/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001011.111.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001791.112.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001791.112.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000401.12.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000401.12.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000401.12.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000401.12.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000401.12.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000401.12.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003471.131.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003471.131.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003471.131.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003471.131.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003471.131.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003471.131.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010002121.140.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010002121.140.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010002121.140.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010002121.140.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010002121.140.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010002121.140.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001261.158.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001261.158.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001261.158.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001261.158.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001261.158.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010001261.158.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003441.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003441.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003441.161.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003441.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003441.161.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003441.161.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003181.220.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003551.225.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003551.225.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003551.225.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003551.225.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003551.225.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010003551.225.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000301.22.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000301.22.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000301.22.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000301.22.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000301.22.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000301.22.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000261.239.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000011.244.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000011.244.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000011.244.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000011.244.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000011.244.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000011.244.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000191.246.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000191.246.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000191.246.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000191.246.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000191.246.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000191.246.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000141.253.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000141.253.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000141.253.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000141.253.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000141.253.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000141.253.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000171.275.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000171.275.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000361.276.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000361.276.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000361.276.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000361.276.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000361.276.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000361.276.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000161.287.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000161.287.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000161.287.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000161.287.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000161.287.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000161.287.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000071.288.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000071.288.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000071.288.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000071.288.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000071.288.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000071.288.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000051.289.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000051.289.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000051.289.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000051.289.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000051.289.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000051.289.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000201.301.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000201.301.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000201.301.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000201.301.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000201.301.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QSVL010000201.301.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000411.307.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000411.307.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000411.307.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000411.307.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000411.307.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000411.307.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000261.315.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000261.315.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000261.315.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000261.315.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000261.315.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000261.315.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000161.323.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000161.323.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000311.32.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000311.32.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000311.32.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000311.32.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000311.32.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000311.32.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000021.339.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000021.339.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000021.339.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000021.339.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000021.339.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000021.339.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000041.346.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000041.346.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000041.346.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000041.346.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000041.346.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000041.346.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000631.347.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000631.347.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000631.347.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000631.347.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000631.347.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000631.347.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000271.34.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000681.368.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000681.368.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000681.368.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000681.368.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000681.368.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000681.368.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000111.36.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000111.36.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000111.36.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000111.36.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000111.36.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000111.36.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000071.380.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000121.382.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000121.382.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000121.382.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000121.382.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000121.382.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QRXP010000121.382.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000291.3.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000291.3.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000291.3.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000291.3.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000291.3.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000291.3.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000011.41.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000011.41.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000011.41.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000011.41.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000011.41.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000011.41.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000531.426.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000531.426.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000531.426.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000531.426.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000531.426.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000531.426.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000581.427.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000581.427.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000581.427.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000581.427.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000581.427.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000581.427.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000461.42.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000461.42.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000461.42.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000461.42.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000461.42.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000461.42.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000461.42.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000461.42.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000231.453.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000231.453.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000231.453.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000231.453.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000231.453.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000231.453.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000101.472.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000101.472.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000171.491.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000011.498.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000011.498.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000011.498.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000011.498.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000011.498.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000011.498.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000341.49.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000341.49.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000341.49.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000341.49.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000341.49.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000341.49.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000351.504.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000351.504.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000351.504.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000351.504.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000351.504.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000351.504.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000411.511.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000411.511.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000411.511.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000411.511.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000411.511.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000411.511.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000041.514.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000041.514.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000041.514.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000041.514.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000041.514.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_SPHU010000041.514.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000021.529.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000021.529.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000021.529.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000021.529.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000021.529.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000021.529.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000161.573.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000161.573.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000161.573.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000161.573.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000161.573.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000161.573.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000111.582.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000241.589.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000241.589.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000391.595.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000391.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000391.595.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000391.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000391.595.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000391.595.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000061.598.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000141.614.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000141.614.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000141.614.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000141.614.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000141.614.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAC010000141.614.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000101.630.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000101.630.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000211.657.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000211.657.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000211.657.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000211.657.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000211.657.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000211.657.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000471.695.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000471.695.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000471.695.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000471.695.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000471.695.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000471.695.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000071.710.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000071.710.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000071.710.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000071.710.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000071.710.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000071.710.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000751.720.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000751.720.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000751.720.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000751.720.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000751.720.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000751.720.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000011.725.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000011.725.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000011.725.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000011.725.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000011.725.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000011.725.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000491.741.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000491.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000491.741.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000491.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000491.741.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000491.741.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010001171.771.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010001171.771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010001171.771.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010001171.771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010001171.771.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010001171.771.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000481.7.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000481.7.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000481.7.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000481.7.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000481.7.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_AGDG010000481.7.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VVZZ010000061.801.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000031.829.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000031.829.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000031.829.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000031.829.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000031.829.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000031.829.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000321.856.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000321.856.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000321.856.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000321.856.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000321.856.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000321.856.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000131.864.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000131.864.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000471.887.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000471.887.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000471.887.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000471.887.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000471.887.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000471.887.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010000201.88.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010000201.88.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010000201.88.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010000201.88.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010000201.88.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_QAJH010000201.88.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000201.892.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000201.892.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000201.892.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000201.892.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000201.892.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000201.892.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000271.893.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000371.903.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000371.903.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000371.903.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000371.903.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000371.903.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000371.903.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000111.910.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000111.910.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000111.910.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000111.910.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000111.910.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/NZ_VWAD010000111.910.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_faecis.result/logfile.txt
