/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000231.124.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000231.124.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000231.124.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000231.124.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000231.124.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000231.124.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000411.18.httB.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/httB.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000411.18.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000101.27.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000101.27.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000101.27.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000101.27.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000101.27.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000101.27.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000981.3.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000981.3.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000981.3.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000981.3.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000981.3.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000981.3.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000651.87.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000651.87.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000651.87.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000651.87.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000651.87.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000651.87.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000171.88.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000171.88.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000171.88.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000171.88.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000171.88.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000171.88.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000331.95.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000331.95.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000331.95.PF14028.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF14028.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000331.95.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
/data/pg-molgen/software/bagel4/tools/hmmsearch/binaries/hmmsearch --noali --cpu 8 --domtblout /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000331.95.PF02624.domtblout --domT 25 /data/pg-molgen/software/bagel4_2022/db_hmm/PF02624.hmm /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/NZ_SRYX010000331.95.tmp_proteins.fna >>/data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_caecimuri.result/logfile.txt
