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000291.1913.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000291.1913.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000291.1913.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000291.1913.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000291.1913.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000291.1913.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000061.1920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000161.1926.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000161.1926.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000161.1926.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000161.1926.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000161.1926.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000161.1926.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000071.1931.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000071.1931.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000071.1931.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000071.1931.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000071.1931.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000071.1931.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000071.1931.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000071.1931.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000051.1939.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000051.1939.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000051.1939.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000051.1939.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000051.1939.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_RCXR010000051.1939.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000061.1942.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000061.1942.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000061.1942.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000061.1942.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000061.1942.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000061.1942.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000051.1949.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000051.1949.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000051.1949.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000051.1949.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000051.1949.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000051.1949.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000171.1955.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000171.1955.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000171.1955.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000171.1955.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000171.1955.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000171.1955.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000021.1966.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000021.1966.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000021.1966.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000021.1966.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000021.1966.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000021.1966.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000021.1966.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000021.1966.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000111.1969.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHB010000131.1975.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645631.1.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645631.1.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645631.1.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645631.1.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645631.1.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645631.1.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000041.2014.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000041.2014.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000041.2014.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000041.2014.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000041.2014.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000041.2014.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000291.2018.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000291.2018.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000291.2018.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000291.2018.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000291.2018.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000291.2018.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000091.2026.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000241.2027.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000241.2027.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000241.2027.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000241.2027.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000241.2027.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000241.2027.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000201.2028.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000201.2028.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000201.2028.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000201.2028.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000201.2028.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000201.2028.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000021.2031.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000021.2031.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000021.2031.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000021.2031.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000021.2031.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000021.2031.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000061.2036.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000061.2036.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000061.2036.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000061.2036.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000061.2036.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000061.2036.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000061.2036.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGQ010000061.2036.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000021.2049.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000021.2049.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000021.2049.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000021.2049.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000021.2049.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000021.2049.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000021.2049.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000021.2049.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000101.2050.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000091.2068.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000091.2068.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000091.2068.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000091.2068.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000091.2068.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000091.2068.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000261.2074.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000261.2074.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000261.2074.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000261.2074.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000261.2074.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000261.2074.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000011.2082.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000151.2093.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000151.2093.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000151.2093.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000151.2093.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000151.2093.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGZ010000151.2093.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645831.20.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645831.20.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645831.20.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645831.20.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645831.20.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645831.20.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000081.2101.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000081.2101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000081.2101.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000081.2101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000081.2101.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000081.2101.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000401.2102.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000401.2102.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000401.2102.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000401.2102.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000401.2102.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000401.2102.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000371.2111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000371.2111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000371.2111.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000371.2111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000371.2111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000371.2111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000161.2131.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000161.2131.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000161.2131.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000161.2131.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000161.2131.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000161.2131.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000571.2134.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000571.2134.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000571.2134.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000571.2134.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000571.2134.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000571.2134.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000361.2146.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000361.2146.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000361.2146.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000361.2146.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000361.2146.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000361.2146.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000071.2158.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000071.2158.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000171.2171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000031.2183.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000031.2183.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000031.2183.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000031.2183.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000031.2183.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGU010000031.2183.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000091.2189.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000151.2190.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000151.2190.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000151.2190.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000151.2190.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000151.2190.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000151.2190.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000041.2209.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000041.2209.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000041.2209.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000041.2209.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000041.2209.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000041.2209.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000041.2209.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000041.2209.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000121.2218.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000011.2220.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000011.2220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000011.2220.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000011.2220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000011.2220.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000011.2220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000081.2232.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000081.2232.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000081.2232.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000081.2232.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000081.2232.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGR010000081.2232.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000381.2251.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000381.2251.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000381.2251.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000381.2251.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000381.2251.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000381.2251.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000351.2256.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000351.2256.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000351.2256.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000351.2256.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000351.2256.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000351.2256.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000471.2264.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000471.2264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000301.2267.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000301.2267.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000301.2267.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000301.2267.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000301.2267.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000301.2267.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000101.2272.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000271.2291.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000271.2291.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000271.2291.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000271.2291.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000271.2291.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000271.2291.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000431.2294.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000431.2294.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000431.2294.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000431.2294.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000431.2294.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000431.2294.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645531.22.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645531.22.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645531.22.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645531.22.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645531.22.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645531.22.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000971.229.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000971.229.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000971.229.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000971.229.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000971.229.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000971.229.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000071.2300.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000071.2300.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000071.2300.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000071.2300.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000071.2300.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000071.2300.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000111.2303.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000111.2303.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000111.2303.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000111.2303.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000111.2303.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGV010000111.2303.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000081.2311.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000081.2311.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000081.2311.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000081.2311.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000081.2311.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000081.2311.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000071.2325.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000071.2325.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000071.2325.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000071.2325.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000071.2325.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000071.2325.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000041.2330.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000121.2334.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000121.2334.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000121.2334.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000121.2334.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000121.2334.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000121.2334.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000391.2339.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000391.2339.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000391.2339.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000391.2339.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000391.2339.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000391.2339.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000041.235.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000041.235.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000041.235.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000041.235.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000041.235.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000041.235.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000421.2367.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000421.2367.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000421.2367.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000421.2367.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000421.2367.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000421.2367.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000031.2376.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000031.2376.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000031.2376.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000031.2376.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000031.2376.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000031.2376.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000361.2380.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000361.2380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000361.2380.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000361.2380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000361.2380.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000361.2380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000101.2381.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGW010000101.2381.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000071.2404.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000071.2404.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000071.2404.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000071.2404.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000071.2404.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000071.2404.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000071.2404.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000071.2404.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000011.2421.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000011.2421.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000011.2421.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000011.2421.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000011.2421.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000011.2421.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000041.2434.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000041.2434.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000041.2434.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000041.2434.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000041.2434.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000041.2434.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000091.2437.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000421.2438.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000421.2438.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000421.2438.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000421.2438.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000421.2438.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000421.2438.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000141.2442.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000141.2442.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000141.2442.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000141.2442.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000141.2442.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000141.2442.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000021.2451.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000021.2451.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000021.2451.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000021.2451.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000021.2451.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPGX010000021.2451.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000261.2480.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000261.2480.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000261.2480.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000261.2480.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000261.2480.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000261.2480.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000201.2481.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000201.2481.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000201.2481.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000201.2481.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000201.2481.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000201.2481.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000021.2503.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000021.2503.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000021.2503.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000021.2503.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000021.2503.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000021.2503.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000071.2508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000061.2510.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000061.2510.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000061.2510.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000061.2510.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000061.2510.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000061.2510.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000061.2510.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000061.2510.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000041.2512.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000041.2512.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000041.2512.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000041.2512.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000041.2512.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000041.2512.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000331.2513.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000331.2513.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000331.2513.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000331.2513.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000331.2513.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPFU010000331.2513.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000191.2527.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000191.2527.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000191.2527.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000191.2527.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000191.2527.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000191.2527.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000061.2533.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000061.2533.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000061.2533.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000061.2533.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000061.2533.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000061.2533.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000131.2542.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000051.2543.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000051.2543.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000051.2543.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000051.2543.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000051.2543.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000051.2543.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000101.2545.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000101.2545.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000101.2545.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000101.2545.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000101.2545.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000101.2545.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000141.2552.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000141.2552.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_SPHA010000111.2561.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0413951.2578.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CP0463971.2580.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000231.2601.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000231.2601.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000231.2601.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000231.2601.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000231.2601.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000231.2601.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000621.2604.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000621.2604.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000621.2604.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000621.2604.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000621.2604.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000621.2604.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000471.2620.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000471.2620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000471.2620.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000471.2620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000471.2620.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000471.2620.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000051.2629.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000181.2657.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000181.2657.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000181.2657.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000181.2657.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000181.2657.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000181.2657.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000111.2674.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000111.2674.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000111.2674.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000111.2674.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000111.2674.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000111.2674.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000111.2674.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000111.2674.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000671.2679.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000671.2679.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000671.2679.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000671.2679.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000671.2679.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000671.2679.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000771.2693.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000771.2693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000771.2693.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000771.2693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000771.2693.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDD0100000771.2693.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100001551.2707.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100001551.2707.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100001551.2707.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100001551.2707.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100001551.2707.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100001551.2707.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645821.27.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645821.27.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645821.27.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645821.27.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645821.27.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645821.27.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010004401.280.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010004401.280.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000271.2815.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000801.2847.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000801.2847.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000801.2847.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000801.2847.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000801.2847.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000801.2847.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000291.2867.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000291.2867.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000291.2867.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000291.2867.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000291.2867.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000291.2867.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000661.2876.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000661.2876.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000661.2876.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000661.2876.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000661.2876.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000661.2876.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000711.2877.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000711.2877.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000711.2877.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000711.2877.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000711.2877.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000711.2877.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000431.2901.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000431.2901.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000431.2901.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000431.2901.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000431.2901.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000431.2901.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000061.2914.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000061.2914.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000151.2960.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000151.2960.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000151.2960.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000151.2960.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000151.2960.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JABWDH0100000151.2960.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LT6222461.2965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645611.2.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645611.2.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645611.2.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645611.2.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645611.2.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645611.2.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000091.3016.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000091.3016.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000091.3016.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000091.3016.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000091.3016.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000091.3016.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000111.3027.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000111.3027.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000111.3027.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000111.3027.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000111.3027.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000111.3027.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000641.3035.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000641.3035.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000641.3035.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000641.3035.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000641.3035.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000641.3035.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000661.3048.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000661.3048.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000661.3048.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000661.3048.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000661.3048.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000661.3048.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000751.3075.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000751.3075.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000171.3076.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000071.3093.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000071.3093.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000071.3093.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000071.3093.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000071.3093.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000071.3093.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000371.3105.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000371.3105.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000371.3105.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000371.3105.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000371.3105.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNDO010000371.3105.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000331.3119.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000331.3119.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000331.3119.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000331.3119.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000331.3119.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000331.3119.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000201.3134.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000201.3134.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000201.3134.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000201.3134.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000201.3134.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000201.3134.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000011.3159.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000381.3171.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000381.3171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000381.3171.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000381.3171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000381.3171.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000381.3171.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000671.319.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000671.319.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000671.319.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000671.319.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000671.319.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000671.319.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000081.3204.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000081.3204.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000081.3204.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000081.3204.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000081.3204.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000081.3204.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000391.3207.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000391.3207.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000281.3217.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000281.3217.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000281.3217.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000281.3217.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000281.3217.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FMYE010000281.3217.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000041.3226.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000041.3226.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000041.3226.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000041.3226.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000041.3226.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000041.3226.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000071.3228.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000071.3228.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000071.3228.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000071.3228.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000071.3228.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000071.3228.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000101.3242.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000101.3242.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000101.3242.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000101.3242.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000101.3242.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000101.3242.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000081.3244.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000081.3244.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000081.3244.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000081.3244.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000081.3244.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000081.3244.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000141.3258.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000241.3264.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000241.3264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000241.3264.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000241.3264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000241.3264.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000241.3264.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000051.3271.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000051.3271.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000051.3271.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000051.3271.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000051.3271.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000051.3271.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000051.3271.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000051.3271.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000091.3275.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000091.3275.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000091.3275.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000091.3275.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000091.3275.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_FNQD010000091.3275.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_UAQF010000041.3281.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000691.3291.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000691.3291.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000691.3291.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000691.3291.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000691.3291.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000691.3291.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000871.3295.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000871.3295.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000871.3295.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000871.3295.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000871.3295.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000871.3295.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000811.3298.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000811.3298.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000811.3298.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000811.3298.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000811.3298.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000811.3298.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000921.3361.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000921.3361.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000921.3361.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000921.3361.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000921.3361.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000921.3361.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000391.3379.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000391.3379.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000391.3379.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000391.3379.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000391.3379.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000391.3379.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000371.3384.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000371.3384.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000371.3384.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000371.3384.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000371.3384.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000371.3384.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000371.3384.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000371.3384.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000401.3395.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000401.3395.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000401.3395.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000401.3395.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000401.3395.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100000401.3395.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001561.3397.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001561.3397.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001561.3397.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001561.3397.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001561.3397.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001561.3397.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001191.3399.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001191.3399.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001191.3399.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001191.3399.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001191.3399.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CAAKNR0100001191.3399.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010003871.352.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010003871.352.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010003871.352.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010003871.352.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010003871.352.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010003871.352.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000651.392.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000761.394.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000761.394.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000761.394.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000761.394.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000761.394.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000761.394.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000621.395.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000621.395.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000621.395.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000621.395.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000621.395.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000621.395.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000641.414.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000641.414.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000641.414.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000641.414.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000641.414.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHG010000641.414.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000751.45.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000751.45.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000751.45.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000751.45.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000751.45.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000751.45.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001461.496.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001461.496.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001461.496.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001461.496.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001461.496.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001461.496.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000531.49.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000531.49.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000531.49.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000531.49.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000531.49.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000531.49.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001641.505.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001641.505.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001641.505.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001641.505.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001641.505.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001641.505.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001641.505.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001641.505.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001571.508.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001571.508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001571.508.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001571.508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001571.508.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001571.508.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001261.51.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001261.51.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001261.51.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001261.51.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001261.51.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001261.51.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001231.533.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001231.533.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001231.533.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001231.533.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001231.533.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001231.533.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001581.539.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001581.539.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001581.539.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001581.539.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001581.539.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001581.539.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001391.556.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001541.557.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001541.557.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001541.557.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001541.557.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001541.557.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010001541.557.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000991.55.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000991.55.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000991.55.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000991.55.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000991.55.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000991.55.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010000291.562.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010000291.562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010000291.562.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010000291.562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010000291.562.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_JNHF010000291.562.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000131.583.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000131.583.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000131.583.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000131.583.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000131.583.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000131.583.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000091.584.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000091.584.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000031.585.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000031.585.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000031.585.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000031.585.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000031.585.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000031.585.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000121.590.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000121.590.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000121.590.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000121.590.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000121.590.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000121.590.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000191.593.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000191.593.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000191.593.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000191.593.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000191.593.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000191.593.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000151.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000051.59.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000051.59.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000051.59.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000051.59.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000051.59.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000051.59.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000051.59.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010000051.59.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000081.601.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000081.601.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000081.601.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000081.601.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000081.601.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000081.601.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000281.603.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000281.603.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000281.603.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000281.603.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000281.603.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000281.603.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000071.617.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000071.617.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000071.617.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000071.617.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000071.617.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_CZBG010000071.617.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000041.646.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000041.646.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000041.646.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000041.646.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000041.646.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000041.646.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000141.664.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000121.665.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000121.665.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000121.665.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000121.665.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000121.665.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000121.665.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000081.672.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000081.672.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000081.672.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000081.672.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000081.672.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000081.672.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000151.673.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000151.673.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000151.673.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000151.673.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000151.673.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000151.673.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000011.680.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000011.680.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000011.680.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000011.680.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000011.680.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000011.680.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000011.680.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000011.680.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000421.689.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000421.689.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000421.689.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000421.689.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000421.689.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_LRDP010000421.689.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645781.6.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645781.6.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645781.6.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645781.6.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645781.6.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645781.6.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684611.721.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684611.721.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684611.721.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684611.721.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684611.721.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684611.721.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684771.740.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684771.740.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684771.740.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684771.740.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684771.740.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684771.740.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684661.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684561.746.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684561.746.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684561.746.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684561.746.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684561.746.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684561.746.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684081.747.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684081.747.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684081.747.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684081.747.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684081.747.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684081.747.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684081.747.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684081.747.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684721.758.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684721.758.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684721.758.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684721.758.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684721.758.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684721.758.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684671.765.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684671.765.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684671.765.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684671.765.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684671.765.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_KQ9684671.765.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001141.76.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001141.76.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001141.76.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001141.76.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001141.76.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001141.76.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000301.781.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000301.781.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000301.781.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000301.781.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000301.781.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000301.781.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000141.782.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000141.782.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000141.782.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000141.782.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000141.782.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000141.782.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000011.790.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000011.790.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000011.790.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000011.790.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000011.790.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000011.790.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000171.797.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000171.797.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000171.797.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000171.797.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000171.797.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000171.797.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000171.797.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000171.797.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645601.7.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645601.7.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645601.7.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645601.7.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645601.7.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_DS2645601.7.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000311.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000251.805.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000251.805.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000251.805.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000251.805.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000251.805.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000251.805.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000421.813.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000421.813.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000421.813.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000421.813.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000421.813.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000421.813.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001431.82.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001431.82.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001431.82.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001431.82.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001431.82.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_ADMO010001431.82.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000051.832.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000051.832.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000051.832.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000051.832.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000051.832.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_NFKW010000051.832.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000171.840.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000171.840.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000171.840.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000171.840.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000171.840.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000171.840.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000171.840.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000171.840.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000041.860.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000031.863.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000031.863.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000031.863.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000031.863.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000031.863.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000031.863.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000221.867.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000221.867.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000221.867.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000221.867.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000221.867.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000221.867.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000301.883.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000301.883.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000301.883.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000301.883.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000301.883.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000301.883.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000351.896.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000351.896.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000351.896.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000351.896.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000351.896.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000351.896.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRBY010000051.898.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000431.904.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000431.904.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000431.904.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000431.904.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000431.904.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000431.904.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000061.920.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000061.920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000061.920.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000061.920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000061.920.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000061.920.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000011.933.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000011.933.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000011.933.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000011.933.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000011.933.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000011.933.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000081.934.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000081.934.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000081.934.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000081.934.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000081.934.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000081.934.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000341.949.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000341.949.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000341.949.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000341.949.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000341.949.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000341.949.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000321.950.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000321.950.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000321.950.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000321.950.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000321.950.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000321.950.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000261.952.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000261.952.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000091.957.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000091.957.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000091.957.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000091.957.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000091.957.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000091.957.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000201.958.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000201.958.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000201.958.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000201.958.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000201.958.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QSWC010000201.958.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000051.965.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000041.966.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000041.966.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000041.966.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000041.966.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000041.966.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000041.966.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000111.968.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000111.968.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000111.968.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000111.968.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000111.968.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000111.968.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000301.979.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000301.979.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000301.979.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000301.979.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000301.979.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000301.979.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000121.983.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000121.983.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000121.983.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000121.983.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000121.983.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000121.983.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000151.985.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000151.985.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000151.985.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000151.985.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000151.985.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000151.985.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000321.991.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000321.991.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000321.991.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000321.991.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000321.991.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000321.991.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000141.992.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/NZ_QRSY010000141.992.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_ovatus.result/logfile.txt
