/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001301.0.fna -queryname NZ_BAIW010001301.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001301.0.fna -queryname NZ_BAIW010001301.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001301.0.fna -queryname NZ_BAIW010001301.0
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000131.9.fna -queryname NZ_BAIW010000131.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000131.9.fna -queryname NZ_BAIW010000131.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000131.9.fna -queryname NZ_BAIW010000131.9
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000601.99.fna -queryname NZ_BAIW010000601.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000601.99.fna -queryname NZ_BAIW010000601.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000601.99.fna -queryname NZ_BAIW010000601.99
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000891.999.fna -queryname NZ_RAZM010000891.999
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000891.999.fna -queryname NZ_RAZM010000891.999
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000891.999.fna -queryname NZ_RAZM010000891.999
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001511.1000.fna -queryname NZ_RAZM010001511.1000
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001511.1000.fna -queryname NZ_RAZM010001511.1000
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001511.1000.fna -queryname NZ_RAZM010001511.1000
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000061.1001.fna -queryname NZ_RAZM010000061.1001
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000061.1001.fna -queryname NZ_RAZM010000061.1001
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000061.1001.fna -queryname NZ_RAZM010000061.1001
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000231.1002.fna -queryname NZ_RAZM010000231.1002
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000231.1002.fna -queryname NZ_RAZM010000231.1002
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000231.1002.fna -queryname NZ_RAZM010000231.1002
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001181.1003.fna -queryname NZ_RAZM010001181.1003
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001181.1003.fna -queryname NZ_RAZM010001181.1003
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001181.1003.fna -queryname NZ_RAZM010001181.1003
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000911.1004.fna -queryname NZ_RAZM010000911.1004
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000911.1004.fna -queryname NZ_RAZM010000911.1004
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000911.1004.fna -queryname NZ_RAZM010000911.1004
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001401.1005.fna -queryname NZ_RAZM010001401.1005
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001401.1005.fna -queryname NZ_RAZM010001401.1005
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001401.1005.fna -queryname NZ_RAZM010001401.1005
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000151.1006.fna -queryname NZ_RAZM010000151.1006
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000151.1006.fna -queryname NZ_RAZM010000151.1006
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000151.1006.fna -queryname NZ_RAZM010000151.1006
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001171.1007.fna -queryname NZ_RAZM010001171.1007
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001171.1007.fna -queryname NZ_RAZM010001171.1007
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001171.1007.fna -queryname NZ_RAZM010001171.1007
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001251.1008.fna -queryname NZ_RAZM010001251.1008
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001251.1008.fna -queryname NZ_RAZM010001251.1008
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001251.1008.fna -queryname NZ_RAZM010001251.1008
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001621.100.fna -queryname NZ_BAIW010001621.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001621.100.fna -queryname NZ_BAIW010001621.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001621.100.fna -queryname NZ_BAIW010001621.100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000341.1009.fna -queryname NZ_RAZM010000341.1009
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000341.1009.fna -queryname NZ_RAZM010000341.1009
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000341.1009.fna -queryname NZ_RAZM010000341.1009
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000281.1010.fna -queryname NZ_RAZM010000281.1010
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000281.1010.fna -queryname NZ_RAZM010000281.1010
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000281.1010.fna -queryname NZ_RAZM010000281.1010
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001071.1011.fna -queryname NZ_RAZM010001071.1011
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001071.1011.fna -queryname NZ_RAZM010001071.1011
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001071.1011.fna -queryname NZ_RAZM010001071.1011
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000241.1012.fna -queryname NZ_RAZM010000241.1012
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000241.1012.fna -queryname NZ_RAZM010000241.1012
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000241.1012.fna -queryname NZ_RAZM010000241.1012
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001441.1013.fna -queryname NZ_RAZM010001441.1013
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001441.1013.fna -queryname NZ_RAZM010001441.1013
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001441.1013.fna -queryname NZ_RAZM010001441.1013
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001081.1014.fna -queryname NZ_RAZM010001081.1014
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001081.1014.fna -queryname NZ_RAZM010001081.1014
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001081.1014.fna -queryname NZ_RAZM010001081.1014
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000561.1015.fna -queryname NZ_RAZM010000561.1015
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000561.1015.fna -queryname NZ_RAZM010000561.1015
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000561.1015.fna -queryname NZ_RAZM010000561.1015
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001051.1016.fna -queryname NZ_RAZM010001051.1016
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001051.1016.fna -queryname NZ_RAZM010001051.1016
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001051.1016.fna -queryname NZ_RAZM010001051.1016
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001211.1017.fna -queryname NZ_RAZM010001211.1017
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001211.1017.fna -queryname NZ_RAZM010001211.1017
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001211.1017.fna -queryname NZ_RAZM010001211.1017
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001091.1018.fna -queryname NZ_RAZM010001091.1018
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001091.1018.fna -queryname NZ_RAZM010001091.1018
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001091.1018.fna -queryname NZ_RAZM010001091.1018
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001001.101.fna -queryname NZ_BAIW010001001.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001001.101.fna -queryname NZ_BAIW010001001.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001001.101.fna -queryname NZ_BAIW010001001.101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001341.1019.fna -queryname NZ_RAZM010001341.1019
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001341.1019.fna -queryname NZ_RAZM010001341.1019
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001341.1019.fna -queryname NZ_RAZM010001341.1019
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000811.1020.fna -queryname NZ_RAZM010000811.1020
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000811.1020.fna -queryname NZ_RAZM010000811.1020
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000811.1020.fna -queryname NZ_RAZM010000811.1020
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001061.1021.fna -queryname NZ_RAZM010001061.1021
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001061.1021.fna -queryname NZ_RAZM010001061.1021
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001061.1021.fna -queryname NZ_RAZM010001061.1021
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000361.1022.fna -queryname NZ_RAZM010000361.1022
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000361.1022.fna -queryname NZ_RAZM010000361.1022
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000361.1022.fna -queryname NZ_RAZM010000361.1022
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001431.1023.fna -queryname NZ_RAZM010001431.1023
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001431.1023.fna -queryname NZ_RAZM010001431.1023
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001431.1023.fna -queryname NZ_RAZM010001431.1023
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000091.1024.fna -queryname NZ_RAZM010000091.1024
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000091.1024.fna -queryname NZ_RAZM010000091.1024
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000091.1024.fna -queryname NZ_RAZM010000091.1024
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000901.1025.fna -queryname NZ_RAZM010000901.1025
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000901.1025.fna -queryname NZ_RAZM010000901.1025
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000901.1025.fna -queryname NZ_RAZM010000901.1025
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000181.1026.fna -queryname NZ_RAZM010000181.1026
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000181.1026.fna -queryname NZ_RAZM010000181.1026
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000181.1026.fna -queryname NZ_RAZM010000181.1026
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001451.1027.fna -queryname NZ_RAZM010001451.1027
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001451.1027.fna -queryname NZ_RAZM010001451.1027
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001451.1027.fna -queryname NZ_RAZM010001451.1027
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000461.1028.fna -queryname NZ_RAZM010000461.1028
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000461.1028.fna -queryname NZ_RAZM010000461.1028
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000461.1028.fna -queryname NZ_RAZM010000461.1028
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000321.102.fna -queryname NZ_BAIW010000321.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000321.102.fna -queryname NZ_BAIW010000321.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000321.102.fna -queryname NZ_BAIW010000321.102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000961.1029.fna -queryname NZ_RAZM010000961.1029
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000961.1029.fna -queryname NZ_RAZM010000961.1029
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000961.1029.fna -queryname NZ_RAZM010000961.1029
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000411.1030.fna -queryname NZ_RAZM010000411.1030
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000411.1030.fna -queryname NZ_RAZM010000411.1030
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000411.1030.fna -queryname NZ_RAZM010000411.1030
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000031.1031.fna -queryname NZ_RAZM010000031.1031
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000031.1031.fna -queryname NZ_RAZM010000031.1031
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000031.1031.fna -queryname NZ_RAZM010000031.1031
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000681.1032.fna -queryname NZ_RAZM010000681.1032
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000681.1032.fna -queryname NZ_RAZM010000681.1032
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000681.1032.fna -queryname NZ_RAZM010000681.1032
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000711.1033.fna -queryname NZ_RAZM010000711.1033
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000711.1033.fna -queryname NZ_RAZM010000711.1033
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000711.1033.fna -queryname NZ_RAZM010000711.1033
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001201.1034.fna -queryname NZ_RAZM010001201.1034
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001201.1034.fna -queryname NZ_RAZM010001201.1034
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001201.1034.fna -queryname NZ_RAZM010001201.1034
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000751.1035.fna -queryname NZ_RAZM010000751.1035
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000751.1035.fna -queryname NZ_RAZM010000751.1035
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000751.1035.fna -queryname NZ_RAZM010000751.1035
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000621.1036.fna -queryname NZ_RAZM010000621.1036
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000621.1036.fna -queryname NZ_RAZM010000621.1036
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000621.1036.fna -queryname NZ_RAZM010000621.1036
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000721.1037.fna -queryname NZ_RAZM010000721.1037
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000721.1037.fna -queryname NZ_RAZM010000721.1037
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000721.1037.fna -queryname NZ_RAZM010000721.1037
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001301.1038.fna -queryname NZ_RAZM010001301.1038
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001301.1038.fna -queryname NZ_RAZM010001301.1038
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001301.1038.fna -queryname NZ_RAZM010001301.1038
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000381.103.fna -queryname NZ_BAIW010000381.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000381.103.fna -queryname NZ_BAIW010000381.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000381.103.fna -queryname NZ_BAIW010000381.103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000821.1039.fna -queryname NZ_RAZM010000821.1039
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000821.1039.fna -queryname NZ_RAZM010000821.1039
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000821.1039.fna -queryname NZ_RAZM010000821.1039
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000531.1040.fna -queryname NZ_RAZM010000531.1040
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000531.1040.fna -queryname NZ_RAZM010000531.1040
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000531.1040.fna -queryname NZ_RAZM010000531.1040
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001381.1041.fna -queryname NZ_RAZM010001381.1041
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001381.1041.fna -queryname NZ_RAZM010001381.1041
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001381.1041.fna -queryname NZ_RAZM010001381.1041
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000521.1042.fna -queryname NZ_RAZM010000521.1042
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000521.1042.fna -queryname NZ_RAZM010000521.1042
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000521.1042.fna -queryname NZ_RAZM010000521.1042
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000671.1043.fna -queryname NZ_RAZM010000671.1043
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000671.1043.fna -queryname NZ_RAZM010000671.1043
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000671.1043.fna -queryname NZ_RAZM010000671.1043
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000501.1044.fna -queryname NZ_RAZM010000501.1044
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000501.1044.fna -queryname NZ_RAZM010000501.1044
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000501.1044.fna -queryname NZ_RAZM010000501.1044
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000211.1045.fna -queryname NZ_RAZM010000211.1045
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000211.1045.fna -queryname NZ_RAZM010000211.1045
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000211.1045.fna -queryname NZ_RAZM010000211.1045
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001471.1046.fna -queryname NZ_RAZM010001471.1046
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001471.1046.fna -queryname NZ_RAZM010001471.1046
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001471.1046.fna -queryname NZ_RAZM010001471.1046
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000491.1047.fna -queryname NZ_RAZM010000491.1047
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000491.1047.fna -queryname NZ_RAZM010000491.1047
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000491.1047.fna -queryname NZ_RAZM010000491.1047
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001311.1048.fna -queryname NZ_RAZM010001311.1048
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001311.1048.fna -queryname NZ_RAZM010001311.1048
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001311.1048.fna -queryname NZ_RAZM010001311.1048
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000841.104.fna -queryname NZ_BAIW010000841.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000841.104.fna -queryname NZ_BAIW010000841.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000841.104.fna -queryname NZ_BAIW010000841.104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001501.1049.fna -queryname NZ_RAZM010001501.1049
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001501.1049.fna -queryname NZ_RAZM010001501.1049
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001501.1049.fna -queryname NZ_RAZM010001501.1049
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001521.1050.fna -queryname NZ_RAZM010001521.1050
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001521.1050.fna -queryname NZ_RAZM010001521.1050
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001521.1050.fna -queryname NZ_RAZM010001521.1050
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000261.1051.fna -queryname NZ_RAZM010000261.1051
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000261.1051.fna -queryname NZ_RAZM010000261.1051
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000261.1051.fna -queryname NZ_RAZM010000261.1051
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000861.1052.fna -queryname NZ_RAZM010000861.1052
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000861.1052.fna -queryname NZ_RAZM010000861.1052
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000861.1052.fna -queryname NZ_RAZM010000861.1052
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000541.1053.fna -queryname NZ_RAZM010000541.1053
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000541.1053.fna -queryname NZ_RAZM010000541.1053
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000541.1053.fna -queryname NZ_RAZM010000541.1053
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001001.1054.fna -queryname NZ_RAZM010001001.1054
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001001.1054.fna -queryname NZ_RAZM010001001.1054
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001001.1054.fna -queryname NZ_RAZM010001001.1054
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000731.1055.fna -queryname NZ_RAZM010000731.1055
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000731.1055.fna -queryname NZ_RAZM010000731.1055
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000731.1055.fna -queryname NZ_RAZM010000731.1055
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000791.1056.fna -queryname NZ_RAZM010000791.1056
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000791.1056.fna -queryname NZ_RAZM010000791.1056
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000791.1056.fna -queryname NZ_RAZM010000791.1056
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000311.1057.fna -queryname NZ_RAZM010000311.1057
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000311.1057.fna -queryname NZ_RAZM010000311.1057
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000311.1057.fna -queryname NZ_RAZM010000311.1057
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000831.1058.fna -queryname NZ_RAZM010000831.1058
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000831.1058.fna -queryname NZ_RAZM010000831.1058
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000831.1058.fna -queryname NZ_RAZM010000831.1058
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000751.105.fna -queryname NZ_BAIW010000751.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000751.105.fna -queryname NZ_BAIW010000751.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000751.105.fna -queryname NZ_BAIW010000751.105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001231.1059.fna -queryname NZ_RAZM010001231.1059
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001231.1059.fna -queryname NZ_RAZM010001231.1059
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001231.1059.fna -queryname NZ_RAZM010001231.1059
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000041.1060.fna -queryname NZ_RAZM010000041.1060
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000041.1060.fna -queryname NZ_RAZM010000041.1060
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000041.1060.fna -queryname NZ_RAZM010000041.1060
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000421.1061.fna -queryname NZ_RAZM010000421.1061
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000421.1061.fna -queryname NZ_RAZM010000421.1061
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000421.1061.fna -queryname NZ_RAZM010000421.1061
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000351.1062.fna -queryname NZ_RAZM010000351.1062
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000351.1062.fna -queryname NZ_RAZM010000351.1062
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000351.1062.fna -queryname NZ_RAZM010000351.1062
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000081.1063.fna -queryname NZ_RAZM010000081.1063
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000081.1063.fna -queryname NZ_RAZM010000081.1063
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000081.1063.fna -queryname NZ_RAZM010000081.1063
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000081.1063.AOI.fna -queryname NZ_RAZM010000081.1063
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000081.1063.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000081.1063.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_RAZM010000081.1063
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_RAZM010000081.1063.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000801.1064.fna -queryname NZ_RAZM010000801.1064
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000801.1064.fna -queryname NZ_RAZM010000801.1064
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000801.1064.fna -queryname NZ_RAZM010000801.1064
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001461.1065.fna -queryname NZ_RAZM010001461.1065
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001461.1065.fna -queryname NZ_RAZM010001461.1065
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001461.1065.fna -queryname NZ_RAZM010001461.1065
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000591.1066.fna -queryname NZ_RAZM010000591.1066
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000591.1066.fna -queryname NZ_RAZM010000591.1066
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000591.1066.fna -queryname NZ_RAZM010000591.1066
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000971.1067.fna -queryname NZ_RAZM010000971.1067
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000971.1067.fna -queryname NZ_RAZM010000971.1067
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000971.1067.fna -queryname NZ_RAZM010000971.1067
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000021.1068.fna -queryname NZ_RAZM010000021.1068
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000021.1068.fna -queryname NZ_RAZM010000021.1068
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000021.1068.fna -queryname NZ_RAZM010000021.1068
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001011.106.fna -queryname NZ_BAIW010001011.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001011.106.fna -queryname NZ_BAIW010001011.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001011.106.fna -queryname NZ_BAIW010001011.106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000111.1069.fna -queryname NZ_RAZM010000111.1069
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000111.1069.fna -queryname NZ_RAZM010000111.1069
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000111.1069.fna -queryname NZ_RAZM010000111.1069
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001261.1070.fna -queryname NZ_RAZM010001261.1070
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001261.1070.fna -queryname NZ_RAZM010001261.1070
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001261.1070.fna -queryname NZ_RAZM010001261.1070
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001141.1071.fna -queryname NZ_RAZM010001141.1071
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001141.1071.fna -queryname NZ_RAZM010001141.1071
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001141.1071.fna -queryname NZ_RAZM010001141.1071
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000781.1072.fna -queryname NZ_RAZM010000781.1072
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000781.1072.fna -queryname NZ_RAZM010000781.1072
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000781.1072.fna -queryname NZ_RAZM010000781.1072
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000881.1073.fna -queryname NZ_RAZM010000881.1073
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000881.1073.fna -queryname NZ_RAZM010000881.1073
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000881.1073.fna -queryname NZ_RAZM010000881.1073
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000481.1074.fna -queryname NZ_RAZM010000481.1074
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000481.1074.fna -queryname NZ_RAZM010000481.1074
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000481.1074.fna -queryname NZ_RAZM010000481.1074
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000221.1075.fna -queryname NZ_RAZM010000221.1075
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000221.1075.fna -queryname NZ_RAZM010000221.1075
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000221.1075.fna -queryname NZ_RAZM010000221.1075
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000161.1076.fna -queryname NZ_RAZM010000161.1076
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000161.1076.fna -queryname NZ_RAZM010000161.1076
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000161.1076.fna -queryname NZ_RAZM010000161.1076
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000771.1077.fna -queryname NZ_RAZM010000771.1077
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000771.1077.fna -queryname NZ_RAZM010000771.1077
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000771.1077.fna -queryname NZ_RAZM010000771.1077
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001151.1078.fna -queryname NZ_RAZM010001151.1078
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001151.1078.fna -queryname NZ_RAZM010001151.1078
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001151.1078.fna -queryname NZ_RAZM010001151.1078
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001371.107.fna -queryname NZ_BAIW010001371.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001371.107.fna -queryname NZ_BAIW010001371.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001371.107.fna -queryname NZ_BAIW010001371.107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000451.1079.fna -queryname NZ_RAZM010000451.1079
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000451.1079.fna -queryname NZ_RAZM010000451.1079
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000451.1079.fna -queryname NZ_RAZM010000451.1079
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000381.1080.fna -queryname NZ_RAZM010000381.1080
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000381.1080.fna -queryname NZ_RAZM010000381.1080
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000381.1080.fna -queryname NZ_RAZM010000381.1080
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001371.1081.fna -queryname NZ_RAZM010001371.1081
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001371.1081.fna -queryname NZ_RAZM010001371.1081
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001371.1081.fna -queryname NZ_RAZM010001371.1081
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000871.1082.fna -queryname NZ_RAZM010000871.1082
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000871.1082.fna -queryname NZ_RAZM010000871.1082
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000871.1082.fna -queryname NZ_RAZM010000871.1082
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000401.1083.fna -queryname NZ_RAZM010000401.1083
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000401.1083.fna -queryname NZ_RAZM010000401.1083
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000401.1083.fna -queryname NZ_RAZM010000401.1083
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000991.1084.fna -queryname NZ_RAZM010000991.1084
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000991.1084.fna -queryname NZ_RAZM010000991.1084
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000991.1084.fna -queryname NZ_RAZM010000991.1084
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001101.1085.fna -queryname NZ_RAZM010001101.1085
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001101.1085.fna -queryname NZ_RAZM010001101.1085
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001101.1085.fna -queryname NZ_RAZM010001101.1085
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000851.1086.fna -queryname NZ_RAZM010000851.1086
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000851.1086.fna -queryname NZ_RAZM010000851.1086
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000851.1086.fna -queryname NZ_RAZM010000851.1086
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001391.1087.fna -queryname NZ_RAZM010001391.1087
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001391.1087.fna -queryname NZ_RAZM010001391.1087
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001391.1087.fna -queryname NZ_RAZM010001391.1087
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000471.1088.fna -queryname NZ_RAZM010000471.1088
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000471.1088.fna -queryname NZ_RAZM010000471.1088
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000471.1088.fna -queryname NZ_RAZM010000471.1088
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001161.108.fna -queryname NZ_BAIW010001161.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001161.108.fna -queryname NZ_BAIW010001161.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001161.108.fna -queryname NZ_BAIW010001161.108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000951.1089.fna -queryname NZ_RAZM010000951.1089
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000951.1089.fna -queryname NZ_RAZM010000951.1089
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000951.1089.fna -queryname NZ_RAZM010000951.1089
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001161.1090.fna -queryname NZ_RAZM010001161.1090
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001161.1090.fna -queryname NZ_RAZM010001161.1090
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001161.1090.fna -queryname NZ_RAZM010001161.1090
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000101.1091.fna -queryname NZ_RAZM010000101.1091
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000101.1091.fna -queryname NZ_RAZM010000101.1091
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000101.1091.fna -queryname NZ_RAZM010000101.1091
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000271.1092.fna -queryname NZ_RAZM010000271.1092
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000271.1092.fna -queryname NZ_RAZM010000271.1092
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000271.1092.fna -queryname NZ_RAZM010000271.1092
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000301.1093.fna -queryname NZ_RAZM010000301.1093
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000301.1093.fna -queryname NZ_RAZM010000301.1093
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000301.1093.fna -queryname NZ_RAZM010000301.1093
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000931.1094.fna -queryname NZ_RAZM010000931.1094
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000931.1094.fna -queryname NZ_RAZM010000931.1094
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000931.1094.fna -queryname NZ_RAZM010000931.1094
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001131.1095.fna -queryname NZ_RAZM010001131.1095
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001131.1095.fna -queryname NZ_RAZM010001131.1095
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001131.1095.fna -queryname NZ_RAZM010001131.1095
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000131.1096.fna -queryname NZ_RAZM010000131.1096
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000131.1096.fna -queryname NZ_RAZM010000131.1096
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000131.1096.fna -queryname NZ_RAZM010000131.1096
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001321.1097.fna -queryname NZ_RAZM010001321.1097
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001321.1097.fna -queryname NZ_RAZM010001321.1097
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001321.1097.fna -queryname NZ_RAZM010001321.1097
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000571.1098.fna -queryname NZ_RAZM010000571.1098
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000571.1098.fna -queryname NZ_RAZM010000571.1098
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000571.1098.fna -queryname NZ_RAZM010000571.1098
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001541.10.fna -queryname NZ_BAIW010001541.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001541.10.fna -queryname NZ_BAIW010001541.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001541.10.fna -queryname NZ_BAIW010001541.10
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000291.109.fna -queryname NZ_BAIW010000291.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000291.109.fna -queryname NZ_BAIW010000291.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000291.109.fna -queryname NZ_BAIW010000291.109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000011.1099.fna -queryname NZ_RAZM010000011.1099
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000011.1099.fna -queryname NZ_RAZM010000011.1099
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000011.1099.fna -queryname NZ_RAZM010000011.1099
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001111.1100.fna -queryname NZ_RAZM010001111.1100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001111.1100.fna -queryname NZ_RAZM010001111.1100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001111.1100.fna -queryname NZ_RAZM010001111.1100
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000581.1101.fna -queryname NZ_RAZM010000581.1101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000581.1101.fna -queryname NZ_RAZM010000581.1101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000581.1101.fna -queryname NZ_RAZM010000581.1101
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000171.1102.fna -queryname NZ_RAZM010000171.1102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000171.1102.fna -queryname NZ_RAZM010000171.1102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000171.1102.fna -queryname NZ_RAZM010000171.1102
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000691.1103.fna -queryname NZ_RAZM010000691.1103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000691.1103.fna -queryname NZ_RAZM010000691.1103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000691.1103.fna -queryname NZ_RAZM010000691.1103
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000191.1104.fna -queryname NZ_RAZM010000191.1104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000191.1104.fna -queryname NZ_RAZM010000191.1104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000191.1104.fna -queryname NZ_RAZM010000191.1104
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001281.1105.fna -queryname NZ_RAZM010001281.1105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001281.1105.fna -queryname NZ_RAZM010001281.1105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001281.1105.fna -queryname NZ_RAZM010001281.1105
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001361.1106.fna -queryname NZ_RAZM010001361.1106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001361.1106.fna -queryname NZ_RAZM010001361.1106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001361.1106.fna -queryname NZ_RAZM010001361.1106
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000511.1107.fna -queryname NZ_RAZM010000511.1107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000511.1107.fna -queryname NZ_RAZM010000511.1107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000511.1107.fna -queryname NZ_RAZM010000511.1107
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000201.1108.fna -queryname NZ_RAZM010000201.1108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000201.1108.fna -queryname NZ_RAZM010000201.1108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000201.1108.fna -queryname NZ_RAZM010000201.1108
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000031.110.fna -queryname NZ_BAIW010000031.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000031.110.fna -queryname NZ_BAIW010000031.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000031.110.fna -queryname NZ_BAIW010000031.110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000431.1109.fna -queryname NZ_RAZM010000431.1109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000431.1109.fna -queryname NZ_RAZM010000431.1109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000431.1109.fna -queryname NZ_RAZM010000431.1109
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000651.1110.fna -queryname NZ_RAZM010000651.1110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000651.1110.fna -queryname NZ_RAZM010000651.1110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000651.1110.fna -queryname NZ_RAZM010000651.1110
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000941.1111.fna -queryname NZ_RAZM010000941.1111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000941.1111.fna -queryname NZ_RAZM010000941.1111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000941.1111.fna -queryname NZ_RAZM010000941.1111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001491.1112.fna -queryname NZ_RAZM010001491.1112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001491.1112.fna -queryname NZ_RAZM010001491.1112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001491.1112.fna -queryname NZ_RAZM010001491.1112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001011.1113.fna -queryname NZ_RAZM010001011.1113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001011.1113.fna -queryname NZ_RAZM010001011.1113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001011.1113.fna -queryname NZ_RAZM010001011.1113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000251.1114.fna -queryname NZ_RAZM010000251.1114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000251.1114.fna -queryname NZ_RAZM010000251.1114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000251.1114.fna -queryname NZ_RAZM010000251.1114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001041.1115.fna -queryname NZ_RAZM010001041.1115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001041.1115.fna -queryname NZ_RAZM010001041.1115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001041.1115.fna -queryname NZ_RAZM010001041.1115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001241.1116.fna -queryname NZ_RAZM010001241.1116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001241.1116.fna -queryname NZ_RAZM010001241.1116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001241.1116.fna -queryname NZ_RAZM010001241.1116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000391.1117.fna -queryname NZ_RAZM010000391.1117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000391.1117.fna -queryname NZ_RAZM010000391.1117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000391.1117.fna -queryname NZ_RAZM010000391.1117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000921.1118.fna -queryname NZ_RAZM010000921.1118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000921.1118.fna -queryname NZ_RAZM010000921.1118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000921.1118.fna -queryname NZ_RAZM010000921.1118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000421.111.fna -queryname NZ_BAIW010000421.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000421.111.fna -queryname NZ_BAIW010000421.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000421.111.fna -queryname NZ_BAIW010000421.111
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000701.1119.fna -queryname NZ_RAZM010000701.1119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000701.1119.fna -queryname NZ_RAZM010000701.1119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000701.1119.fna -queryname NZ_RAZM010000701.1119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000741.1120.fna -queryname NZ_RAZM010000741.1120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000741.1120.fna -queryname NZ_RAZM010000741.1120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000741.1120.fna -queryname NZ_RAZM010000741.1120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001481.1121.fna -queryname NZ_RAZM010001481.1121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001481.1121.fna -queryname NZ_RAZM010001481.1121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001481.1121.fna -queryname NZ_RAZM010001481.1121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000661.1122.fna -queryname NZ_RAZM010000661.1122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000661.1122.fna -queryname NZ_RAZM010000661.1122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000661.1122.fna -queryname NZ_RAZM010000661.1122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001331.1123.fna -queryname NZ_RAZM010001331.1123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001331.1123.fna -queryname NZ_RAZM010001331.1123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001331.1123.fna -queryname NZ_RAZM010001331.1123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000371.1124.fna -queryname NZ_RAZM010000371.1124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000371.1124.fna -queryname NZ_RAZM010000371.1124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000371.1124.fna -queryname NZ_RAZM010000371.1124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000291.1125.fna -queryname NZ_RAZM010000291.1125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000291.1125.fna -queryname NZ_RAZM010000291.1125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000291.1125.fna -queryname NZ_RAZM010000291.1125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000441.1126.fna -queryname NZ_RAZM010000441.1126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000441.1126.fna -queryname NZ_RAZM010000441.1126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000441.1126.fna -queryname NZ_RAZM010000441.1126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001061.1127.fna -queryname NZ_SPPV010001061.1127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001061.1127.fna -queryname NZ_SPPV010001061.1127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001061.1127.fna -queryname NZ_SPPV010001061.1127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001161.1128.fna -queryname NZ_SPPV010001161.1128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001161.1128.fna -queryname NZ_SPPV010001161.1128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001161.1128.fna -queryname NZ_SPPV010001161.1128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000731.112.fna -queryname NZ_BAIW010000731.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000731.112.fna -queryname NZ_BAIW010000731.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000731.112.fna -queryname NZ_BAIW010000731.112
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001001.1129.fna -queryname NZ_SPPV010001001.1129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001001.1129.fna -queryname NZ_SPPV010001001.1129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001001.1129.fna -queryname NZ_SPPV010001001.1129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000621.1130.fna -queryname NZ_SPPV010000621.1130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000621.1130.fna -queryname NZ_SPPV010000621.1130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000621.1130.fna -queryname NZ_SPPV010000621.1130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000651.1131.fna -queryname NZ_SPPV010000651.1131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000651.1131.fna -queryname NZ_SPPV010000651.1131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000651.1131.fna -queryname NZ_SPPV010000651.1131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000741.1132.fna -queryname NZ_SPPV010000741.1132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000741.1132.fna -queryname NZ_SPPV010000741.1132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000741.1132.fna -queryname NZ_SPPV010000741.1132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000601.1133.fna -queryname NZ_SPPV010000601.1133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000601.1133.fna -queryname NZ_SPPV010000601.1133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000601.1133.fna -queryname NZ_SPPV010000601.1133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000021.1134.fna -queryname NZ_SPPV010000021.1134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000021.1134.fna -queryname NZ_SPPV010000021.1134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000021.1134.fna -queryname NZ_SPPV010000021.1134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000391.1135.fna -queryname NZ_SPPV010000391.1135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000391.1135.fna -queryname NZ_SPPV010000391.1135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000391.1135.fna -queryname NZ_SPPV010000391.1135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000381.1136.fna -queryname NZ_SPPV010000381.1136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000381.1136.fna -queryname NZ_SPPV010000381.1136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000381.1136.fna -queryname NZ_SPPV010000381.1136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000201.1137.fna -queryname NZ_SPPV010000201.1137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000201.1137.fna -queryname NZ_SPPV010000201.1137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000201.1137.fna -queryname NZ_SPPV010000201.1137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000411.1138.fna -queryname NZ_SPPV010000411.1138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000411.1138.fna -queryname NZ_SPPV010000411.1138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000411.1138.fna -queryname NZ_SPPV010000411.1138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001431.113.fna -queryname NZ_BAIW010001431.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001431.113.fna -queryname NZ_BAIW010001431.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001431.113.fna -queryname NZ_BAIW010001431.113
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000671.1139.fna -queryname NZ_SPPV010000671.1139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000671.1139.fna -queryname NZ_SPPV010000671.1139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000671.1139.fna -queryname NZ_SPPV010000671.1139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000121.1140.fna -queryname NZ_SPPV010000121.1140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000121.1140.fna -queryname NZ_SPPV010000121.1140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000121.1140.fna -queryname NZ_SPPV010000121.1140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000371.1141.fna -queryname NZ_SPPV010000371.1141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000371.1141.fna -queryname NZ_SPPV010000371.1141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000371.1141.fna -queryname NZ_SPPV010000371.1141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000451.1142.fna -queryname NZ_SPPV010000451.1142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000451.1142.fna -queryname NZ_SPPV010000451.1142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000451.1142.fna -queryname NZ_SPPV010000451.1142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000471.1143.fna -queryname NZ_SPPV010000471.1143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000471.1143.fna -queryname NZ_SPPV010000471.1143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000471.1143.fna -queryname NZ_SPPV010000471.1143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001091.1144.fna -queryname NZ_SPPV010001091.1144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001091.1144.fna -queryname NZ_SPPV010001091.1144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001091.1144.fna -queryname NZ_SPPV010001091.1144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000071.1145.fna -queryname NZ_SPPV010000071.1145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000071.1145.fna -queryname NZ_SPPV010000071.1145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000071.1145.fna -queryname NZ_SPPV010000071.1145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000151.1146.fna -queryname NZ_SPPV010000151.1146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000151.1146.fna -queryname NZ_SPPV010000151.1146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000151.1146.fna -queryname NZ_SPPV010000151.1146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000241.1147.fna -queryname NZ_SPPV010000241.1147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000241.1147.fna -queryname NZ_SPPV010000241.1147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000241.1147.fna -queryname NZ_SPPV010000241.1147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000161.1148.fna -queryname NZ_SPPV010000161.1148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000161.1148.fna -queryname NZ_SPPV010000161.1148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000161.1148.fna -queryname NZ_SPPV010000161.1148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001321.114.fna -queryname NZ_BAIW010001321.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001321.114.fna -queryname NZ_BAIW010001321.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001321.114.fna -queryname NZ_BAIW010001321.114
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000081.1149.fna -queryname NZ_SPPV010000081.1149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000081.1149.fna -queryname NZ_SPPV010000081.1149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000081.1149.fna -queryname NZ_SPPV010000081.1149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000081.1149.AOI.fna -queryname NZ_SPPV010000081.1149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000081.1149.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000081.1149.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_SPPV010000081.1149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_SPPV010000081.1149.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000811.1150.fna -queryname NZ_SPPV010000811.1150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000811.1150.fna -queryname NZ_SPPV010000811.1150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000811.1150.fna -queryname NZ_SPPV010000811.1150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001181.1151.fna -queryname NZ_SPPV010001181.1151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001181.1151.fna -queryname NZ_SPPV010001181.1151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001181.1151.fna -queryname NZ_SPPV010001181.1151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000591.1152.fna -queryname NZ_SPPV010000591.1152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000591.1152.fna -queryname NZ_SPPV010000591.1152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000591.1152.fna -queryname NZ_SPPV010000591.1152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000171.1153.fna -queryname NZ_SPPV010000171.1153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000171.1153.fna -queryname NZ_SPPV010000171.1153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000171.1153.fna -queryname NZ_SPPV010000171.1153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000141.1154.fna -queryname NZ_SPPV010000141.1154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000141.1154.fna -queryname NZ_SPPV010000141.1154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000141.1154.fna -queryname NZ_SPPV010000141.1154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001201.1155.fna -queryname NZ_SPPV010001201.1155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001201.1155.fna -queryname NZ_SPPV010001201.1155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001201.1155.fna -queryname NZ_SPPV010001201.1155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000631.1156.fna -queryname NZ_SPPV010000631.1156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000631.1156.fna -queryname NZ_SPPV010000631.1156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000631.1156.fna -queryname NZ_SPPV010000631.1156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000941.1157.fna -queryname NZ_SPPV010000941.1157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000941.1157.fna -queryname NZ_SPPV010000941.1157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000941.1157.fna -queryname NZ_SPPV010000941.1157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000091.1158.fna -queryname NZ_SPPV010000091.1158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000091.1158.fna -queryname NZ_SPPV010000091.1158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000091.1158.fna -queryname NZ_SPPV010000091.1158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001081.115.fna -queryname NZ_BAIW010001081.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001081.115.fna -queryname NZ_BAIW010001081.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001081.115.fna -queryname NZ_BAIW010001081.115
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000061.1159.fna -queryname NZ_SPPV010000061.1159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000061.1159.fna -queryname NZ_SPPV010000061.1159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000061.1159.fna -queryname NZ_SPPV010000061.1159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000111.1160.fna -queryname NZ_SPPV010000111.1160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000111.1160.fna -queryname NZ_SPPV010000111.1160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000111.1160.fna -queryname NZ_SPPV010000111.1160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000331.1161.fna -queryname NZ_SPPV010000331.1161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000331.1161.fna -queryname NZ_SPPV010000331.1161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000331.1161.fna -queryname NZ_SPPV010000331.1161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001111.1162.fna -queryname NZ_SPPV010001111.1162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001111.1162.fna -queryname NZ_SPPV010001111.1162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001111.1162.fna -queryname NZ_SPPV010001111.1162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000761.1163.fna -queryname NZ_SPPV010000761.1163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000761.1163.fna -queryname NZ_SPPV010000761.1163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000761.1163.fna -queryname NZ_SPPV010000761.1163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001031.1164.fna -queryname NZ_SPPV010001031.1164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001031.1164.fna -queryname NZ_SPPV010001031.1164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001031.1164.fna -queryname NZ_SPPV010001031.1164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000041.1165.fna -queryname NZ_SPPV010000041.1165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000041.1165.fna -queryname NZ_SPPV010000041.1165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000041.1165.fna -queryname NZ_SPPV010000041.1165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000571.1166.fna -queryname NZ_SPPV010000571.1166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000571.1166.fna -queryname NZ_SPPV010000571.1166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000571.1166.fna -queryname NZ_SPPV010000571.1166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000981.1167.fna -queryname NZ_SPPV010000981.1167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000981.1167.fna -queryname NZ_SPPV010000981.1167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000981.1167.fna -queryname NZ_SPPV010000981.1167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000541.1168.fna -queryname NZ_SPPV010000541.1168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000541.1168.fna -queryname NZ_SPPV010000541.1168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000541.1168.fna -queryname NZ_SPPV010000541.1168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001261.116.fna -queryname NZ_BAIW010001261.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001261.116.fna -queryname NZ_BAIW010001261.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001261.116.fna -queryname NZ_BAIW010001261.116
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000441.1169.fna -queryname NZ_SPPV010000441.1169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000441.1169.fna -queryname NZ_SPPV010000441.1169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000441.1169.fna -queryname NZ_SPPV010000441.1169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001021.1170.fna -queryname NZ_SPPV010001021.1170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001021.1170.fna -queryname NZ_SPPV010001021.1170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001021.1170.fna -queryname NZ_SPPV010001021.1170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000461.1171.fna -queryname NZ_SPPV010000461.1171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000461.1171.fna -queryname NZ_SPPV010000461.1171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000461.1171.fna -queryname NZ_SPPV010000461.1171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000511.1172.fna -queryname NZ_SPPV010000511.1172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000511.1172.fna -queryname NZ_SPPV010000511.1172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000511.1172.fna -queryname NZ_SPPV010000511.1172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000231.1173.fna -queryname NZ_SPPV010000231.1173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000231.1173.fna -queryname NZ_SPPV010000231.1173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000231.1173.fna -queryname NZ_SPPV010000231.1173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000551.1174.fna -queryname NZ_SPPV010000551.1174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000551.1174.fna -queryname NZ_SPPV010000551.1174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000551.1174.fna -queryname NZ_SPPV010000551.1174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000611.1175.fna -queryname NZ_SPPV010000611.1175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000611.1175.fna -queryname NZ_SPPV010000611.1175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000611.1175.fna -queryname NZ_SPPV010000611.1175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000301.1176.fna -queryname NZ_SPPV010000301.1176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000301.1176.fna -queryname NZ_SPPV010000301.1176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000301.1176.fna -queryname NZ_SPPV010000301.1176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000291.1177.fna -queryname NZ_SPPV010000291.1177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000291.1177.fna -queryname NZ_SPPV010000291.1177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000291.1177.fna -queryname NZ_SPPV010000291.1177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000841.1178.fna -queryname NZ_SPPV010000841.1178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000841.1178.fna -queryname NZ_SPPV010000841.1178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000841.1178.fna -queryname NZ_SPPV010000841.1178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001531.117.fna -queryname NZ_BAIW010001531.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001531.117.fna -queryname NZ_BAIW010001531.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001531.117.fna -queryname NZ_BAIW010001531.117
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000881.1179.fna -queryname NZ_SPPV010000881.1179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000881.1179.fna -queryname NZ_SPPV010000881.1179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000881.1179.fna -queryname NZ_SPPV010000881.1179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000641.1180.fna -queryname NZ_SPPV010000641.1180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000641.1180.fna -queryname NZ_SPPV010000641.1180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000641.1180.fna -queryname NZ_SPPV010000641.1180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000281.1181.fna -queryname NZ_SPPV010000281.1181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000281.1181.fna -queryname NZ_SPPV010000281.1181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000281.1181.fna -queryname NZ_SPPV010000281.1181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000131.1182.fna -queryname NZ_SPPV010000131.1182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000131.1182.fna -queryname NZ_SPPV010000131.1182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000131.1182.fna -queryname NZ_SPPV010000131.1182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001191.1183.fna -queryname NZ_SPPV010001191.1183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001191.1183.fna -queryname NZ_SPPV010001191.1183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001191.1183.fna -queryname NZ_SPPV010001191.1183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000531.1184.fna -queryname NZ_SPPV010000531.1184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000531.1184.fna -queryname NZ_SPPV010000531.1184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000531.1184.fna -queryname NZ_SPPV010000531.1184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001011.1185.fna -queryname NZ_SPPV010001011.1185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001011.1185.fna -queryname NZ_SPPV010001011.1185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001011.1185.fna -queryname NZ_SPPV010001011.1185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000901.1186.fna -queryname NZ_SPPV010000901.1186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000901.1186.fna -queryname NZ_SPPV010000901.1186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000901.1186.fna -queryname NZ_SPPV010000901.1186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000561.1187.fna -queryname NZ_SPPV010000561.1187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000561.1187.fna -queryname NZ_SPPV010000561.1187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000561.1187.fna -queryname NZ_SPPV010000561.1187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001141.1188.fna -queryname NZ_SPPV010001141.1188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001141.1188.fna -queryname NZ_SPPV010001141.1188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001141.1188.fna -queryname NZ_SPPV010001141.1188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001171.118.fna -queryname NZ_BAIW010001171.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001171.118.fna -queryname NZ_BAIW010001171.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001171.118.fna -queryname NZ_BAIW010001171.118
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000801.1189.fna -queryname NZ_SPPV010000801.1189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000801.1189.fna -queryname NZ_SPPV010000801.1189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000801.1189.fna -queryname NZ_SPPV010000801.1189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001081.1190.fna -queryname NZ_SPPV010001081.1190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001081.1190.fna -queryname NZ_SPPV010001081.1190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001081.1190.fna -queryname NZ_SPPV010001081.1190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000271.1191.fna -queryname NZ_SPPV010000271.1191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000271.1191.fna -queryname NZ_SPPV010000271.1191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000271.1191.fna -queryname NZ_SPPV010000271.1191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001071.1192.fna -queryname NZ_SPPV010001071.1192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001071.1192.fna -queryname NZ_SPPV010001071.1192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001071.1192.fna -queryname NZ_SPPV010001071.1192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001051.1193.fna -queryname NZ_SPPV010001051.1193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001051.1193.fna -queryname NZ_SPPV010001051.1193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001051.1193.fna -queryname NZ_SPPV010001051.1193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000721.1194.fna -queryname NZ_SPPV010000721.1194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000721.1194.fna -queryname NZ_SPPV010000721.1194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000721.1194.fna -queryname NZ_SPPV010000721.1194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000361.1195.fna -queryname NZ_SPPV010000361.1195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000361.1195.fna -queryname NZ_SPPV010000361.1195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000361.1195.fna -queryname NZ_SPPV010000361.1195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000711.1196.fna -queryname NZ_SPPV010000711.1196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000711.1196.fna -queryname NZ_SPPV010000711.1196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000711.1196.fna -queryname NZ_SPPV010000711.1196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000971.1197.fna -queryname NZ_SPPV010000971.1197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000971.1197.fna -queryname NZ_SPPV010000971.1197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000971.1197.fna -queryname NZ_SPPV010000971.1197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000791.1198.fna -queryname NZ_SPPV010000791.1198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000791.1198.fna -queryname NZ_SPPV010000791.1198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000791.1198.fna -queryname NZ_SPPV010000791.1198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000991.11.fna -queryname NZ_BAIW010000991.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000991.11.fna -queryname NZ_BAIW010000991.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000991.11.fna -queryname NZ_BAIW010000991.11
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000741.119.fna -queryname NZ_BAIW010000741.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000741.119.fna -queryname NZ_BAIW010000741.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000741.119.fna -queryname NZ_BAIW010000741.119
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000221.1199.fna -queryname NZ_SPPV010000221.1199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000221.1199.fna -queryname NZ_SPPV010000221.1199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000221.1199.fna -queryname NZ_SPPV010000221.1199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000861.1200.fna -queryname NZ_SPPV010000861.1200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000861.1200.fna -queryname NZ_SPPV010000861.1200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000861.1200.fna -queryname NZ_SPPV010000861.1200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000431.1201.fna -queryname NZ_SPPV010000431.1201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000431.1201.fna -queryname NZ_SPPV010000431.1201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000431.1201.fna -queryname NZ_SPPV010000431.1201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000501.1202.fna -queryname NZ_SPPV010000501.1202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000501.1202.fna -queryname NZ_SPPV010000501.1202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000501.1202.fna -queryname NZ_SPPV010000501.1202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000211.1203.fna -queryname NZ_SPPV010000211.1203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000211.1203.fna -queryname NZ_SPPV010000211.1203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000211.1203.fna -queryname NZ_SPPV010000211.1203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000581.1204.fna -queryname NZ_SPPV010000581.1204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000581.1204.fna -queryname NZ_SPPV010000581.1204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000581.1204.fna -queryname NZ_SPPV010000581.1204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000961.1205.fna -queryname NZ_SPPV010000961.1205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000961.1205.fna -queryname NZ_SPPV010000961.1205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000961.1205.fna -queryname NZ_SPPV010000961.1205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000011.1206.fna -queryname NZ_SPPV010000011.1206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000011.1206.fna -queryname NZ_SPPV010000011.1206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000011.1206.fna -queryname NZ_SPPV010000011.1206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000701.1207.fna -queryname NZ_SPPV010000701.1207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000701.1207.fna -queryname NZ_SPPV010000701.1207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000701.1207.fna -queryname NZ_SPPV010000701.1207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001171.1208.fna -queryname NZ_SPPV010001171.1208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001171.1208.fna -queryname NZ_SPPV010001171.1208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001171.1208.fna -queryname NZ_SPPV010001171.1208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001651.120.fna -queryname NZ_BAIW010001651.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001651.120.fna -queryname NZ_BAIW010001651.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001651.120.fna -queryname NZ_BAIW010001651.120
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000351.1209.fna -queryname NZ_SPPV010000351.1209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000351.1209.fna -queryname NZ_SPPV010000351.1209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000351.1209.fna -queryname NZ_SPPV010000351.1209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000191.1210.fna -queryname NZ_SPPV010000191.1210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000191.1210.fna -queryname NZ_SPPV010000191.1210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000191.1210.fna -queryname NZ_SPPV010000191.1210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000401.1211.fna -queryname NZ_SPPV010000401.1211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000401.1211.fna -queryname NZ_SPPV010000401.1211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000401.1211.fna -queryname NZ_SPPV010000401.1211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000891.1212.fna -queryname NZ_SPPV010000891.1212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000891.1212.fna -queryname NZ_SPPV010000891.1212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000891.1212.fna -queryname NZ_SPPV010000891.1212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000051.1213.fna -queryname NZ_SPPV010000051.1213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000051.1213.fna -queryname NZ_SPPV010000051.1213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000051.1213.fna -queryname NZ_SPPV010000051.1213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000831.1214.fna -queryname NZ_SPPV010000831.1214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000831.1214.fna -queryname NZ_SPPV010000831.1214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000831.1214.fna -queryname NZ_SPPV010000831.1214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000661.1215.fna -queryname NZ_SPPV010000661.1215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000661.1215.fna -queryname NZ_SPPV010000661.1215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000661.1215.fna -queryname NZ_SPPV010000661.1215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000921.1216.fna -queryname NZ_SPPV010000921.1216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000921.1216.fna -queryname NZ_SPPV010000921.1216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000921.1216.fna -queryname NZ_SPPV010000921.1216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000681.1217.fna -queryname NZ_SPPV010000681.1217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000681.1217.fna -queryname NZ_SPPV010000681.1217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000681.1217.fna -queryname NZ_SPPV010000681.1217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001121.1218.fna -queryname NZ_SPPV010001121.1218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001121.1218.fna -queryname NZ_SPPV010001121.1218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001121.1218.fna -queryname NZ_SPPV010001121.1218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000811.121.fna -queryname NZ_BAIW010000811.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000811.121.fna -queryname NZ_BAIW010000811.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000811.121.fna -queryname NZ_BAIW010000811.121
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001101.1219.fna -queryname NZ_SPPV010001101.1219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001101.1219.fna -queryname NZ_SPPV010001101.1219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001101.1219.fna -queryname NZ_SPPV010001101.1219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000251.1220.fna -queryname NZ_SPPV010000251.1220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000251.1220.fna -queryname NZ_SPPV010000251.1220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000251.1220.fna -queryname NZ_SPPV010000251.1220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000311.1221.fna -queryname NZ_SPPV010000311.1221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000311.1221.fna -queryname NZ_SPPV010000311.1221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000311.1221.fna -queryname NZ_SPPV010000311.1221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001151.1222.fna -queryname NZ_SPPV010001151.1222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001151.1222.fna -queryname NZ_SPPV010001151.1222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001151.1222.fna -queryname NZ_SPPV010001151.1222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000521.1223.fna -queryname NZ_SPPV010000521.1223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000521.1223.fna -queryname NZ_SPPV010000521.1223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000521.1223.fna -queryname NZ_SPPV010000521.1223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000181.1224.fna -queryname NZ_SPPV010000181.1224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000181.1224.fna -queryname NZ_SPPV010000181.1224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000181.1224.fna -queryname NZ_SPPV010000181.1224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000871.1225.fna -queryname NZ_SPPV010000871.1225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000871.1225.fna -queryname NZ_SPPV010000871.1225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000871.1225.fna -queryname NZ_SPPV010000871.1225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000911.1226.fna -queryname NZ_SPPV010000911.1226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000911.1226.fna -queryname NZ_SPPV010000911.1226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000911.1226.fna -queryname NZ_SPPV010000911.1226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001131.1227.fna -queryname NZ_SPPV010001131.1227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001131.1227.fna -queryname NZ_SPPV010001131.1227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001131.1227.fna -queryname NZ_SPPV010001131.1227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000341.1228.fna -queryname NZ_SPPV010000341.1228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000341.1228.fna -queryname NZ_SPPV010000341.1228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000341.1228.fna -queryname NZ_SPPV010000341.1228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000521.122.fna -queryname NZ_BAIW010000521.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000521.122.fna -queryname NZ_BAIW010000521.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000521.122.fna -queryname NZ_BAIW010000521.122
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000321.1229.fna -queryname NZ_SPPV010000321.1229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000321.1229.fna -queryname NZ_SPPV010000321.1229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000321.1229.fna -queryname NZ_SPPV010000321.1229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000951.1230.fna -queryname NZ_SPPV010000951.1230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000951.1230.fna -queryname NZ_SPPV010000951.1230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000951.1230.fna -queryname NZ_SPPV010000951.1230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001041.1231.fna -queryname NZ_SPPV010001041.1231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001041.1231.fna -queryname NZ_SPPV010001041.1231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010001041.1231.fna -queryname NZ_SPPV010001041.1231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000851.1232.fna -queryname NZ_SPPV010000851.1232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000851.1232.fna -queryname NZ_SPPV010000851.1232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000851.1232.fna -queryname NZ_SPPV010000851.1232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000261.1233.fna -queryname NZ_SPPV010000261.1233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000261.1233.fna -queryname NZ_SPPV010000261.1233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000261.1233.fna -queryname NZ_SPPV010000261.1233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000101.1234.fna -queryname NZ_SPPV010000101.1234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000101.1234.fna -queryname NZ_SPPV010000101.1234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000101.1234.fna -queryname NZ_SPPV010000101.1234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000421.1235.fna -queryname NZ_SPPV010000421.1235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000421.1235.fna -queryname NZ_SPPV010000421.1235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000421.1235.fna -queryname NZ_SPPV010000421.1235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000751.1236.fna -queryname NZ_SPPV010000751.1236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000751.1236.fna -queryname NZ_SPPV010000751.1236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000751.1236.fna -queryname NZ_SPPV010000751.1236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000691.1237.fna -queryname NZ_SPPV010000691.1237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000691.1237.fna -queryname NZ_SPPV010000691.1237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000691.1237.fna -queryname NZ_SPPV010000691.1237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000991.1238.fna -queryname NZ_SPPV010000991.1238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000991.1238.fna -queryname NZ_SPPV010000991.1238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000991.1238.fna -queryname NZ_SPPV010000991.1238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001421.123.fna -queryname NZ_BAIW010001421.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001421.123.fna -queryname NZ_BAIW010001421.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001421.123.fna -queryname NZ_BAIW010001421.123
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000481.1239.fna -queryname NZ_SPPV010000481.1239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000481.1239.fna -queryname NZ_SPPV010000481.1239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000481.1239.fna -queryname NZ_SPPV010000481.1239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000821.1240.fna -queryname NZ_SPPV010000821.1240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000821.1240.fna -queryname NZ_SPPV010000821.1240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000821.1240.fna -queryname NZ_SPPV010000821.1240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000781.1241.fna -queryname NZ_SPPV010000781.1241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000781.1241.fna -queryname NZ_SPPV010000781.1241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000781.1241.fna -queryname NZ_SPPV010000781.1241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000031.1242.fna -queryname NZ_SPPV010000031.1242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000031.1242.fna -queryname NZ_SPPV010000031.1242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000031.1242.fna -queryname NZ_SPPV010000031.1242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000031.1242.AOI.fna -queryname NZ_SPPV010000031.1242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000031.1242.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000031.1242.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_SPPV010000031.1242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_SPPV010000031.1242.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000731.1243.fna -queryname NZ_SPPV010000731.1243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000731.1243.fna -queryname NZ_SPPV010000731.1243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000731.1243.fna -queryname NZ_SPPV010000731.1243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000491.1244.fna -queryname NZ_SPPV010000491.1244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000491.1244.fna -queryname NZ_SPPV010000491.1244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000491.1244.fna -queryname NZ_SPPV010000491.1244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000771.1245.fna -queryname NZ_SPPV010000771.1245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000771.1245.fna -queryname NZ_SPPV010000771.1245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000771.1245.fna -queryname NZ_SPPV010000771.1245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000931.1246.fna -queryname NZ_SPPV010000931.1246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000931.1246.fna -queryname NZ_SPPV010000931.1246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SPPV010000931.1246.fna -queryname NZ_SPPV010000931.1246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001081.1247.fna -queryname NZ_SRZA010001081.1247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001081.1247.fna -queryname NZ_SRZA010001081.1247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001081.1247.fna -queryname NZ_SRZA010001081.1247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000921.1248.fna -queryname NZ_SRZA010000921.1248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000921.1248.fna -queryname NZ_SRZA010000921.1248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000921.1248.fna -queryname NZ_SRZA010000921.1248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000581.124.fna -queryname NZ_BAIW010000581.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000581.124.fna -queryname NZ_BAIW010000581.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000581.124.fna -queryname NZ_BAIW010000581.124
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001101.1249.fna -queryname NZ_SRZA010001101.1249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001101.1249.fna -queryname NZ_SRZA010001101.1249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001101.1249.fna -queryname NZ_SRZA010001101.1249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001011.1250.fna -queryname NZ_SRZA010001011.1250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001011.1250.fna -queryname NZ_SRZA010001011.1250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001011.1250.fna -queryname NZ_SRZA010001011.1250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000131.1251.fna -queryname NZ_SRZA010000131.1251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000131.1251.fna -queryname NZ_SRZA010000131.1251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000131.1251.fna -queryname NZ_SRZA010000131.1251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001361.1252.fna -queryname NZ_SRZA010001361.1252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001361.1252.fna -queryname NZ_SRZA010001361.1252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001361.1252.fna -queryname NZ_SRZA010001361.1252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000101.1253.fna -queryname NZ_SRZA010000101.1253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000101.1253.fna -queryname NZ_SRZA010000101.1253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000101.1253.fna -queryname NZ_SRZA010000101.1253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000361.1254.fna -queryname NZ_SRZA010000361.1254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000361.1254.fna -queryname NZ_SRZA010000361.1254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000361.1254.fna -queryname NZ_SRZA010000361.1254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000611.1255.fna -queryname NZ_SRZA010000611.1255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000611.1255.fna -queryname NZ_SRZA010000611.1255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000611.1255.fna -queryname NZ_SRZA010000611.1255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000881.1256.fna -queryname NZ_SRZA010000881.1256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000881.1256.fna -queryname NZ_SRZA010000881.1256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000881.1256.fna -queryname NZ_SRZA010000881.1256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000631.1257.fna -queryname NZ_SRZA010000631.1257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000631.1257.fna -queryname NZ_SRZA010000631.1257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000631.1257.fna -queryname NZ_SRZA010000631.1257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000291.1258.fna -queryname NZ_SRZA010000291.1258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000291.1258.fna -queryname NZ_SRZA010000291.1258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000291.1258.fna -queryname NZ_SRZA010000291.1258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000311.125.fna -queryname NZ_BAIW010000311.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000311.125.fna -queryname NZ_BAIW010000311.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000311.125.fna -queryname NZ_BAIW010000311.125
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000041.1259.fna -queryname NZ_SRZA010000041.1259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000041.1259.fna -queryname NZ_SRZA010000041.1259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000041.1259.fna -queryname NZ_SRZA010000041.1259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001181.1260.fna -queryname NZ_SRZA010001181.1260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001181.1260.fna -queryname NZ_SRZA010001181.1260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001181.1260.fna -queryname NZ_SRZA010001181.1260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000681.1261.fna -queryname NZ_SRZA010000681.1261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000681.1261.fna -queryname NZ_SRZA010000681.1261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000681.1261.fna -queryname NZ_SRZA010000681.1261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000331.1262.fna -queryname NZ_SRZA010000331.1262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000331.1262.fna -queryname NZ_SRZA010000331.1262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000331.1262.fna -queryname NZ_SRZA010000331.1262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000081.1263.fna -queryname NZ_SRZA010000081.1263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000081.1263.fna -queryname NZ_SRZA010000081.1263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000081.1263.fna -queryname NZ_SRZA010000081.1263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001121.1264.fna -queryname NZ_SRZA010001121.1264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001121.1264.fna -queryname NZ_SRZA010001121.1264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001121.1264.fna -queryname NZ_SRZA010001121.1264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000381.1265.fna -queryname NZ_SRZA010000381.1265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000381.1265.fna -queryname NZ_SRZA010000381.1265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000381.1265.fna -queryname NZ_SRZA010000381.1265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001151.1266.fna -queryname NZ_SRZA010001151.1266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001151.1266.fna -queryname NZ_SRZA010001151.1266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001151.1266.fna -queryname NZ_SRZA010001151.1266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000841.1267.fna -queryname NZ_SRZA010000841.1267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000841.1267.fna -queryname NZ_SRZA010000841.1267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000841.1267.fna -queryname NZ_SRZA010000841.1267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001271.1268.fna -queryname NZ_SRZA010001271.1268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001271.1268.fna -queryname NZ_SRZA010001271.1268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001271.1268.fna -queryname NZ_SRZA010001271.1268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000571.126.fna -queryname NZ_BAIW010000571.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000571.126.fna -queryname NZ_BAIW010000571.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000571.126.fna -queryname NZ_BAIW010000571.126
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000591.1269.fna -queryname NZ_SRZA010000591.1269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000591.1269.fna -queryname NZ_SRZA010000591.1269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000591.1269.fna -queryname NZ_SRZA010000591.1269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000311.1270.fna -queryname NZ_SRZA010000311.1270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000311.1270.fna -queryname NZ_SRZA010000311.1270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000311.1270.fna -queryname NZ_SRZA010000311.1270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000691.1271.fna -queryname NZ_SRZA010000691.1271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000691.1271.fna -queryname NZ_SRZA010000691.1271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000691.1271.fna -queryname NZ_SRZA010000691.1271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000571.1272.fna -queryname NZ_SRZA010000571.1272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000571.1272.fna -queryname NZ_SRZA010000571.1272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000571.1272.fna -queryname NZ_SRZA010000571.1272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000481.1273.fna -queryname NZ_SRZA010000481.1273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000481.1273.fna -queryname NZ_SRZA010000481.1273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000481.1273.fna -queryname NZ_SRZA010000481.1273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000031.1274.fna -queryname NZ_SRZA010000031.1274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000031.1274.fna -queryname NZ_SRZA010000031.1274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000031.1274.fna -queryname NZ_SRZA010000031.1274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000151.1275.fna -queryname NZ_SRZA010000151.1275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000151.1275.fna -queryname NZ_SRZA010000151.1275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000151.1275.fna -queryname NZ_SRZA010000151.1275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000151.1275.AOI.fna -queryname NZ_SRZA010000151.1275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000151.1275.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000151.1275.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_SRZA010000151.1275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_SRZA010000151.1275.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000911.1276.fna -queryname NZ_SRZA010000911.1276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000911.1276.fna -queryname NZ_SRZA010000911.1276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000911.1276.fna -queryname NZ_SRZA010000911.1276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000301.1277.fna -queryname NZ_SRZA010000301.1277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000301.1277.fna -queryname NZ_SRZA010000301.1277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000301.1277.fna -queryname NZ_SRZA010000301.1277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000791.1278.fna -queryname NZ_SRZA010000791.1278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000791.1278.fna -queryname NZ_SRZA010000791.1278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000791.1278.fna -queryname NZ_SRZA010000791.1278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000371.127.fna -queryname NZ_BAIW010000371.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000371.127.fna -queryname NZ_BAIW010000371.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000371.127.fna -queryname NZ_BAIW010000371.127
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000431.1279.fna -queryname NZ_SRZA010000431.1279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000431.1279.fna -queryname NZ_SRZA010000431.1279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000431.1279.fna -queryname NZ_SRZA010000431.1279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000531.1280.fna -queryname NZ_SRZA010000531.1280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000531.1280.fna -queryname NZ_SRZA010000531.1280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000531.1280.fna -queryname NZ_SRZA010000531.1280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000021.1281.fna -queryname NZ_SRZA010000021.1281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000021.1281.fna -queryname NZ_SRZA010000021.1281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000021.1281.fna -queryname NZ_SRZA010000021.1281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000731.1282.fna -queryname NZ_SRZA010000731.1282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000731.1282.fna -queryname NZ_SRZA010000731.1282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000731.1282.fna -queryname NZ_SRZA010000731.1282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000091.1283.fna -queryname NZ_SRZA010000091.1283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000091.1283.fna -queryname NZ_SRZA010000091.1283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000091.1283.fna -queryname NZ_SRZA010000091.1283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001311.1284.fna -queryname NZ_SRZA010001311.1284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001311.1284.fna -queryname NZ_SRZA010001311.1284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001311.1284.fna -queryname NZ_SRZA010001311.1284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000861.1285.fna -queryname NZ_SRZA010000861.1285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000861.1285.fna -queryname NZ_SRZA010000861.1285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000861.1285.fna -queryname NZ_SRZA010000861.1285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000071.1286.fna -queryname NZ_SRZA010000071.1286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000071.1286.fna -queryname NZ_SRZA010000071.1286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000071.1286.fna -queryname NZ_SRZA010000071.1286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000281.1287.fna -queryname NZ_SRZA010000281.1287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000281.1287.fna -queryname NZ_SRZA010000281.1287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000281.1287.fna -queryname NZ_SRZA010000281.1287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000931.1288.fna -queryname NZ_SRZA010000931.1288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000931.1288.fna -queryname NZ_SRZA010000931.1288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000931.1288.fna -queryname NZ_SRZA010000931.1288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000391.128.fna -queryname NZ_BAIW010000391.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000391.128.fna -queryname NZ_BAIW010000391.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000391.128.fna -queryname NZ_BAIW010000391.128
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001051.1289.fna -queryname NZ_SRZA010001051.1289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001051.1289.fna -queryname NZ_SRZA010001051.1289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001051.1289.fna -queryname NZ_SRZA010001051.1289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000501.1290.fna -queryname NZ_SRZA010000501.1290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000501.1290.fna -queryname NZ_SRZA010000501.1290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000501.1290.fna -queryname NZ_SRZA010000501.1290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000271.1291.fna -queryname NZ_SRZA010000271.1291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000271.1291.fna -queryname NZ_SRZA010000271.1291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000271.1291.fna -queryname NZ_SRZA010000271.1291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000991.1292.fna -queryname NZ_SRZA010000991.1292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000991.1292.fna -queryname NZ_SRZA010000991.1292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000991.1292.fna -queryname NZ_SRZA010000991.1292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000541.1293.fna -queryname NZ_SRZA010000541.1293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000541.1293.fna -queryname NZ_SRZA010000541.1293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000541.1293.fna -queryname NZ_SRZA010000541.1293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001091.1294.fna -queryname NZ_SRZA010001091.1294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001091.1294.fna -queryname NZ_SRZA010001091.1294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001091.1294.fna -queryname NZ_SRZA010001091.1294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000511.1295.fna -queryname NZ_SRZA010000511.1295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000511.1295.fna -queryname NZ_SRZA010000511.1295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000511.1295.fna -queryname NZ_SRZA010000511.1295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000601.1296.fna -queryname NZ_SRZA010000601.1296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000601.1296.fna -queryname NZ_SRZA010000601.1296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000601.1296.fna -queryname NZ_SRZA010000601.1296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000891.1297.fna -queryname NZ_SRZA010000891.1297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000891.1297.fna -queryname NZ_SRZA010000891.1297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000891.1297.fna -queryname NZ_SRZA010000891.1297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000941.1298.fna -queryname NZ_SRZA010000941.1298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000941.1298.fna -queryname NZ_SRZA010000941.1298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000941.1298.fna -queryname NZ_SRZA010000941.1298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000971.12.fna -queryname NZ_BAIW010000971.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000971.12.fna -queryname NZ_BAIW010000971.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000971.12.fna -queryname NZ_BAIW010000971.12
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000901.129.fna -queryname NZ_BAIW010000901.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000901.129.fna -queryname NZ_BAIW010000901.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000901.129.fna -queryname NZ_BAIW010000901.129
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000671.1299.fna -queryname NZ_SRZA010000671.1299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000671.1299.fna -queryname NZ_SRZA010000671.1299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000671.1299.fna -queryname NZ_SRZA010000671.1299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001221.1300.fna -queryname NZ_SRZA010001221.1300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001221.1300.fna -queryname NZ_SRZA010001221.1300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001221.1300.fna -queryname NZ_SRZA010001221.1300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000411.1301.fna -queryname NZ_SRZA010000411.1301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000411.1301.fna -queryname NZ_SRZA010000411.1301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000411.1301.fna -queryname NZ_SRZA010000411.1301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001331.1302.fna -queryname NZ_SRZA010001331.1302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001331.1302.fna -queryname NZ_SRZA010001331.1302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001331.1302.fna -queryname NZ_SRZA010001331.1302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001041.1303.fna -queryname NZ_SRZA010001041.1303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001041.1303.fna -queryname NZ_SRZA010001041.1303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001041.1303.fna -queryname NZ_SRZA010001041.1303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000781.1304.fna -queryname NZ_SRZA010000781.1304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000781.1304.fna -queryname NZ_SRZA010000781.1304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000781.1304.fna -queryname NZ_SRZA010000781.1304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000231.1305.fna -queryname NZ_SRZA010000231.1305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000231.1305.fna -queryname NZ_SRZA010000231.1305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000231.1305.fna -queryname NZ_SRZA010000231.1305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000641.1306.fna -queryname NZ_SRZA010000641.1306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000641.1306.fna -queryname NZ_SRZA010000641.1306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000641.1306.fna -queryname NZ_SRZA010000641.1306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000651.1307.fna -queryname NZ_SRZA010000651.1307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000651.1307.fna -queryname NZ_SRZA010000651.1307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000651.1307.fna -queryname NZ_SRZA010000651.1307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001201.1308.fna -queryname NZ_SRZA010001201.1308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001201.1308.fna -queryname NZ_SRZA010001201.1308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001201.1308.fna -queryname NZ_SRZA010001201.1308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001121.130.fna -queryname NZ_BAIW010001121.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001121.130.fna -queryname NZ_BAIW010001121.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001121.130.fna -queryname NZ_BAIW010001121.130
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000521.1309.fna -queryname NZ_SRZA010000521.1309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000521.1309.fna -queryname NZ_SRZA010000521.1309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000521.1309.fna -queryname NZ_SRZA010000521.1309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000191.1310.fna -queryname NZ_SRZA010000191.1310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000191.1310.fna -queryname NZ_SRZA010000191.1310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000191.1310.fna -queryname NZ_SRZA010000191.1310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000951.1311.fna -queryname NZ_SRZA010000951.1311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000951.1311.fna -queryname NZ_SRZA010000951.1311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000951.1311.fna -queryname NZ_SRZA010000951.1311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000491.1312.fna -queryname NZ_SRZA010000491.1312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000491.1312.fna -queryname NZ_SRZA010000491.1312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000491.1312.fna -queryname NZ_SRZA010000491.1312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001291.1313.fna -queryname NZ_SRZA010001291.1313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001291.1313.fna -queryname NZ_SRZA010001291.1313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001291.1313.fna -queryname NZ_SRZA010001291.1313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000391.1314.fna -queryname NZ_SRZA010000391.1314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000391.1314.fna -queryname NZ_SRZA010000391.1314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000391.1314.fna -queryname NZ_SRZA010000391.1314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000441.1315.fna -queryname NZ_SRZA010000441.1315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000441.1315.fna -queryname NZ_SRZA010000441.1315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000441.1315.fna -queryname NZ_SRZA010000441.1315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000341.1316.fna -queryname NZ_SRZA010000341.1316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000341.1316.fna -queryname NZ_SRZA010000341.1316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000341.1316.fna -queryname NZ_SRZA010000341.1316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000051.1317.fna -queryname NZ_SRZA010000051.1317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000051.1317.fna -queryname NZ_SRZA010000051.1317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000051.1317.fna -queryname NZ_SRZA010000051.1317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001001.1318.fna -queryname NZ_SRZA010001001.1318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001001.1318.fna -queryname NZ_SRZA010001001.1318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001001.1318.fna -queryname NZ_SRZA010001001.1318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001141.131.fna -queryname NZ_BAIW010001141.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001141.131.fna -queryname NZ_BAIW010001141.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001141.131.fna -queryname NZ_BAIW010001141.131
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000711.1319.fna -queryname NZ_SRZA010000711.1319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000711.1319.fna -queryname NZ_SRZA010000711.1319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000711.1319.fna -queryname NZ_SRZA010000711.1319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001061.1320.fna -queryname NZ_SRZA010001061.1320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001061.1320.fna -queryname NZ_SRZA010001061.1320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001061.1320.fna -queryname NZ_SRZA010001061.1320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001341.1321.fna -queryname NZ_SRZA010001341.1321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001341.1321.fna -queryname NZ_SRZA010001341.1321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001341.1321.fna -queryname NZ_SRZA010001341.1321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000141.1322.fna -queryname NZ_SRZA010000141.1322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000141.1322.fna -queryname NZ_SRZA010000141.1322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000141.1322.fna -queryname NZ_SRZA010000141.1322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000121.1323.fna -queryname NZ_SRZA010000121.1323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000121.1323.fna -queryname NZ_SRZA010000121.1323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000121.1323.fna -queryname NZ_SRZA010000121.1323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000581.1324.fna -queryname NZ_SRZA010000581.1324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000581.1324.fna -queryname NZ_SRZA010000581.1324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000581.1324.fna -queryname NZ_SRZA010000581.1324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001261.1325.fna -queryname NZ_SRZA010001261.1325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001261.1325.fna -queryname NZ_SRZA010001261.1325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001261.1325.fna -queryname NZ_SRZA010001261.1325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000171.1326.fna -queryname NZ_SRZA010000171.1326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000171.1326.fna -queryname NZ_SRZA010000171.1326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000171.1326.fna -queryname NZ_SRZA010000171.1326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000551.1327.fna -queryname NZ_SRZA010000551.1327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000551.1327.fna -queryname NZ_SRZA010000551.1327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000551.1327.fna -queryname NZ_SRZA010000551.1327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001301.1328.fna -queryname NZ_SRZA010001301.1328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001301.1328.fna -queryname NZ_SRZA010001301.1328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001301.1328.fna -queryname NZ_SRZA010001301.1328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000941.132.fna -queryname NZ_BAIW010000941.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000941.132.fna -queryname NZ_BAIW010000941.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000941.132.fna -queryname NZ_BAIW010000941.132
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000971.1329.fna -queryname NZ_SRZA010000971.1329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000971.1329.fna -queryname NZ_SRZA010000971.1329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000971.1329.fna -queryname NZ_SRZA010000971.1329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000741.1330.fna -queryname NZ_SRZA010000741.1330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000741.1330.fna -queryname NZ_SRZA010000741.1330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000741.1330.fna -queryname NZ_SRZA010000741.1330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000761.1331.fna -queryname NZ_SRZA010000761.1331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000761.1331.fna -queryname NZ_SRZA010000761.1331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000761.1331.fna -queryname NZ_SRZA010000761.1331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000461.1332.fna -queryname NZ_SRZA010000461.1332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000461.1332.fna -queryname NZ_SRZA010000461.1332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000461.1332.fna -queryname NZ_SRZA010000461.1332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000471.1333.fna -queryname NZ_SRZA010000471.1333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000471.1333.fna -queryname NZ_SRZA010000471.1333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000471.1333.fna -queryname NZ_SRZA010000471.1333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000981.1334.fna -queryname NZ_SRZA010000981.1334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000981.1334.fna -queryname NZ_SRZA010000981.1334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000981.1334.fna -queryname NZ_SRZA010000981.1334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000351.1335.fna -queryname NZ_SRZA010000351.1335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000351.1335.fna -queryname NZ_SRZA010000351.1335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000351.1335.fna -queryname NZ_SRZA010000351.1335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000661.1336.fna -queryname NZ_SRZA010000661.1336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000661.1336.fna -queryname NZ_SRZA010000661.1336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000661.1336.fna -queryname NZ_SRZA010000661.1336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000241.1337.fna -queryname NZ_SRZA010000241.1337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000241.1337.fna -queryname NZ_SRZA010000241.1337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000241.1337.fna -queryname NZ_SRZA010000241.1337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001251.1338.fna -queryname NZ_SRZA010001251.1338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001251.1338.fna -queryname NZ_SRZA010001251.1338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001251.1338.fna -queryname NZ_SRZA010001251.1338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000921.133.fna -queryname NZ_BAIW010000921.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000921.133.fna -queryname NZ_BAIW010000921.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000921.133.fna -queryname NZ_BAIW010000921.133
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000251.1339.fna -queryname NZ_SRZA010000251.1339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000251.1339.fna -queryname NZ_SRZA010000251.1339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000251.1339.fna -queryname NZ_SRZA010000251.1339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000421.1340.fna -queryname NZ_SRZA010000421.1340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000421.1340.fna -queryname NZ_SRZA010000421.1340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000421.1340.fna -queryname NZ_SRZA010000421.1340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000111.1341.fna -queryname NZ_SRZA010000111.1341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000111.1341.fna -queryname NZ_SRZA010000111.1341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000111.1341.fna -queryname NZ_SRZA010000111.1341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000811.1342.fna -queryname NZ_SRZA010000811.1342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000811.1342.fna -queryname NZ_SRZA010000811.1342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000811.1342.fna -queryname NZ_SRZA010000811.1342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000221.1343.fna -queryname NZ_SRZA010000221.1343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000221.1343.fna -queryname NZ_SRZA010000221.1343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000221.1343.fna -queryname NZ_SRZA010000221.1343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000451.1344.fna -queryname NZ_SRZA010000451.1344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000451.1344.fna -queryname NZ_SRZA010000451.1344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000451.1344.fna -queryname NZ_SRZA010000451.1344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000621.1345.fna -queryname NZ_SRZA010000621.1345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000621.1345.fna -queryname NZ_SRZA010000621.1345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000621.1345.fna -queryname NZ_SRZA010000621.1345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000371.1346.fna -queryname NZ_SRZA010000371.1346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000371.1346.fna -queryname NZ_SRZA010000371.1346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000371.1346.fna -queryname NZ_SRZA010000371.1346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001211.1347.fna -queryname NZ_SRZA010001211.1347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001211.1347.fna -queryname NZ_SRZA010001211.1347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001211.1347.fna -queryname NZ_SRZA010001211.1347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000961.1348.fna -queryname NZ_SRZA010000961.1348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000961.1348.fna -queryname NZ_SRZA010000961.1348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000961.1348.fna -queryname NZ_SRZA010000961.1348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001491.134.fna -queryname NZ_BAIW010001491.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001491.134.fna -queryname NZ_BAIW010001491.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001491.134.fna -queryname NZ_BAIW010001491.134
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000321.1349.fna -queryname NZ_SRZA010000321.1349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000321.1349.fna -queryname NZ_SRZA010000321.1349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000321.1349.fna -queryname NZ_SRZA010000321.1349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000901.1350.fna -queryname NZ_SRZA010000901.1350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000901.1350.fna -queryname NZ_SRZA010000901.1350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000901.1350.fna -queryname NZ_SRZA010000901.1350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000261.1351.fna -queryname NZ_SRZA010000261.1351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000261.1351.fna -queryname NZ_SRZA010000261.1351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000261.1351.fna -queryname NZ_SRZA010000261.1351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001191.1352.fna -queryname NZ_SRZA010001191.1352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001191.1352.fna -queryname NZ_SRZA010001191.1352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001191.1352.fna -queryname NZ_SRZA010001191.1352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000721.1353.fna -queryname NZ_SRZA010000721.1353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000721.1353.fna -queryname NZ_SRZA010000721.1353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000721.1353.fna -queryname NZ_SRZA010000721.1353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000871.1354.fna -queryname NZ_SRZA010000871.1354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000871.1354.fna -queryname NZ_SRZA010000871.1354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000871.1354.fna -queryname NZ_SRZA010000871.1354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000011.1355.fna -queryname NZ_SRZA010000011.1355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000011.1355.fna -queryname NZ_SRZA010000011.1355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000011.1355.fna -queryname NZ_SRZA010000011.1355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000831.1356.fna -queryname NZ_SRZA010000831.1356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000831.1356.fna -queryname NZ_SRZA010000831.1356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000831.1356.fna -queryname NZ_SRZA010000831.1356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000161.1357.fna -queryname NZ_SRZA010000161.1357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000161.1357.fna -queryname NZ_SRZA010000161.1357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000161.1357.fna -queryname NZ_SRZA010000161.1357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000401.1358.fna -queryname NZ_SRZA010000401.1358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000401.1358.fna -queryname NZ_SRZA010000401.1358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000401.1358.fna -queryname NZ_SRZA010000401.1358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001211.135.fna -queryname NZ_BAIW010001211.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001211.135.fna -queryname NZ_BAIW010001211.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001211.135.fna -queryname NZ_BAIW010001211.135
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001071.1359.fna -queryname NZ_SRZA010001071.1359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001071.1359.fna -queryname NZ_SRZA010001071.1359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001071.1359.fna -queryname NZ_SRZA010001071.1359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000771.1360.fna -queryname NZ_SRZA010000771.1360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000771.1360.fna -queryname NZ_SRZA010000771.1360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000771.1360.fna -queryname NZ_SRZA010000771.1360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000751.1361.fna -queryname NZ_SRZA010000751.1361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000751.1361.fna -queryname NZ_SRZA010000751.1361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000751.1361.fna -queryname NZ_SRZA010000751.1361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001241.1362.fna -queryname NZ_SRZA010001241.1362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001241.1362.fna -queryname NZ_SRZA010001241.1362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001241.1362.fna -queryname NZ_SRZA010001241.1362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001021.1363.fna -queryname NZ_SRZA010001021.1363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001021.1363.fna -queryname NZ_SRZA010001021.1363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001021.1363.fna -queryname NZ_SRZA010001021.1363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000701.1364.fna -queryname NZ_SRZA010000701.1364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000701.1364.fna -queryname NZ_SRZA010000701.1364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000701.1364.fna -queryname NZ_SRZA010000701.1364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000211.1365.fna -queryname NZ_SRZA010000211.1365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000211.1365.fna -queryname NZ_SRZA010000211.1365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000211.1365.fna -queryname NZ_SRZA010000211.1365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001141.1366.fna -queryname NZ_SRZA010001141.1366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001141.1366.fna -queryname NZ_SRZA010001141.1366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001141.1366.fna -queryname NZ_SRZA010001141.1366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000561.1367.fna -queryname NZ_SRZA010000561.1367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000561.1367.fna -queryname NZ_SRZA010000561.1367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000561.1367.fna -queryname NZ_SRZA010000561.1367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001031.1368.fna -queryname NZ_SRZA010001031.1368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001031.1368.fna -queryname NZ_SRZA010001031.1368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001031.1368.fna -queryname NZ_SRZA010001031.1368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001691.136.fna -queryname NZ_BAIW010001691.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001691.136.fna -queryname NZ_BAIW010001691.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001691.136.fna -queryname NZ_BAIW010001691.136
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000061.1369.fna -queryname NZ_SRZA010000061.1369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000061.1369.fna -queryname NZ_SRZA010000061.1369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000061.1369.fna -queryname NZ_SRZA010000061.1369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001231.1370.fna -queryname NZ_SRZA010001231.1370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001231.1370.fna -queryname NZ_SRZA010001231.1370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001231.1370.fna -queryname NZ_SRZA010001231.1370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001161.1371.fna -queryname NZ_SRZA010001161.1371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001161.1371.fna -queryname NZ_SRZA010001161.1371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001161.1371.fna -queryname NZ_SRZA010001161.1371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000851.1372.fna -queryname NZ_SRZA010000851.1372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000851.1372.fna -queryname NZ_SRZA010000851.1372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000851.1372.fna -queryname NZ_SRZA010000851.1372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001111.1373.fna -queryname NZ_SRZA010001111.1373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001111.1373.fna -queryname NZ_SRZA010001111.1373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001111.1373.fna -queryname NZ_SRZA010001111.1373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000821.1374.fna -queryname NZ_SRZA010000821.1374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000821.1374.fna -queryname NZ_SRZA010000821.1374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000821.1374.fna -queryname NZ_SRZA010000821.1374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001131.1375.fna -queryname NZ_SRZA010001131.1375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001131.1375.fna -queryname NZ_SRZA010001131.1375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001131.1375.fna -queryname NZ_SRZA010001131.1375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001281.1376.fna -queryname NZ_SRZA010001281.1376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001281.1376.fna -queryname NZ_SRZA010001281.1376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001281.1376.fna -queryname NZ_SRZA010001281.1376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000201.1377.fna -queryname NZ_SRZA010000201.1377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000201.1377.fna -queryname NZ_SRZA010000201.1377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000201.1377.fna -queryname NZ_SRZA010000201.1377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000181.1378.fna -queryname NZ_SRZA010000181.1378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000181.1378.fna -queryname NZ_SRZA010000181.1378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000181.1378.fna -queryname NZ_SRZA010000181.1378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001231.137.fna -queryname NZ_BAIW010001231.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001231.137.fna -queryname NZ_BAIW010001231.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001231.137.fna -queryname NZ_BAIW010001231.137
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001321.1379.fna -queryname NZ_SRZA010001321.1379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001321.1379.fna -queryname NZ_SRZA010001321.1379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001321.1379.fna -queryname NZ_SRZA010001321.1379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000801.1380.fna -queryname NZ_SRZA010000801.1380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000801.1380.fna -queryname NZ_SRZA010000801.1380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010000801.1380.fna -queryname NZ_SRZA010000801.1380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001171.1381.fna -queryname NZ_SRZA010001171.1381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001171.1381.fna -queryname NZ_SRZA010001171.1381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001171.1381.fna -queryname NZ_SRZA010001171.1381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001351.1382.fna -queryname NZ_SRZA010001351.1382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001351.1382.fna -queryname NZ_SRZA010001351.1382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_SRZA010001351.1382.fna -queryname NZ_SRZA010001351.1382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000041.1383.fna -queryname NZ_VIRE010000041.1383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000041.1383.fna -queryname NZ_VIRE010000041.1383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000041.1383.fna -queryname NZ_VIRE010000041.1383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000161.1384.fna -queryname NZ_VIRE010000161.1384
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000161.1384.fna -queryname NZ_VIRE010000161.1384
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000161.1384.fna -queryname NZ_VIRE010000161.1384
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001341.1385.fna -queryname NZ_VIRE010001341.1385
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001341.1385.fna -queryname NZ_VIRE010001341.1385
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001341.1385.fna -queryname NZ_VIRE010001341.1385
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001171.1386.fna -queryname NZ_VIRE010001171.1386
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001171.1386.fna -queryname NZ_VIRE010001171.1386
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001171.1386.fna -queryname NZ_VIRE010001171.1386
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000551.1387.fna -queryname NZ_VIRE010000551.1387
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000551.1387.fna -queryname NZ_VIRE010000551.1387
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000551.1387.fna -queryname NZ_VIRE010000551.1387
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000331.1388.fna -queryname NZ_VIRE010000331.1388
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000331.1388.fna -queryname NZ_VIRE010000331.1388
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000331.1388.fna -queryname NZ_VIRE010000331.1388
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000801.138.fna -queryname NZ_BAIW010000801.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000801.138.fna -queryname NZ_BAIW010000801.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000801.138.fna -queryname NZ_BAIW010000801.138
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000831.1389.fna -queryname NZ_VIRE010000831.1389
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000831.1389.fna -queryname NZ_VIRE010000831.1389
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000831.1389.fna -queryname NZ_VIRE010000831.1389
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000791.1390.fna -queryname NZ_VIRE010000791.1390
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000791.1390.fna -queryname NZ_VIRE010000791.1390
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000791.1390.fna -queryname NZ_VIRE010000791.1390
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000171.1391.fna -queryname NZ_VIRE010000171.1391
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000171.1391.fna -queryname NZ_VIRE010000171.1391
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000171.1391.fna -queryname NZ_VIRE010000171.1391
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000271.1392.fna -queryname NZ_VIRE010000271.1392
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000271.1392.fna -queryname NZ_VIRE010000271.1392
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000271.1392.fna -queryname NZ_VIRE010000271.1392
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001291.1393.fna -queryname NZ_VIRE010001291.1393
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001291.1393.fna -queryname NZ_VIRE010001291.1393
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001291.1393.fna -queryname NZ_VIRE010001291.1393
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000671.1394.fna -queryname NZ_VIRE010000671.1394
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000671.1394.fna -queryname NZ_VIRE010000671.1394
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000671.1394.fna -queryname NZ_VIRE010000671.1394
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001211.1395.fna -queryname NZ_VIRE010001211.1395
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001211.1395.fna -queryname NZ_VIRE010001211.1395
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001211.1395.fna -queryname NZ_VIRE010001211.1395
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000861.1396.fna -queryname NZ_VIRE010000861.1396
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000861.1396.fna -queryname NZ_VIRE010000861.1396
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000861.1396.fna -queryname NZ_VIRE010000861.1396
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000481.1397.fna -queryname NZ_VIRE010000481.1397
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000481.1397.fna -queryname NZ_VIRE010000481.1397
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000481.1397.fna -queryname NZ_VIRE010000481.1397
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000681.1398.fna -queryname NZ_VIRE010000681.1398
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000681.1398.fna -queryname NZ_VIRE010000681.1398
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000681.1398.fna -queryname NZ_VIRE010000681.1398
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000151.13.fna -queryname NZ_BAIW010000151.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000151.13.fna -queryname NZ_BAIW010000151.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000151.13.fna -queryname NZ_BAIW010000151.13
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000641.139.fna -queryname NZ_BAIW010000641.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000641.139.fna -queryname NZ_BAIW010000641.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000641.139.fna -queryname NZ_BAIW010000641.139
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000991.1399.fna -queryname NZ_VIRE010000991.1399
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000991.1399.fna -queryname NZ_VIRE010000991.1399
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000991.1399.fna -queryname NZ_VIRE010000991.1399
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001311.1400.fna -queryname NZ_VIRE010001311.1400
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001311.1400.fna -queryname NZ_VIRE010001311.1400
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001311.1400.fna -queryname NZ_VIRE010001311.1400
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001231.1401.fna -queryname NZ_VIRE010001231.1401
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001231.1401.fna -queryname NZ_VIRE010001231.1401
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001231.1401.fna -queryname NZ_VIRE010001231.1401
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000801.1402.fna -queryname NZ_VIRE010000801.1402
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000801.1402.fna -queryname NZ_VIRE010000801.1402
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000801.1402.fna -queryname NZ_VIRE010000801.1402
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000931.1403.fna -queryname NZ_VIRE010000931.1403
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000931.1403.fna -queryname NZ_VIRE010000931.1403
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000931.1403.fna -queryname NZ_VIRE010000931.1403
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000321.1404.fna -queryname NZ_VIRE010000321.1404
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000321.1404.fna -queryname NZ_VIRE010000321.1404
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000321.1404.fna -queryname NZ_VIRE010000321.1404
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001201.1405.fna -queryname NZ_VIRE010001201.1405
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001201.1405.fna -queryname NZ_VIRE010001201.1405
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001201.1405.fna -queryname NZ_VIRE010001201.1405
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000251.1406.fna -queryname NZ_VIRE010000251.1406
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000251.1406.fna -queryname NZ_VIRE010000251.1406
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000251.1406.fna -queryname NZ_VIRE010000251.1406
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001031.1407.fna -queryname NZ_VIRE010001031.1407
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001031.1407.fna -queryname NZ_VIRE010001031.1407
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001031.1407.fna -queryname NZ_VIRE010001031.1407
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000351.1408.fna -queryname NZ_VIRE010000351.1408
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000351.1408.fna -queryname NZ_VIRE010000351.1408
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000351.1408.fna -queryname NZ_VIRE010000351.1408
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001551.140.fna -queryname NZ_BAIW010001551.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001551.140.fna -queryname NZ_BAIW010001551.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001551.140.fna -queryname NZ_BAIW010001551.140
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000381.1409.fna -queryname NZ_VIRE010000381.1409
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000381.1409.fna -queryname NZ_VIRE010000381.1409
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000381.1409.fna -queryname NZ_VIRE010000381.1409
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000301.1410.fna -queryname NZ_VIRE010000301.1410
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000301.1410.fna -queryname NZ_VIRE010000301.1410
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000301.1410.fna -queryname NZ_VIRE010000301.1410
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000771.1411.fna -queryname NZ_VIRE010000771.1411
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000771.1411.fna -queryname NZ_VIRE010000771.1411
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000771.1411.fna -queryname NZ_VIRE010000771.1411
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000401.1412.fna -queryname NZ_VIRE010000401.1412
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000401.1412.fna -queryname NZ_VIRE010000401.1412
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000401.1412.fna -queryname NZ_VIRE010000401.1412
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000211.1413.fna -queryname NZ_VIRE010000211.1413
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000211.1413.fna -queryname NZ_VIRE010000211.1413
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000211.1413.fna -queryname NZ_VIRE010000211.1413
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001151.1414.fna -queryname NZ_VIRE010001151.1414
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001151.1414.fna -queryname NZ_VIRE010001151.1414
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001151.1414.fna -queryname NZ_VIRE010001151.1414
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001041.1415.fna -queryname NZ_VIRE010001041.1415
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001041.1415.fna -queryname NZ_VIRE010001041.1415
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001041.1415.fna -queryname NZ_VIRE010001041.1415
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000441.1416.fna -queryname NZ_VIRE010000441.1416
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000441.1416.fna -queryname NZ_VIRE010000441.1416
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000441.1416.fna -queryname NZ_VIRE010000441.1416
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000601.1417.fna -queryname NZ_VIRE010000601.1417
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000601.1417.fna -queryname NZ_VIRE010000601.1417
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000601.1417.fna -queryname NZ_VIRE010000601.1417
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000371.1418.fna -queryname NZ_VIRE010000371.1418
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000371.1418.fna -queryname NZ_VIRE010000371.1418
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000371.1418.fna -queryname NZ_VIRE010000371.1418
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001701.141.fna -queryname NZ_BAIW010001701.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001701.141.fna -queryname NZ_BAIW010001701.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001701.141.fna -queryname NZ_BAIW010001701.141
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000961.1419.fna -queryname NZ_VIRE010000961.1419
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000961.1419.fna -queryname NZ_VIRE010000961.1419
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000961.1419.fna -queryname NZ_VIRE010000961.1419
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000781.1420.fna -queryname NZ_VIRE010000781.1420
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000781.1420.fna -queryname NZ_VIRE010000781.1420
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000781.1420.fna -queryname NZ_VIRE010000781.1420
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000261.1421.fna -queryname NZ_VIRE010000261.1421
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000261.1421.fna -queryname NZ_VIRE010000261.1421
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000261.1421.fna -queryname NZ_VIRE010000261.1421
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001371.1422.fna -queryname NZ_VIRE010001371.1422
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001371.1422.fna -queryname NZ_VIRE010001371.1422
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001371.1422.fna -queryname NZ_VIRE010001371.1422
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000391.1423.fna -queryname NZ_VIRE010000391.1423
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000391.1423.fna -queryname NZ_VIRE010000391.1423
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000391.1423.fna -queryname NZ_VIRE010000391.1423
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000241.1424.fna -queryname NZ_VIRE010000241.1424
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000241.1424.fna -queryname NZ_VIRE010000241.1424
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000241.1424.fna -queryname NZ_VIRE010000241.1424
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000091.1425.fna -queryname NZ_VIRE010000091.1425
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000091.1425.fna -queryname NZ_VIRE010000091.1425
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000091.1425.fna -queryname NZ_VIRE010000091.1425
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001111.1426.fna -queryname NZ_VIRE010001111.1426
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001111.1426.fna -queryname NZ_VIRE010001111.1426
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001111.1426.fna -queryname NZ_VIRE010001111.1426
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000081.1427.fna -queryname NZ_VIRE010000081.1427
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000081.1427.fna -queryname NZ_VIRE010000081.1427
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000081.1427.fna -queryname NZ_VIRE010000081.1427
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001011.1428.fna -queryname NZ_VIRE010001011.1428
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001011.1428.fna -queryname NZ_VIRE010001011.1428
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001011.1428.fna -queryname NZ_VIRE010001011.1428
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001631.142.fna -queryname NZ_BAIW010001631.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001631.142.fna -queryname NZ_BAIW010001631.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001631.142.fna -queryname NZ_BAIW010001631.142
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000191.1429.fna -queryname NZ_VIRE010000191.1429
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000191.1429.fna -queryname NZ_VIRE010000191.1429
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000191.1429.fna -queryname NZ_VIRE010000191.1429
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000131.1430.fna -queryname NZ_VIRE010000131.1430
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000131.1430.fna -queryname NZ_VIRE010000131.1430
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000131.1430.fna -queryname NZ_VIRE010000131.1430
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000121.1431.fna -queryname NZ_VIRE010000121.1431
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000121.1431.fna -queryname NZ_VIRE010000121.1431
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000121.1431.fna -queryname NZ_VIRE010000121.1431
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001081.1432.fna -queryname NZ_VIRE010001081.1432
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001081.1432.fna -queryname NZ_VIRE010001081.1432
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001081.1432.fna -queryname NZ_VIRE010001081.1432
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000291.1433.fna -queryname NZ_VIRE010000291.1433
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000291.1433.fna -queryname NZ_VIRE010000291.1433
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000291.1433.fna -queryname NZ_VIRE010000291.1433
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000941.1434.fna -queryname NZ_VIRE010000941.1434
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000941.1434.fna -queryname NZ_VIRE010000941.1434
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000941.1434.fna -queryname NZ_VIRE010000941.1434
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000201.1435.fna -queryname NZ_VIRE010000201.1435
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000201.1435.fna -queryname NZ_VIRE010000201.1435
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000201.1435.fna -queryname NZ_VIRE010000201.1435
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000021.1436.fna -queryname NZ_VIRE010000021.1436
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000021.1436.fna -queryname NZ_VIRE010000021.1436
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000021.1436.fna -queryname NZ_VIRE010000021.1436
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000281.1437.fna -queryname NZ_VIRE010000281.1437
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000281.1437.fna -queryname NZ_VIRE010000281.1437
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000281.1437.fna -queryname NZ_VIRE010000281.1437
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001141.1438.fna -queryname NZ_VIRE010001141.1438
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001141.1438.fna -queryname NZ_VIRE010001141.1438
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001141.1438.fna -queryname NZ_VIRE010001141.1438
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000891.143.fna -queryname NZ_BAIW010000891.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000891.143.fna -queryname NZ_BAIW010000891.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000891.143.fna -queryname NZ_BAIW010000891.143
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000011.1439.fna -queryname NZ_VIRE010000011.1439
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000011.1439.fna -queryname NZ_VIRE010000011.1439
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000011.1439.fna -queryname NZ_VIRE010000011.1439
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000701.1440.fna -queryname NZ_VIRE010000701.1440
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000701.1440.fna -queryname NZ_VIRE010000701.1440
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000701.1440.fna -queryname NZ_VIRE010000701.1440
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000471.1441.fna -queryname NZ_VIRE010000471.1441
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000471.1441.fna -queryname NZ_VIRE010000471.1441
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000471.1441.fna -queryname NZ_VIRE010000471.1441
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000471.1441.AOI.fna -queryname NZ_VIRE010000471.1441
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000471.1441.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000471.1441.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_VIRE010000471.1441
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_VIRE010000471.1441.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000111.1442.fna -queryname NZ_VIRE010000111.1442
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000111.1442.fna -queryname NZ_VIRE010000111.1442
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000111.1442.fna -queryname NZ_VIRE010000111.1442
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000901.1443.fna -queryname NZ_VIRE010000901.1443
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000901.1443.fna -queryname NZ_VIRE010000901.1443
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000901.1443.fna -queryname NZ_VIRE010000901.1443
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001101.1444.fna -queryname NZ_VIRE010001101.1444
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001101.1444.fna -queryname NZ_VIRE010001101.1444
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001101.1444.fna -queryname NZ_VIRE010001101.1444
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000181.1445.fna -queryname NZ_VIRE010000181.1445
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000181.1445.fna -queryname NZ_VIRE010000181.1445
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000181.1445.fna -queryname NZ_VIRE010000181.1445
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000971.1446.fna -queryname NZ_VIRE010000971.1446
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000971.1446.fna -queryname NZ_VIRE010000971.1446
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000971.1446.fna -queryname NZ_VIRE010000971.1446
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001261.1447.fna -queryname NZ_VIRE010001261.1447
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001261.1447.fna -queryname NZ_VIRE010001261.1447
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001261.1447.fna -queryname NZ_VIRE010001261.1447
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000591.1448.fna -queryname NZ_VIRE010000591.1448
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000591.1448.fna -queryname NZ_VIRE010000591.1448
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000591.1448.fna -queryname NZ_VIRE010000591.1448
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000461.144.fna -queryname NZ_BAIW010000461.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000461.144.fna -queryname NZ_BAIW010000461.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000461.144.fna -queryname NZ_BAIW010000461.144
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001091.1449.fna -queryname NZ_VIRE010001091.1449
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001091.1449.fna -queryname NZ_VIRE010001091.1449
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001091.1449.fna -queryname NZ_VIRE010001091.1449
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000691.1450.fna -queryname NZ_VIRE010000691.1450
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000691.1450.fna -queryname NZ_VIRE010000691.1450
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000691.1450.fna -queryname NZ_VIRE010000691.1450
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000421.1451.fna -queryname NZ_VIRE010000421.1451
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000421.1451.fna -queryname NZ_VIRE010000421.1451
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000421.1451.fna -queryname NZ_VIRE010000421.1451
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001381.1452.fna -queryname NZ_VIRE010001381.1452
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001381.1452.fna -queryname NZ_VIRE010001381.1452
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001381.1452.fna -queryname NZ_VIRE010001381.1452
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001191.1453.fna -queryname NZ_VIRE010001191.1453
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001191.1453.fna -queryname NZ_VIRE010001191.1453
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001191.1453.fna -queryname NZ_VIRE010001191.1453
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000741.1454.fna -queryname NZ_VIRE010000741.1454
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000741.1454.fna -queryname NZ_VIRE010000741.1454
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000741.1454.fna -queryname NZ_VIRE010000741.1454
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000841.1455.fna -queryname NZ_VIRE010000841.1455
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000841.1455.fna -queryname NZ_VIRE010000841.1455
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000841.1455.fna -queryname NZ_VIRE010000841.1455
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000661.1456.fna -queryname NZ_VIRE010000661.1456
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000661.1456.fna -queryname NZ_VIRE010000661.1456
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000661.1456.fna -queryname NZ_VIRE010000661.1456
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000521.1457.fna -queryname NZ_VIRE010000521.1457
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000521.1457.fna -queryname NZ_VIRE010000521.1457
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000521.1457.fna -queryname NZ_VIRE010000521.1457
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000461.1458.fna -queryname NZ_VIRE010000461.1458
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000461.1458.fna -queryname NZ_VIRE010000461.1458
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000461.1458.fna -queryname NZ_VIRE010000461.1458
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001461.145.fna -queryname NZ_BAIW010001461.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001461.145.fna -queryname NZ_BAIW010001461.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001461.145.fna -queryname NZ_BAIW010001461.145
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000621.1459.fna -queryname NZ_VIRE010000621.1459
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000621.1459.fna -queryname NZ_VIRE010000621.1459
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000621.1459.fna -queryname NZ_VIRE010000621.1459
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000811.1460.fna -queryname NZ_VIRE010000811.1460
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000811.1460.fna -queryname NZ_VIRE010000811.1460
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000811.1460.fna -queryname NZ_VIRE010000811.1460
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000231.1461.fna -queryname NZ_VIRE010000231.1461
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000231.1461.fna -queryname NZ_VIRE010000231.1461
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000231.1461.fna -queryname NZ_VIRE010000231.1461
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001281.1462.fna -queryname NZ_VIRE010001281.1462
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001281.1462.fna -queryname NZ_VIRE010001281.1462
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001281.1462.fna -queryname NZ_VIRE010001281.1462
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000531.1463.fna -queryname NZ_VIRE010000531.1463
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000531.1463.fna -queryname NZ_VIRE010000531.1463
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000531.1463.fna -queryname NZ_VIRE010000531.1463
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000151.1464.fna -queryname NZ_VIRE010000151.1464
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000151.1464.fna -queryname NZ_VIRE010000151.1464
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000151.1464.fna -queryname NZ_VIRE010000151.1464
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000511.1465.fna -queryname NZ_VIRE010000511.1465
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000511.1465.fna -queryname NZ_VIRE010000511.1465
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000511.1465.fna -queryname NZ_VIRE010000511.1465
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000921.1466.fna -queryname NZ_VIRE010000921.1466
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000921.1466.fna -queryname NZ_VIRE010000921.1466
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000921.1466.fna -queryname NZ_VIRE010000921.1466
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000311.1467.fna -queryname NZ_VIRE010000311.1467
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000311.1467.fna -queryname NZ_VIRE010000311.1467
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000311.1467.fna -queryname NZ_VIRE010000311.1467
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001351.1468.fna -queryname NZ_VIRE010001351.1468
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001351.1468.fna -queryname NZ_VIRE010001351.1468
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001351.1468.fna -queryname NZ_VIRE010001351.1468
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000221.146.fna -queryname NZ_BAIW010000221.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000221.146.fna -queryname NZ_BAIW010000221.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000221.146.fna -queryname NZ_BAIW010000221.146
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001161.1469.fna -queryname NZ_VIRE010001161.1469
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001161.1469.fna -queryname NZ_VIRE010001161.1469
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001161.1469.fna -queryname NZ_VIRE010001161.1469
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000641.1470.fna -queryname NZ_VIRE010000641.1470
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000641.1470.fna -queryname NZ_VIRE010000641.1470
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000641.1470.fna -queryname NZ_VIRE010000641.1470
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000721.1471.fna -queryname NZ_VIRE010000721.1471
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000721.1471.fna -queryname NZ_VIRE010000721.1471
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000721.1471.fna -queryname NZ_VIRE010000721.1471
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000711.1472.fna -queryname NZ_VIRE010000711.1472
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000711.1472.fna -queryname NZ_VIRE010000711.1472
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000711.1472.fna -queryname NZ_VIRE010000711.1472
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001331.1473.fna -queryname NZ_VIRE010001331.1473
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001331.1473.fna -queryname NZ_VIRE010001331.1473
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001331.1473.fna -queryname NZ_VIRE010001331.1473
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000101.1474.fna -queryname NZ_VIRE010000101.1474
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000101.1474.fna -queryname NZ_VIRE010000101.1474
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000101.1474.fna -queryname NZ_VIRE010000101.1474
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000951.1475.fna -queryname NZ_VIRE010000951.1475
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000951.1475.fna -queryname NZ_VIRE010000951.1475
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000951.1475.fna -queryname NZ_VIRE010000951.1475
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000221.1476.fna -queryname NZ_VIRE010000221.1476
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000221.1476.fna -queryname NZ_VIRE010000221.1476
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000221.1476.fna -queryname NZ_VIRE010000221.1476
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000341.1477.fna -queryname NZ_VIRE010000341.1477
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000341.1477.fna -queryname NZ_VIRE010000341.1477
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000341.1477.fna -queryname NZ_VIRE010000341.1477
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000631.1478.fna -queryname NZ_VIRE010000631.1478
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000631.1478.fna -queryname NZ_VIRE010000631.1478
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000631.1478.fna -queryname NZ_VIRE010000631.1478
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000011.147.fna -queryname NZ_BAIW010000011.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000011.147.fna -queryname NZ_BAIW010000011.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000011.147.fna -queryname NZ_BAIW010000011.147
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000061.1479.fna -queryname NZ_VIRE010000061.1479
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000061.1479.fna -queryname NZ_VIRE010000061.1479
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000061.1479.fna -queryname NZ_VIRE010000061.1479
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000751.1480.fna -queryname NZ_VIRE010000751.1480
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000751.1480.fna -queryname NZ_VIRE010000751.1480
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000751.1480.fna -queryname NZ_VIRE010000751.1480
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000571.1481.fna -queryname NZ_VIRE010000571.1481
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000571.1481.fna -queryname NZ_VIRE010000571.1481
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000571.1481.fna -queryname NZ_VIRE010000571.1481
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000501.1482.fna -queryname NZ_VIRE010000501.1482
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000501.1482.fna -queryname NZ_VIRE010000501.1482
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000501.1482.fna -queryname NZ_VIRE010000501.1482
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001061.1483.fna -queryname NZ_VIRE010001061.1483
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001061.1483.fna -queryname NZ_VIRE010001061.1483
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001061.1483.fna -queryname NZ_VIRE010001061.1483
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000871.1484.fna -queryname NZ_VIRE010000871.1484
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000871.1484.fna -queryname NZ_VIRE010000871.1484
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000871.1484.fna -queryname NZ_VIRE010000871.1484
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001071.1485.fna -queryname NZ_VIRE010001071.1485
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001071.1485.fna -queryname NZ_VIRE010001071.1485
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001071.1485.fna -queryname NZ_VIRE010001071.1485
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001001.1486.fna -queryname NZ_VIRE010001001.1486
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001001.1486.fna -queryname NZ_VIRE010001001.1486
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001001.1486.fna -queryname NZ_VIRE010001001.1486
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001021.1487.fna -queryname NZ_VIRE010001021.1487
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001021.1487.fna -queryname NZ_VIRE010001021.1487
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001021.1487.fna -queryname NZ_VIRE010001021.1487
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000031.1488.fna -queryname NZ_VIRE010000031.1488
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000031.1488.fna -queryname NZ_VIRE010000031.1488
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000031.1488.fna -queryname NZ_VIRE010000031.1488
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000491.148.fna -queryname NZ_BAIW010000491.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000491.148.fna -queryname NZ_BAIW010000491.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000491.148.fna -queryname NZ_BAIW010000491.148
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001271.1489.fna -queryname NZ_VIRE010001271.1489
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001271.1489.fna -queryname NZ_VIRE010001271.1489
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001271.1489.fna -queryname NZ_VIRE010001271.1489
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001051.1490.fna -queryname NZ_VIRE010001051.1490
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001051.1490.fna -queryname NZ_VIRE010001051.1490
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001051.1490.fna -queryname NZ_VIRE010001051.1490
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000731.1491.fna -queryname NZ_VIRE010000731.1491
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000731.1491.fna -queryname NZ_VIRE010000731.1491
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000731.1491.fna -queryname NZ_VIRE010000731.1491
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000451.1492.fna -queryname NZ_VIRE010000451.1492
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000451.1492.fna -queryname NZ_VIRE010000451.1492
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000451.1492.fna -queryname NZ_VIRE010000451.1492
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000411.1493.fna -queryname NZ_VIRE010000411.1493
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000411.1493.fna -queryname NZ_VIRE010000411.1493
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000411.1493.fna -queryname NZ_VIRE010000411.1493
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000911.1494.fna -queryname NZ_VIRE010000911.1494
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000911.1494.fna -queryname NZ_VIRE010000911.1494
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000911.1494.fna -queryname NZ_VIRE010000911.1494
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000651.1495.fna -queryname NZ_VIRE010000651.1495
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000651.1495.fna -queryname NZ_VIRE010000651.1495
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000651.1495.fna -queryname NZ_VIRE010000651.1495
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000611.1496.fna -queryname NZ_VIRE010000611.1496
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000611.1496.fna -queryname NZ_VIRE010000611.1496
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000611.1496.fna -queryname NZ_VIRE010000611.1496
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001121.1497.fna -queryname NZ_VIRE010001121.1497
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001121.1497.fna -queryname NZ_VIRE010001121.1497
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001121.1497.fna -queryname NZ_VIRE010001121.1497
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000071.1498.fna -queryname NZ_VIRE010000071.1498
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000071.1498.fna -queryname NZ_VIRE010000071.1498
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000071.1498.fna -queryname NZ_VIRE010000071.1498
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001411.14.fna -queryname NZ_BAIW010001411.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001411.14.fna -queryname NZ_BAIW010001411.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001411.14.fna -queryname NZ_BAIW010001411.14
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001561.149.fna -queryname NZ_BAIW010001561.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001561.149.fna -queryname NZ_BAIW010001561.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001561.149.fna -queryname NZ_BAIW010001561.149
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000361.1499.fna -queryname NZ_VIRE010000361.1499
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000361.1499.fna -queryname NZ_VIRE010000361.1499
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000361.1499.fna -queryname NZ_VIRE010000361.1499
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000851.1500.fna -queryname NZ_VIRE010000851.1500
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000851.1500.fna -queryname NZ_VIRE010000851.1500
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000851.1500.fna -queryname NZ_VIRE010000851.1500
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000491.1501.fna -queryname NZ_VIRE010000491.1501
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000491.1501.fna -queryname NZ_VIRE010000491.1501
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000491.1501.fna -queryname NZ_VIRE010000491.1501
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000581.1502.fna -queryname NZ_VIRE010000581.1502
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000581.1502.fna -queryname NZ_VIRE010000581.1502
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000581.1502.fna -queryname NZ_VIRE010000581.1502
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001301.1503.fna -queryname NZ_VIRE010001301.1503
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001301.1503.fna -queryname NZ_VIRE010001301.1503
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001301.1503.fna -queryname NZ_VIRE010001301.1503
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001361.1504.fna -queryname NZ_VIRE010001361.1504
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001361.1504.fna -queryname NZ_VIRE010001361.1504
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001361.1504.fna -queryname NZ_VIRE010001361.1504
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000431.1505.fna -queryname NZ_VIRE010000431.1505
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000431.1505.fna -queryname NZ_VIRE010000431.1505
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000431.1505.fna -queryname NZ_VIRE010000431.1505
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000051.1506.fna -queryname NZ_VIRE010000051.1506
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000051.1506.fna -queryname NZ_VIRE010000051.1506
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000051.1506.fna -queryname NZ_VIRE010000051.1506
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000881.1507.fna -queryname NZ_VIRE010000881.1507
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000881.1507.fna -queryname NZ_VIRE010000881.1507
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000881.1507.fna -queryname NZ_VIRE010000881.1507
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000141.1508.fna -queryname NZ_VIRE010000141.1508
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000141.1508.fna -queryname NZ_VIRE010000141.1508
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000141.1508.fna -queryname NZ_VIRE010000141.1508
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001351.150.fna -queryname NZ_BAIW010001351.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001351.150.fna -queryname NZ_BAIW010001351.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001351.150.fna -queryname NZ_BAIW010001351.150
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001391.1509.fna -queryname NZ_VIRE010001391.1509
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001391.1509.fna -queryname NZ_VIRE010001391.1509
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001391.1509.fna -queryname NZ_VIRE010001391.1509
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000761.1510.fna -queryname NZ_VIRE010000761.1510
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000761.1510.fna -queryname NZ_VIRE010000761.1510
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000761.1510.fna -queryname NZ_VIRE010000761.1510
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000821.1511.fna -queryname NZ_VIRE010000821.1511
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000821.1511.fna -queryname NZ_VIRE010000821.1511
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000821.1511.fna -queryname NZ_VIRE010000821.1511
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001321.1512.fna -queryname NZ_VIRE010001321.1512
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001321.1512.fna -queryname NZ_VIRE010001321.1512
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010001321.1512.fna -queryname NZ_VIRE010001321.1512
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000891.1513.fna -queryname NZ_VIRE010000891.1513
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000891.1513.fna -queryname NZ_VIRE010000891.1513
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_VIRE010000891.1513.fna -queryname NZ_VIRE010000891.1513
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000321.1514.fna -queryname NZ_BLLS010000321.1514
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000321.1514.fna -queryname NZ_BLLS010000321.1514
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000321.1514.fna -queryname NZ_BLLS010000321.1514
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001711.1515.fna -queryname NZ_BLLS010001711.1515
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001711.1515.fna -queryname NZ_BLLS010001711.1515
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001711.1515.fna -queryname NZ_BLLS010001711.1515
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001301.1516.fna -queryname NZ_BLLS010001301.1516
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001301.1516.fna -queryname NZ_BLLS010001301.1516
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001301.1516.fna -queryname NZ_BLLS010001301.1516
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002381.1517.fna -queryname NZ_BLLS010002381.1517
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002381.1517.fna -queryname NZ_BLLS010002381.1517
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002381.1517.fna -queryname NZ_BLLS010002381.1517
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001281.1518.fna -queryname NZ_BLLS010001281.1518
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001281.1518.fna -queryname NZ_BLLS010001281.1518
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001281.1518.fna -queryname NZ_BLLS010001281.1518
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001331.151.fna -queryname NZ_BAIW010001331.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001331.151.fna -queryname NZ_BAIW010001331.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001331.151.fna -queryname NZ_BAIW010001331.151
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000571.1519.fna -queryname NZ_BLLS010000571.1519
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000571.1519.fna -queryname NZ_BLLS010000571.1519
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000571.1519.fna -queryname NZ_BLLS010000571.1519
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000151.1520.fna -queryname NZ_BLLS010000151.1520
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000151.1520.fna -queryname NZ_BLLS010000151.1520
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000151.1520.fna -queryname NZ_BLLS010000151.1520
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002341.1521.fna -queryname NZ_BLLS010002341.1521
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002341.1521.fna -queryname NZ_BLLS010002341.1521
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002341.1521.fna -queryname NZ_BLLS010002341.1521
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002031.1522.fna -queryname NZ_BLLS010002031.1522
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002031.1522.fna -queryname NZ_BLLS010002031.1522
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002031.1522.fna -queryname NZ_BLLS010002031.1522
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001831.1523.fna -queryname NZ_BLLS010001831.1523
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001831.1523.fna -queryname NZ_BLLS010001831.1523
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001831.1523.fna -queryname NZ_BLLS010001831.1523
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001901.1524.fna -queryname NZ_BLLS010001901.1524
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001901.1524.fna -queryname NZ_BLLS010001901.1524
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001901.1524.fna -queryname NZ_BLLS010001901.1524
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000121.1525.fna -queryname NZ_BLLS010000121.1525
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000121.1525.fna -queryname NZ_BLLS010000121.1525
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000121.1525.fna -queryname NZ_BLLS010000121.1525
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002111.1526.fna -queryname NZ_BLLS010002111.1526
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002111.1526.fna -queryname NZ_BLLS010002111.1526
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002111.1526.fna -queryname NZ_BLLS010002111.1526
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000991.1527.fna -queryname NZ_BLLS010000991.1527
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000991.1527.fna -queryname NZ_BLLS010000991.1527
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000991.1527.fna -queryname NZ_BLLS010000991.1527
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001931.1528.fna -queryname NZ_BLLS010001931.1528
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001931.1528.fna -queryname NZ_BLLS010001931.1528
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001931.1528.fna -queryname NZ_BLLS010001931.1528
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000451.152.fna -queryname NZ_BAIW010000451.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000451.152.fna -queryname NZ_BAIW010000451.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000451.152.fna -queryname NZ_BAIW010000451.152
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001881.1529.fna -queryname NZ_BLLS010001881.1529
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001881.1529.fna -queryname NZ_BLLS010001881.1529
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001881.1529.fna -queryname NZ_BLLS010001881.1529
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001251.1530.fna -queryname NZ_BLLS010001251.1530
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001251.1530.fna -queryname NZ_BLLS010001251.1530
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001251.1530.fna -queryname NZ_BLLS010001251.1530
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000691.1531.fna -queryname NZ_BLLS010000691.1531
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000691.1531.fna -queryname NZ_BLLS010000691.1531
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000691.1531.fna -queryname NZ_BLLS010000691.1531
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002181.1532.fna -queryname NZ_BLLS010002181.1532
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002181.1532.fna -queryname NZ_BLLS010002181.1532
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002181.1532.fna -queryname NZ_BLLS010002181.1532
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000361.1533.fna -queryname NZ_BLLS010000361.1533
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000361.1533.fna -queryname NZ_BLLS010000361.1533
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000361.1533.fna -queryname NZ_BLLS010000361.1533
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000041.1534.fna -queryname NZ_BLLS010000041.1534
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000041.1534.fna -queryname NZ_BLLS010000041.1534
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000041.1534.fna -queryname NZ_BLLS010000041.1534
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000931.1535.fna -queryname NZ_BLLS010000931.1535
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000931.1535.fna -queryname NZ_BLLS010000931.1535
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000931.1535.fna -queryname NZ_BLLS010000931.1535
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001551.1536.fna -queryname NZ_BLLS010001551.1536
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001551.1536.fna -queryname NZ_BLLS010001551.1536
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001551.1536.fna -queryname NZ_BLLS010001551.1536
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001521.1537.fna -queryname NZ_BLLS010001521.1537
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001521.1537.fna -queryname NZ_BLLS010001521.1537
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001521.1537.fna -queryname NZ_BLLS010001521.1537
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002441.1538.fna -queryname NZ_BLLS010002441.1538
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002441.1538.fna -queryname NZ_BLLS010002441.1538
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002441.1538.fna -queryname NZ_BLLS010002441.1538
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001241.153.fna -queryname NZ_BAIW010001241.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001241.153.fna -queryname NZ_BAIW010001241.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001241.153.fna -queryname NZ_BAIW010001241.153
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002071.1539.fna -queryname NZ_BLLS010002071.1539
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002071.1539.fna -queryname NZ_BLLS010002071.1539
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002071.1539.fna -queryname NZ_BLLS010002071.1539
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002361.1540.fna -queryname NZ_BLLS010002361.1540
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002361.1540.fna -queryname NZ_BLLS010002361.1540
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002361.1540.fna -queryname NZ_BLLS010002361.1540
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001541.1541.fna -queryname NZ_BLLS010001541.1541
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001541.1541.fna -queryname NZ_BLLS010001541.1541
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001541.1541.fna -queryname NZ_BLLS010001541.1541
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000861.1542.fna -queryname NZ_BLLS010000861.1542
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000861.1542.fna -queryname NZ_BLLS010000861.1542
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000861.1542.fna -queryname NZ_BLLS010000861.1542
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000201.1543.fna -queryname NZ_BLLS010000201.1543
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000201.1543.fna -queryname NZ_BLLS010000201.1543
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000201.1543.fna -queryname NZ_BLLS010000201.1543
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000951.1544.fna -queryname NZ_BLLS010000951.1544
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000951.1544.fna -queryname NZ_BLLS010000951.1544
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000951.1544.fna -queryname NZ_BLLS010000951.1544
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001571.1545.fna -queryname NZ_BLLS010001571.1545
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001571.1545.fna -queryname NZ_BLLS010001571.1545
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001571.1545.fna -queryname NZ_BLLS010001571.1545
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000301.1546.fna -queryname NZ_BLLS010000301.1546
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000301.1546.fna -queryname NZ_BLLS010000301.1546
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000301.1546.fna -queryname NZ_BLLS010000301.1546
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000051.1547.fna -queryname NZ_BLLS010000051.1547
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000051.1547.fna -queryname NZ_BLLS010000051.1547
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000051.1547.fna -queryname NZ_BLLS010000051.1547
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002161.1548.fna -queryname NZ_BLLS010002161.1548
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002161.1548.fna -queryname NZ_BLLS010002161.1548
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002161.1548.fna -queryname NZ_BLLS010002161.1548
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001281.154.fna -queryname NZ_BAIW010001281.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001281.154.fna -queryname NZ_BAIW010001281.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001281.154.fna -queryname NZ_BAIW010001281.154
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000131.1549.fna -queryname NZ_BLLS010000131.1549
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000131.1549.fna -queryname NZ_BLLS010000131.1549
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000131.1549.fna -queryname NZ_BLLS010000131.1549
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001121.1550.fna -queryname NZ_BLLS010001121.1550
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001121.1550.fna -queryname NZ_BLLS010001121.1550
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001121.1550.fna -queryname NZ_BLLS010001121.1550
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001331.1551.fna -queryname NZ_BLLS010001331.1551
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001331.1551.fna -queryname NZ_BLLS010001331.1551
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001331.1551.fna -queryname NZ_BLLS010001331.1551
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002261.1552.fna -queryname NZ_BLLS010002261.1552
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002261.1552.fna -queryname NZ_BLLS010002261.1552
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002261.1552.fna -queryname NZ_BLLS010002261.1552
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002011.1553.fna -queryname NZ_BLLS010002011.1553
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002011.1553.fna -queryname NZ_BLLS010002011.1553
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002011.1553.fna -queryname NZ_BLLS010002011.1553
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002141.1554.fna -queryname NZ_BLLS010002141.1554
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002141.1554.fna -queryname NZ_BLLS010002141.1554
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002141.1554.fna -queryname NZ_BLLS010002141.1554
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002391.1555.fna -queryname NZ_BLLS010002391.1555
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002391.1555.fna -queryname NZ_BLLS010002391.1555
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002391.1555.fna -queryname NZ_BLLS010002391.1555
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000411.1556.fna -queryname NZ_BLLS010000411.1556
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000411.1556.fna -queryname NZ_BLLS010000411.1556
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000411.1556.fna -queryname NZ_BLLS010000411.1556
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000191.1557.fna -queryname NZ_BLLS010000191.1557
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000191.1557.fna -queryname NZ_BLLS010000191.1557
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000191.1557.fna -queryname NZ_BLLS010000191.1557
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002211.1558.fna -queryname NZ_BLLS010002211.1558
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002211.1558.fna -queryname NZ_BLLS010002211.1558
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002211.1558.fna -queryname NZ_BLLS010002211.1558
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000771.155.fna -queryname NZ_BAIW010000771.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000771.155.fna -queryname NZ_BAIW010000771.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000771.155.fna -queryname NZ_BAIW010000771.155
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001381.1559.fna -queryname NZ_BLLS010001381.1559
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001381.1559.fna -queryname NZ_BLLS010001381.1559
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001381.1559.fna -queryname NZ_BLLS010001381.1559
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000541.1560.fna -queryname NZ_BLLS010000541.1560
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000541.1560.fna -queryname NZ_BLLS010000541.1560
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000541.1560.fna -queryname NZ_BLLS010000541.1560
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001681.1561.fna -queryname NZ_BLLS010001681.1561
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001681.1561.fna -queryname NZ_BLLS010001681.1561
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001681.1561.fna -queryname NZ_BLLS010001681.1561
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002351.1562.fna -queryname NZ_BLLS010002351.1562
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002351.1562.fna -queryname NZ_BLLS010002351.1562
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002351.1562.fna -queryname NZ_BLLS010002351.1562
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002371.1563.fna -queryname NZ_BLLS010002371.1563
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002371.1563.fna -queryname NZ_BLLS010002371.1563
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002371.1563.fna -queryname NZ_BLLS010002371.1563
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000461.1564.fna -queryname NZ_BLLS010000461.1564
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000461.1564.fna -queryname NZ_BLLS010000461.1564
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000461.1564.fna -queryname NZ_BLLS010000461.1564
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000921.1565.fna -queryname NZ_BLLS010000921.1565
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000921.1565.fna -queryname NZ_BLLS010000921.1565
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000921.1565.fna -queryname NZ_BLLS010000921.1565
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002151.1566.fna -queryname NZ_BLLS010002151.1566
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002151.1566.fna -queryname NZ_BLLS010002151.1566
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002151.1566.fna -queryname NZ_BLLS010002151.1566
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001511.1567.fna -queryname NZ_BLLS010001511.1567
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001511.1567.fna -queryname NZ_BLLS010001511.1567
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001511.1567.fna -queryname NZ_BLLS010001511.1567
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001671.1568.fna -queryname NZ_BLLS010001671.1568
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001671.1568.fna -queryname NZ_BLLS010001671.1568
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001671.1568.fna -queryname NZ_BLLS010001671.1568
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000211.156.fna -queryname NZ_BAIW010000211.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000211.156.fna -queryname NZ_BAIW010000211.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000211.156.fna -queryname NZ_BAIW010000211.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000211.156.AOI.fna -queryname NZ_BAIW010000211.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000211.156.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000211.156.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_BAIW010000211.156
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_BAIW010000211.156.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001811.1569.fna -queryname NZ_BLLS010001811.1569
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001811.1569.fna -queryname NZ_BLLS010001811.1569
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001811.1569.fna -queryname NZ_BLLS010001811.1569
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000801.1570.fna -queryname NZ_BLLS010000801.1570
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000801.1570.fna -queryname NZ_BLLS010000801.1570
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000801.1570.fna -queryname NZ_BLLS010000801.1570
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002201.1571.fna -queryname NZ_BLLS010002201.1571
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002201.1571.fna -queryname NZ_BLLS010002201.1571
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002201.1571.fna -queryname NZ_BLLS010002201.1571
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001951.1572.fna -queryname NZ_BLLS010001951.1572
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001951.1572.fna -queryname NZ_BLLS010001951.1572
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001951.1572.fna -queryname NZ_BLLS010001951.1572
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000281.1573.fna -queryname NZ_BLLS010000281.1573
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000281.1573.fna -queryname NZ_BLLS010000281.1573
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000281.1573.fna -queryname NZ_BLLS010000281.1573
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000781.1574.fna -queryname NZ_BLLS010000781.1574
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000781.1574.fna -queryname NZ_BLLS010000781.1574
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000781.1574.fna -queryname NZ_BLLS010000781.1574
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000381.1575.fna -queryname NZ_BLLS010000381.1575
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000381.1575.fna -queryname NZ_BLLS010000381.1575
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000381.1575.fna -queryname NZ_BLLS010000381.1575
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000501.1576.fna -queryname NZ_BLLS010000501.1576
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000501.1576.fna -queryname NZ_BLLS010000501.1576
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000501.1576.fna -queryname NZ_BLLS010000501.1576
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000401.1577.fna -queryname NZ_BLLS010000401.1577
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000401.1577.fna -queryname NZ_BLLS010000401.1577
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000401.1577.fna -queryname NZ_BLLS010000401.1577
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000061.1578.fna -queryname NZ_BLLS010000061.1578
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000061.1578.fna -queryname NZ_BLLS010000061.1578
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000061.1578.fna -queryname NZ_BLLS010000061.1578
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001221.157.fna -queryname NZ_BAIW010001221.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001221.157.fna -queryname NZ_BAIW010001221.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001221.157.fna -queryname NZ_BAIW010001221.157
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001271.1579.fna -queryname NZ_BLLS010001271.1579
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001271.1579.fna -queryname NZ_BLLS010001271.1579
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001271.1579.fna -queryname NZ_BLLS010001271.1579
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000521.1580.fna -queryname NZ_BLLS010000521.1580
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000521.1580.fna -queryname NZ_BLLS010000521.1580
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000521.1580.fna -queryname NZ_BLLS010000521.1580
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000601.1581.fna -queryname NZ_BLLS010000601.1581
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000601.1581.fna -queryname NZ_BLLS010000601.1581
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000601.1581.fna -queryname NZ_BLLS010000601.1581
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001311.1582.fna -queryname NZ_BLLS010001311.1582
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001311.1582.fna -queryname NZ_BLLS010001311.1582
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001311.1582.fna -queryname NZ_BLLS010001311.1582
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001741.1583.fna -queryname NZ_BLLS010001741.1583
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001741.1583.fna -queryname NZ_BLLS010001741.1583
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001741.1583.fna -queryname NZ_BLLS010001741.1583
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001561.1584.fna -queryname NZ_BLLS010001561.1584
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001561.1584.fna -queryname NZ_BLLS010001561.1584
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001561.1584.fna -queryname NZ_BLLS010001561.1584
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000311.1585.fna -queryname NZ_BLLS010000311.1585
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000311.1585.fna -queryname NZ_BLLS010000311.1585
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000311.1585.fna -queryname NZ_BLLS010000311.1585
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001781.1586.fna -queryname NZ_BLLS010001781.1586
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001781.1586.fna -queryname NZ_BLLS010001781.1586
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001781.1586.fna -queryname NZ_BLLS010001781.1586
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001961.1587.fna -queryname NZ_BLLS010001961.1587
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001961.1587.fna -queryname NZ_BLLS010001961.1587
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001961.1587.fna -queryname NZ_BLLS010001961.1587
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000771.1588.fna -queryname NZ_BLLS010000771.1588
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000771.1588.fna -queryname NZ_BLLS010000771.1588
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000771.1588.fna -queryname NZ_BLLS010000771.1588
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001041.158.fna -queryname NZ_BAIW010001041.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001041.158.fna -queryname NZ_BAIW010001041.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001041.158.fna -queryname NZ_BAIW010001041.158
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000431.1589.fna -queryname NZ_BLLS010000431.1589
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000431.1589.fna -queryname NZ_BLLS010000431.1589
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000431.1589.fna -queryname NZ_BLLS010000431.1589
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001451.1590.fna -queryname NZ_BLLS010001451.1590
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001451.1590.fna -queryname NZ_BLLS010001451.1590
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001451.1590.fna -queryname NZ_BLLS010001451.1590
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001401.1591.fna -queryname NZ_BLLS010001401.1591
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001401.1591.fna -queryname NZ_BLLS010001401.1591
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001401.1591.fna -queryname NZ_BLLS010001401.1591
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000791.1592.fna -queryname NZ_BLLS010000791.1592
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000791.1592.fna -queryname NZ_BLLS010000791.1592
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000791.1592.fna -queryname NZ_BLLS010000791.1592
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001611.1593.fna -queryname NZ_BLLS010001611.1593
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001611.1593.fna -queryname NZ_BLLS010001611.1593
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001611.1593.fna -queryname NZ_BLLS010001611.1593
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001701.1594.fna -queryname NZ_BLLS010001701.1594
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001701.1594.fna -queryname NZ_BLLS010001701.1594
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001701.1594.fna -queryname NZ_BLLS010001701.1594
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000101.1595.fna -queryname NZ_BLLS010000101.1595
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000101.1595.fna -queryname NZ_BLLS010000101.1595
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000101.1595.fna -queryname NZ_BLLS010000101.1595
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000511.1596.fna -queryname NZ_BLLS010000511.1596
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000511.1596.fna -queryname NZ_BLLS010000511.1596
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000511.1596.fna -queryname NZ_BLLS010000511.1596
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000251.1597.fna -queryname NZ_BLLS010000251.1597
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000251.1597.fna -queryname NZ_BLLS010000251.1597
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000251.1597.fna -queryname NZ_BLLS010000251.1597
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000181.1598.fna -queryname NZ_BLLS010000181.1598
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000181.1598.fna -queryname NZ_BLLS010000181.1598
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000181.1598.fna -queryname NZ_BLLS010000181.1598
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001711.15.fna -queryname NZ_BAIW010001711.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001711.15.fna -queryname NZ_BAIW010001711.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001711.15.fna -queryname NZ_BAIW010001711.15
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000631.159.fna -queryname NZ_BAIW010000631.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000631.159.fna -queryname NZ_BAIW010000631.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000631.159.fna -queryname NZ_BAIW010000631.159
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001721.1599.fna -queryname NZ_BLLS010001721.1599
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001721.1599.fna -queryname NZ_BLLS010001721.1599
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001721.1599.fna -queryname NZ_BLLS010001721.1599
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000841.1600.fna -queryname NZ_BLLS010000841.1600
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000841.1600.fna -queryname NZ_BLLS010000841.1600
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000841.1600.fna -queryname NZ_BLLS010000841.1600
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000451.1601.fna -queryname NZ_BLLS010000451.1601
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000451.1601.fna -queryname NZ_BLLS010000451.1601
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000451.1601.fna -queryname NZ_BLLS010000451.1601
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000651.1602.fna -queryname NZ_BLLS010000651.1602
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000651.1602.fna -queryname NZ_BLLS010000651.1602
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000651.1602.fna -queryname NZ_BLLS010000651.1602
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001621.1603.fna -queryname NZ_BLLS010001621.1603
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001621.1603.fna -queryname NZ_BLLS010001621.1603
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001621.1603.fna -queryname NZ_BLLS010001621.1603
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001221.1604.fna -queryname NZ_BLLS010001221.1604
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001221.1604.fna -queryname NZ_BLLS010001221.1604
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001221.1604.fna -queryname NZ_BLLS010001221.1604
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000811.1605.fna -queryname NZ_BLLS010000811.1605
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000811.1605.fna -queryname NZ_BLLS010000811.1605
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000811.1605.fna -queryname NZ_BLLS010000811.1605
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002221.1606.fna -queryname NZ_BLLS010002221.1606
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002221.1606.fna -queryname NZ_BLLS010002221.1606
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002221.1606.fna -queryname NZ_BLLS010002221.1606
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001851.1607.fna -queryname NZ_BLLS010001851.1607
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001851.1607.fna -queryname NZ_BLLS010001851.1607
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001851.1607.fna -queryname NZ_BLLS010001851.1607
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001991.1608.fna -queryname NZ_BLLS010001991.1608
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001991.1608.fna -queryname NZ_BLLS010001991.1608
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001991.1608.fna -queryname NZ_BLLS010001991.1608
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001501.160.fna -queryname NZ_BAIW010001501.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001501.160.fna -queryname NZ_BAIW010001501.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001501.160.fna -queryname NZ_BAIW010001501.160
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000741.1609.fna -queryname NZ_BLLS010000741.1609
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000741.1609.fna -queryname NZ_BLLS010000741.1609
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000741.1609.fna -queryname NZ_BLLS010000741.1609
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002281.1610.fna -queryname NZ_BLLS010002281.1610
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002281.1610.fna -queryname NZ_BLLS010002281.1610
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002281.1610.fna -queryname NZ_BLLS010002281.1610
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001481.1611.fna -queryname NZ_BLLS010001481.1611
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001481.1611.fna -queryname NZ_BLLS010001481.1611
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001481.1611.fna -queryname NZ_BLLS010001481.1611
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001321.1612.fna -queryname NZ_BLLS010001321.1612
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001321.1612.fna -queryname NZ_BLLS010001321.1612
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001321.1612.fna -queryname NZ_BLLS010001321.1612
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001921.1613.fna -queryname NZ_BLLS010001921.1613
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001921.1613.fna -queryname NZ_BLLS010001921.1613
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001921.1613.fna -queryname NZ_BLLS010001921.1613
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000821.1614.fna -queryname NZ_BLLS010000821.1614
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000821.1614.fna -queryname NZ_BLLS010000821.1614
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000821.1614.fna -queryname NZ_BLLS010000821.1614
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001191.1615.fna -queryname NZ_BLLS010001191.1615
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001191.1615.fna -queryname NZ_BLLS010001191.1615
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001191.1615.fna -queryname NZ_BLLS010001191.1615
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000631.1616.fna -queryname NZ_BLLS010000631.1616
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000631.1616.fna -queryname NZ_BLLS010000631.1616
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000631.1616.fna -queryname NZ_BLLS010000631.1616
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000391.1617.fna -queryname NZ_BLLS010000391.1617
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000391.1617.fna -queryname NZ_BLLS010000391.1617
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000391.1617.fna -queryname NZ_BLLS010000391.1617
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001021.1618.fna -queryname NZ_BLLS010001021.1618
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001021.1618.fna -queryname NZ_BLLS010001021.1618
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001021.1618.fna -queryname NZ_BLLS010001021.1618
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000361.161.fna -queryname NZ_BAIW010000361.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000361.161.fna -queryname NZ_BAIW010000361.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000361.161.fna -queryname NZ_BAIW010000361.161
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001861.1619.fna -queryname NZ_BLLS010001861.1619
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001861.1619.fna -queryname NZ_BLLS010001861.1619
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001861.1619.fna -queryname NZ_BLLS010001861.1619
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002401.1620.fna -queryname NZ_BLLS010002401.1620
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002401.1620.fna -queryname NZ_BLLS010002401.1620
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002401.1620.fna -queryname NZ_BLLS010002401.1620
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000111.1621.fna -queryname NZ_BLLS010000111.1621
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000111.1621.fna -queryname NZ_BLLS010000111.1621
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000111.1621.fna -queryname NZ_BLLS010000111.1621
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001291.1622.fna -queryname NZ_BLLS010001291.1622
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001291.1622.fna -queryname NZ_BLLS010001291.1622
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001291.1622.fna -queryname NZ_BLLS010001291.1622
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000641.1623.fna -queryname NZ_BLLS010000641.1623
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000641.1623.fna -queryname NZ_BLLS010000641.1623
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000641.1623.fna -queryname NZ_BLLS010000641.1623
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000021.1624.fna -queryname NZ_BLLS010000021.1624
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000021.1624.fna -queryname NZ_BLLS010000021.1624
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000021.1624.fna -queryname NZ_BLLS010000021.1624
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001871.1625.fna -queryname NZ_BLLS010001871.1625
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001871.1625.fna -queryname NZ_BLLS010001871.1625
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001871.1625.fna -queryname NZ_BLLS010001871.1625
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001351.1626.fna -queryname NZ_BLLS010001351.1626
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001351.1626.fna -queryname NZ_BLLS010001351.1626
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001351.1626.fna -queryname NZ_BLLS010001351.1626
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000961.1627.fna -queryname NZ_BLLS010000961.1627
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000961.1627.fna -queryname NZ_BLLS010000961.1627
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000961.1627.fna -queryname NZ_BLLS010000961.1627
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000551.1628.fna -queryname NZ_BLLS010000551.1628
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000551.1628.fna -queryname NZ_BLLS010000551.1628
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000551.1628.fna -queryname NZ_BLLS010000551.1628
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000861.162.fna -queryname NZ_BAIW010000861.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000861.162.fna -queryname NZ_BAIW010000861.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000861.162.fna -queryname NZ_BAIW010000861.162
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002061.1629.fna -queryname NZ_BLLS010002061.1629
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002061.1629.fna -queryname NZ_BLLS010002061.1629
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002061.1629.fna -queryname NZ_BLLS010002061.1629
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002451.1630.fna -queryname NZ_BLLS010002451.1630
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002451.1630.fna -queryname NZ_BLLS010002451.1630
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002451.1630.fna -queryname NZ_BLLS010002451.1630
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000671.1631.fna -queryname NZ_BLLS010000671.1631
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000671.1631.fna -queryname NZ_BLLS010000671.1631
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000671.1631.fna -queryname NZ_BLLS010000671.1631
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000011.1632.fna -queryname NZ_BLLS010000011.1632
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000011.1632.fna -queryname NZ_BLLS010000011.1632
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000011.1632.fna -queryname NZ_BLLS010000011.1632
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000871.1633.fna -queryname NZ_BLLS010000871.1633
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000871.1633.fna -queryname NZ_BLLS010000871.1633
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000871.1633.fna -queryname NZ_BLLS010000871.1633
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000171.1634.fna -queryname NZ_BLLS010000171.1634
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000171.1634.fna -queryname NZ_BLLS010000171.1634
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000171.1634.fna -queryname NZ_BLLS010000171.1634
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000421.1635.fna -queryname NZ_BLLS010000421.1635
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000421.1635.fna -queryname NZ_BLLS010000421.1635
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000421.1635.fna -queryname NZ_BLLS010000421.1635
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001941.1636.fna -queryname NZ_BLLS010001941.1636
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001941.1636.fna -queryname NZ_BLLS010001941.1636
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001941.1636.fna -queryname NZ_BLLS010001941.1636
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001391.1637.fna -queryname NZ_BLLS010001391.1637
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001391.1637.fna -queryname NZ_BLLS010001391.1637
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001391.1637.fna -queryname NZ_BLLS010001391.1637
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001841.1638.fna -queryname NZ_BLLS010001841.1638
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001841.1638.fna -queryname NZ_BLLS010001841.1638
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001841.1638.fna -queryname NZ_BLLS010001841.1638
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000761.163.fna -queryname NZ_BAIW010000761.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000761.163.fna -queryname NZ_BAIW010000761.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000761.163.fna -queryname NZ_BAIW010000761.163
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001491.1639.fna -queryname NZ_BLLS010001491.1639
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001491.1639.fna -queryname NZ_BLLS010001491.1639
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001491.1639.fna -queryname NZ_BLLS010001491.1639
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000091.1640.fna -queryname NZ_BLLS010000091.1640
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000091.1640.fna -queryname NZ_BLLS010000091.1640
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000091.1640.fna -queryname NZ_BLLS010000091.1640
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002041.1641.fna -queryname NZ_BLLS010002041.1641
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002041.1641.fna -queryname NZ_BLLS010002041.1641
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002041.1641.fna -queryname NZ_BLLS010002041.1641
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000941.1642.fna -queryname NZ_BLLS010000941.1642
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000941.1642.fna -queryname NZ_BLLS010000941.1642
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000941.1642.fna -queryname NZ_BLLS010000941.1642
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002171.1643.fna -queryname NZ_BLLS010002171.1643
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002171.1643.fna -queryname NZ_BLLS010002171.1643
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002171.1643.fna -queryname NZ_BLLS010002171.1643
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000711.1644.fna -queryname NZ_BLLS010000711.1644
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000711.1644.fna -queryname NZ_BLLS010000711.1644
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000711.1644.fna -queryname NZ_BLLS010000711.1644
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002421.1645.fna -queryname NZ_BLLS010002421.1645
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002421.1645.fna -queryname NZ_BLLS010002421.1645
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002421.1645.fna -queryname NZ_BLLS010002421.1645
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000621.1646.fna -queryname NZ_BLLS010000621.1646
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000621.1646.fna -queryname NZ_BLLS010000621.1646
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000621.1646.fna -queryname NZ_BLLS010000621.1646
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000491.1647.fna -queryname NZ_BLLS010000491.1647
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000491.1647.fna -queryname NZ_BLLS010000491.1647
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000491.1647.fna -queryname NZ_BLLS010000491.1647
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000351.1648.fna -queryname NZ_BLLS010000351.1648
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000351.1648.fna -queryname NZ_BLLS010000351.1648
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000351.1648.fna -queryname NZ_BLLS010000351.1648
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000411.164.fna -queryname NZ_BAIW010000411.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000411.164.fna -queryname NZ_BAIW010000411.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000411.164.fna -queryname NZ_BAIW010000411.164
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000241.1649.fna -queryname NZ_BLLS010000241.1649
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000241.1649.fna -queryname NZ_BLLS010000241.1649
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000241.1649.fna -queryname NZ_BLLS010000241.1649
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001431.1650.fna -queryname NZ_BLLS010001431.1650
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001431.1650.fna -queryname NZ_BLLS010001431.1650
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001431.1650.fna -queryname NZ_BLLS010001431.1650
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001091.1651.fna -queryname NZ_BLLS010001091.1651
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001091.1651.fna -queryname NZ_BLLS010001091.1651
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001091.1651.fna -queryname NZ_BLLS010001091.1651
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001371.1652.fna -queryname NZ_BLLS010001371.1652
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001371.1652.fna -queryname NZ_BLLS010001371.1652
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001371.1652.fna -queryname NZ_BLLS010001371.1652
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001801.1653.fna -queryname NZ_BLLS010001801.1653
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001801.1653.fna -queryname NZ_BLLS010001801.1653
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001801.1653.fna -queryname NZ_BLLS010001801.1653
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000981.1654.fna -queryname NZ_BLLS010000981.1654
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000981.1654.fna -queryname NZ_BLLS010000981.1654
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000981.1654.fna -queryname NZ_BLLS010000981.1654
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002321.1655.fna -queryname NZ_BLLS010002321.1655
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002321.1655.fna -queryname NZ_BLLS010002321.1655
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002321.1655.fna -queryname NZ_BLLS010002321.1655
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000341.1656.fna -queryname NZ_BLLS010000341.1656
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000341.1656.fna -queryname NZ_BLLS010000341.1656
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000341.1656.fna -queryname NZ_BLLS010000341.1656
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002001.1657.fna -queryname NZ_BLLS010002001.1657
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002001.1657.fna -queryname NZ_BLLS010002001.1657
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002001.1657.fna -queryname NZ_BLLS010002001.1657
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001911.1658.fna -queryname NZ_BLLS010001911.1658
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001911.1658.fna -queryname NZ_BLLS010001911.1658
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001911.1658.fna -queryname NZ_BLLS010001911.1658
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000401.165.fna -queryname NZ_BAIW010000401.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000401.165.fna -queryname NZ_BAIW010000401.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000401.165.fna -queryname NZ_BAIW010000401.165
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000911.1659.fna -queryname NZ_BLLS010000911.1659
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000911.1659.fna -queryname NZ_BLLS010000911.1659
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000911.1659.fna -queryname NZ_BLLS010000911.1659
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001651.1660.fna -queryname NZ_BLLS010001651.1660
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001651.1660.fna -queryname NZ_BLLS010001651.1660
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001651.1660.fna -queryname NZ_BLLS010001651.1660
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001771.1661.fna -queryname NZ_BLLS010001771.1661
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001771.1661.fna -queryname NZ_BLLS010001771.1661
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001771.1661.fna -queryname NZ_BLLS010001771.1661
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000901.1662.fna -queryname NZ_BLLS010000901.1662
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000901.1662.fna -queryname NZ_BLLS010000901.1662
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000901.1662.fna -queryname NZ_BLLS010000901.1662
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001661.1663.fna -queryname NZ_BLLS010001661.1663
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001661.1663.fna -queryname NZ_BLLS010001661.1663
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001661.1663.fna -queryname NZ_BLLS010001661.1663
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001661.1663.AOI.fna -queryname NZ_BLLS010001661.1663
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001661.1663.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001661.1663.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_BLLS010001661.1663
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_BLLS010001661.1663.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000971.1664.fna -queryname NZ_BLLS010000971.1664
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000971.1664.fna -queryname NZ_BLLS010000971.1664
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000971.1664.fna -queryname NZ_BLLS010000971.1664
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000721.1665.fna -queryname NZ_BLLS010000721.1665
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000721.1665.fna -queryname NZ_BLLS010000721.1665
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000721.1665.fna -queryname NZ_BLLS010000721.1665
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001041.1666.fna -queryname NZ_BLLS010001041.1666
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001041.1666.fna -queryname NZ_BLLS010001041.1666
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001041.1666.fna -queryname NZ_BLLS010001041.1666
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001641.1667.fna -queryname NZ_BLLS010001641.1667
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001641.1667.fna -queryname NZ_BLLS010001641.1667
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001641.1667.fna -queryname NZ_BLLS010001641.1667
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000231.1668.fna -queryname NZ_BLLS010000231.1668
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000231.1668.fna -queryname NZ_BLLS010000231.1668
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000231.1668.fna -queryname NZ_BLLS010000231.1668
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000961.166.fna -queryname NZ_BAIW010000961.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000961.166.fna -queryname NZ_BAIW010000961.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000961.166.fna -queryname NZ_BAIW010000961.166
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000751.1669.fna -queryname NZ_BLLS010000751.1669
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000751.1669.fna -queryname NZ_BLLS010000751.1669
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000751.1669.fna -queryname NZ_BLLS010000751.1669
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001601.1670.fna -queryname NZ_BLLS010001601.1670
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001601.1670.fna -queryname NZ_BLLS010001601.1670
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001601.1670.fna -queryname NZ_BLLS010001601.1670
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000271.1671.fna -queryname NZ_BLLS010000271.1671
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000271.1671.fna -queryname NZ_BLLS010000271.1671
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000271.1671.fna -queryname NZ_BLLS010000271.1671
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000701.1672.fna -queryname NZ_BLLS010000701.1672
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000701.1672.fna -queryname NZ_BLLS010000701.1672
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000701.1672.fna -queryname NZ_BLLS010000701.1672
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002331.1673.fna -queryname NZ_BLLS010002331.1673
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002331.1673.fna -queryname NZ_BLLS010002331.1673
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002331.1673.fna -queryname NZ_BLLS010002331.1673
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001791.1674.fna -queryname NZ_BLLS010001791.1674
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001791.1674.fna -queryname NZ_BLLS010001791.1674
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001791.1674.fna -queryname NZ_BLLS010001791.1674
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000211.1675.fna -queryname NZ_BLLS010000211.1675
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000211.1675.fna -queryname NZ_BLLS010000211.1675
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000211.1675.fna -queryname NZ_BLLS010000211.1675
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001001.1676.fna -queryname NZ_BLLS010001001.1676
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001001.1676.fna -queryname NZ_BLLS010001001.1676
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001001.1676.fna -queryname NZ_BLLS010001001.1676
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001691.1677.fna -queryname NZ_BLLS010001691.1677
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001691.1677.fna -queryname NZ_BLLS010001691.1677
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001691.1677.fna -queryname NZ_BLLS010001691.1677
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002411.1678.fna -queryname NZ_BLLS010002411.1678
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002411.1678.fna -queryname NZ_BLLS010002411.1678
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002411.1678.fna -queryname NZ_BLLS010002411.1678
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000911.167.fna -queryname NZ_BAIW010000911.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000911.167.fna -queryname NZ_BAIW010000911.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000911.167.fna -queryname NZ_BAIW010000911.167
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002091.1679.fna -queryname NZ_BLLS010002091.1679
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002091.1679.fna -queryname NZ_BLLS010002091.1679
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002091.1679.fna -queryname NZ_BLLS010002091.1679
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000031.1680.fna -queryname NZ_BLLS010000031.1680
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000031.1680.fna -queryname NZ_BLLS010000031.1680
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000031.1680.fna -queryname NZ_BLLS010000031.1680
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000221.1681.fna -queryname NZ_BLLS010000221.1681
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000221.1681.fna -queryname NZ_BLLS010000221.1681
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000221.1681.fna -queryname NZ_BLLS010000221.1681
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002251.1682.fna -queryname NZ_BLLS010002251.1682
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002251.1682.fna -queryname NZ_BLLS010002251.1682
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002251.1682.fna -queryname NZ_BLLS010002251.1682
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000471.1683.fna -queryname NZ_BLLS010000471.1683
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000471.1683.fna -queryname NZ_BLLS010000471.1683
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000471.1683.fna -queryname NZ_BLLS010000471.1683
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002051.1684.fna -queryname NZ_BLLS010002051.1684
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002051.1684.fna -queryname NZ_BLLS010002051.1684
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002051.1684.fna -queryname NZ_BLLS010002051.1684
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001461.1685.fna -queryname NZ_BLLS010001461.1685
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001461.1685.fna -queryname NZ_BLLS010001461.1685
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001461.1685.fna -queryname NZ_BLLS010001461.1685
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001101.1686.fna -queryname NZ_BLLS010001101.1686
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001101.1686.fna -queryname NZ_BLLS010001101.1686
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001101.1686.fna -queryname NZ_BLLS010001101.1686
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001731.1687.fna -queryname NZ_BLLS010001731.1687
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001731.1687.fna -queryname NZ_BLLS010001731.1687
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001731.1687.fna -queryname NZ_BLLS010001731.1687
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002101.1688.fna -queryname NZ_BLLS010002101.1688
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002101.1688.fna -queryname NZ_BLLS010002101.1688
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002101.1688.fna -queryname NZ_BLLS010002101.1688
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001441.168.fna -queryname NZ_BAIW010001441.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001441.168.fna -queryname NZ_BAIW010001441.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001441.168.fna -queryname NZ_BAIW010001441.168
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001581.1689.fna -queryname NZ_BLLS010001581.1689
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001581.1689.fna -queryname NZ_BLLS010001581.1689
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001581.1689.fna -queryname NZ_BLLS010001581.1689
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001081.1690.fna -queryname NZ_BLLS010001081.1690
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001081.1690.fna -queryname NZ_BLLS010001081.1690
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001081.1690.fna -queryname NZ_BLLS010001081.1690
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000881.1691.fna -queryname NZ_BLLS010000881.1691
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000881.1691.fna -queryname NZ_BLLS010000881.1691
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000881.1691.fna -queryname NZ_BLLS010000881.1691
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002241.1692.fna -queryname NZ_BLLS010002241.1692
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002241.1692.fna -queryname NZ_BLLS010002241.1692
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002241.1692.fna -queryname NZ_BLLS010002241.1692
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002191.1693.fna -queryname NZ_BLLS010002191.1693
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002191.1693.fna -queryname NZ_BLLS010002191.1693
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002191.1693.fna -queryname NZ_BLLS010002191.1693
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000081.1694.fna -queryname NZ_BLLS010000081.1694
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000081.1694.fna -queryname NZ_BLLS010000081.1694
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000081.1694.fna -queryname NZ_BLLS010000081.1694
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000531.1695.fna -queryname NZ_BLLS010000531.1695
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000531.1695.fna -queryname NZ_BLLS010000531.1695
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000531.1695.fna -queryname NZ_BLLS010000531.1695
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000731.1696.fna -queryname NZ_BLLS010000731.1696
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000731.1696.fna -queryname NZ_BLLS010000731.1696
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000731.1696.fna -queryname NZ_BLLS010000731.1696
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001501.1697.fna -queryname NZ_BLLS010001501.1697
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001501.1697.fna -queryname NZ_BLLS010001501.1697
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001501.1697.fna -queryname NZ_BLLS010001501.1697
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001761.1698.fna -queryname NZ_BLLS010001761.1698
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001761.1698.fna -queryname NZ_BLLS010001761.1698
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001761.1698.fna -queryname NZ_BLLS010001761.1698
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001101.16.fna -queryname NZ_BAIW010001101.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001101.16.fna -queryname NZ_BAIW010001101.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001101.16.fna -queryname NZ_BAIW010001101.16
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000481.169.fna -queryname NZ_BAIW010000481.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000481.169.fna -queryname NZ_BAIW010000481.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000481.169.fna -queryname NZ_BAIW010000481.169
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001361.1699.fna -queryname NZ_BLLS010001361.1699
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001361.1699.fna -queryname NZ_BLLS010001361.1699
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001361.1699.fna -queryname NZ_BLLS010001361.1699
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000851.1700.fna -queryname NZ_BLLS010000851.1700
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000851.1700.fna -queryname NZ_BLLS010000851.1700
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000851.1700.fna -queryname NZ_BLLS010000851.1700
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000891.1701.fna -queryname NZ_BLLS010000891.1701
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000891.1701.fna -queryname NZ_BLLS010000891.1701
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000891.1701.fna -queryname NZ_BLLS010000891.1701
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002021.1702.fna -queryname NZ_BLLS010002021.1702
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002021.1702.fna -queryname NZ_BLLS010002021.1702
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002021.1702.fna -queryname NZ_BLLS010002021.1702
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001211.1703.fna -queryname NZ_BLLS010001211.1703
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001211.1703.fna -queryname NZ_BLLS010001211.1703
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001211.1703.fna -queryname NZ_BLLS010001211.1703
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001751.1704.fna -queryname NZ_BLLS010001751.1704
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001751.1704.fna -queryname NZ_BLLS010001751.1704
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001751.1704.fna -queryname NZ_BLLS010001751.1704
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001631.1705.fna -queryname NZ_BLLS010001631.1705
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001631.1705.fna -queryname NZ_BLLS010001631.1705
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001631.1705.fna -queryname NZ_BLLS010001631.1705
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001181.1706.fna -queryname NZ_BLLS010001181.1706
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001181.1706.fna -queryname NZ_BLLS010001181.1706
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001181.1706.fna -queryname NZ_BLLS010001181.1706
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000581.1707.fna -queryname NZ_BLLS010000581.1707
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000581.1707.fna -queryname NZ_BLLS010000581.1707
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000581.1707.fna -queryname NZ_BLLS010000581.1707
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000161.1708.fna -queryname NZ_BLLS010000161.1708
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000161.1708.fna -queryname NZ_BLLS010000161.1708
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000161.1708.fna -queryname NZ_BLLS010000161.1708
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000161.1708.AOI.fna -queryname NZ_BLLS010000161.1708
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000161.1708.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000161.1708.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_BLLS010000161.1708
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_BLLS010000161.1708.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000711.170.fna -queryname NZ_BAIW010000711.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000711.170.fna -queryname NZ_BAIW010000711.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000711.170.fna -queryname NZ_BAIW010000711.170
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001341.1709.fna -queryname NZ_BLLS010001341.1709
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001341.1709.fna -queryname NZ_BLLS010001341.1709
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001341.1709.fna -queryname NZ_BLLS010001341.1709
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002431.1710.fna -queryname NZ_BLLS010002431.1710
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002431.1710.fna -queryname NZ_BLLS010002431.1710
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002431.1710.fna -queryname NZ_BLLS010002431.1710
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001261.1711.fna -queryname NZ_BLLS010001261.1711
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001261.1711.fna -queryname NZ_BLLS010001261.1711
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001261.1711.fna -queryname NZ_BLLS010001261.1711
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002301.1712.fna -queryname NZ_BLLS010002301.1712
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002301.1712.fna -queryname NZ_BLLS010002301.1712
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002301.1712.fna -queryname NZ_BLLS010002301.1712
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001051.1713.fna -queryname NZ_BLLS010001051.1713
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001051.1713.fna -queryname NZ_BLLS010001051.1713
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001051.1713.fna -queryname NZ_BLLS010001051.1713
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001891.1714.fna -queryname NZ_BLLS010001891.1714
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001891.1714.fna -queryname NZ_BLLS010001891.1714
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001891.1714.fna -queryname NZ_BLLS010001891.1714
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002131.1715.fna -queryname NZ_BLLS010002131.1715
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002131.1715.fna -queryname NZ_BLLS010002131.1715
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002131.1715.fna -queryname NZ_BLLS010002131.1715
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002291.1716.fna -queryname NZ_BLLS010002291.1716
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002291.1716.fna -queryname NZ_BLLS010002291.1716
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002291.1716.fna -queryname NZ_BLLS010002291.1716
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000611.1717.fna -queryname NZ_BLLS010000611.1717
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000611.1717.fna -queryname NZ_BLLS010000611.1717
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000611.1717.fna -queryname NZ_BLLS010000611.1717
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000681.1718.fna -queryname NZ_BLLS010000681.1718
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000681.1718.fna -queryname NZ_BLLS010000681.1718
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000681.1718.fna -queryname NZ_BLLS010000681.1718
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000111.171.fna -queryname NZ_BAIW010000111.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000111.171.fna -queryname NZ_BAIW010000111.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000111.171.fna -queryname NZ_BAIW010000111.171
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000561.1719.fna -queryname NZ_BLLS010000561.1719
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000561.1719.fna -queryname NZ_BLLS010000561.1719
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000561.1719.fna -queryname NZ_BLLS010000561.1719
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001071.1720.fna -queryname NZ_BLLS010001071.1720
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001071.1720.fna -queryname NZ_BLLS010001071.1720
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001071.1720.fna -queryname NZ_BLLS010001071.1720
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001011.1721.fna -queryname NZ_BLLS010001011.1721
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001011.1721.fna -queryname NZ_BLLS010001011.1721
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001011.1721.fna -queryname NZ_BLLS010001011.1721
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000331.1722.fna -queryname NZ_BLLS010000331.1722
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000331.1722.fna -queryname NZ_BLLS010000331.1722
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000331.1722.fna -queryname NZ_BLLS010000331.1722
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001111.1723.fna -queryname NZ_BLLS010001111.1723
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001111.1723.fna -queryname NZ_BLLS010001111.1723
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001111.1723.fna -queryname NZ_BLLS010001111.1723
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000071.1724.fna -queryname NZ_BLLS010000071.1724
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000071.1724.fna -queryname NZ_BLLS010000071.1724
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000071.1724.fna -queryname NZ_BLLS010000071.1724
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001241.1725.fna -queryname NZ_BLLS010001241.1725
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001241.1725.fna -queryname NZ_BLLS010001241.1725
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001241.1725.fna -queryname NZ_BLLS010001241.1725
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001591.1726.fna -queryname NZ_BLLS010001591.1726
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001591.1726.fna -queryname NZ_BLLS010001591.1726
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001591.1726.fna -queryname NZ_BLLS010001591.1726
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001031.1727.fna -queryname NZ_BLLS010001031.1727
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001031.1727.fna -queryname NZ_BLLS010001031.1727
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001031.1727.fna -queryname NZ_BLLS010001031.1727
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002231.1728.fna -queryname NZ_BLLS010002231.1728
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002231.1728.fna -queryname NZ_BLLS010002231.1728
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002231.1728.fna -queryname NZ_BLLS010002231.1728
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008701.172.fna -queryname NZ_CDPR010008701.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008701.172.fna -queryname NZ_CDPR010008701.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008701.172.fna -queryname NZ_CDPR010008701.172
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001531.1729.fna -queryname NZ_BLLS010001531.1729
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001531.1729.fna -queryname NZ_BLLS010001531.1729
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001531.1729.fna -queryname NZ_BLLS010001531.1729
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001421.1730.fna -queryname NZ_BLLS010001421.1730
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001421.1730.fna -queryname NZ_BLLS010001421.1730
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001421.1730.fna -queryname NZ_BLLS010001421.1730
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001161.1731.fna -queryname NZ_BLLS010001161.1731
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001161.1731.fna -queryname NZ_BLLS010001161.1731
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001161.1731.fna -queryname NZ_BLLS010001161.1731
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001971.1732.fna -queryname NZ_BLLS010001971.1732
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001971.1732.fna -queryname NZ_BLLS010001971.1732
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001971.1732.fna -queryname NZ_BLLS010001971.1732
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002081.1733.fna -queryname NZ_BLLS010002081.1733
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002081.1733.fna -queryname NZ_BLLS010002081.1733
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002081.1733.fna -queryname NZ_BLLS010002081.1733
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001171.1734.fna -queryname NZ_BLLS010001171.1734
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001171.1734.fna -queryname NZ_BLLS010001171.1734
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001171.1734.fna -queryname NZ_BLLS010001171.1734
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000441.1735.fna -queryname NZ_BLLS010000441.1735
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000441.1735.fna -queryname NZ_BLLS010000441.1735
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000441.1735.fna -queryname NZ_BLLS010000441.1735
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001441.1736.fna -queryname NZ_BLLS010001441.1736
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001441.1736.fna -queryname NZ_BLLS010001441.1736
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001441.1736.fna -queryname NZ_BLLS010001441.1736
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001201.1737.fna -queryname NZ_BLLS010001201.1737
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001201.1737.fna -queryname NZ_BLLS010001201.1737
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001201.1737.fna -queryname NZ_BLLS010001201.1737
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001981.1738.fna -queryname NZ_BLLS010001981.1738
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001981.1738.fna -queryname NZ_BLLS010001981.1738
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001981.1738.fna -queryname NZ_BLLS010001981.1738
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009511.173.fna -queryname NZ_CDPR010009511.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009511.173.fna -queryname NZ_CDPR010009511.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009511.173.fna -queryname NZ_CDPR010009511.173
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000831.1739.fna -queryname NZ_BLLS010000831.1739
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000831.1739.fna -queryname NZ_BLLS010000831.1739
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000831.1739.fna -queryname NZ_BLLS010000831.1739
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002271.1740.fna -queryname NZ_BLLS010002271.1740
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002271.1740.fna -queryname NZ_BLLS010002271.1740
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002271.1740.fna -queryname NZ_BLLS010002271.1740
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000371.1741.fna -queryname NZ_BLLS010000371.1741
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000371.1741.fna -queryname NZ_BLLS010000371.1741
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000371.1741.fna -queryname NZ_BLLS010000371.1741
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000591.1742.fna -queryname NZ_BLLS010000591.1742
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000591.1742.fna -queryname NZ_BLLS010000591.1742
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000591.1742.fna -queryname NZ_BLLS010000591.1742
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002121.1743.fna -queryname NZ_BLLS010002121.1743
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002121.1743.fna -queryname NZ_BLLS010002121.1743
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002121.1743.fna -queryname NZ_BLLS010002121.1743
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001821.1744.fna -queryname NZ_BLLS010001821.1744
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001821.1744.fna -queryname NZ_BLLS010001821.1744
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001821.1744.fna -queryname NZ_BLLS010001821.1744
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000481.1745.fna -queryname NZ_BLLS010000481.1745
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000481.1745.fna -queryname NZ_BLLS010000481.1745
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000481.1745.fna -queryname NZ_BLLS010000481.1745
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001471.1746.fna -queryname NZ_BLLS010001471.1746
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001471.1746.fna -queryname NZ_BLLS010001471.1746
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001471.1746.fna -queryname NZ_BLLS010001471.1746
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001411.1747.fna -queryname NZ_BLLS010001411.1747
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001411.1747.fna -queryname NZ_BLLS010001411.1747
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001411.1747.fna -queryname NZ_BLLS010001411.1747
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001231.1748.fna -queryname NZ_BLLS010001231.1748
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001231.1748.fna -queryname NZ_BLLS010001231.1748
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001231.1748.fna -queryname NZ_BLLS010001231.1748
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007111.174.fna -queryname NZ_CDPR010007111.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007111.174.fna -queryname NZ_CDPR010007111.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007111.174.fna -queryname NZ_CDPR010007111.174
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000291.1749.fna -queryname NZ_BLLS010000291.1749
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000291.1749.fna -queryname NZ_BLLS010000291.1749
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000291.1749.fna -queryname NZ_BLLS010000291.1749
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000661.1750.fna -queryname NZ_BLLS010000661.1750
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000661.1750.fna -queryname NZ_BLLS010000661.1750
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000661.1750.fna -queryname NZ_BLLS010000661.1750
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001141.1751.fna -queryname NZ_BLLS010001141.1751
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001141.1751.fna -queryname NZ_BLLS010001141.1751
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001141.1751.fna -queryname NZ_BLLS010001141.1751
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000261.1752.fna -queryname NZ_BLLS010000261.1752
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000261.1752.fna -queryname NZ_BLLS010000261.1752
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000261.1752.fna -queryname NZ_BLLS010000261.1752
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000761.1753.fna -queryname NZ_BLLS010000761.1753
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000761.1753.fna -queryname NZ_BLLS010000761.1753
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000761.1753.fna -queryname NZ_BLLS010000761.1753
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001131.1754.fna -queryname NZ_BLLS010001131.1754
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001131.1754.fna -queryname NZ_BLLS010001131.1754
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001131.1754.fna -queryname NZ_BLLS010001131.1754
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001061.1755.fna -queryname NZ_BLLS010001061.1755
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001061.1755.fna -queryname NZ_BLLS010001061.1755
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001061.1755.fna -queryname NZ_BLLS010001061.1755
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000141.1756.fna -queryname NZ_BLLS010000141.1756
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000141.1756.fna -queryname NZ_BLLS010000141.1756
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010000141.1756.fna -queryname NZ_BLLS010000141.1756
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001151.1757.fna -queryname NZ_BLLS010001151.1757
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001151.1757.fna -queryname NZ_BLLS010001151.1757
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010001151.1757.fna -queryname NZ_BLLS010001151.1757
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002311.1758.fna -queryname NZ_BLLS010002311.1758
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002311.1758.fna -queryname NZ_BLLS010002311.1758
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BLLS010002311.1758.fna -queryname NZ_BLLS010002311.1758
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004111.175.fna -queryname NZ_CDPR010004111.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004111.175.fna -queryname NZ_CDPR010004111.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004111.175.fna -queryname NZ_CDPR010004111.175
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000081.1759.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000081.1759
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000081.1759.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000081.1759
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000081.1759.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000081.1759
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000091.1760.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000091.1760
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000091.1760.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000091.1760
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000091.1760.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000091.1760
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000011.1761.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000011.1761
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000011.1761.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000011.1761
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000011.1761.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000011.1761
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000011.1761.AOI.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000011.1761
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000011.1761.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000011.1761.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_CAEUHO0100000011.1761
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_CAEUHO0100000011.1761.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000041.1762.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000041.1762
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000041.1762.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000041.1762
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000041.1762.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000041.1762
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000041.1762.AOI.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000041.1762
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000041.1762.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000041.1762.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_CAEUHO0100000041.1762
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_CAEUHO0100000041.1762.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000071.1763.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000071.1763
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000071.1763.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000071.1763
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000071.1763.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000071.1763
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000051.1764.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000051.1764
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000051.1764.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000051.1764
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000051.1764.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000051.1764
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000061.1765.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000061.1765
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000061.1765.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000061.1765
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CAEUHO0100000061.1765.fna -queryname NZ_CAEUHO0100000061.1765
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004051.176.fna -queryname NZ_CDPR010004051.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004051.176.fna -queryname NZ_CDPR010004051.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004051.176.fna -queryname NZ_CDPR010004051.176
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008361.177.fna -queryname NZ_CDPR010008361.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008361.177.fna -queryname NZ_CDPR010008361.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008361.177.fna -queryname NZ_CDPR010008361.177
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000901.178.fna -queryname NZ_CDPR010000901.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000901.178.fna -queryname NZ_CDPR010000901.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000901.178.fna -queryname NZ_CDPR010000901.178
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001091.17.fna -queryname NZ_BAIW010001091.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001091.17.fna -queryname NZ_BAIW010001091.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001091.17.fna -queryname NZ_BAIW010001091.17
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001771.179.fna -queryname NZ_CDPR010001771.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001771.179.fna -queryname NZ_CDPR010001771.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001771.179.fna -queryname NZ_CDPR010001771.179
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000961.180.fna -queryname NZ_CDPR010000961.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000961.180.fna -queryname NZ_CDPR010000961.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000961.180.fna -queryname NZ_CDPR010000961.180
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005371.181.fna -queryname NZ_CDPR010005371.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005371.181.fna -queryname NZ_CDPR010005371.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005371.181.fna -queryname NZ_CDPR010005371.181
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010011751.182.fna -queryname NZ_CDPR010011751.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010011751.182.fna -queryname NZ_CDPR010011751.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010011751.182.fna -queryname NZ_CDPR010011751.182
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004781.183.fna -queryname NZ_CDPR010004781.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004781.183.fna -queryname NZ_CDPR010004781.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004781.183.fna -queryname NZ_CDPR010004781.183
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003641.184.fna -queryname NZ_CDPR010003641.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003641.184.fna -queryname NZ_CDPR010003641.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003641.184.fna -queryname NZ_CDPR010003641.184
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002491.185.fna -queryname NZ_CDPR010002491.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002491.185.fna -queryname NZ_CDPR010002491.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002491.185.fna -queryname NZ_CDPR010002491.185
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007151.186.fna -queryname NZ_CDPR010007151.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007151.186.fna -queryname NZ_CDPR010007151.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007151.186.fna -queryname NZ_CDPR010007151.186
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002251.187.fna -queryname NZ_CDPR010002251.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002251.187.fna -queryname NZ_CDPR010002251.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002251.187.fna -queryname NZ_CDPR010002251.187
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002701.188.fna -queryname NZ_CDPR010002701.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002701.188.fna -queryname NZ_CDPR010002701.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002701.188.fna -queryname NZ_CDPR010002701.188
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000541.18.fna -queryname NZ_BAIW010000541.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000541.18.fna -queryname NZ_BAIW010000541.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000541.18.fna -queryname NZ_BAIW010000541.18
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007951.189.fna -queryname NZ_CDPR010007951.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007951.189.fna -queryname NZ_CDPR010007951.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007951.189.fna -queryname NZ_CDPR010007951.189
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005301.190.fna -queryname NZ_CDPR010005301.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005301.190.fna -queryname NZ_CDPR010005301.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005301.190.fna -queryname NZ_CDPR010005301.190
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007931.191.fna -queryname NZ_CDPR010007931.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007931.191.fna -queryname NZ_CDPR010007931.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007931.191.fna -queryname NZ_CDPR010007931.191
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004381.192.fna -queryname NZ_CDPR010004381.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004381.192.fna -queryname NZ_CDPR010004381.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004381.192.fna -queryname NZ_CDPR010004381.192
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000201.193.fna -queryname NZ_CDPR010000201.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000201.193.fna -queryname NZ_CDPR010000201.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000201.193.fna -queryname NZ_CDPR010000201.193
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008591.194.fna -queryname NZ_CDPR010008591.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008591.194.fna -queryname NZ_CDPR010008591.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008591.194.fna -queryname NZ_CDPR010008591.194
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003011.195.fna -queryname NZ_CDPR010003011.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003011.195.fna -queryname NZ_CDPR010003011.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003011.195.fna -queryname NZ_CDPR010003011.195
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003421.196.fna -queryname NZ_CDPR010003421.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003421.196.fna -queryname NZ_CDPR010003421.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003421.196.fna -queryname NZ_CDPR010003421.196
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005101.197.fna -queryname NZ_CDPR010005101.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005101.197.fna -queryname NZ_CDPR010005101.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005101.197.fna -queryname NZ_CDPR010005101.197
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006071.198.fna -queryname NZ_CDPR010006071.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006071.198.fna -queryname NZ_CDPR010006071.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006071.198.fna -queryname NZ_CDPR010006071.198
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001361.1.fna -queryname NZ_BAIW010001361.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001361.1.fna -queryname NZ_BAIW010001361.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001361.1.fna -queryname NZ_BAIW010001361.1
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000871.19.fna -queryname NZ_BAIW010000871.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000871.19.fna -queryname NZ_BAIW010000871.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000871.19.fna -queryname NZ_BAIW010000871.19
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000051.199.fna -queryname NZ_CDPR010000051.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000051.199.fna -queryname NZ_CDPR010000051.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000051.199.fna -queryname NZ_CDPR010000051.199
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010012901.200.fna -queryname NZ_CDPR010012901.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010012901.200.fna -queryname NZ_CDPR010012901.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010012901.200.fna -queryname NZ_CDPR010012901.200
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000461.201.fna -queryname NZ_CDPR010000461.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000461.201.fna -queryname NZ_CDPR010000461.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000461.201.fna -queryname NZ_CDPR010000461.201
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002141.202.fna -queryname NZ_CDPR010002141.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002141.202.fna -queryname NZ_CDPR010002141.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002141.202.fna -queryname NZ_CDPR010002141.202
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002381.203.fna -queryname NZ_CDPR010002381.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002381.203.fna -queryname NZ_CDPR010002381.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002381.203.fna -queryname NZ_CDPR010002381.203
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001831.204.fna -queryname NZ_CDPR010001831.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001831.204.fna -queryname NZ_CDPR010001831.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001831.204.fna -queryname NZ_CDPR010001831.204
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004581.205.fna -queryname NZ_CDPR010004581.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004581.205.fna -queryname NZ_CDPR010004581.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004581.205.fna -queryname NZ_CDPR010004581.205
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003881.206.fna -queryname NZ_CDPR010003881.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003881.206.fna -queryname NZ_CDPR010003881.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003881.206.fna -queryname NZ_CDPR010003881.206
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004931.207.fna -queryname NZ_CDPR010004931.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004931.207.fna -queryname NZ_CDPR010004931.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004931.207.fna -queryname NZ_CDPR010004931.207
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000141.208.fna -queryname NZ_CDPR010000141.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000141.208.fna -queryname NZ_CDPR010000141.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000141.208.fna -queryname NZ_CDPR010000141.208
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000671.20.fna -queryname NZ_BAIW010000671.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000671.20.fna -queryname NZ_BAIW010000671.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000671.20.fna -queryname NZ_BAIW010000671.20
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003091.209.fna -queryname NZ_CDPR010003091.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003091.209.fna -queryname NZ_CDPR010003091.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003091.209.fna -queryname NZ_CDPR010003091.209
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005731.210.fna -queryname NZ_CDPR010005731.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005731.210.fna -queryname NZ_CDPR010005731.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005731.210.fna -queryname NZ_CDPR010005731.210
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006711.211.fna -queryname NZ_CDPR010006711.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006711.211.fna -queryname NZ_CDPR010006711.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006711.211.fna -queryname NZ_CDPR010006711.211
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001881.212.fna -queryname NZ_CDPR010001881.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001881.212.fna -queryname NZ_CDPR010001881.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001881.212.fna -queryname NZ_CDPR010001881.212
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006691.213.fna -queryname NZ_CDPR010006691.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006691.213.fna -queryname NZ_CDPR010006691.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006691.213.fna -queryname NZ_CDPR010006691.213
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000011.214.fna -queryname NZ_CDPR010000011.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000011.214.fna -queryname NZ_CDPR010000011.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000011.214.fna -queryname NZ_CDPR010000011.214
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004161.215.fna -queryname NZ_CDPR010004161.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004161.215.fna -queryname NZ_CDPR010004161.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004161.215.fna -queryname NZ_CDPR010004161.215
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004241.216.fna -queryname NZ_CDPR010004241.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004241.216.fna -queryname NZ_CDPR010004241.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004241.216.fna -queryname NZ_CDPR010004241.216
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001841.217.fna -queryname NZ_CDPR010001841.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001841.217.fna -queryname NZ_CDPR010001841.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001841.217.fna -queryname NZ_CDPR010001841.217
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001051.218.fna -queryname NZ_CDPR010001051.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001051.218.fna -queryname NZ_CDPR010001051.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001051.218.fna -queryname NZ_CDPR010001051.218
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001201.21.fna -queryname NZ_BAIW010001201.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001201.21.fna -queryname NZ_BAIW010001201.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001201.21.fna -queryname NZ_BAIW010001201.21
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000921.219.fna -queryname NZ_CDPR010000921.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000921.219.fna -queryname NZ_CDPR010000921.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000921.219.fna -queryname NZ_CDPR010000921.219
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004441.220.fna -queryname NZ_CDPR010004441.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004441.220.fna -queryname NZ_CDPR010004441.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004441.220.fna -queryname NZ_CDPR010004441.220
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002801.221.fna -queryname NZ_CDPR010002801.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002801.221.fna -queryname NZ_CDPR010002801.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002801.221.fna -queryname NZ_CDPR010002801.221
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009571.222.fna -queryname NZ_CDPR010009571.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009571.222.fna -queryname NZ_CDPR010009571.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009571.222.fna -queryname NZ_CDPR010009571.222
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006031.223.fna -queryname NZ_CDPR010006031.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006031.223.fna -queryname NZ_CDPR010006031.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006031.223.fna -queryname NZ_CDPR010006031.223
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003931.224.fna -queryname NZ_CDPR010003931.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003931.224.fna -queryname NZ_CDPR010003931.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003931.224.fna -queryname NZ_CDPR010003931.224
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001261.225.fna -queryname NZ_CDPR010001261.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001261.225.fna -queryname NZ_CDPR010001261.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001261.225.fna -queryname NZ_CDPR010001261.225
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002031.226.fna -queryname NZ_CDPR010002031.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002031.226.fna -queryname NZ_CDPR010002031.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002031.226.fna -queryname NZ_CDPR010002031.226
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005451.227.fna -queryname NZ_CDPR010005451.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005451.227.fna -queryname NZ_CDPR010005451.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005451.227.fna -queryname NZ_CDPR010005451.227
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007351.228.fna -queryname NZ_CDPR010007351.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007351.228.fna -queryname NZ_CDPR010007351.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007351.228.fna -queryname NZ_CDPR010007351.228
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000081.22.fna -queryname NZ_BAIW010000081.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000081.22.fna -queryname NZ_BAIW010000081.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000081.22.fna -queryname NZ_BAIW010000081.22
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010241.229.fna -queryname NZ_CDPR010010241.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010241.229.fna -queryname NZ_CDPR010010241.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010241.229.fna -queryname NZ_CDPR010010241.229
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002191.230.fna -queryname NZ_CDPR010002191.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002191.230.fna -queryname NZ_CDPR010002191.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002191.230.fna -queryname NZ_CDPR010002191.230
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002101.231.fna -queryname NZ_CDPR010002101.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002101.231.fna -queryname NZ_CDPR010002101.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002101.231.fna -queryname NZ_CDPR010002101.231
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001301.232.fna -queryname NZ_CDPR010001301.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001301.232.fna -queryname NZ_CDPR010001301.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001301.232.fna -queryname NZ_CDPR010001301.232
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000551.233.fna -queryname NZ_CDPR010000551.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000551.233.fna -queryname NZ_CDPR010000551.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000551.233.fna -queryname NZ_CDPR010000551.233
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000101.234.fna -queryname NZ_CDPR010000101.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000101.234.fna -queryname NZ_CDPR010000101.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000101.234.fna -queryname NZ_CDPR010000101.234
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001131.235.fna -queryname NZ_CDPR010001131.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001131.235.fna -queryname NZ_CDPR010001131.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001131.235.fna -queryname NZ_CDPR010001131.235
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004211.236.fna -queryname NZ_CDPR010004211.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004211.236.fna -queryname NZ_CDPR010004211.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004211.236.fna -queryname NZ_CDPR010004211.236
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009601.237.fna -queryname NZ_CDPR010009601.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009601.237.fna -queryname NZ_CDPR010009601.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009601.237.fna -queryname NZ_CDPR010009601.237
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001751.238.fna -queryname NZ_CDPR010001751.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001751.238.fna -queryname NZ_CDPR010001751.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001751.238.fna -queryname NZ_CDPR010001751.238
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000331.23.fna -queryname NZ_BAIW010000331.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000331.23.fna -queryname NZ_BAIW010000331.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000331.23.fna -queryname NZ_BAIW010000331.23
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004061.239.fna -queryname NZ_CDPR010004061.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004061.239.fna -queryname NZ_CDPR010004061.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004061.239.fna -queryname NZ_CDPR010004061.239
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009091.240.fna -queryname NZ_CDPR010009091.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009091.240.fna -queryname NZ_CDPR010009091.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009091.240.fna -queryname NZ_CDPR010009091.240
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000851.241.fna -queryname NZ_CDPR010000851.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000851.241.fna -queryname NZ_CDPR010000851.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000851.241.fna -queryname NZ_CDPR010000851.241
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003821.242.fna -queryname NZ_CDPR010003821.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003821.242.fna -queryname NZ_CDPR010003821.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003821.242.fna -queryname NZ_CDPR010003821.242
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003591.243.fna -queryname NZ_CDPR010003591.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003591.243.fna -queryname NZ_CDPR010003591.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003591.243.fna -queryname NZ_CDPR010003591.243
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002281.244.fna -queryname NZ_CDPR010002281.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002281.244.fna -queryname NZ_CDPR010002281.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002281.244.fna -queryname NZ_CDPR010002281.244
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001651.245.fna -queryname NZ_CDPR010001651.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001651.245.fna -queryname NZ_CDPR010001651.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001651.245.fna -queryname NZ_CDPR010001651.245
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001851.246.fna -queryname NZ_CDPR010001851.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001851.246.fna -queryname NZ_CDPR010001851.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001851.246.fna -queryname NZ_CDPR010001851.246
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013831.247.fna -queryname NZ_CDPR010013831.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013831.247.fna -queryname NZ_CDPR010013831.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013831.247.fna -queryname NZ_CDPR010013831.247
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013821.248.fna -queryname NZ_CDPR010013821.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013821.248.fna -queryname NZ_CDPR010013821.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013821.248.fna -queryname NZ_CDPR010013821.248
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001071.24.fna -queryname NZ_BAIW010001071.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001071.24.fna -queryname NZ_BAIW010001071.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001071.24.fna -queryname NZ_BAIW010001071.24
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002451.249.fna -queryname NZ_CDPR010002451.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002451.249.fna -queryname NZ_CDPR010002451.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002451.249.fna -queryname NZ_CDPR010002451.249
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001061.250.fna -queryname NZ_CDPR010001061.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001061.250.fna -queryname NZ_CDPR010001061.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001061.250.fna -queryname NZ_CDPR010001061.250
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001121.251.fna -queryname NZ_CDPR010001121.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001121.251.fna -queryname NZ_CDPR010001121.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001121.251.fna -queryname NZ_CDPR010001121.251
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001801.252.fna -queryname NZ_CDPR010001801.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001801.252.fna -queryname NZ_CDPR010001801.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001801.252.fna -queryname NZ_CDPR010001801.252
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004611.253.fna -queryname NZ_CDPR010004611.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004611.253.fna -queryname NZ_CDPR010004611.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004611.253.fna -queryname NZ_CDPR010004611.253
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003331.254.fna -queryname NZ_CDPR010003331.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003331.254.fna -queryname NZ_CDPR010003331.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003331.254.fna -queryname NZ_CDPR010003331.254
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006451.255.fna -queryname NZ_CDPR010006451.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006451.255.fna -queryname NZ_CDPR010006451.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006451.255.fna -queryname NZ_CDPR010006451.255
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006261.256.fna -queryname NZ_CDPR010006261.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006261.256.fna -queryname NZ_CDPR010006261.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006261.256.fna -queryname NZ_CDPR010006261.256
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007501.257.fna -queryname NZ_CDPR010007501.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007501.257.fna -queryname NZ_CDPR010007501.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007501.257.fna -queryname NZ_CDPR010007501.257
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007161.258.fna -queryname NZ_CDPR010007161.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007161.258.fna -queryname NZ_CDPR010007161.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007161.258.fna -queryname NZ_CDPR010007161.258
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000281.25.fna -queryname NZ_BAIW010000281.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000281.25.fna -queryname NZ_BAIW010000281.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000281.25.fna -queryname NZ_BAIW010000281.25
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000671.259.fna -queryname NZ_CDPR010000671.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000671.259.fna -queryname NZ_CDPR010000671.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000671.259.fna -queryname NZ_CDPR010000671.259
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003781.260.fna -queryname NZ_CDPR010003781.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003781.260.fna -queryname NZ_CDPR010003781.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003781.260.fna -queryname NZ_CDPR010003781.260
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008301.261.fna -queryname NZ_CDPR010008301.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008301.261.fna -queryname NZ_CDPR010008301.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008301.261.fna -queryname NZ_CDPR010008301.261
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000191.262.fna -queryname NZ_CDPR010000191.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000191.262.fna -queryname NZ_CDPR010000191.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000191.262.fna -queryname NZ_CDPR010000191.262
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002741.263.fna -queryname NZ_CDPR010002741.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002741.263.fna -queryname NZ_CDPR010002741.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002741.263.fna -queryname NZ_CDPR010002741.263
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005391.264.fna -queryname NZ_CDPR010005391.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005391.264.fna -queryname NZ_CDPR010005391.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005391.264.fna -queryname NZ_CDPR010005391.264
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004691.265.fna -queryname NZ_CDPR010004691.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004691.265.fna -queryname NZ_CDPR010004691.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004691.265.fna -queryname NZ_CDPR010004691.265
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006791.266.fna -queryname NZ_CDPR010006791.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006791.266.fna -queryname NZ_CDPR010006791.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006791.266.fna -queryname NZ_CDPR010006791.266
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001821.267.fna -queryname NZ_CDPR010001821.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001821.267.fna -queryname NZ_CDPR010001821.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001821.267.fna -queryname NZ_CDPR010001821.267
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001541.268.fna -queryname NZ_CDPR010001541.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001541.268.fna -queryname NZ_CDPR010001541.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001541.268.fna -queryname NZ_CDPR010001541.268
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001341.26.fna -queryname NZ_BAIW010001341.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001341.26.fna -queryname NZ_BAIW010001341.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001341.26.fna -queryname NZ_BAIW010001341.26
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005561.269.fna -queryname NZ_CDPR010005561.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005561.269.fna -queryname NZ_CDPR010005561.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005561.269.fna -queryname NZ_CDPR010005561.269
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003181.270.fna -queryname NZ_CDPR010003181.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003181.270.fna -queryname NZ_CDPR010003181.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003181.270.fna -queryname NZ_CDPR010003181.270
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000701.271.fna -queryname NZ_CDPR010000701.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000701.271.fna -queryname NZ_CDPR010000701.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000701.271.fna -queryname NZ_CDPR010000701.271
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001871.272.fna -queryname NZ_CDPR010001871.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001871.272.fna -queryname NZ_CDPR010001871.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001871.272.fna -queryname NZ_CDPR010001871.272
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004591.273.fna -queryname NZ_CDPR010004591.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004591.273.fna -queryname NZ_CDPR010004591.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004591.273.fna -queryname NZ_CDPR010004591.273
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010261.274.fna -queryname NZ_CDPR010010261.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010261.274.fna -queryname NZ_CDPR010010261.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010261.274.fna -queryname NZ_CDPR010010261.274
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002261.275.fna -queryname NZ_CDPR010002261.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002261.275.fna -queryname NZ_CDPR010002261.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002261.275.fna -queryname NZ_CDPR010002261.275
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003531.276.fna -queryname NZ_CDPR010003531.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003531.276.fna -queryname NZ_CDPR010003531.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003531.276.fna -queryname NZ_CDPR010003531.276
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001351.277.fna -queryname NZ_CDPR010001351.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001351.277.fna -queryname NZ_CDPR010001351.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001351.277.fna -queryname NZ_CDPR010001351.277
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000861.278.fna -queryname NZ_CDPR010000861.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000861.278.fna -queryname NZ_CDPR010000861.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000861.278.fna -queryname NZ_CDPR010000861.278
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001271.27.fna -queryname NZ_BAIW010001271.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001271.27.fna -queryname NZ_BAIW010001271.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001271.27.fna -queryname NZ_BAIW010001271.27
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008001.279.fna -queryname NZ_CDPR010008001.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008001.279.fna -queryname NZ_CDPR010008001.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008001.279.fna -queryname NZ_CDPR010008001.279
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002921.280.fna -queryname NZ_CDPR010002921.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002921.280.fna -queryname NZ_CDPR010002921.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002921.280.fna -queryname NZ_CDPR010002921.280
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002591.281.fna -queryname NZ_CDPR010002591.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002591.281.fna -queryname NZ_CDPR010002591.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002591.281.fna -queryname NZ_CDPR010002591.281
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001621.282.fna -queryname NZ_CDPR010001621.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001621.282.fna -queryname NZ_CDPR010001621.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001621.282.fna -queryname NZ_CDPR010001621.282
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004511.283.fna -queryname NZ_CDPR010004511.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004511.283.fna -queryname NZ_CDPR010004511.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004511.283.fna -queryname NZ_CDPR010004511.283
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007281.284.fna -queryname NZ_CDPR010007281.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007281.284.fna -queryname NZ_CDPR010007281.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007281.284.fna -queryname NZ_CDPR010007281.284
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002661.285.fna -queryname NZ_CDPR010002661.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002661.285.fna -queryname NZ_CDPR010002661.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002661.285.fna -queryname NZ_CDPR010002661.285
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009121.286.fna -queryname NZ_CDPR010009121.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009121.286.fna -queryname NZ_CDPR010009121.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009121.286.fna -queryname NZ_CDPR010009121.286
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007941.287.fna -queryname NZ_CDPR010007941.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007941.287.fna -queryname NZ_CDPR010007941.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007941.287.fna -queryname NZ_CDPR010007941.287
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004701.288.fna -queryname NZ_CDPR010004701.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004701.288.fna -queryname NZ_CDPR010004701.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004701.288.fna -queryname NZ_CDPR010004701.288
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001151.28.fna -queryname NZ_BAIW010001151.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001151.28.fna -queryname NZ_BAIW010001151.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001151.28.fna -queryname NZ_BAIW010001151.28
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006361.289.fna -queryname NZ_CDPR010006361.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006361.289.fna -queryname NZ_CDPR010006361.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006361.289.fna -queryname NZ_CDPR010006361.289
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001331.290.fna -queryname NZ_CDPR010001331.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001331.290.fna -queryname NZ_CDPR010001331.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001331.290.fna -queryname NZ_CDPR010001331.290
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005291.291.fna -queryname NZ_CDPR010005291.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005291.291.fna -queryname NZ_CDPR010005291.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005291.291.fna -queryname NZ_CDPR010005291.291
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008201.292.fna -queryname NZ_CDPR010008201.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008201.292.fna -queryname NZ_CDPR010008201.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008201.292.fna -queryname NZ_CDPR010008201.292
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007561.293.fna -queryname NZ_CDPR010007561.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007561.293.fna -queryname NZ_CDPR010007561.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007561.293.fna -queryname NZ_CDPR010007561.293
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002711.294.fna -queryname NZ_CDPR010002711.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002711.294.fna -queryname NZ_CDPR010002711.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002711.294.fna -queryname NZ_CDPR010002711.294
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001231.295.fna -queryname NZ_CDPR010001231.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001231.295.fna -queryname NZ_CDPR010001231.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001231.295.fna -queryname NZ_CDPR010001231.295
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001911.296.fna -queryname NZ_CDPR010001911.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001911.296.fna -queryname NZ_CDPR010001911.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001911.296.fna -queryname NZ_CDPR010001911.296
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001581.297.fna -queryname NZ_CDPR010001581.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001581.297.fna -queryname NZ_CDPR010001581.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001581.297.fna -queryname NZ_CDPR010001581.297
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006931.298.fna -queryname NZ_CDPR010006931.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006931.298.fna -queryname NZ_CDPR010006931.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006931.298.fna -queryname NZ_CDPR010006931.298
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000301.2.fna -queryname NZ_BAIW010000301.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000301.2.fna -queryname NZ_BAIW010000301.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000301.2.fna -queryname NZ_BAIW010000301.2
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000261.29.fna -queryname NZ_BAIW010000261.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000261.29.fna -queryname NZ_BAIW010000261.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000261.29.fna -queryname NZ_BAIW010000261.29
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001951.299.fna -queryname NZ_CDPR010001951.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001951.299.fna -queryname NZ_CDPR010001951.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001951.299.fna -queryname NZ_CDPR010001951.299
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007991.300.fna -queryname NZ_CDPR010007991.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007991.300.fna -queryname NZ_CDPR010007991.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007991.300.fna -queryname NZ_CDPR010007991.300
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010041.301.fna -queryname NZ_CDPR010010041.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010041.301.fna -queryname NZ_CDPR010010041.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010041.301.fna -queryname NZ_CDPR010010041.301
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004681.302.fna -queryname NZ_CDPR010004681.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004681.302.fna -queryname NZ_CDPR010004681.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004681.302.fna -queryname NZ_CDPR010004681.302
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001081.303.fna -queryname NZ_CDPR010001081.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001081.303.fna -queryname NZ_CDPR010001081.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001081.303.fna -queryname NZ_CDPR010001081.303
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001201.304.fna -queryname NZ_CDPR010001201.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001201.304.fna -queryname NZ_CDPR010001201.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001201.304.fna -queryname NZ_CDPR010001201.304
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009471.305.fna -queryname NZ_CDPR010009471.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009471.305.fna -queryname NZ_CDPR010009471.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009471.305.fna -queryname NZ_CDPR010009471.305
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007051.306.fna -queryname NZ_CDPR010007051.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007051.306.fna -queryname NZ_CDPR010007051.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007051.306.fna -queryname NZ_CDPR010007051.306
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004771.307.fna -queryname NZ_CDPR010004771.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004771.307.fna -queryname NZ_CDPR010004771.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004771.307.fna -queryname NZ_CDPR010004771.307
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006101.308.fna -queryname NZ_CDPR010006101.308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006101.308.fna -queryname NZ_CDPR010006101.308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006101.308.fna -queryname NZ_CDPR010006101.308
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001021.30.fna -queryname NZ_BAIW010001021.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001021.30.fna -queryname NZ_BAIW010001021.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001021.30.fna -queryname NZ_BAIW010001021.30
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004731.309.fna -queryname NZ_CDPR010004731.309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004731.309.fna -queryname NZ_CDPR010004731.309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004731.309.fna -queryname NZ_CDPR010004731.309
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001691.310.fna -queryname NZ_CDPR010001691.310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001691.310.fna -queryname NZ_CDPR010001691.310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001691.310.fna -queryname NZ_CDPR010001691.310
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000941.311.fna -queryname NZ_CDPR010000941.311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000941.311.fna -queryname NZ_CDPR010000941.311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000941.311.fna -queryname NZ_CDPR010000941.311
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003191.312.fna -queryname NZ_CDPR010003191.312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003191.312.fna -queryname NZ_CDPR010003191.312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003191.312.fna -queryname NZ_CDPR010003191.312
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004471.313.fna -queryname NZ_CDPR010004471.313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004471.313.fna -queryname NZ_CDPR010004471.313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004471.313.fna -queryname NZ_CDPR010004471.313
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007591.314.fna -queryname NZ_CDPR010007591.314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007591.314.fna -queryname NZ_CDPR010007591.314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007591.314.fna -queryname NZ_CDPR010007591.314
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001171.315.fna -queryname NZ_CDPR010001171.315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001171.315.fna -queryname NZ_CDPR010001171.315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001171.315.fna -queryname NZ_CDPR010001171.315
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000661.316.fna -queryname NZ_CDPR010000661.316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000661.316.fna -queryname NZ_CDPR010000661.316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000661.316.fna -queryname NZ_CDPR010000661.316
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003511.317.fna -queryname NZ_CDPR010003511.317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003511.317.fna -queryname NZ_CDPR010003511.317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003511.317.fna -queryname NZ_CDPR010003511.317
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008941.318.fna -queryname NZ_CDPR010008941.318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008941.318.fna -queryname NZ_CDPR010008941.318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008941.318.fna -queryname NZ_CDPR010008941.318
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001661.31.fna -queryname NZ_BAIW010001661.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001661.31.fna -queryname NZ_BAIW010001661.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001661.31.fna -queryname NZ_BAIW010001661.31
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003691.319.fna -queryname NZ_CDPR010003691.319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003691.319.fna -queryname NZ_CDPR010003691.319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003691.319.fna -queryname NZ_CDPR010003691.319
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007061.320.fna -queryname NZ_CDPR010007061.320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007061.320.fna -queryname NZ_CDPR010007061.320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007061.320.fna -queryname NZ_CDPR010007061.320
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005681.321.fna -queryname NZ_CDPR010005681.321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005681.321.fna -queryname NZ_CDPR010005681.321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005681.321.fna -queryname NZ_CDPR010005681.321
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006051.322.fna -queryname NZ_CDPR010006051.322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006051.322.fna -queryname NZ_CDPR010006051.322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006051.322.fna -queryname NZ_CDPR010006051.322
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005081.323.fna -queryname NZ_CDPR010005081.323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005081.323.fna -queryname NZ_CDPR010005081.323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005081.323.fna -queryname NZ_CDPR010005081.323
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000771.324.fna -queryname NZ_CDPR010000771.324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000771.324.fna -queryname NZ_CDPR010000771.324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000771.324.fna -queryname NZ_CDPR010000771.324
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004901.325.fna -queryname NZ_CDPR010004901.325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004901.325.fna -queryname NZ_CDPR010004901.325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004901.325.fna -queryname NZ_CDPR010004901.325
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010012041.326.fna -queryname NZ_CDPR010012041.326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010012041.326.fna -queryname NZ_CDPR010012041.326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010012041.326.fna -queryname NZ_CDPR010012041.326
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000251.327.fna -queryname NZ_CDPR010000251.327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000251.327.fna -queryname NZ_CDPR010000251.327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000251.327.fna -queryname NZ_CDPR010000251.327
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001151.328.fna -queryname NZ_CDPR010001151.328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001151.328.fna -queryname NZ_CDPR010001151.328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001151.328.fna -queryname NZ_CDPR010001151.328
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000041.32.fna -queryname NZ_BAIW010000041.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000041.32.fna -queryname NZ_BAIW010000041.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000041.32.fna -queryname NZ_BAIW010000041.32
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003411.329.fna -queryname NZ_CDPR010003411.329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003411.329.fna -queryname NZ_CDPR010003411.329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003411.329.fna -queryname NZ_CDPR010003411.329
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000981.330.fna -queryname NZ_CDPR010000981.330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000981.330.fna -queryname NZ_CDPR010000981.330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000981.330.fna -queryname NZ_CDPR010000981.330
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004411.331.fna -queryname NZ_CDPR010004411.331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004411.331.fna -queryname NZ_CDPR010004411.331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004411.331.fna -queryname NZ_CDPR010004411.331
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002501.332.fna -queryname NZ_CDPR010002501.332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002501.332.fna -queryname NZ_CDPR010002501.332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002501.332.fna -queryname NZ_CDPR010002501.332
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005501.333.fna -queryname NZ_CDPR010005501.333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005501.333.fna -queryname NZ_CDPR010005501.333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005501.333.fna -queryname NZ_CDPR010005501.333
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001321.334.fna -queryname NZ_CDPR010001321.334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001321.334.fna -queryname NZ_CDPR010001321.334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001321.334.fna -queryname NZ_CDPR010001321.334
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004461.335.fna -queryname NZ_CDPR010004461.335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004461.335.fna -queryname NZ_CDPR010004461.335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004461.335.fna -queryname NZ_CDPR010004461.335
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004481.336.fna -queryname NZ_CDPR010004481.336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004481.336.fna -queryname NZ_CDPR010004481.336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004481.336.fna -queryname NZ_CDPR010004481.336
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004891.337.fna -queryname NZ_CDPR010004891.337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004891.337.fna -queryname NZ_CDPR010004891.337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004891.337.fna -queryname NZ_CDPR010004891.337
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005541.338.fna -queryname NZ_CDPR010005541.338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005541.338.fna -queryname NZ_CDPR010005541.338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005541.338.fna -queryname NZ_CDPR010005541.338
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000681.33.fna -queryname NZ_BAIW010000681.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000681.33.fna -queryname NZ_BAIW010000681.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000681.33.fna -queryname NZ_BAIW010000681.33
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006131.339.fna -queryname NZ_CDPR010006131.339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006131.339.fna -queryname NZ_CDPR010006131.339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006131.339.fna -queryname NZ_CDPR010006131.339
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000971.340.fna -queryname NZ_CDPR010000971.340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000971.340.fna -queryname NZ_CDPR010000971.340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000971.340.fna -queryname NZ_CDPR010000971.340
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007261.341.fna -queryname NZ_CDPR010007261.341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007261.341.fna -queryname NZ_CDPR010007261.341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007261.341.fna -queryname NZ_CDPR010007261.341
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000031.342.fna -queryname NZ_CDPR010000031.342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000031.342.fna -queryname NZ_CDPR010000031.342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000031.342.fna -queryname NZ_CDPR010000031.342
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003471.343.fna -queryname NZ_CDPR010003471.343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003471.343.fna -queryname NZ_CDPR010003471.343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003471.343.fna -queryname NZ_CDPR010003471.343
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008631.344.fna -queryname NZ_CDPR010008631.344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008631.344.fna -queryname NZ_CDPR010008631.344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008631.344.fna -queryname NZ_CDPR010008631.344
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005801.345.fna -queryname NZ_CDPR010005801.345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005801.345.fna -queryname NZ_CDPR010005801.345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005801.345.fna -queryname NZ_CDPR010005801.345
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001901.346.fna -queryname NZ_CDPR010001901.346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001901.346.fna -queryname NZ_CDPR010001901.346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001901.346.fna -queryname NZ_CDPR010001901.346
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007771.347.fna -queryname NZ_CDPR010007771.347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007771.347.fna -queryname NZ_CDPR010007771.347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007771.347.fna -queryname NZ_CDPR010007771.347
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003381.348.fna -queryname NZ_CDPR010003381.348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003381.348.fna -queryname NZ_CDPR010003381.348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003381.348.fna -queryname NZ_CDPR010003381.348
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001131.34.fna -queryname NZ_BAIW010001131.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001131.34.fna -queryname NZ_BAIW010001131.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001131.34.fna -queryname NZ_BAIW010001131.34
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006941.349.fna -queryname NZ_CDPR010006941.349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006941.349.fna -queryname NZ_CDPR010006941.349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006941.349.fna -queryname NZ_CDPR010006941.349
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004811.350.fna -queryname NZ_CDPR010004811.350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004811.350.fna -queryname NZ_CDPR010004811.350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004811.350.fna -queryname NZ_CDPR010004811.350
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007301.351.fna -queryname NZ_CDPR010007301.351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007301.351.fna -queryname NZ_CDPR010007301.351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007301.351.fna -queryname NZ_CDPR010007301.351
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000931.352.fna -queryname NZ_CDPR010000931.352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000931.352.fna -queryname NZ_CDPR010000931.352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000931.352.fna -queryname NZ_CDPR010000931.352
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002511.353.fna -queryname NZ_CDPR010002511.353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002511.353.fna -queryname NZ_CDPR010002511.353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002511.353.fna -queryname NZ_CDPR010002511.353
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006161.354.fna -queryname NZ_CDPR010006161.354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006161.354.fna -queryname NZ_CDPR010006161.354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006161.354.fna -queryname NZ_CDPR010006161.354
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003651.355.fna -queryname NZ_CDPR010003651.355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003651.355.fna -queryname NZ_CDPR010003651.355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003651.355.fna -queryname NZ_CDPR010003651.355
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002091.356.fna -queryname NZ_CDPR010002091.356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002091.356.fna -queryname NZ_CDPR010002091.356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002091.356.fna -queryname NZ_CDPR010002091.356
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008821.357.fna -queryname NZ_CDPR010008821.357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008821.357.fna -queryname NZ_CDPR010008821.357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008821.357.fna -queryname NZ_CDPR010008821.357
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005831.358.fna -queryname NZ_CDPR010005831.358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005831.358.fna -queryname NZ_CDPR010005831.358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005831.358.fna -queryname NZ_CDPR010005831.358
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001111.35.fna -queryname NZ_BAIW010001111.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001111.35.fna -queryname NZ_BAIW010001111.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001111.35.fna -queryname NZ_BAIW010001111.35
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002271.359.fna -queryname NZ_CDPR010002271.359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002271.359.fna -queryname NZ_CDPR010002271.359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002271.359.fna -queryname NZ_CDPR010002271.359
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002911.360.fna -queryname NZ_CDPR010002911.360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002911.360.fna -queryname NZ_CDPR010002911.360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002911.360.fna -queryname NZ_CDPR010002911.360
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001991.361.fna -queryname NZ_CDPR010001991.361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001991.361.fna -queryname NZ_CDPR010001991.361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001991.361.fna -queryname NZ_CDPR010001991.361
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003341.362.fna -queryname NZ_CDPR010003341.362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003341.362.fna -queryname NZ_CDPR010003341.362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003341.362.fna -queryname NZ_CDPR010003341.362
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000161.363.fna -queryname NZ_CDPR010000161.363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000161.363.fna -queryname NZ_CDPR010000161.363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000161.363.fna -queryname NZ_CDPR010000161.363
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001681.364.fna -queryname NZ_CDPR010001681.364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001681.364.fna -queryname NZ_CDPR010001681.364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001681.364.fna -queryname NZ_CDPR010001681.364
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001861.365.fna -queryname NZ_CDPR010001861.365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001861.365.fna -queryname NZ_CDPR010001861.365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001861.365.fna -queryname NZ_CDPR010001861.365
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003961.366.fna -queryname NZ_CDPR010003961.366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003961.366.fna -queryname NZ_CDPR010003961.366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003961.366.fna -queryname NZ_CDPR010003961.366
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001191.367.fna -queryname NZ_CDPR010001191.367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001191.367.fna -queryname NZ_CDPR010001191.367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001191.367.fna -queryname NZ_CDPR010001191.367
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001411.368.fna -queryname NZ_CDPR010001411.368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001411.368.fna -queryname NZ_CDPR010001411.368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001411.368.fna -queryname NZ_CDPR010001411.368
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000121.36.fna -queryname NZ_BAIW010000121.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000121.36.fna -queryname NZ_BAIW010000121.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000121.36.fna -queryname NZ_BAIW010000121.36
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000831.369.fna -queryname NZ_CDPR010000831.369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000831.369.fna -queryname NZ_CDPR010000831.369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000831.369.fna -queryname NZ_CDPR010000831.369
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010191.370.fna -queryname NZ_CDPR010010191.370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010191.370.fna -queryname NZ_CDPR010010191.370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010191.370.fna -queryname NZ_CDPR010010191.370
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002881.371.fna -queryname NZ_CDPR010002881.371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002881.371.fna -queryname NZ_CDPR010002881.371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002881.371.fna -queryname NZ_CDPR010002881.371
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009081.372.fna -queryname NZ_CDPR010009081.372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009081.372.fna -queryname NZ_CDPR010009081.372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009081.372.fna -queryname NZ_CDPR010009081.372
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007521.373.fna -queryname NZ_CDPR010007521.373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007521.373.fna -queryname NZ_CDPR010007521.373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007521.373.fna -queryname NZ_CDPR010007521.373
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006651.374.fna -queryname NZ_CDPR010006651.374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006651.374.fna -queryname NZ_CDPR010006651.374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006651.374.fna -queryname NZ_CDPR010006651.374
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000521.375.fna -queryname NZ_CDPR010000521.375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000521.375.fna -queryname NZ_CDPR010000521.375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000521.375.fna -queryname NZ_CDPR010000521.375
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001381.376.fna -queryname NZ_CDPR010001381.376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001381.376.fna -queryname NZ_CDPR010001381.376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001381.376.fna -queryname NZ_CDPR010001381.376
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002151.377.fna -queryname NZ_CDPR010002151.377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002151.377.fna -queryname NZ_CDPR010002151.377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002151.377.fna -queryname NZ_CDPR010002151.377
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000151.378.fna -queryname NZ_CDPR010000151.378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000151.378.fna -queryname NZ_CDPR010000151.378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000151.378.fna -queryname NZ_CDPR010000151.378
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000701.37.fna -queryname NZ_BAIW010000701.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000701.37.fna -queryname NZ_BAIW010000701.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000701.37.fna -queryname NZ_BAIW010000701.37
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010431.379.fna -queryname NZ_CDPR010010431.379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010431.379.fna -queryname NZ_CDPR010010431.379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010431.379.fna -queryname NZ_CDPR010010431.379
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002471.380.fna -queryname NZ_CDPR010002471.380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002471.380.fna -queryname NZ_CDPR010002471.380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002471.380.fna -queryname NZ_CDPR010002471.380
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007651.381.fna -queryname NZ_CDPR010007651.381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007651.381.fna -queryname NZ_CDPR010007651.381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007651.381.fna -queryname NZ_CDPR010007651.381
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009891.382.fna -queryname NZ_CDPR010009891.382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009891.382.fna -queryname NZ_CDPR010009891.382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009891.382.fna -queryname NZ_CDPR010009891.382
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002201.383.fna -queryname NZ_CDPR010002201.383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002201.383.fna -queryname NZ_CDPR010002201.383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002201.383.fna -queryname NZ_CDPR010002201.383
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006811.384.fna -queryname NZ_CDPR010006811.384
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006811.384.fna -queryname NZ_CDPR010006811.384
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006811.384.fna -queryname NZ_CDPR010006811.384
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005131.385.fna -queryname NZ_CDPR010005131.385
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005131.385.fna -queryname NZ_CDPR010005131.385
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005131.385.fna -queryname NZ_CDPR010005131.385
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007611.386.fna -queryname NZ_CDPR010007611.386
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007611.386.fna -queryname NZ_CDPR010007611.386
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007611.386.fna -queryname NZ_CDPR010007611.386
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008281.387.fna -queryname NZ_CDPR010008281.387
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008281.387.fna -queryname NZ_CDPR010008281.387
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008281.387.fna -queryname NZ_CDPR010008281.387
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002011.388.fna -queryname NZ_CDPR010002011.388
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002011.388.fna -queryname NZ_CDPR010002011.388
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002011.388.fna -queryname NZ_CDPR010002011.388
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000091.38.fna -queryname NZ_BAIW010000091.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000091.38.fna -queryname NZ_BAIW010000091.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000091.38.fna -queryname NZ_BAIW010000091.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000091.38.AOI.fna -queryname NZ_BAIW010000091.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000091.38.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000091.38.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_BAIW010000091.38
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_BAIW010000091.38.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003991.389.fna -queryname NZ_CDPR010003991.389
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003991.389.fna -queryname NZ_CDPR010003991.389
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003991.389.fna -queryname NZ_CDPR010003991.389
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003111.390.fna -queryname NZ_CDPR010003111.390
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003111.390.fna -queryname NZ_CDPR010003111.390
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003111.390.fna -queryname NZ_CDPR010003111.390
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001511.391.fna -queryname NZ_CDPR010001511.391
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001511.391.fna -queryname NZ_CDPR010001511.391
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001511.391.fna -queryname NZ_CDPR010001511.391
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006801.392.fna -queryname NZ_CDPR010006801.392
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006801.392.fna -queryname NZ_CDPR010006801.392
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006801.392.fna -queryname NZ_CDPR010006801.392
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002981.393.fna -queryname NZ_CDPR010002981.393
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002981.393.fna -queryname NZ_CDPR010002981.393
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002981.393.fna -queryname NZ_CDPR010002981.393
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000311.394.fna -queryname NZ_CDPR010000311.394
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000311.394.fna -queryname NZ_CDPR010000311.394
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000311.394.fna -queryname NZ_CDPR010000311.394
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005051.395.fna -queryname NZ_CDPR010005051.395
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005051.395.fna -queryname NZ_CDPR010005051.395
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005051.395.fna -queryname NZ_CDPR010005051.395
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001571.396.fna -queryname NZ_CDPR010001571.396
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001571.396.fna -queryname NZ_CDPR010001571.396
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001571.396.fna -queryname NZ_CDPR010001571.396
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000441.397.fna -queryname NZ_CDPR010000441.397
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000441.397.fna -queryname NZ_CDPR010000441.397
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000441.397.fna -queryname NZ_CDPR010000441.397
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005121.398.fna -queryname NZ_CDPR010005121.398
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005121.398.fna -queryname NZ_CDPR010005121.398
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005121.398.fna -queryname NZ_CDPR010005121.398
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000851.3.fna -queryname NZ_BAIW010000851.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000851.3.fna -queryname NZ_BAIW010000851.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000851.3.fna -queryname NZ_BAIW010000851.3
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001391.39.fna -queryname NZ_BAIW010001391.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001391.39.fna -queryname NZ_BAIW010001391.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001391.39.fna -queryname NZ_BAIW010001391.39
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001521.399.fna -queryname NZ_CDPR010001521.399
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001521.399.fna -queryname NZ_CDPR010001521.399
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001521.399.fna -queryname NZ_CDPR010001521.399
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003121.400.fna -queryname NZ_CDPR010003121.400
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003121.400.fna -queryname NZ_CDPR010003121.400
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003121.400.fna -queryname NZ_CDPR010003121.400
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000731.401.fna -queryname NZ_CDPR010000731.401
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000731.401.fna -queryname NZ_CDPR010000731.401
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000731.401.fna -queryname NZ_CDPR010000731.401
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005311.402.fna -queryname NZ_CDPR010005311.402
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005311.402.fna -queryname NZ_CDPR010005311.402
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005311.402.fna -queryname NZ_CDPR010005311.402
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000421.403.fna -queryname NZ_CDPR010000421.403
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000421.403.fna -queryname NZ_CDPR010000421.403
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000421.403.fna -queryname NZ_CDPR010000421.403
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001641.404.fna -queryname NZ_CDPR010001641.404
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001641.404.fna -queryname NZ_CDPR010001641.404
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001641.404.fna -queryname NZ_CDPR010001641.404
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001111.405.fna -queryname NZ_CDPR010001111.405
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001111.405.fna -queryname NZ_CDPR010001111.405
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001111.405.fna -queryname NZ_CDPR010001111.405
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007201.406.fna -queryname NZ_CDPR010007201.406
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007201.406.fna -queryname NZ_CDPR010007201.406
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007201.406.fna -queryname NZ_CDPR010007201.406
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004911.407.fna -queryname NZ_CDPR010004911.407
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004911.407.fna -queryname NZ_CDPR010004911.407
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004911.407.fna -queryname NZ_CDPR010004911.407
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009811.408.fna -queryname NZ_CDPR010009811.408
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009811.408.fna -queryname NZ_CDPR010009811.408
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009811.408.fna -queryname NZ_CDPR010009811.408
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001051.40.fna -queryname NZ_BAIW010001051.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001051.40.fna -queryname NZ_BAIW010001051.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001051.40.fna -queryname NZ_BAIW010001051.40
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006631.409.fna -queryname NZ_CDPR010006631.409
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006631.409.fna -queryname NZ_CDPR010006631.409
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006631.409.fna -queryname NZ_CDPR010006631.409
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001961.410.fna -queryname NZ_CDPR010001961.410
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001961.410.fna -queryname NZ_CDPR010001961.410
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001961.410.fna -queryname NZ_CDPR010001961.410
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003151.411.fna -queryname NZ_CDPR010003151.411
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003151.411.fna -queryname NZ_CDPR010003151.411
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003151.411.fna -queryname NZ_CDPR010003151.411
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004221.412.fna -queryname NZ_CDPR010004221.412
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004221.412.fna -queryname NZ_CDPR010004221.412
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004221.412.fna -queryname NZ_CDPR010004221.412
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003791.413.fna -queryname NZ_CDPR010003791.413
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003791.413.fna -queryname NZ_CDPR010003791.413
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003791.413.fna -queryname NZ_CDPR010003791.413
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002631.414.fna -queryname NZ_CDPR010002631.414
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002631.414.fna -queryname NZ_CDPR010002631.414
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002631.414.fna -queryname NZ_CDPR010002631.414
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001181.415.fna -queryname NZ_CDPR010001181.415
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001181.415.fna -queryname NZ_CDPR010001181.415
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001181.415.fna -queryname NZ_CDPR010001181.415
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003371.416.fna -queryname NZ_CDPR010003371.416
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003371.416.fna -queryname NZ_CDPR010003371.416
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003371.416.fna -queryname NZ_CDPR010003371.416
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004151.417.fna -queryname NZ_CDPR010004151.417
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004151.417.fna -queryname NZ_CDPR010004151.417
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004151.417.fna -queryname NZ_CDPR010004151.417
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004421.418.fna -queryname NZ_CDPR010004421.418
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004421.418.fna -queryname NZ_CDPR010004421.418
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004421.418.fna -queryname NZ_CDPR010004421.418
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001251.41.fna -queryname NZ_BAIW010001251.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001251.41.fna -queryname NZ_BAIW010001251.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001251.41.fna -queryname NZ_BAIW010001251.41
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003921.419.fna -queryname NZ_CDPR010003921.419
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003921.419.fna -queryname NZ_CDPR010003921.419
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003921.419.fna -queryname NZ_CDPR010003921.419
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001731.420.fna -queryname NZ_CDPR010001731.420
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001731.420.fna -queryname NZ_CDPR010001731.420
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001731.420.fna -queryname NZ_CDPR010001731.420
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006851.421.fna -queryname NZ_CDPR010006851.421
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006851.421.fna -queryname NZ_CDPR010006851.421
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006851.421.fna -queryname NZ_CDPR010006851.421
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007321.422.fna -queryname NZ_CDPR010007321.422
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007321.422.fna -queryname NZ_CDPR010007321.422
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007321.422.fna -queryname NZ_CDPR010007321.422
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000021.423.fna -queryname NZ_CDPR010000021.423
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000021.423.fna -queryname NZ_CDPR010000021.423
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000021.423.fna -queryname NZ_CDPR010000021.423
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005481.424.fna -queryname NZ_CDPR010005481.424
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005481.424.fna -queryname NZ_CDPR010005481.424
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005481.424.fna -queryname NZ_CDPR010005481.424
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007211.425.fna -queryname NZ_CDPR010007211.425
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007211.425.fna -queryname NZ_CDPR010007211.425
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007211.425.fna -queryname NZ_CDPR010007211.425
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005961.426.fna -queryname NZ_CDPR010005961.426
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005961.426.fna -queryname NZ_CDPR010005961.426
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005961.426.fna -queryname NZ_CDPR010005961.426
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003001.427.fna -queryname NZ_CDPR010003001.427
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003001.427.fna -queryname NZ_CDPR010003001.427
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003001.427.fna -queryname NZ_CDPR010003001.427
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005411.428.fna -queryname NZ_CDPR010005411.428
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005411.428.fna -queryname NZ_CDPR010005411.428
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005411.428.fna -queryname NZ_CDPR010005411.428
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001061.42.fna -queryname NZ_BAIW010001061.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001061.42.fna -queryname NZ_BAIW010001061.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001061.42.fna -queryname NZ_BAIW010001061.42
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000821.429.fna -queryname NZ_CDPR010000821.429
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000821.429.fna -queryname NZ_CDPR010000821.429
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000821.429.fna -queryname NZ_CDPR010000821.429
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000091.430.fna -queryname NZ_CDPR010000091.430
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000091.430.fna -queryname NZ_CDPR010000091.430
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000091.430.fna -queryname NZ_CDPR010000091.430
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007461.431.fna -queryname NZ_CDPR010007461.431
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007461.431.fna -queryname NZ_CDPR010007461.431
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007461.431.fna -queryname NZ_CDPR010007461.431
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001291.432.fna -queryname NZ_CDPR010001291.432
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001291.432.fna -queryname NZ_CDPR010001291.432
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001291.432.fna -queryname NZ_CDPR010001291.432
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000211.433.fna -queryname NZ_CDPR010000211.433
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000211.433.fna -queryname NZ_CDPR010000211.433
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000211.433.fna -queryname NZ_CDPR010000211.433
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005791.434.fna -queryname NZ_CDPR010005791.434
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005791.434.fna -queryname NZ_CDPR010005791.434
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005791.434.fna -queryname NZ_CDPR010005791.434
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002291.435.fna -queryname NZ_CDPR010002291.435
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002291.435.fna -queryname NZ_CDPR010002291.435
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002291.435.fna -queryname NZ_CDPR010002291.435
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000371.436.fna -queryname NZ_CDPR010000371.436
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000371.436.fna -queryname NZ_CDPR010000371.436
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000371.436.fna -queryname NZ_CDPR010000371.436
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006981.437.fna -queryname NZ_CDPR010006981.437
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006981.437.fna -queryname NZ_CDPR010006981.437
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006981.437.fna -queryname NZ_CDPR010006981.437
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013811.438.fna -queryname NZ_CDPR010013811.438
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013811.438.fna -queryname NZ_CDPR010013811.438
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013811.438.fna -queryname NZ_CDPR010013811.438
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000191.43.fna -queryname NZ_BAIW010000191.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000191.43.fna -queryname NZ_BAIW010000191.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000191.43.fna -queryname NZ_BAIW010000191.43
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003211.439.fna -queryname NZ_CDPR010003211.439
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003211.439.fna -queryname NZ_CDPR010003211.439
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003211.439.fna -queryname NZ_CDPR010003211.439
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002391.440.fna -queryname NZ_CDPR010002391.440
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002391.440.fna -queryname NZ_CDPR010002391.440
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002391.440.fna -queryname NZ_CDPR010002391.440
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009631.441.fna -queryname NZ_CDPR010009631.441
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009631.441.fna -queryname NZ_CDPR010009631.441
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009631.441.fna -queryname NZ_CDPR010009631.441
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010321.442.fna -queryname NZ_CDPR010010321.442
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010321.442.fna -queryname NZ_CDPR010010321.442
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010321.442.fna -queryname NZ_CDPR010010321.442
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000911.443.fna -queryname NZ_CDPR010000911.443
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000911.443.fna -queryname NZ_CDPR010000911.443
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000911.443.fna -queryname NZ_CDPR010000911.443
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006561.444.fna -queryname NZ_CDPR010006561.444
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006561.444.fna -queryname NZ_CDPR010006561.444
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006561.444.fna -queryname NZ_CDPR010006561.444
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003981.445.fna -queryname NZ_CDPR010003981.445
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003981.445.fna -queryname NZ_CDPR010003981.445
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003981.445.fna -queryname NZ_CDPR010003981.445
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005251.446.fna -queryname NZ_CDPR010005251.446
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005251.446.fna -queryname NZ_CDPR010005251.446
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005251.446.fna -queryname NZ_CDPR010005251.446
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007861.447.fna -queryname NZ_CDPR010007861.447
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007861.447.fna -queryname NZ_CDPR010007861.447
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007861.447.fna -queryname NZ_CDPR010007861.447
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000841.448.fna -queryname NZ_CDPR010000841.448
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000841.448.fna -queryname NZ_CDPR010000841.448
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000841.448.fna -queryname NZ_CDPR010000841.448
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000791.44.fna -queryname NZ_BAIW010000791.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000791.44.fna -queryname NZ_BAIW010000791.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000791.44.fna -queryname NZ_BAIW010000791.44
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000431.449.fna -queryname NZ_CDPR010000431.449
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000431.449.fna -queryname NZ_CDPR010000431.449
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000431.449.fna -queryname NZ_CDPR010000431.449
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000601.450.fna -queryname NZ_CDPR010000601.450
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000601.450.fna -queryname NZ_CDPR010000601.450
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000601.450.fna -queryname NZ_CDPR010000601.450
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001741.451.fna -queryname NZ_CDPR010001741.451
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001741.451.fna -queryname NZ_CDPR010001741.451
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001741.451.fna -queryname NZ_CDPR010001741.451
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004851.452.fna -queryname NZ_CDPR010004851.452
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004851.452.fna -queryname NZ_CDPR010004851.452
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004851.452.fna -queryname NZ_CDPR010004851.452
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005631.453.fna -queryname NZ_CDPR010005631.453
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005631.453.fna -queryname NZ_CDPR010005631.453
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005631.453.fna -queryname NZ_CDPR010005631.453
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004741.454.fna -queryname NZ_CDPR010004741.454
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004741.454.fna -queryname NZ_CDPR010004741.454
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004741.454.fna -queryname NZ_CDPR010004741.454
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004971.455.fna -queryname NZ_CDPR010004971.455
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004971.455.fna -queryname NZ_CDPR010004971.455
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004971.455.fna -queryname NZ_CDPR010004971.455
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008791.456.fna -queryname NZ_CDPR010008791.456
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008791.456.fna -queryname NZ_CDPR010008791.456
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008791.456.fna -queryname NZ_CDPR010008791.456
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010551.457.fna -queryname NZ_CDPR010010551.457
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010551.457.fna -queryname NZ_CDPR010010551.457
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010551.457.fna -queryname NZ_CDPR010010551.457
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004021.458.fna -queryname NZ_CDPR010004021.458
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004021.458.fna -queryname NZ_CDPR010004021.458
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004021.458.fna -queryname NZ_CDPR010004021.458
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000981.45.fna -queryname NZ_BAIW010000981.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000981.45.fna -queryname NZ_BAIW010000981.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000981.45.fna -queryname NZ_BAIW010000981.45
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001551.459.fna -queryname NZ_CDPR010001551.459
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001551.459.fna -queryname NZ_CDPR010001551.459
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001551.459.fna -queryname NZ_CDPR010001551.459
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001471.460.fna -queryname NZ_CDPR010001471.460
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001471.460.fna -queryname NZ_CDPR010001471.460
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001471.460.fna -queryname NZ_CDPR010001471.460
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002791.461.fna -queryname NZ_CDPR010002791.461
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002791.461.fna -queryname NZ_CDPR010002791.461
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002791.461.fna -queryname NZ_CDPR010002791.461
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005521.462.fna -queryname NZ_CDPR010005521.462
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005521.462.fna -queryname NZ_CDPR010005521.462
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005521.462.fna -queryname NZ_CDPR010005521.462
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006871.463.fna -queryname NZ_CDPR010006871.463
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006871.463.fna -queryname NZ_CDPR010006871.463
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006871.463.fna -queryname NZ_CDPR010006871.463
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005531.464.fna -queryname NZ_CDPR010005531.464
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005531.464.fna -queryname NZ_CDPR010005531.464
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005531.464.fna -queryname NZ_CDPR010005531.464
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003751.465.fna -queryname NZ_CDPR010003751.465
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003751.465.fna -queryname NZ_CDPR010003751.465
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003751.465.fna -queryname NZ_CDPR010003751.465
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001001.466.fna -queryname NZ_CDPR010001001.466
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001001.466.fna -queryname NZ_CDPR010001001.466
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001001.466.fna -queryname NZ_CDPR010001001.466
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009441.467.fna -queryname NZ_CDPR010009441.467
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009441.467.fna -queryname NZ_CDPR010009441.467
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009441.467.fna -queryname NZ_CDPR010009441.467
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007671.468.fna -queryname NZ_CDPR010007671.468
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007671.468.fna -queryname NZ_CDPR010007671.468
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007671.468.fna -queryname NZ_CDPR010007671.468
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000141.46.fna -queryname NZ_BAIW010000141.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000141.46.fna -queryname NZ_BAIW010000141.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000141.46.fna -queryname NZ_BAIW010000141.46
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002081.469.fna -queryname NZ_CDPR010002081.469
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002081.469.fna -queryname NZ_CDPR010002081.469
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002081.469.fna -queryname NZ_CDPR010002081.469
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004791.470.fna -queryname NZ_CDPR010004791.470
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004791.470.fna -queryname NZ_CDPR010004791.470
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004791.470.fna -queryname NZ_CDPR010004791.470
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008051.471.fna -queryname NZ_CDPR010008051.471
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008051.471.fna -queryname NZ_CDPR010008051.471
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008051.471.fna -queryname NZ_CDPR010008051.471
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003271.472.fna -queryname NZ_CDPR010003271.472
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003271.472.fna -queryname NZ_CDPR010003271.472
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003271.472.fna -queryname NZ_CDPR010003271.472
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009101.473.fna -queryname NZ_CDPR010009101.473
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009101.473.fna -queryname NZ_CDPR010009101.473
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009101.473.fna -queryname NZ_CDPR010009101.473
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000061.474.fna -queryname NZ_CDPR010000061.474
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000061.474.fna -queryname NZ_CDPR010000061.474
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000061.474.fna -queryname NZ_CDPR010000061.474
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006741.475.fna -queryname NZ_CDPR010006741.475
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006741.475.fna -queryname NZ_CDPR010006741.475
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006741.475.fna -queryname NZ_CDPR010006741.475
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008031.476.fna -queryname NZ_CDPR010008031.476
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008031.476.fna -queryname NZ_CDPR010008031.476
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008031.476.fna -queryname NZ_CDPR010008031.476
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004141.477.fna -queryname NZ_CDPR010004141.477
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004141.477.fna -queryname NZ_CDPR010004141.477
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004141.477.fna -queryname NZ_CDPR010004141.477
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005991.478.fna -queryname NZ_CDPR010005991.478
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005991.478.fna -queryname NZ_CDPR010005991.478
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005991.478.fna -queryname NZ_CDPR010005991.478
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000651.47.fna -queryname NZ_BAIW010000651.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000651.47.fna -queryname NZ_BAIW010000651.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000651.47.fna -queryname NZ_BAIW010000651.47
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001701.479.fna -queryname NZ_CDPR010001701.479
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001701.479.fna -queryname NZ_CDPR010001701.479
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001701.479.fna -queryname NZ_CDPR010001701.479
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002061.480.fna -queryname NZ_CDPR010002061.480
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002061.480.fna -queryname NZ_CDPR010002061.480
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002061.480.fna -queryname NZ_CDPR010002061.480
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007371.481.fna -queryname NZ_CDPR010007371.481
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007371.481.fna -queryname NZ_CDPR010007371.481
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007371.481.fna -queryname NZ_CDPR010007371.481
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004041.482.fna -queryname NZ_CDPR010004041.482
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004041.482.fna -queryname NZ_CDPR010004041.482
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004041.482.fna -queryname NZ_CDPR010004041.482
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007901.483.fna -queryname NZ_CDPR010007901.483
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007901.483.fna -queryname NZ_CDPR010007901.483
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007901.483.fna -queryname NZ_CDPR010007901.483
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000241.484.fna -queryname NZ_CDPR010000241.484
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000241.484.fna -queryname NZ_CDPR010000241.484
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000241.484.fna -queryname NZ_CDPR010000241.484
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002361.485.fna -queryname NZ_CDPR010002361.485
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002361.485.fna -queryname NZ_CDPR010002361.485
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002361.485.fna -queryname NZ_CDPR010002361.485
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007251.486.fna -queryname NZ_CDPR010007251.486
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007251.486.fna -queryname NZ_CDPR010007251.486
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007251.486.fna -queryname NZ_CDPR010007251.486
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005971.487.fna -queryname NZ_CDPR010005971.487
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005971.487.fna -queryname NZ_CDPR010005971.487
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005971.487.fna -queryname NZ_CDPR010005971.487
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000621.488.fna -queryname NZ_CDPR010000621.488
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000621.488.fna -queryname NZ_CDPR010000621.488
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000621.488.fna -queryname NZ_CDPR010000621.488
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001511.48.fna -queryname NZ_BAIW010001511.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001511.48.fna -queryname NZ_BAIW010001511.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001511.48.fna -queryname NZ_BAIW010001511.48
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002731.489.fna -queryname NZ_CDPR010002731.489
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002731.489.fna -queryname NZ_CDPR010002731.489
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002731.489.fna -queryname NZ_CDPR010002731.489
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010011931.490.fna -queryname NZ_CDPR010011931.490
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010011931.490.fna -queryname NZ_CDPR010011931.490
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010011931.490.fna -queryname NZ_CDPR010011931.490
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000351.491.fna -queryname NZ_CDPR010000351.491
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000351.491.fna -queryname NZ_CDPR010000351.491
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000351.491.fna -queryname NZ_CDPR010000351.491
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007191.492.fna -queryname NZ_CDPR010007191.492
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007191.492.fna -queryname NZ_CDPR010007191.492
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007191.492.fna -queryname NZ_CDPR010007191.492
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003761.493.fna -queryname NZ_CDPR010003761.493
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003761.493.fna -queryname NZ_CDPR010003761.493
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003761.493.fna -queryname NZ_CDPR010003761.493
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005221.494.fna -queryname NZ_CDPR010005221.494
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005221.494.fna -queryname NZ_CDPR010005221.494
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005221.494.fna -queryname NZ_CDPR010005221.494
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001401.495.fna -queryname NZ_CDPR010001401.495
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001401.495.fna -queryname NZ_CDPR010001401.495
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001401.495.fna -queryname NZ_CDPR010001401.495
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004401.496.fna -queryname NZ_CDPR010004401.496
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004401.496.fna -queryname NZ_CDPR010004401.496
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004401.496.fna -queryname NZ_CDPR010004401.496
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005471.497.fna -queryname NZ_CDPR010005471.497
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005471.497.fna -queryname NZ_CDPR010005471.497
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005471.497.fna -queryname NZ_CDPR010005471.497
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004391.498.fna -queryname NZ_CDPR010004391.498
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004391.498.fna -queryname NZ_CDPR010004391.498
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004391.498.fna -queryname NZ_CDPR010004391.498
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001291.4.fna -queryname NZ_BAIW010001291.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001291.4.fna -queryname NZ_BAIW010001291.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001291.4.fna -queryname NZ_BAIW010001291.4
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001641.49.fna -queryname NZ_BAIW010001641.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001641.49.fna -queryname NZ_BAIW010001641.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001641.49.fna -queryname NZ_BAIW010001641.49
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000751.499.fna -queryname NZ_CDPR010000751.499
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000751.499.fna -queryname NZ_CDPR010000751.499
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000751.499.fna -queryname NZ_CDPR010000751.499
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005611.500.fna -queryname NZ_CDPR010005611.500
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005611.500.fna -queryname NZ_CDPR010005611.500
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005611.500.fna -queryname NZ_CDPR010005611.500
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002521.501.fna -queryname NZ_CDPR010002521.501
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002521.501.fna -queryname NZ_CDPR010002521.501
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002521.501.fna -queryname NZ_CDPR010002521.501
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006781.502.fna -queryname NZ_CDPR010006781.502
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006781.502.fna -queryname NZ_CDPR010006781.502
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006781.502.fna -queryname NZ_CDPR010006781.502
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003021.503.fna -queryname NZ_CDPR010003021.503
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003021.503.fna -queryname NZ_CDPR010003021.503
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003021.503.fna -queryname NZ_CDPR010003021.503
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003741.504.fna -queryname NZ_CDPR010003741.504
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003741.504.fna -queryname NZ_CDPR010003741.504
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003741.504.fna -queryname NZ_CDPR010003741.504
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000591.505.fna -queryname NZ_CDPR010000591.505
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000591.505.fna -queryname NZ_CDPR010000591.505
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000591.505.fna -queryname NZ_CDPR010000591.505
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004721.506.fna -queryname NZ_CDPR010004721.506
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004721.506.fna -queryname NZ_CDPR010004721.506
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004721.506.fna -queryname NZ_CDPR010004721.506
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004251.507.fna -queryname NZ_CDPR010004251.507
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004251.507.fna -queryname NZ_CDPR010004251.507
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004251.507.fna -queryname NZ_CDPR010004251.507
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007411.508.fna -queryname NZ_CDPR010007411.508
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007411.508.fna -queryname NZ_CDPR010007411.508
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007411.508.fna -queryname NZ_CDPR010007411.508
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000471.50.fna -queryname NZ_BAIW010000471.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000471.50.fna -queryname NZ_BAIW010000471.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000471.50.fna -queryname NZ_BAIW010000471.50
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000511.509.fna -queryname NZ_CDPR010000511.509
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000511.509.fna -queryname NZ_CDPR010000511.509
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000511.509.fna -queryname NZ_CDPR010000511.509
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007541.510.fna -queryname NZ_CDPR010007541.510
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007541.510.fna -queryname NZ_CDPR010007541.510
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007541.510.fna -queryname NZ_CDPR010007541.510
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004651.511.fna -queryname NZ_CDPR010004651.511
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004651.511.fna -queryname NZ_CDPR010004651.511
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004651.511.fna -queryname NZ_CDPR010004651.511
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007881.512.fna -queryname NZ_CDPR010007881.512
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007881.512.fna -queryname NZ_CDPR010007881.512
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007881.512.fna -queryname NZ_CDPR010007881.512
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000611.513.fna -queryname NZ_CDPR010000611.513
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000611.513.fna -queryname NZ_CDPR010000611.513
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000611.513.fna -queryname NZ_CDPR010000611.513
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004861.514.fna -queryname NZ_CDPR010004861.514
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004861.514.fna -queryname NZ_CDPR010004861.514
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004861.514.fna -queryname NZ_CDPR010004861.514
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000171.515.fna -queryname NZ_CDPR010000171.515
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000171.515.fna -queryname NZ_CDPR010000171.515
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000171.515.fna -queryname NZ_CDPR010000171.515
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003461.516.fna -queryname NZ_CDPR010003461.516
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003461.516.fna -queryname NZ_CDPR010003461.516
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003461.516.fna -queryname NZ_CDPR010003461.516
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000131.517.fna -queryname NZ_CDPR010000131.517
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000131.517.fna -queryname NZ_CDPR010000131.517
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000131.517.fna -queryname NZ_CDPR010000131.517
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002351.518.fna -queryname NZ_CDPR010002351.518
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002351.518.fna -queryname NZ_CDPR010002351.518
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002351.518.fna -queryname NZ_CDPR010002351.518
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001611.51.fna -queryname NZ_BAIW010001611.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001611.51.fna -queryname NZ_BAIW010001611.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001611.51.fna -queryname NZ_BAIW010001611.51
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004821.519.fna -queryname NZ_CDPR010004821.519
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004821.519.fna -queryname NZ_CDPR010004821.519
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004821.519.fna -queryname NZ_CDPR010004821.519
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002641.520.fna -queryname NZ_CDPR010002641.520
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002641.520.fna -queryname NZ_CDPR010002641.520
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002641.520.fna -queryname NZ_CDPR010002641.520
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001311.521.fna -queryname NZ_CDPR010001311.521
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001311.521.fna -queryname NZ_CDPR010001311.521
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001311.521.fna -queryname NZ_CDPR010001311.521
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000541.522.fna -queryname NZ_CDPR010000541.522
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000541.522.fna -queryname NZ_CDPR010000541.522
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000541.522.fna -queryname NZ_CDPR010000541.522
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001421.523.fna -queryname NZ_CDPR010001421.523
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001421.523.fna -queryname NZ_CDPR010001421.523
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001421.523.fna -queryname NZ_CDPR010001421.523
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004711.524.fna -queryname NZ_CDPR010004711.524
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004711.524.fna -queryname NZ_CDPR010004711.524
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004711.524.fna -queryname NZ_CDPR010004711.524
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001891.525.fna -queryname NZ_CDPR010001891.525
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001891.525.fna -queryname NZ_CDPR010001891.525
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001891.525.fna -queryname NZ_CDPR010001891.525
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000561.526.fna -queryname NZ_CDPR010000561.526
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000561.526.fna -queryname NZ_CDPR010000561.526
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000561.526.fna -queryname NZ_CDPR010000561.526
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000991.527.fna -queryname NZ_CDPR010000991.527
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000991.527.fna -queryname NZ_CDPR010000991.527
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000991.527.fna -queryname NZ_CDPR010000991.527
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007551.528.fna -queryname NZ_CDPR010007551.528
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007551.528.fna -queryname NZ_CDPR010007551.528
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007551.528.fna -queryname NZ_CDPR010007551.528
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001581.52.fna -queryname NZ_BAIW010001581.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001581.52.fna -queryname NZ_BAIW010001581.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001581.52.fna -queryname NZ_BAIW010001581.52
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003451.529.fna -queryname NZ_CDPR010003451.529
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003451.529.fna -queryname NZ_CDPR010003451.529
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003451.529.fna -queryname NZ_CDPR010003451.529
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002441.530.fna -queryname NZ_CDPR010002441.530
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002441.530.fna -queryname NZ_CDPR010002441.530
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002441.530.fna -queryname NZ_CDPR010002441.530
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000271.531.fna -queryname NZ_CDPR010000271.531
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000271.531.fna -queryname NZ_CDPR010000271.531
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000271.531.fna -queryname NZ_CDPR010000271.531
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000871.532.fna -queryname NZ_CDPR010000871.532
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000871.532.fna -queryname NZ_CDPR010000871.532
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000871.532.fna -queryname NZ_CDPR010000871.532
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000071.533.fna -queryname NZ_CDPR010000071.533
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000071.533.fna -queryname NZ_CDPR010000071.533
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000071.533.fna -queryname NZ_CDPR010000071.533
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003351.534.fna -queryname NZ_CDPR010003351.534
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003351.534.fna -queryname NZ_CDPR010003351.534
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003351.534.fna -queryname NZ_CDPR010003351.534
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000111.535.fna -queryname NZ_CDPR010000111.535
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000111.535.fna -queryname NZ_CDPR010000111.535
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000111.535.fna -queryname NZ_CDPR010000111.535
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001461.536.fna -queryname NZ_CDPR010001461.536
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001461.536.fna -queryname NZ_CDPR010001461.536
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001461.536.fna -queryname NZ_CDPR010001461.536
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002551.537.fna -queryname NZ_CDPR010002551.537
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002551.537.fna -queryname NZ_CDPR010002551.537
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002551.537.fna -queryname NZ_CDPR010002551.537
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004311.538.fna -queryname NZ_CDPR010004311.538
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004311.538.fna -queryname NZ_CDPR010004311.538
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004311.538.fna -queryname NZ_CDPR010004311.538
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000071.53.fna -queryname NZ_BAIW010000071.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000071.53.fna -queryname NZ_BAIW010000071.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000071.53.fna -queryname NZ_BAIW010000071.53
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005181.539.fna -queryname NZ_CDPR010005181.539
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005181.539.fna -queryname NZ_CDPR010005181.539
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005181.539.fna -queryname NZ_CDPR010005181.539
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004571.540.fna -queryname NZ_CDPR010004571.540
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004571.540.fna -queryname NZ_CDPR010004571.540
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004571.540.fna -queryname NZ_CDPR010004571.540
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004841.541.fna -queryname NZ_CDPR010004841.541
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004841.541.fna -queryname NZ_CDPR010004841.541
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004841.541.fna -queryname NZ_CDPR010004841.541
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005701.542.fna -queryname NZ_CDPR010005701.542
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005701.542.fna -queryname NZ_CDPR010005701.542
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005701.542.fna -queryname NZ_CDPR010005701.542
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003801.543.fna -queryname NZ_CDPR010003801.543
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003801.543.fna -queryname NZ_CDPR010003801.543
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003801.543.fna -queryname NZ_CDPR010003801.543
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002001.544.fna -queryname NZ_CDPR010002001.544
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002001.544.fna -queryname NZ_CDPR010002001.544
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002001.544.fna -queryname NZ_CDPR010002001.544
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000341.545.fna -queryname NZ_CDPR010000341.545
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000341.545.fna -queryname NZ_CDPR010000341.545
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000341.545.fna -queryname NZ_CDPR010000341.545
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002321.546.fna -queryname NZ_CDPR010002321.546
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002321.546.fna -queryname NZ_CDPR010002321.546
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002321.546.fna -queryname NZ_CDPR010002321.546
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000651.547.fna -queryname NZ_CDPR010000651.547
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000651.547.fna -queryname NZ_CDPR010000651.547
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000651.547.fna -queryname NZ_CDPR010000651.547
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002541.548.fna -queryname NZ_CDPR010002541.548
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002541.548.fna -queryname NZ_CDPR010002541.548
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002541.548.fna -queryname NZ_CDPR010002541.548
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000351.54.fna -queryname NZ_BAIW010000351.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000351.54.fna -queryname NZ_BAIW010000351.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000351.54.fna -queryname NZ_BAIW010000351.54
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000321.549.fna -queryname NZ_CDPR010000321.549
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000321.549.fna -queryname NZ_CDPR010000321.549
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000321.549.fna -queryname NZ_CDPR010000321.549
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006091.550.fna -queryname NZ_CDPR010006091.550
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006091.550.fna -queryname NZ_CDPR010006091.550
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006091.550.fna -queryname NZ_CDPR010006091.550
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003711.551.fna -queryname NZ_CDPR010003711.551
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003711.551.fna -queryname NZ_CDPR010003711.551
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003711.551.fna -queryname NZ_CDPR010003711.551
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003131.552.fna -queryname NZ_CDPR010003131.552
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003131.552.fna -queryname NZ_CDPR010003131.552
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003131.552.fna -queryname NZ_CDPR010003131.552
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006351.553.fna -queryname NZ_CDPR010006351.553
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006351.553.fna -queryname NZ_CDPR010006351.553
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006351.553.fna -queryname NZ_CDPR010006351.553
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000181.554.fna -queryname NZ_CDPR010000181.554
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000181.554.fna -queryname NZ_CDPR010000181.554
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000181.554.fna -queryname NZ_CDPR010000181.554
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007721.555.fna -queryname NZ_CDPR010007721.555
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007721.555.fna -queryname NZ_CDPR010007721.555
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007721.555.fna -queryname NZ_CDPR010007721.555
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003071.556.fna -queryname NZ_CDPR010003071.556
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003071.556.fna -queryname NZ_CDPR010003071.556
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003071.556.fna -queryname NZ_CDPR010003071.556
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004951.557.fna -queryname NZ_CDPR010004951.557
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004951.557.fna -queryname NZ_CDPR010004951.557
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004951.557.fna -queryname NZ_CDPR010004951.557
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003401.558.fna -queryname NZ_CDPR010003401.558
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003401.558.fna -queryname NZ_CDPR010003401.558
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003401.558.fna -queryname NZ_CDPR010003401.558
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000341.55.fna -queryname NZ_BAIW010000341.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000341.55.fna -queryname NZ_BAIW010000341.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000341.55.fna -queryname NZ_BAIW010000341.55
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010051.559.fna -queryname NZ_CDPR010010051.559
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010051.559.fna -queryname NZ_CDPR010010051.559
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010051.559.fna -queryname NZ_CDPR010010051.559
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002841.560.fna -queryname NZ_CDPR010002841.560
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002841.560.fna -queryname NZ_CDPR010002841.560
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002841.560.fna -queryname NZ_CDPR010002841.560
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007101.561.fna -queryname NZ_CDPR010007101.561
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007101.561.fna -queryname NZ_CDPR010007101.561
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007101.561.fna -queryname NZ_CDPR010007101.561
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004071.562.fna -queryname NZ_CDPR010004071.562
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004071.562.fna -queryname NZ_CDPR010004071.562
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004071.562.fna -queryname NZ_CDPR010004071.562
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001031.563.fna -queryname NZ_CDPR010001031.563
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001031.563.fna -queryname NZ_CDPR010001031.563
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001031.563.fna -queryname NZ_CDPR010001031.563
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008181.564.fna -queryname NZ_CDPR010008181.564
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008181.564.fna -queryname NZ_CDPR010008181.564
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008181.564.fna -queryname NZ_CDPR010008181.564
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001501.565.fna -queryname NZ_CDPR010001501.565
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001501.565.fna -queryname NZ_CDPR010001501.565
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001501.565.fna -queryname NZ_CDPR010001501.565
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003361.566.fna -queryname NZ_CDPR010003361.566
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003361.566.fna -queryname NZ_CDPR010003361.566
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003361.566.fna -queryname NZ_CDPR010003361.566
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002241.567.fna -queryname NZ_CDPR010002241.567
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002241.567.fna -queryname NZ_CDPR010002241.567
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002241.567.fna -queryname NZ_CDPR010002241.567
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002811.568.fna -queryname NZ_CDPR010002811.568
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002811.568.fna -queryname NZ_CDPR010002811.568
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002811.568.fna -queryname NZ_CDPR010002811.568
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001401.56.fna -queryname NZ_BAIW010001401.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001401.56.fna -queryname NZ_BAIW010001401.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001401.56.fna -queryname NZ_BAIW010001401.56
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002341.569.fna -queryname NZ_CDPR010002341.569
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002341.569.fna -queryname NZ_CDPR010002341.569
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002341.569.fna -queryname NZ_CDPR010002341.569
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003171.570.fna -queryname NZ_CDPR010003171.570
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003171.570.fna -queryname NZ_CDPR010003171.570
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003171.570.fna -queryname NZ_CDPR010003171.570
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004961.571.fna -queryname NZ_CDPR010004961.571
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004961.571.fna -queryname NZ_CDPR010004961.571
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004961.571.fna -queryname NZ_CDPR010004961.571
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000391.572.fna -queryname NZ_CDPR010000391.572
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000391.572.fna -queryname NZ_CDPR010000391.572
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000391.572.fna -queryname NZ_CDPR010000391.572
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006731.573.fna -queryname NZ_CDPR010006731.573
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006731.573.fna -queryname NZ_CDPR010006731.573
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006731.573.fna -queryname NZ_CDPR010006731.573
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000221.574.fna -queryname NZ_CDPR010000221.574
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000221.574.fna -queryname NZ_CDPR010000221.574
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000221.574.fna -queryname NZ_CDPR010000221.574
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007531.575.fna -queryname NZ_CDPR010007531.575
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007531.575.fna -queryname NZ_CDPR010007531.575
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007531.575.fna -queryname NZ_CDPR010007531.575
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000411.576.fna -queryname NZ_CDPR010000411.576
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000411.576.fna -queryname NZ_CDPR010000411.576
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000411.576.fna -queryname NZ_CDPR010000411.576
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007961.577.fna -queryname NZ_CDPR010007961.577
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007961.577.fna -queryname NZ_CDPR010007961.577
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007961.577.fna -queryname NZ_CDPR010007961.577
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004351.578.fna -queryname NZ_CDPR010004351.578
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004351.578.fna -queryname NZ_CDPR010004351.578
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004351.578.fna -queryname NZ_CDPR010004351.578
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000181.57.fna -queryname NZ_BAIW010000181.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000181.57.fna -queryname NZ_BAIW010000181.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000181.57.fna -queryname NZ_BAIW010000181.57
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001781.579.fna -queryname NZ_CDPR010001781.579
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001781.579.fna -queryname NZ_CDPR010001781.579
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001781.579.fna -queryname NZ_CDPR010001781.579
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004201.580.fna -queryname NZ_CDPR010004201.580
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004201.580.fna -queryname NZ_CDPR010004201.580
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004201.580.fna -queryname NZ_CDPR010004201.580
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004561.581.fna -queryname NZ_CDPR010004561.581
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004561.581.fna -queryname NZ_CDPR010004561.581
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004561.581.fna -queryname NZ_CDPR010004561.581
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001491.582.fna -queryname NZ_CDPR010001491.582
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001491.582.fna -queryname NZ_CDPR010001491.582
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001491.582.fna -queryname NZ_CDPR010001491.582
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000491.583.fna -queryname NZ_CDPR010000491.583
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000491.583.fna -queryname NZ_CDPR010000491.583
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000491.583.fna -queryname NZ_CDPR010000491.583
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006991.584.fna -queryname NZ_CDPR010006991.584
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006991.584.fna -queryname NZ_CDPR010006991.584
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006991.584.fna -queryname NZ_CDPR010006991.584
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009031.585.fna -queryname NZ_CDPR010009031.585
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009031.585.fna -queryname NZ_CDPR010009031.585
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009031.585.fna -queryname NZ_CDPR010009031.585
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004521.586.fna -queryname NZ_CDPR010004521.586
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004521.586.fna -queryname NZ_CDPR010004521.586
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004521.586.fna -queryname NZ_CDPR010004521.586
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003051.587.fna -queryname NZ_CDPR010003051.587
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003051.587.fna -queryname NZ_CDPR010003051.587
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003051.587.fna -queryname NZ_CDPR010003051.587
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001601.588.fna -queryname NZ_CDPR010001601.588
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001601.588.fna -queryname NZ_CDPR010001601.588
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001601.588.fna -queryname NZ_CDPR010001601.588
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001031.58.fna -queryname NZ_BAIW010001031.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001031.58.fna -queryname NZ_BAIW010001031.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001031.58.fna -queryname NZ_BAIW010001031.58
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002181.589.fna -queryname NZ_CDPR010002181.589
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002181.589.fna -queryname NZ_CDPR010002181.589
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002181.589.fna -queryname NZ_CDPR010002181.589
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001161.590.fna -queryname NZ_CDPR010001161.590
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001161.590.fna -queryname NZ_CDPR010001161.590
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001161.590.fna -queryname NZ_CDPR010001161.590
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006671.591.fna -queryname NZ_CDPR010006671.591
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006671.591.fna -queryname NZ_CDPR010006671.591
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006671.591.fna -queryname NZ_CDPR010006671.591
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003771.592.fna -queryname NZ_CDPR010003771.592
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003771.592.fna -queryname NZ_CDPR010003771.592
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003771.592.fna -queryname NZ_CDPR010003771.592
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006821.593.fna -queryname NZ_CDPR010006821.593
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006821.593.fna -queryname NZ_CDPR010006821.593
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006821.593.fna -queryname NZ_CDPR010006821.593
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006841.594.fna -queryname NZ_CDPR010006841.594
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006841.594.fna -queryname NZ_CDPR010006841.594
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006841.594.fna -queryname NZ_CDPR010006841.594
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002831.595.fna -queryname NZ_CDPR010002831.595
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002831.595.fna -queryname NZ_CDPR010002831.595
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002831.595.fna -queryname NZ_CDPR010002831.595
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005921.596.fna -queryname NZ_CDPR010005921.596
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005921.596.fna -queryname NZ_CDPR010005921.596
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005921.596.fna -queryname NZ_CDPR010005921.596
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005111.597.fna -queryname NZ_CDPR010005111.597
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005111.597.fna -queryname NZ_CDPR010005111.597
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005111.597.fna -queryname NZ_CDPR010005111.597
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001251.598.fna -queryname NZ_CDPR010001251.598
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001251.598.fna -queryname NZ_CDPR010001251.598
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001251.598.fna -queryname NZ_CDPR010001251.598
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001251.598.AOI.fna -queryname NZ_CDPR010001251.598
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001251.598.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001251.598.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_CDPR010001251.598
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_CDPR010001251.598.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000821.5.fna -queryname NZ_BAIW010000821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000821.5.fna -queryname NZ_BAIW010000821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000821.5.fna -queryname NZ_BAIW010000821.5
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001601.59.fna -queryname NZ_BAIW010001601.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001601.59.fna -queryname NZ_BAIW010001601.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001601.59.fna -queryname NZ_BAIW010001601.59
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006501.599.fna -queryname NZ_CDPR010006501.599
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006501.599.fna -queryname NZ_CDPR010006501.599
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006501.599.fna -queryname NZ_CDPR010006501.599
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000641.600.fna -queryname NZ_CDPR010000641.600
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000641.600.fna -queryname NZ_CDPR010000641.600
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000641.600.fna -queryname NZ_CDPR010000641.600
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001441.601.fna -queryname NZ_CDPR010001441.601
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001441.601.fna -queryname NZ_CDPR010001441.601
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001441.601.fna -queryname NZ_CDPR010001441.601
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002111.602.fna -queryname NZ_CDPR010002111.602
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002111.602.fna -queryname NZ_CDPR010002111.602
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002111.602.fna -queryname NZ_CDPR010002111.602
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008691.603.fna -queryname NZ_CDPR010008691.603
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008691.603.fna -queryname NZ_CDPR010008691.603
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008691.603.fna -queryname NZ_CDPR010008691.603
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002041.604.fna -queryname NZ_CDPR010002041.604
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002041.604.fna -queryname NZ_CDPR010002041.604
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002041.604.fna -queryname NZ_CDPR010002041.604
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007761.605.fna -queryname NZ_CDPR010007761.605
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007761.605.fna -queryname NZ_CDPR010007761.605
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007761.605.fna -queryname NZ_CDPR010007761.605
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007661.606.fna -queryname NZ_CDPR010007661.606
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007661.606.fna -queryname NZ_CDPR010007661.606
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007661.606.fna -queryname NZ_CDPR010007661.606
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007751.607.fna -queryname NZ_CDPR010007751.607
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007751.607.fna -queryname NZ_CDPR010007751.607
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007751.607.fna -queryname NZ_CDPR010007751.607
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008831.608.fna -queryname NZ_CDPR010008831.608
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008831.608.fna -queryname NZ_CDPR010008831.608
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008831.608.fna -queryname NZ_CDPR010008831.608
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001181.60.fna -queryname NZ_BAIW010001181.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001181.60.fna -queryname NZ_BAIW010001181.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001181.60.fna -queryname NZ_BAIW010001181.60
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000401.609.fna -queryname NZ_CDPR010000401.609
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000401.609.fna -queryname NZ_CDPR010000401.609
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000401.609.fna -queryname NZ_CDPR010000401.609
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007241.610.fna -queryname NZ_CDPR010007241.610
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007241.610.fna -queryname NZ_CDPR010007241.610
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007241.610.fna -queryname NZ_CDPR010007241.610
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003851.611.fna -queryname NZ_CDPR010003851.611
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003851.611.fna -queryname NZ_CDPR010003851.611
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003851.611.fna -queryname NZ_CDPR010003851.611
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006431.612.fna -queryname NZ_CDPR010006431.612
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006431.612.fna -queryname NZ_CDPR010006431.612
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006431.612.fna -queryname NZ_CDPR010006431.612
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003291.613.fna -queryname NZ_CDPR010003291.613
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003291.613.fna -queryname NZ_CDPR010003291.613
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003291.613.fna -queryname NZ_CDPR010003291.613
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005911.614.fna -queryname NZ_CDPR010005911.614
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005911.614.fna -queryname NZ_CDPR010005911.614
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005911.614.fna -queryname NZ_CDPR010005911.614
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001931.615.fna -queryname NZ_CDPR010001931.615
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001931.615.fna -queryname NZ_CDPR010001931.615
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001931.615.fna -queryname NZ_CDPR010001931.615
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001531.616.fna -queryname NZ_CDPR010001531.616
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001531.616.fna -queryname NZ_CDPR010001531.616
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001531.616.fna -queryname NZ_CDPR010001531.616
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005211.617.fna -queryname NZ_CDPR010005211.617
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005211.617.fna -queryname NZ_CDPR010005211.617
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005211.617.fna -queryname NZ_CDPR010005211.617
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013911.618.fna -queryname NZ_CDPR010013911.618
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013911.618.fna -queryname NZ_CDPR010013911.618
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013911.618.fna -queryname NZ_CDPR010013911.618
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001381.61.fna -queryname NZ_BAIW010001381.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001381.61.fna -queryname NZ_BAIW010001381.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001381.61.fna -queryname NZ_BAIW010001381.61
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006881.619.fna -queryname NZ_CDPR010006881.619
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006881.619.fna -queryname NZ_CDPR010006881.619
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006881.619.fna -queryname NZ_CDPR010006881.619
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013861.620.fna -queryname NZ_CDPR010013861.620
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013861.620.fna -queryname NZ_CDPR010013861.620
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013861.620.fna -queryname NZ_CDPR010013861.620
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007311.621.fna -queryname NZ_CDPR010007311.621
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007311.621.fna -queryname NZ_CDPR010007311.621
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007311.621.fna -queryname NZ_CDPR010007311.621
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007381.622.fna -queryname NZ_CDPR010007381.622
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007381.622.fna -queryname NZ_CDPR010007381.622
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007381.622.fna -queryname NZ_CDPR010007381.622
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003831.623.fna -queryname NZ_CDPR010003831.623
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003831.623.fna -queryname NZ_CDPR010003831.623
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003831.623.fna -queryname NZ_CDPR010003831.623
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001481.624.fna -queryname NZ_CDPR010001481.624
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001481.624.fna -queryname NZ_CDPR010001481.624
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001481.624.fna -queryname NZ_CDPR010001481.624
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003231.625.fna -queryname NZ_CDPR010003231.625
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003231.625.fna -queryname NZ_CDPR010003231.625
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003231.625.fna -queryname NZ_CDPR010003231.625
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002771.626.fna -queryname NZ_CDPR010002771.626
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002771.626.fna -queryname NZ_CDPR010002771.626
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002771.626.fna -queryname NZ_CDPR010002771.626
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003571.627.fna -queryname NZ_CDPR010003571.627
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003571.627.fna -queryname NZ_CDPR010003571.627
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003571.627.fna -queryname NZ_CDPR010003571.627
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001711.628.fna -queryname NZ_CDPR010001711.628
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001711.628.fna -queryname NZ_CDPR010001711.628
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001711.628.fna -queryname NZ_CDPR010001711.628
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000061.62.fna -queryname NZ_BAIW010000061.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000061.62.fna -queryname NZ_BAIW010000061.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000061.62.fna -queryname NZ_BAIW010000061.62
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002761.629.fna -queryname NZ_CDPR010002761.629
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002761.629.fna -queryname NZ_CDPR010002761.629
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002761.629.fna -queryname NZ_CDPR010002761.629
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000811.630.fna -queryname NZ_CDPR010000811.630
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000811.630.fna -queryname NZ_CDPR010000811.630
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000811.630.fna -queryname NZ_CDPR010000811.630
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005821.631.fna -queryname NZ_CDPR010005821.631
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005821.631.fna -queryname NZ_CDPR010005821.631
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005821.631.fna -queryname NZ_CDPR010005821.631
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000331.632.fna -queryname NZ_CDPR010000331.632
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000331.632.fna -queryname NZ_CDPR010000331.632
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000331.632.fna -queryname NZ_CDPR010000331.632
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007791.633.fna -queryname NZ_CDPR010007791.633
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007791.633.fna -queryname NZ_CDPR010007791.633
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007791.633.fna -queryname NZ_CDPR010007791.633
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002691.634.fna -queryname NZ_CDPR010002691.634
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002691.634.fna -queryname NZ_CDPR010002691.634
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002691.634.fna -queryname NZ_CDPR010002691.634
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013891.635.fna -queryname NZ_CDPR010013891.635
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013891.635.fna -queryname NZ_CDPR010013891.635
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013891.635.fna -queryname NZ_CDPR010013891.635
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003431.636.fna -queryname NZ_CDPR010003431.636
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003431.636.fna -queryname NZ_CDPR010003431.636
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003431.636.fna -queryname NZ_CDPR010003431.636
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005771.637.fna -queryname NZ_CDPR010005771.637
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005771.637.fna -queryname NZ_CDPR010005771.637
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005771.637.fna -queryname NZ_CDPR010005771.637
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003941.638.fna -queryname NZ_CDPR010003941.638
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003941.638.fna -queryname NZ_CDPR010003941.638
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003941.638.fna -queryname NZ_CDPR010003941.638
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000171.63.fna -queryname NZ_BAIW010000171.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000171.63.fna -queryname NZ_BAIW010000171.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000171.63.fna -queryname NZ_BAIW010000171.63
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001211.639.fna -queryname NZ_CDPR010001211.639
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001211.639.fna -queryname NZ_CDPR010001211.639
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001211.639.fna -queryname NZ_CDPR010001211.639
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001971.640.fna -queryname NZ_CDPR010001971.640
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001971.640.fna -queryname NZ_CDPR010001971.640
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001971.640.fna -queryname NZ_CDPR010001971.640
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007181.641.fna -queryname NZ_CDPR010007181.641
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007181.641.fna -queryname NZ_CDPR010007181.641
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007181.641.fna -queryname NZ_CDPR010007181.641
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002891.642.fna -queryname NZ_CDPR010002891.642
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002891.642.fna -queryname NZ_CDPR010002891.642
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002891.642.fna -queryname NZ_CDPR010002891.642
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005871.643.fna -queryname NZ_CDPR010005871.643
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005871.643.fna -queryname NZ_CDPR010005871.643
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005871.643.fna -queryname NZ_CDPR010005871.643
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005161.644.fna -queryname NZ_CDPR010005161.644
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005161.644.fna -queryname NZ_CDPR010005161.644
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005161.644.fna -queryname NZ_CDPR010005161.644
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004011.645.fna -queryname NZ_CDPR010004011.645
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004011.645.fna -queryname NZ_CDPR010004011.645
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004011.645.fna -queryname NZ_CDPR010004011.645
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003661.646.fna -queryname NZ_CDPR010003661.646
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003661.646.fna -queryname NZ_CDPR010003661.646
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003661.646.fna -queryname NZ_CDPR010003661.646
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000681.647.fna -queryname NZ_CDPR010000681.647
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000681.647.fna -queryname NZ_CDPR010000681.647
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000681.647.fna -queryname NZ_CDPR010000681.647
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005591.648.fna -queryname NZ_CDPR010005591.648
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005591.648.fna -queryname NZ_CDPR010005591.648
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005591.648.fna -queryname NZ_CDPR010005591.648
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001681.64.fna -queryname NZ_BAIW010001681.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001681.64.fna -queryname NZ_BAIW010001681.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001681.64.fna -queryname NZ_BAIW010001681.64
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003101.649.fna -queryname NZ_CDPR010003101.649
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003101.649.fna -queryname NZ_CDPR010003101.649
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003101.649.fna -queryname NZ_CDPR010003101.649
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004501.650.fna -queryname NZ_CDPR010004501.650
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004501.650.fna -queryname NZ_CDPR010004501.650
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004501.650.fna -queryname NZ_CDPR010004501.650
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002211.651.fna -queryname NZ_CDPR010002211.651
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002211.651.fna -queryname NZ_CDPR010002211.651
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002211.651.fna -queryname NZ_CDPR010002211.651
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000281.652.fna -queryname NZ_CDPR010000281.652
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000281.652.fna -queryname NZ_CDPR010000281.652
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000281.652.fna -queryname NZ_CDPR010000281.652
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004341.653.fna -queryname NZ_CDPR010004341.653
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004341.653.fna -queryname NZ_CDPR010004341.653
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004341.653.fna -queryname NZ_CDPR010004341.653
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003501.654.fna -queryname NZ_CDPR010003501.654
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003501.654.fna -queryname NZ_CDPR010003501.654
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003501.654.fna -queryname NZ_CDPR010003501.654
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007221.655.fna -queryname NZ_CDPR010007221.655
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007221.655.fna -queryname NZ_CDPR010007221.655
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007221.655.fna -queryname NZ_CDPR010007221.655
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003241.656.fna -queryname NZ_CDPR010003241.656
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003241.656.fna -queryname NZ_CDPR010003241.656
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003241.656.fna -queryname NZ_CDPR010003241.656
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005931.657.fna -queryname NZ_CDPR010005931.657
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005931.657.fna -queryname NZ_CDPR010005931.657
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005931.657.fna -queryname NZ_CDPR010005931.657
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000711.658.fna -queryname NZ_CDPR010000711.658
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000711.658.fna -queryname NZ_CDPR010000711.658
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000711.658.fna -queryname NZ_CDPR010000711.658
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000721.65.fna -queryname NZ_BAIW010000721.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000721.65.fna -queryname NZ_BAIW010000721.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000721.65.fna -queryname NZ_BAIW010000721.65
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006971.659.fna -queryname NZ_CDPR010006971.659
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006971.659.fna -queryname NZ_CDPR010006971.659
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006971.659.fna -queryname NZ_CDPR010006971.659
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003731.660.fna -queryname NZ_CDPR010003731.660
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003731.660.fna -queryname NZ_CDPR010003731.660
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003731.660.fna -queryname NZ_CDPR010003731.660
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008911.661.fna -queryname NZ_CDPR010008911.661
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008911.661.fna -queryname NZ_CDPR010008911.661
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008911.661.fna -queryname NZ_CDPR010008911.661
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005491.662.fna -queryname NZ_CDPR010005491.662
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005491.662.fna -queryname NZ_CDPR010005491.662
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005491.662.fna -queryname NZ_CDPR010005491.662
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004171.663.fna -queryname NZ_CDPR010004171.663
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004171.663.fna -queryname NZ_CDPR010004171.663
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004171.663.fna -queryname NZ_CDPR010004171.663
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008681.664.fna -queryname NZ_CDPR010008681.664
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008681.664.fna -queryname NZ_CDPR010008681.664
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008681.664.fna -queryname NZ_CDPR010008681.664
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002531.665.fna -queryname NZ_CDPR010002531.665
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002531.665.fna -queryname NZ_CDPR010002531.665
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002531.665.fna -queryname NZ_CDPR010002531.665
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005851.666.fna -queryname NZ_CDPR010005851.666
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005851.666.fna -queryname NZ_CDPR010005851.666
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005851.666.fna -queryname NZ_CDPR010005851.666
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008271.667.fna -queryname NZ_CDPR010008271.667
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008271.667.fna -queryname NZ_CDPR010008271.667
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008271.667.fna -queryname NZ_CDPR010008271.667
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000581.668.fna -queryname NZ_CDPR010000581.668
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000581.668.fna -queryname NZ_CDPR010000581.668
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000581.668.fna -queryname NZ_CDPR010000581.668
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000231.66.fna -queryname NZ_BAIW010000231.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000231.66.fna -queryname NZ_BAIW010000231.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000231.66.fna -queryname NZ_BAIW010000231.66
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005571.669.fna -queryname NZ_CDPR010005571.669
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005571.669.fna -queryname NZ_CDPR010005571.669
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005571.669.fna -queryname NZ_CDPR010005571.669
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006831.670.fna -queryname NZ_CDPR010006831.670
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006831.670.fna -queryname NZ_CDPR010006831.670
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006831.670.fna -queryname NZ_CDPR010006831.670
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000741.671.fna -queryname NZ_CDPR010000741.671
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000741.671.fna -queryname NZ_CDPR010000741.671
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000741.671.fna -queryname NZ_CDPR010000741.671
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003891.672.fna -queryname NZ_CDPR010003891.672
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003891.672.fna -queryname NZ_CDPR010003891.672
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003891.672.fna -queryname NZ_CDPR010003891.672
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004631.673.fna -queryname NZ_CDPR010004631.673
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004631.673.fna -queryname NZ_CDPR010004631.673
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004631.673.fna -queryname NZ_CDPR010004631.673
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007511.674.fna -queryname NZ_CDPR010007511.674
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007511.674.fna -queryname NZ_CDPR010007511.674
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007511.674.fna -queryname NZ_CDPR010007511.674
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000791.675.fna -queryname NZ_CDPR010000791.675
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000791.675.fna -queryname NZ_CDPR010000791.675
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000791.675.fna -queryname NZ_CDPR010000791.675
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001921.676.fna -queryname NZ_CDPR010001921.676
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001921.676.fna -queryname NZ_CDPR010001921.676
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001921.676.fna -queryname NZ_CDPR010001921.676
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002171.677.fna -queryname NZ_CDPR010002171.677
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002171.677.fna -queryname NZ_CDPR010002171.677
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002171.677.fna -queryname NZ_CDPR010002171.677
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002991.678.fna -queryname NZ_CDPR010002991.678
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002991.678.fna -queryname NZ_CDPR010002991.678
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002991.678.fna -queryname NZ_CDPR010002991.678
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001191.67.fna -queryname NZ_BAIW010001191.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001191.67.fna -queryname NZ_BAIW010001191.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001191.67.fna -queryname NZ_BAIW010001191.67
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002651.679.fna -queryname NZ_CDPR010002651.679
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002651.679.fna -queryname NZ_CDPR010002651.679
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002651.679.fna -queryname NZ_CDPR010002651.679
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000261.680.fna -queryname NZ_CDPR010000261.680
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000261.680.fna -queryname NZ_CDPR010000261.680
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000261.680.fna -queryname NZ_CDPR010000261.680
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000951.681.fna -queryname NZ_CDPR010000951.681
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000951.681.fna -queryname NZ_CDPR010000951.681
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000951.681.fna -queryname NZ_CDPR010000951.681
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003951.682.fna -queryname NZ_CDPR010003951.682
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003951.682.fna -queryname NZ_CDPR010003951.682
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003951.682.fna -queryname NZ_CDPR010003951.682
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006551.683.fna -queryname NZ_CDPR010006551.683
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006551.683.fna -queryname NZ_CDPR010006551.683
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006551.683.fna -queryname NZ_CDPR010006551.683
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004991.684.fna -queryname NZ_CDPR010004991.684
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004991.684.fna -queryname NZ_CDPR010004991.684
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004991.684.fna -queryname NZ_CDPR010004991.684
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004641.685.fna -queryname NZ_CDPR010004641.685
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004641.685.fna -queryname NZ_CDPR010004641.685
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004641.685.fna -queryname NZ_CDPR010004641.685
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002301.686.fna -queryname NZ_CDPR010002301.686
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002301.686.fna -queryname NZ_CDPR010002301.686
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002301.686.fna -queryname NZ_CDPR010002301.686
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004001.687.fna -queryname NZ_CDPR010004001.687
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004001.687.fna -queryname NZ_CDPR010004001.687
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004001.687.fna -queryname NZ_CDPR010004001.687
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001361.688.fna -queryname NZ_CDPR010001361.688
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001361.688.fna -queryname NZ_CDPR010001361.688
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001361.688.fna -queryname NZ_CDPR010001361.688
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000201.68.fna -queryname NZ_BAIW010000201.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000201.68.fna -queryname NZ_BAIW010000201.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000201.68.fna -queryname NZ_BAIW010000201.68
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002461.689.fna -queryname NZ_CDPR010002461.689
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002461.689.fna -queryname NZ_CDPR010002461.689
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002461.689.fna -queryname NZ_CDPR010002461.689
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002901.690.fna -queryname NZ_CDPR010002901.690
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002901.690.fna -queryname NZ_CDPR010002901.690
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002901.690.fna -queryname NZ_CDPR010002901.690
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001761.691.fna -queryname NZ_CDPR010001761.691
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001761.691.fna -queryname NZ_CDPR010001761.691
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001761.691.fna -queryname NZ_CDPR010001761.691
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002621.692.fna -queryname NZ_CDPR010002621.692
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002621.692.fna -queryname NZ_CDPR010002621.692
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002621.692.fna -queryname NZ_CDPR010002621.692
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002311.693.fna -queryname NZ_CDPR010002311.693
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002311.693.fna -queryname NZ_CDPR010002311.693
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002311.693.fna -queryname NZ_CDPR010002311.693
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002601.694.fna -queryname NZ_CDPR010002601.694
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002601.694.fna -queryname NZ_CDPR010002601.694
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002601.694.fna -queryname NZ_CDPR010002601.694
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004451.695.fna -queryname NZ_CDPR010004451.695
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004451.695.fna -queryname NZ_CDPR010004451.695
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004451.695.fna -queryname NZ_CDPR010004451.695
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003441.696.fna -queryname NZ_CDPR010003441.696
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003441.696.fna -queryname NZ_CDPR010003441.696
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003441.696.fna -queryname NZ_CDPR010003441.696
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001661.697.fna -queryname NZ_CDPR010001661.697
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001661.697.fna -queryname NZ_CDPR010001661.697
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001661.697.fna -queryname NZ_CDPR010001661.697
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003611.698.fna -queryname NZ_CDPR010003611.698
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003611.698.fna -queryname NZ_CDPR010003611.698
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003611.698.fna -queryname NZ_CDPR010003611.698
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000021.6.fna -queryname NZ_BAIW010000021.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000021.6.fna -queryname NZ_BAIW010000021.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000021.6.fna -queryname NZ_BAIW010000021.6
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000051.69.fna -queryname NZ_BAIW010000051.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000051.69.fna -queryname NZ_BAIW010000051.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000051.69.fna -queryname NZ_BAIW010000051.69
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006541.699.fna -queryname NZ_CDPR010006541.699
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006541.699.fna -queryname NZ_CDPR010006541.699
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006541.699.fna -queryname NZ_CDPR010006541.699
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008641.700.fna -queryname NZ_CDPR010008641.700
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008641.700.fna -queryname NZ_CDPR010008641.700
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008641.700.fna -queryname NZ_CDPR010008641.700
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004981.701.fna -queryname NZ_CDPR010004981.701
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004981.701.fna -queryname NZ_CDPR010004981.701
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004981.701.fna -queryname NZ_CDPR010004981.701
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001561.702.fna -queryname NZ_CDPR010001561.702
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001561.702.fna -queryname NZ_CDPR010001561.702
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001561.702.fna -queryname NZ_CDPR010001561.702
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004361.703.fna -queryname NZ_CDPR010004361.703
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004361.703.fna -queryname NZ_CDPR010004361.703
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004361.703.fna -queryname NZ_CDPR010004361.703
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008331.704.fna -queryname NZ_CDPR010008331.704
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008331.704.fna -queryname NZ_CDPR010008331.704
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008331.704.fna -queryname NZ_CDPR010008331.704
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000081.705.fna -queryname NZ_CDPR010000081.705
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000081.705.fna -queryname NZ_CDPR010000081.705
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000081.705.fna -queryname NZ_CDPR010000081.705
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002161.706.fna -queryname NZ_CDPR010002161.706
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002161.706.fna -queryname NZ_CDPR010002161.706
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002161.706.fna -queryname NZ_CDPR010002161.706
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001071.707.fna -queryname NZ_CDPR010001071.707
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001071.707.fna -queryname NZ_CDPR010001071.707
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001071.707.fna -queryname NZ_CDPR010001071.707
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008061.708.fna -queryname NZ_CDPR010008061.708
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008061.708.fna -queryname NZ_CDPR010008061.708
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008061.708.fna -queryname NZ_CDPR010008061.708
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000531.70.fna -queryname NZ_BAIW010000531.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000531.70.fna -queryname NZ_BAIW010000531.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000531.70.fna -queryname NZ_BAIW010000531.70
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003721.709.fna -queryname NZ_CDPR010003721.709
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003721.709.fna -queryname NZ_CDPR010003721.709
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003721.709.fna -queryname NZ_CDPR010003721.709
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002481.710.fna -queryname NZ_CDPR010002481.710
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002481.710.fna -queryname NZ_CDPR010002481.710
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002481.710.fna -queryname NZ_CDPR010002481.710
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005441.711.fna -queryname NZ_CDPR010005441.711
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005441.711.fna -queryname NZ_CDPR010005441.711
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005441.711.fna -queryname NZ_CDPR010005441.711
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007071.712.fna -queryname NZ_CDPR010007071.712
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007071.712.fna -queryname NZ_CDPR010007071.712
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007071.712.fna -queryname NZ_CDPR010007071.712
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003861.713.fna -queryname NZ_CDPR010003861.713
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003861.713.fna -queryname NZ_CDPR010003861.713
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003861.713.fna -queryname NZ_CDPR010003861.713
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001431.714.fna -queryname NZ_CDPR010001431.714
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001431.714.fna -queryname NZ_CDPR010001431.714
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001431.714.fna -queryname NZ_CDPR010001431.714
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002221.715.fna -queryname NZ_CDPR010002221.715
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002221.715.fna -queryname NZ_CDPR010002221.715
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002221.715.fna -queryname NZ_CDPR010002221.715
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001011.716.fna -queryname NZ_CDPR010001011.716
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001011.716.fna -queryname NZ_CDPR010001011.716
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001011.716.fna -queryname NZ_CDPR010001011.716
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003061.717.fna -queryname NZ_CDPR010003061.717
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003061.717.fna -queryname NZ_CDPR010003061.717
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003061.717.fna -queryname NZ_CDPR010003061.717
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009581.718.fna -queryname NZ_CDPR010009581.718
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009581.718.fna -queryname NZ_CDPR010009581.718
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009581.718.fna -queryname NZ_CDPR010009581.718
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001471.71.fna -queryname NZ_BAIW010001471.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001471.71.fna -queryname NZ_BAIW010001471.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001471.71.fna -queryname NZ_BAIW010001471.71
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000451.719.fna -queryname NZ_CDPR010000451.719
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000451.719.fna -queryname NZ_CDPR010000451.719
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000451.719.fna -queryname NZ_CDPR010000451.719
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006951.720.fna -queryname NZ_CDPR010006951.720
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006951.720.fna -queryname NZ_CDPR010006951.720
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006951.720.fna -queryname NZ_CDPR010006951.720
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002331.721.fna -queryname NZ_CDPR010002331.721
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002331.721.fna -queryname NZ_CDPR010002331.721
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002331.721.fna -queryname NZ_CDPR010002331.721
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013841.722.fna -queryname NZ_CDPR010013841.722
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013841.722.fna -queryname NZ_CDPR010013841.722
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010013841.722.fna -queryname NZ_CDPR010013841.722
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009181.723.fna -queryname NZ_CDPR010009181.723
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009181.723.fna -queryname NZ_CDPR010009181.723
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009181.723.fna -queryname NZ_CDPR010009181.723
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002371.724.fna -queryname NZ_CDPR010002371.724
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002371.724.fna -queryname NZ_CDPR010002371.724
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002371.724.fna -queryname NZ_CDPR010002371.724
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002021.725.fna -queryname NZ_CDPR010002021.725
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002021.725.fna -queryname NZ_CDPR010002021.725
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002021.725.fna -queryname NZ_CDPR010002021.725
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002931.726.fna -queryname NZ_CDPR010002931.726
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002931.726.fna -queryname NZ_CDPR010002931.726
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002931.726.fna -queryname NZ_CDPR010002931.726
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003871.727.fna -queryname NZ_CDPR010003871.727
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003871.727.fna -queryname NZ_CDPR010003871.727
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003871.727.fna -queryname NZ_CDPR010003871.727
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008381.728.fna -queryname NZ_CDPR010008381.728
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008381.728.fna -queryname NZ_CDPR010008381.728
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008381.728.fna -queryname NZ_CDPR010008381.728
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000161.72.fna -queryname NZ_BAIW010000161.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000161.72.fna -queryname NZ_BAIW010000161.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000161.72.fna -queryname NZ_BAIW010000161.72
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002971.729.fna -queryname NZ_CDPR010002971.729
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002971.729.fna -queryname NZ_CDPR010002971.729
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002971.729.fna -queryname NZ_CDPR010002971.729
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008191.730.fna -queryname NZ_CDPR010008191.730
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008191.730.fna -queryname NZ_CDPR010008191.730
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008191.730.fna -queryname NZ_CDPR010008191.730
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007401.731.fna -queryname NZ_CDPR010007401.731
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007401.731.fna -queryname NZ_CDPR010007401.731
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007401.731.fna -queryname NZ_CDPR010007401.731
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003701.732.fna -queryname NZ_CDPR010003701.732
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003701.732.fna -queryname NZ_CDPR010003701.732
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003701.732.fna -queryname NZ_CDPR010003701.732
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003681.733.fna -queryname NZ_CDPR010003681.733
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003681.733.fna -queryname NZ_CDPR010003681.733
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003681.733.fna -queryname NZ_CDPR010003681.733
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010491.734.fna -queryname NZ_CDPR010010491.734
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010491.734.fna -queryname NZ_CDPR010010491.734
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010010491.734.fna -queryname NZ_CDPR010010491.734
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003161.735.fna -queryname NZ_CDPR010003161.735
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003161.735.fna -queryname NZ_CDPR010003161.735
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003161.735.fna -queryname NZ_CDPR010003161.735
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002231.736.fna -queryname NZ_CDPR010002231.736
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002231.736.fna -queryname NZ_CDPR010002231.736
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002231.736.fna -queryname NZ_CDPR010002231.736
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000891.737.fna -queryname NZ_CDPR010000891.737
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000891.737.fna -queryname NZ_CDPR010000891.737
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000891.737.fna -queryname NZ_CDPR010000891.737
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003141.738.fna -queryname NZ_CDPR010003141.738
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003141.738.fna -queryname NZ_CDPR010003141.738
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003141.738.fna -queryname NZ_CDPR010003141.738
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001311.73.fna -queryname NZ_BAIW010001311.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001311.73.fna -queryname NZ_BAIW010001311.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001311.73.fna -queryname NZ_BAIW010001311.73
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004231.739.fna -queryname NZ_CDPR010004231.739
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004231.739.fna -queryname NZ_CDPR010004231.739
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004231.739.fna -queryname NZ_CDPR010004231.739
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000531.740.fna -queryname NZ_CDPR010000531.740
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000531.740.fna -queryname NZ_CDPR010000531.740
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000531.740.fna -queryname NZ_CDPR010000531.740
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001021.741.fna -queryname NZ_CDPR010001021.741
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001021.741.fna -queryname NZ_CDPR010001021.741
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001021.741.fna -queryname NZ_CDPR010001021.741
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008571.742.fna -queryname NZ_CDPR010008571.742
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008571.742.fna -queryname NZ_CDPR010008571.742
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008571.742.fna -queryname NZ_CDPR010008571.742
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000691.743.fna -queryname NZ_CDPR010000691.743
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000691.743.fna -queryname NZ_CDPR010000691.743
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000691.743.fna -queryname NZ_CDPR010000691.743
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006221.744.fna -queryname NZ_CDPR010006221.744
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006221.744.fna -queryname NZ_CDPR010006221.744
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006221.744.fna -queryname NZ_CDPR010006221.744
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004291.745.fna -queryname NZ_CDPR010004291.745
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004291.745.fna -queryname NZ_CDPR010004291.745
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004291.745.fna -queryname NZ_CDPR010004291.745
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001341.746.fna -queryname NZ_CDPR010001341.746
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001341.746.fna -queryname NZ_CDPR010001341.746
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001341.746.fna -queryname NZ_CDPR010001341.746
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001041.747.fna -queryname NZ_CDPR010001041.747
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001041.747.fna -queryname NZ_CDPR010001041.747
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001041.747.fna -queryname NZ_CDPR010001041.747
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003561.748.fna -queryname NZ_CDPR010003561.748
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003561.748.fna -queryname NZ_CDPR010003561.748
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003561.748.fna -queryname NZ_CDPR010003561.748
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000691.74.fna -queryname NZ_BAIW010000691.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000691.74.fna -queryname NZ_BAIW010000691.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000691.74.fna -queryname NZ_BAIW010000691.74
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000231.749.fna -queryname NZ_CDPR010000231.749
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000231.749.fna -queryname NZ_CDPR010000231.749
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000231.749.fna -queryname NZ_CDPR010000231.749
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002571.750.fna -queryname NZ_CDPR010002571.750
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002571.750.fna -queryname NZ_CDPR010002571.750
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002571.750.fna -queryname NZ_CDPR010002571.750
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007621.751.fna -queryname NZ_CDPR010007621.751
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007621.751.fna -queryname NZ_CDPR010007621.751
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007621.751.fna -queryname NZ_CDPR010007621.751
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000571.752.fna -queryname NZ_CDPR010000571.752
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000571.752.fna -queryname NZ_CDPR010000571.752
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000571.752.fna -queryname NZ_CDPR010000571.752
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007141.753.fna -queryname NZ_CDPR010007141.753
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007141.753.fna -queryname NZ_CDPR010007141.753
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007141.753.fna -queryname NZ_CDPR010007141.753
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004531.754.fna -queryname NZ_CDPR010004531.754
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004531.754.fna -queryname NZ_CDPR010004531.754
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004531.754.fna -queryname NZ_CDPR010004531.754
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008501.755.fna -queryname NZ_CDPR010008501.755
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008501.755.fna -queryname NZ_CDPR010008501.755
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010008501.755.fna -queryname NZ_CDPR010008501.755
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006411.756.fna -queryname NZ_CDPR010006411.756
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006411.756.fna -queryname NZ_CDPR010006411.756
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006411.756.fna -queryname NZ_CDPR010006411.756
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001391.757.fna -queryname NZ_CDPR010001391.757
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001391.757.fna -queryname NZ_CDPR010001391.757
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001391.757.fna -queryname NZ_CDPR010001391.757
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000361.758.fna -queryname NZ_CDPR010000361.758
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000361.758.fna -queryname NZ_CDPR010000361.758
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000361.758.fna -queryname NZ_CDPR010000361.758
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001591.75.fna -queryname NZ_BAIW010001591.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001591.75.fna -queryname NZ_BAIW010001591.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001591.75.fna -queryname NZ_BAIW010001591.75
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002051.759.fna -queryname NZ_CDPR010002051.759
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002051.759.fna -queryname NZ_CDPR010002051.759
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002051.759.fna -queryname NZ_CDPR010002051.759
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005231.760.fna -queryname NZ_CDPR010005231.760
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005231.760.fna -queryname NZ_CDPR010005231.760
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005231.760.fna -queryname NZ_CDPR010005231.760
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005141.761.fna -queryname NZ_CDPR010005141.761
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005141.761.fna -queryname NZ_CDPR010005141.761
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005141.761.fna -queryname NZ_CDPR010005141.761
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000381.762.fna -queryname NZ_CDPR010000381.762
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000381.762.fna -queryname NZ_CDPR010000381.762
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000381.762.fna -queryname NZ_CDPR010000381.762
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006681.763.fna -queryname NZ_CDPR010006681.763
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006681.763.fna -queryname NZ_CDPR010006681.763
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006681.763.fna -queryname NZ_CDPR010006681.763
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007871.764.fna -queryname NZ_CDPR010007871.764
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007871.764.fna -queryname NZ_CDPR010007871.764
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007871.764.fna -queryname NZ_CDPR010007871.764
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004751.765.fna -queryname NZ_CDPR010004751.765
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004751.765.fna -queryname NZ_CDPR010004751.765
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004751.765.fna -queryname NZ_CDPR010004751.765
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001981.766.fna -queryname NZ_CDPR010001981.766
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001981.766.fna -queryname NZ_CDPR010001981.766
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001981.766.fna -queryname NZ_CDPR010001981.766
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009851.767.fna -queryname NZ_CDPR010009851.767
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009851.767.fna -queryname NZ_CDPR010009851.767
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009851.767.fna -queryname NZ_CDPR010009851.767
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007421.768.fna -queryname NZ_CDPR010007421.768
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007421.768.fna -queryname NZ_CDPR010007421.768
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007421.768.fna -queryname NZ_CDPR010007421.768
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000831.76.fna -queryname NZ_BAIW010000831.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000831.76.fna -queryname NZ_BAIW010000831.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000831.76.fna -queryname NZ_BAIW010000831.76
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001101.769.fna -queryname NZ_CDPR010001101.769
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001101.769.fna -queryname NZ_CDPR010001101.769
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001101.769.fna -queryname NZ_CDPR010001101.769
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000121.770.fna -queryname NZ_CDPR010000121.770
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000121.770.fna -queryname NZ_CDPR010000121.770
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000121.770.fna -queryname NZ_CDPR010000121.770
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002671.771.fna -queryname NZ_CDPR010002671.771
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002671.771.fna -queryname NZ_CDPR010002671.771
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002671.771.fna -queryname NZ_CDPR010002671.771
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001631.772.fna -queryname NZ_CDPR010001631.772
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001631.772.fna -queryname NZ_CDPR010001631.772
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001631.772.fna -queryname NZ_CDPR010001631.772
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003281.773.fna -queryname NZ_CDPR010003281.773
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003281.773.fna -queryname NZ_CDPR010003281.773
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003281.773.fna -queryname NZ_CDPR010003281.773
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009501.774.fna -queryname NZ_CDPR010009501.774
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009501.774.fna -queryname NZ_CDPR010009501.774
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009501.774.fna -queryname NZ_CDPR010009501.774
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005351.775.fna -queryname NZ_CDPR010005351.775
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005351.775.fna -queryname NZ_CDPR010005351.775
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005351.775.fna -queryname NZ_CDPR010005351.775
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006081.776.fna -queryname NZ_CDPR010006081.776
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006081.776.fna -queryname NZ_CDPR010006081.776
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006081.776.fna -queryname NZ_CDPR010006081.776
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007701.777.fna -queryname NZ_CDPR010007701.777
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007701.777.fna -queryname NZ_CDPR010007701.777
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010007701.777.fna -queryname NZ_CDPR010007701.777
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002871.778.fna -queryname NZ_CDPR010002871.778
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002871.778.fna -queryname NZ_CDPR010002871.778
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002871.778.fna -queryname NZ_CDPR010002871.778
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001571.77.fna -queryname NZ_BAIW010001571.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001571.77.fna -queryname NZ_BAIW010001571.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001571.77.fna -queryname NZ_BAIW010001571.77
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006331.779.fna -queryname NZ_CDPR010006331.779
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006331.779.fna -queryname NZ_CDPR010006331.779
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006331.779.fna -queryname NZ_CDPR010006331.779
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002941.780.fna -queryname NZ_CDPR010002941.780
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002941.780.fna -queryname NZ_CDPR010002941.780
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002941.780.fna -queryname NZ_CDPR010002941.780
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000631.781.fna -queryname NZ_CDPR010000631.781
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000631.781.fna -queryname NZ_CDPR010000631.781
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000631.781.fna -queryname NZ_CDPR010000631.781
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004831.782.fna -queryname NZ_CDPR010004831.782
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004831.782.fna -queryname NZ_CDPR010004831.782
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004831.782.fna -queryname NZ_CDPR010004831.782
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003491.783.fna -queryname NZ_CDPR010003491.783
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003491.783.fna -queryname NZ_CDPR010003491.783
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003491.783.fna -queryname NZ_CDPR010003491.783
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001091.784.fna -queryname NZ_CDPR010001091.784
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001091.784.fna -queryname NZ_CDPR010001091.784
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001091.784.fna -queryname NZ_CDPR010001091.784
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001611.785.fna -queryname NZ_CDPR010001611.785
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001611.785.fna -queryname NZ_CDPR010001611.785
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001611.785.fna -queryname NZ_CDPR010001611.785
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001811.786.fna -queryname NZ_CDPR010001811.786
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001811.786.fna -queryname NZ_CDPR010001811.786
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001811.786.fna -queryname NZ_CDPR010001811.786
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001141.787.fna -queryname NZ_CDPR010001141.787
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001141.787.fna -queryname NZ_CDPR010001141.787
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001141.787.fna -queryname NZ_CDPR010001141.787
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004671.788.fna -queryname NZ_CDPR010004671.788
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004671.788.fna -queryname NZ_CDPR010004671.788
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004671.788.fna -queryname NZ_CDPR010004671.788
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001671.78.fna -queryname NZ_BAIW010001671.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001671.78.fna -queryname NZ_BAIW010001671.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001671.78.fna -queryname NZ_BAIW010001671.78
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005421.789.fna -queryname NZ_CDPR010005421.789
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005421.789.fna -queryname NZ_CDPR010005421.789
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005421.789.fna -queryname NZ_CDPR010005421.789
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000471.790.fna -queryname NZ_CDPR010000471.790
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000471.790.fna -queryname NZ_CDPR010000471.790
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000471.790.fna -queryname NZ_CDPR010000471.790
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001281.791.fna -queryname NZ_CDPR010001281.791
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001281.791.fna -queryname NZ_CDPR010001281.791
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001281.791.fna -queryname NZ_CDPR010001281.791
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004281.792.fna -queryname NZ_CDPR010004281.792
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004281.792.fna -queryname NZ_CDPR010004281.792
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004281.792.fna -queryname NZ_CDPR010004281.792
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006911.793.fna -queryname NZ_CDPR010006911.793
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006911.793.fna -queryname NZ_CDPR010006911.793
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006911.793.fna -queryname NZ_CDPR010006911.793
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002071.794.fna -queryname NZ_CDPR010002071.794
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002071.794.fna -queryname NZ_CDPR010002071.794
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002071.794.fna -queryname NZ_CDPR010002071.794
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006211.795.fna -queryname NZ_CDPR010006211.795
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006211.795.fna -queryname NZ_CDPR010006211.795
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006211.795.fna -queryname NZ_CDPR010006211.795
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000301.796.fna -queryname NZ_CDPR010000301.796
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000301.796.fna -queryname NZ_CDPR010000301.796
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000301.796.fna -queryname NZ_CDPR010000301.796
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001221.797.fna -queryname NZ_CDPR010001221.797
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001221.797.fna -queryname NZ_CDPR010001221.797
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010001221.797.fna -queryname NZ_CDPR010001221.797
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002581.798.fna -queryname NZ_CDPR010002581.798
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002581.798.fna -queryname NZ_CDPR010002581.798
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002581.798.fna -queryname NZ_CDPR010002581.798
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000251.7.fna -queryname NZ_BAIW010000251.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000251.7.fna -queryname NZ_BAIW010000251.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000251.7.fna -queryname NZ_BAIW010000251.7
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000611.79.fna -queryname NZ_BAIW010000611.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000611.79.fna -queryname NZ_BAIW010000611.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000611.79.fna -queryname NZ_BAIW010000611.79
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005691.799.fna -queryname NZ_CDPR010005691.799
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005691.799.fna -queryname NZ_CDPR010005691.799
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010005691.799.fna -queryname NZ_CDPR010005691.799
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003391.800.fna -queryname NZ_CDPR010003391.800
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003391.800.fna -queryname NZ_CDPR010003391.800
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003391.800.fna -queryname NZ_CDPR010003391.800
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009491.801.fna -queryname NZ_CDPR010009491.801
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009491.801.fna -queryname NZ_CDPR010009491.801
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009491.801.fna -queryname NZ_CDPR010009491.801
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004491.802.fna -queryname NZ_CDPR010004491.802
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004491.802.fna -queryname NZ_CDPR010004491.802
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004491.802.fna -queryname NZ_CDPR010004491.802
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002751.803.fna -queryname NZ_CDPR010002751.803
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002751.803.fna -queryname NZ_CDPR010002751.803
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002751.803.fna -queryname NZ_CDPR010002751.803
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002681.804.fna -queryname NZ_CDPR010002681.804
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002681.804.fna -queryname NZ_CDPR010002681.804
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002681.804.fna -queryname NZ_CDPR010002681.804
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004301.805.fna -queryname NZ_CDPR010004301.805
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004301.805.fna -queryname NZ_CDPR010004301.805
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004301.805.fna -queryname NZ_CDPR010004301.805
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006111.806.fna -queryname NZ_CDPR010006111.806
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006111.806.fna -queryname NZ_CDPR010006111.806
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006111.806.fna -queryname NZ_CDPR010006111.806
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000761.807.fna -queryname NZ_CDPR010000761.807
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000761.807.fna -queryname NZ_CDPR010000761.807
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010000761.807.fna -queryname NZ_CDPR010000761.807
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003251.808.fna -queryname NZ_CDPR010003251.808
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003251.808.fna -queryname NZ_CDPR010003251.808
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003251.808.fna -queryname NZ_CDPR010003251.808
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000441.80.fna -queryname NZ_BAIW010000441.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000441.80.fna -queryname NZ_BAIW010000441.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000441.80.fna -queryname NZ_BAIW010000441.80
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002561.809.fna -queryname NZ_CDPR010002561.809
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002561.809.fna -queryname NZ_CDPR010002561.809
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010002561.809.fna -queryname NZ_CDPR010002561.809
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004431.810.fna -queryname NZ_CDPR010004431.810
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004431.810.fna -queryname NZ_CDPR010004431.810
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010004431.810.fna -queryname NZ_CDPR010004431.810
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003201.811.fna -queryname NZ_CDPR010003201.811
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003201.811.fna -queryname NZ_CDPR010003201.811
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010003201.811.fna -queryname NZ_CDPR010003201.811
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009901.812.fna -queryname NZ_CDPR010009901.812
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009901.812.fna -queryname NZ_CDPR010009901.812
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010009901.812.fna -queryname NZ_CDPR010009901.812
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006891.813.fna -queryname NZ_CDPR010006891.813
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006891.813.fna -queryname NZ_CDPR010006891.813
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_CDPR010006891.813.fna -queryname NZ_CDPR010006891.813
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001511.814.fna -queryname NZ_RAYS010001511.814
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001511.814.fna -queryname NZ_RAYS010001511.814
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001511.814.fna -queryname NZ_RAYS010001511.814
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000741.815.fna -queryname NZ_RAYS010000741.815
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000741.815.fna -queryname NZ_RAYS010000741.815
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000741.815.fna -queryname NZ_RAYS010000741.815
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000261.816.fna -queryname NZ_RAYS010000261.816
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000261.816.fna -queryname NZ_RAYS010000261.816
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000261.816.fna -queryname NZ_RAYS010000261.816
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001071.817.fna -queryname NZ_RAYS010001071.817
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001071.817.fna -queryname NZ_RAYS010001071.817
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001071.817.fna -queryname NZ_RAYS010001071.817
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001121.818.fna -queryname NZ_RAYS010001121.818
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001121.818.fna -queryname NZ_RAYS010001121.818
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001121.818.fna -queryname NZ_RAYS010001121.818
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000781.81.fna -queryname NZ_BAIW010000781.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000781.81.fna -queryname NZ_BAIW010000781.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000781.81.fna -queryname NZ_BAIW010000781.81
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001491.819.fna -queryname NZ_RAYS010001491.819
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001491.819.fna -queryname NZ_RAYS010001491.819
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001491.819.fna -queryname NZ_RAYS010001491.819
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000411.820.fna -queryname NZ_RAYS010000411.820
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000411.820.fna -queryname NZ_RAYS010000411.820
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000411.820.fna -queryname NZ_RAYS010000411.820
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000171.821.fna -queryname NZ_RAYS010000171.821
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000171.821.fna -queryname NZ_RAYS010000171.821
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000171.821.fna -queryname NZ_RAYS010000171.821
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001561.822.fna -queryname NZ_RAYS010001561.822
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001561.822.fna -queryname NZ_RAYS010001561.822
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001561.822.fna -queryname NZ_RAYS010001561.822
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000231.823.fna -queryname NZ_RAYS010000231.823
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000231.823.fna -queryname NZ_RAYS010000231.823
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000231.823.fna -queryname NZ_RAYS010000231.823
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000291.824.fna -queryname NZ_RAYS010000291.824
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000291.824.fna -queryname NZ_RAYS010000291.824
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000291.824.fna -queryname NZ_RAYS010000291.824
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000881.825.fna -queryname NZ_RAYS010000881.825
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000881.825.fna -queryname NZ_RAYS010000881.825
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000881.825.fna -queryname NZ_RAYS010000881.825
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000021.826.fna -queryname NZ_RAYS010000021.826
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000021.826.fna -queryname NZ_RAYS010000021.826
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000021.826.fna -queryname NZ_RAYS010000021.826
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000871.827.fna -queryname NZ_RAYS010000871.827
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000871.827.fna -queryname NZ_RAYS010000871.827
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000871.827.fna -queryname NZ_RAYS010000871.827
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001191.828.fna -queryname NZ_RAYS010001191.828
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001191.828.fna -queryname NZ_RAYS010001191.828
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001191.828.fna -queryname NZ_RAYS010001191.828
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001451.82.fna -queryname NZ_BAIW010001451.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001451.82.fna -queryname NZ_BAIW010001451.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001451.82.fna -queryname NZ_BAIW010001451.82
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001461.829.fna -queryname NZ_RAYS010001461.829
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001461.829.fna -queryname NZ_RAYS010001461.829
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001461.829.fna -queryname NZ_RAYS010001461.829
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001451.830.fna -queryname NZ_RAYS010001451.830
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001451.830.fna -queryname NZ_RAYS010001451.830
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001451.830.fna -queryname NZ_RAYS010001451.830
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000961.831.fna -queryname NZ_RAYS010000961.831
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000961.831.fna -queryname NZ_RAYS010000961.831
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000961.831.fna -queryname NZ_RAYS010000961.831
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000851.832.fna -queryname NZ_RAYS010000851.832
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000851.832.fna -queryname NZ_RAYS010000851.832
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000851.832.fna -queryname NZ_RAYS010000851.832
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000591.833.fna -queryname NZ_RAYS010000591.833
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000591.833.fna -queryname NZ_RAYS010000591.833
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000591.833.fna -queryname NZ_RAYS010000591.833
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001261.834.fna -queryname NZ_RAYS010001261.834
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001261.834.fna -queryname NZ_RAYS010001261.834
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001261.834.fna -queryname NZ_RAYS010001261.834
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000601.835.fna -queryname NZ_RAYS010000601.835
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000601.835.fna -queryname NZ_RAYS010000601.835
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000601.835.fna -queryname NZ_RAYS010000601.835
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000951.836.fna -queryname NZ_RAYS010000951.836
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000951.836.fna -queryname NZ_RAYS010000951.836
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000951.836.fna -queryname NZ_RAYS010000951.836
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000651.837.fna -queryname NZ_RAYS010000651.837
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000651.837.fna -queryname NZ_RAYS010000651.837
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000651.837.fna -queryname NZ_RAYS010000651.837
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000351.838.fna -queryname NZ_RAYS010000351.838
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000351.838.fna -queryname NZ_RAYS010000351.838
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000351.838.fna -queryname NZ_RAYS010000351.838
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001481.83.fna -queryname NZ_BAIW010001481.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001481.83.fna -queryname NZ_BAIW010001481.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001481.83.fna -queryname NZ_BAIW010001481.83
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001621.839.fna -queryname NZ_RAYS010001621.839
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001621.839.fna -queryname NZ_RAYS010001621.839
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001621.839.fna -queryname NZ_RAYS010001621.839
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001271.840.fna -queryname NZ_RAYS010001271.840
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001271.840.fna -queryname NZ_RAYS010001271.840
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001271.840.fna -queryname NZ_RAYS010001271.840
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000281.841.fna -queryname NZ_RAYS010000281.841
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000281.841.fna -queryname NZ_RAYS010000281.841
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000281.841.fna -queryname NZ_RAYS010000281.841
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001701.842.fna -queryname NZ_RAYS010001701.842
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001701.842.fna -queryname NZ_RAYS010001701.842
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001701.842.fna -queryname NZ_RAYS010001701.842
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000711.843.fna -queryname NZ_RAYS010000711.843
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000711.843.fna -queryname NZ_RAYS010000711.843
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000711.843.fna -queryname NZ_RAYS010000711.843
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001441.844.fna -queryname NZ_RAYS010001441.844
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001441.844.fna -queryname NZ_RAYS010001441.844
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001441.844.fna -queryname NZ_RAYS010001441.844
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001601.845.fna -queryname NZ_RAYS010001601.845
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001601.845.fna -queryname NZ_RAYS010001601.845
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001601.845.fna -queryname NZ_RAYS010001601.845
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001581.846.fna -queryname NZ_RAYS010001581.846
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001581.846.fna -queryname NZ_RAYS010001581.846
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001581.846.fna -queryname NZ_RAYS010001581.846
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001541.847.fna -queryname NZ_RAYS010001541.847
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001541.847.fna -queryname NZ_RAYS010001541.847
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001541.847.fna -queryname NZ_RAYS010001541.847
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001431.848.fna -queryname NZ_RAYS010001431.848
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001431.848.fna -queryname NZ_RAYS010001431.848
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001431.848.fna -queryname NZ_RAYS010001431.848
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000591.84.fna -queryname NZ_BAIW010000591.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000591.84.fna -queryname NZ_BAIW010000591.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000591.84.fna -queryname NZ_BAIW010000591.84
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001391.849.fna -queryname NZ_RAYS010001391.849
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001391.849.fna -queryname NZ_RAYS010001391.849
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001391.849.fna -queryname NZ_RAYS010001391.849
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000501.850.fna -queryname NZ_RAYS010000501.850
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000501.850.fna -queryname NZ_RAYS010000501.850
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000501.850.fna -queryname NZ_RAYS010000501.850
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001321.851.fna -queryname NZ_RAYS010001321.851
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001321.851.fna -queryname NZ_RAYS010001321.851
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001321.851.fna -queryname NZ_RAYS010001321.851
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000691.852.fna -queryname NZ_RAYS010000691.852
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000691.852.fna -queryname NZ_RAYS010000691.852
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000691.852.fna -queryname NZ_RAYS010000691.852
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000181.853.fna -queryname NZ_RAYS010000181.853
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000181.853.fna -queryname NZ_RAYS010000181.853
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000181.853.fna -queryname NZ_RAYS010000181.853
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000841.854.fna -queryname NZ_RAYS010000841.854
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000841.854.fna -queryname NZ_RAYS010000841.854
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000841.854.fna -queryname NZ_RAYS010000841.854
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000831.855.fna -queryname NZ_RAYS010000831.855
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000831.855.fna -queryname NZ_RAYS010000831.855
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000831.855.fna -queryname NZ_RAYS010000831.855
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000811.856.fna -queryname NZ_RAYS010000811.856
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000811.856.fna -queryname NZ_RAYS010000811.856
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000811.856.fna -queryname NZ_RAYS010000811.856
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001131.857.fna -queryname NZ_RAYS010001131.857
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001131.857.fna -queryname NZ_RAYS010001131.857
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001131.857.fna -queryname NZ_RAYS010001131.857
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000191.858.fna -queryname NZ_RAYS010000191.858
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000191.858.fna -queryname NZ_RAYS010000191.858
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000191.858.fna -queryname NZ_RAYS010000191.858
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000101.85.fna -queryname NZ_BAIW010000101.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000101.85.fna -queryname NZ_BAIW010000101.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000101.85.fna -queryname NZ_BAIW010000101.85
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001481.859.fna -queryname NZ_RAYS010001481.859
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001481.859.fna -queryname NZ_RAYS010001481.859
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001481.859.fna -queryname NZ_RAYS010001481.859
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001501.860.fna -queryname NZ_RAYS010001501.860
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001501.860.fna -queryname NZ_RAYS010001501.860
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001501.860.fna -queryname NZ_RAYS010001501.860
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001301.861.fna -queryname NZ_RAYS010001301.861
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001301.861.fna -queryname NZ_RAYS010001301.861
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001301.861.fna -queryname NZ_RAYS010001301.861
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000121.862.fna -queryname NZ_RAYS010000121.862
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000121.862.fna -queryname NZ_RAYS010000121.862
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000121.862.fna -queryname NZ_RAYS010000121.862
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000911.863.fna -queryname NZ_RAYS010000911.863
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000911.863.fna -queryname NZ_RAYS010000911.863
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000911.863.fna -queryname NZ_RAYS010000911.863
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000211.864.fna -queryname NZ_RAYS010000211.864
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000211.864.fna -queryname NZ_RAYS010000211.864
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000211.864.fna -queryname NZ_RAYS010000211.864
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001151.865.fna -queryname NZ_RAYS010001151.865
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001151.865.fna -queryname NZ_RAYS010001151.865
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001151.865.fna -queryname NZ_RAYS010001151.865
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000101.866.fna -queryname NZ_RAYS010000101.866
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000101.866.fna -queryname NZ_RAYS010000101.866
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000101.866.fna -queryname NZ_RAYS010000101.866
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001411.867.fna -queryname NZ_RAYS010001411.867
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001411.867.fna -queryname NZ_RAYS010001411.867
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001411.867.fna -queryname NZ_RAYS010001411.867
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000371.868.fna -queryname NZ_RAYS010000371.868
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000371.868.fna -queryname NZ_RAYS010000371.868
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000371.868.fna -queryname NZ_RAYS010000371.868
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000501.86.fna -queryname NZ_BAIW010000501.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000501.86.fna -queryname NZ_BAIW010000501.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000501.86.fna -queryname NZ_BAIW010000501.86
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000051.869.fna -queryname NZ_RAYS010000051.869
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000051.869.fna -queryname NZ_RAYS010000051.869
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000051.869.fna -queryname NZ_RAYS010000051.869
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000331.870.fna -queryname NZ_RAYS010000331.870
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000331.870.fna -queryname NZ_RAYS010000331.870
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000331.870.fna -queryname NZ_RAYS010000331.870
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001051.871.fna -queryname NZ_RAYS010001051.871
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001051.871.fna -queryname NZ_RAYS010001051.871
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001051.871.fna -queryname NZ_RAYS010001051.871
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000431.872.fna -queryname NZ_RAYS010000431.872
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000431.872.fna -queryname NZ_RAYS010000431.872
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000431.872.fna -queryname NZ_RAYS010000431.872
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001571.873.fna -queryname NZ_RAYS010001571.873
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001571.873.fna -queryname NZ_RAYS010001571.873
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001571.873.fna -queryname NZ_RAYS010001571.873
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000621.874.fna -queryname NZ_RAYS010000621.874
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000621.874.fna -queryname NZ_RAYS010000621.874
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000621.874.fna -queryname NZ_RAYS010000621.874
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000731.875.fna -queryname NZ_RAYS010000731.875
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000731.875.fna -queryname NZ_RAYS010000731.875
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000731.875.fna -queryname NZ_RAYS010000731.875
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000861.876.fna -queryname NZ_RAYS010000861.876
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000861.876.fna -queryname NZ_RAYS010000861.876
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000861.876.fna -queryname NZ_RAYS010000861.876
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001281.877.fna -queryname NZ_RAYS010001281.877
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001281.877.fna -queryname NZ_RAYS010001281.877
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001281.877.fna -queryname NZ_RAYS010001281.877
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001211.878.fna -queryname NZ_RAYS010001211.878
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001211.878.fna -queryname NZ_RAYS010001211.878
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001211.878.fna -queryname NZ_RAYS010001211.878
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000551.87.fna -queryname NZ_BAIW010000551.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000551.87.fna -queryname NZ_BAIW010000551.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000551.87.fna -queryname NZ_BAIW010000551.87
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000991.879.fna -queryname NZ_RAYS010000991.879
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000991.879.fna -queryname NZ_RAYS010000991.879
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000991.879.fna -queryname NZ_RAYS010000991.879
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000391.880.fna -queryname NZ_RAYS010000391.880
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000391.880.fna -queryname NZ_RAYS010000391.880
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000391.880.fna -queryname NZ_RAYS010000391.880
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000441.881.fna -queryname NZ_RAYS010000441.881
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000441.881.fna -queryname NZ_RAYS010000441.881
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000441.881.fna -queryname NZ_RAYS010000441.881
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000681.882.fna -queryname NZ_RAYS010000681.882
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000681.882.fna -queryname NZ_RAYS010000681.882
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000681.882.fna -queryname NZ_RAYS010000681.882
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000541.883.fna -queryname NZ_RAYS010000541.883
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000541.883.fna -queryname NZ_RAYS010000541.883
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000541.883.fna -queryname NZ_RAYS010000541.883
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001711.884.fna -queryname NZ_RAYS010001711.884
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001711.884.fna -queryname NZ_RAYS010001711.884
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001711.884.fna -queryname NZ_RAYS010001711.884
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000551.885.fna -queryname NZ_RAYS010000551.885
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000551.885.fna -queryname NZ_RAYS010000551.885
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000551.885.fna -queryname NZ_RAYS010000551.885
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000461.886.fna -queryname NZ_RAYS010000461.886
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000461.886.fna -queryname NZ_RAYS010000461.886
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000461.886.fna -queryname NZ_RAYS010000461.886
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000041.887.fna -queryname NZ_RAYS010000041.887
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000041.887.fna -queryname NZ_RAYS010000041.887
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000041.887.fna -queryname NZ_RAYS010000041.887
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001111.888.fna -queryname NZ_RAYS010001111.888
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001111.888.fna -queryname NZ_RAYS010001111.888
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001111.888.fna -queryname NZ_RAYS010001111.888
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001521.88.fna -queryname NZ_BAIW010001521.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001521.88.fna -queryname NZ_BAIW010001521.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001521.88.fna -queryname NZ_BAIW010001521.88
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000901.889.fna -queryname NZ_RAYS010000901.889
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000901.889.fna -queryname NZ_RAYS010000901.889
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000901.889.fna -queryname NZ_RAYS010000901.889
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001061.890.fna -queryname NZ_RAYS010001061.890
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001061.890.fna -queryname NZ_RAYS010001061.890
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001061.890.fna -queryname NZ_RAYS010001061.890
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001341.891.fna -queryname NZ_RAYS010001341.891
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001341.891.fna -queryname NZ_RAYS010001341.891
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001341.891.fna -queryname NZ_RAYS010001341.891
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000671.892.fna -queryname NZ_RAYS010000671.892
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000671.892.fna -queryname NZ_RAYS010000671.892
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000671.892.fna -queryname NZ_RAYS010000671.892
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000031.893.fna -queryname NZ_RAYS010000031.893
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000031.893.fna -queryname NZ_RAYS010000031.893
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000031.893.fna -queryname NZ_RAYS010000031.893
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001371.894.fna -queryname NZ_RAYS010001371.894
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001371.894.fna -queryname NZ_RAYS010001371.894
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001371.894.fna -queryname NZ_RAYS010001371.894
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001031.895.fna -queryname NZ_RAYS010001031.895
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001031.895.fna -queryname NZ_RAYS010001031.895
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001031.895.fna -queryname NZ_RAYS010001031.895
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000011.896.fna -queryname NZ_RAYS010000011.896
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000011.896.fna -queryname NZ_RAYS010000011.896
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000011.896.fna -queryname NZ_RAYS010000011.896
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000251.897.fna -queryname NZ_RAYS010000251.897
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000251.897.fna -queryname NZ_RAYS010000251.897
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000251.897.fna -queryname NZ_RAYS010000251.897
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000981.898.fna -queryname NZ_RAYS010000981.898
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000981.898.fna -queryname NZ_RAYS010000981.898
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000981.898.fna -queryname NZ_RAYS010000981.898
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000661.8.fna -queryname NZ_BAIW010000661.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000661.8.fna -queryname NZ_BAIW010000661.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000661.8.fna -queryname NZ_BAIW010000661.8
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000621.89.fna -queryname NZ_BAIW010000621.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000621.89.fna -queryname NZ_BAIW010000621.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000621.89.fna -queryname NZ_BAIW010000621.89
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000421.899.fna -queryname NZ_RAYS010000421.899
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000421.899.fna -queryname NZ_RAYS010000421.899
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000421.899.fna -queryname NZ_RAYS010000421.899
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000361.900.fna -queryname NZ_RAYS010000361.900
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000361.900.fna -queryname NZ_RAYS010000361.900
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000361.900.fna -queryname NZ_RAYS010000361.900
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000751.901.fna -queryname NZ_RAYS010000751.901
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000751.901.fna -queryname NZ_RAYS010000751.901
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000751.901.fna -queryname NZ_RAYS010000751.901
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000531.902.fna -queryname NZ_RAYS010000531.902
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000531.902.fna -queryname NZ_RAYS010000531.902
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000531.902.fna -queryname NZ_RAYS010000531.902
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001681.903.fna -queryname NZ_RAYS010001681.903
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001681.903.fna -queryname NZ_RAYS010001681.903
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001681.903.fna -queryname NZ_RAYS010001681.903
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000401.904.fna -queryname NZ_RAYS010000401.904
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000401.904.fna -queryname NZ_RAYS010000401.904
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000401.904.fna -queryname NZ_RAYS010000401.904
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001651.905.fna -queryname NZ_RAYS010001651.905
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001651.905.fna -queryname NZ_RAYS010001651.905
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001651.905.fna -queryname NZ_RAYS010001651.905
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001171.906.fna -queryname NZ_RAYS010001171.906
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001171.906.fna -queryname NZ_RAYS010001171.906
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001171.906.fna -queryname NZ_RAYS010001171.906
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000511.907.fna -queryname NZ_RAYS010000511.907
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000511.907.fna -queryname NZ_RAYS010000511.907
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000511.907.fna -queryname NZ_RAYS010000511.907
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000971.908.fna -queryname NZ_RAYS010000971.908
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000971.908.fna -queryname NZ_RAYS010000971.908
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000971.908.fna -queryname NZ_RAYS010000971.908
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000951.90.fna -queryname NZ_BAIW010000951.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000951.90.fna -queryname NZ_BAIW010000951.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000951.90.fna -queryname NZ_BAIW010000951.90
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000781.909.fna -queryname NZ_RAYS010000781.909
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000781.909.fna -queryname NZ_RAYS010000781.909
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000781.909.fna -queryname NZ_RAYS010000781.909
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001001.910.fna -queryname NZ_RAYS010001001.910
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001001.910.fna -queryname NZ_RAYS010001001.910
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001001.910.fna -queryname NZ_RAYS010001001.910
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000661.911.fna -queryname NZ_RAYS010000661.911
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000661.911.fna -queryname NZ_RAYS010000661.911
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000661.911.fna -queryname NZ_RAYS010000661.911
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001521.912.fna -queryname NZ_RAYS010001521.912
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001521.912.fna -queryname NZ_RAYS010001521.912
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001521.912.fna -queryname NZ_RAYS010001521.912
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001641.913.fna -queryname NZ_RAYS010001641.913
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001641.913.fna -queryname NZ_RAYS010001641.913
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001641.913.fna -queryname NZ_RAYS010001641.913
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000721.914.fna -queryname NZ_RAYS010000721.914
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000721.914.fna -queryname NZ_RAYS010000721.914
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000721.914.fna -queryname NZ_RAYS010000721.914
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001611.915.fna -queryname NZ_RAYS010001611.915
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001611.915.fna -queryname NZ_RAYS010001611.915
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001611.915.fna -queryname NZ_RAYS010001611.915
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001331.916.fna -queryname NZ_RAYS010001331.916
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001331.916.fna -queryname NZ_RAYS010001331.916
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001331.916.fna -queryname NZ_RAYS010001331.916
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000791.917.fna -queryname NZ_RAYS010000791.917
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000791.917.fna -queryname NZ_RAYS010000791.917
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000791.917.fna -queryname NZ_RAYS010000791.917
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001361.918.fna -queryname NZ_RAYS010001361.918
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001361.918.fna -queryname NZ_RAYS010001361.918
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001361.918.fna -queryname NZ_RAYS010001361.918
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000561.91.fna -queryname NZ_BAIW010000561.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000561.91.fna -queryname NZ_BAIW010000561.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000561.91.fna -queryname NZ_BAIW010000561.91
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000561.919.fna -queryname NZ_RAYS010000561.919
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000561.919.fna -queryname NZ_RAYS010000561.919
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000561.919.fna -queryname NZ_RAYS010000561.919
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000201.920.fna -queryname NZ_RAYS010000201.920
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000201.920.fna -queryname NZ_RAYS010000201.920
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000201.920.fna -queryname NZ_RAYS010000201.920
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001381.921.fna -queryname NZ_RAYS010001381.921
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001381.921.fna -queryname NZ_RAYS010001381.921
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001381.921.fna -queryname NZ_RAYS010001381.921
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001021.922.fna -queryname NZ_RAYS010001021.922
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001021.922.fna -queryname NZ_RAYS010001021.922
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001021.922.fna -queryname NZ_RAYS010001021.922
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000821.923.fna -queryname NZ_RAYS010000821.923
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000821.923.fna -queryname NZ_RAYS010000821.923
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000821.923.fna -queryname NZ_RAYS010000821.923
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000081.924.fna -queryname NZ_RAYS010000081.924
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000081.924.fna -queryname NZ_RAYS010000081.924
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000081.924.fna -queryname NZ_RAYS010000081.924
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001671.925.fna -queryname NZ_RAYS010001671.925
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001671.925.fna -queryname NZ_RAYS010001671.925
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001671.925.fna -queryname NZ_RAYS010001671.925
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000451.926.fna -queryname NZ_RAYS010000451.926
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000451.926.fna -queryname NZ_RAYS010000451.926
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000451.926.fna -queryname NZ_RAYS010000451.926
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000771.927.fna -queryname NZ_RAYS010000771.927
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000771.927.fna -queryname NZ_RAYS010000771.927
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000771.927.fna -queryname NZ_RAYS010000771.927
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000161.928.fna -queryname NZ_RAYS010000161.928
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000161.928.fna -queryname NZ_RAYS010000161.928
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000161.928.fna -queryname NZ_RAYS010000161.928
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001721.92.fna -queryname NZ_BAIW010001721.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001721.92.fna -queryname NZ_BAIW010001721.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010001721.92.fna -queryname NZ_BAIW010001721.92
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000071.929.fna -queryname NZ_RAYS010000071.929
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000071.929.fna -queryname NZ_RAYS010000071.929
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000071.929.fna -queryname NZ_RAYS010000071.929
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001531.930.fna -queryname NZ_RAYS010001531.930
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001531.930.fna -queryname NZ_RAYS010001531.930
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001531.930.fna -queryname NZ_RAYS010001531.930
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001421.931.fna -queryname NZ_RAYS010001421.931
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001421.931.fna -queryname NZ_RAYS010001421.931
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001421.931.fna -queryname NZ_RAYS010001421.931
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001401.932.fna -queryname NZ_RAYS010001401.932
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001401.932.fna -queryname NZ_RAYS010001401.932
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001401.932.fna -queryname NZ_RAYS010001401.932
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000581.933.fna -queryname NZ_RAYS010000581.933
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000581.933.fna -queryname NZ_RAYS010000581.933
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000581.933.fna -queryname NZ_RAYS010000581.933
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000221.934.fna -queryname NZ_RAYS010000221.934
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000221.934.fna -queryname NZ_RAYS010000221.934
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000221.934.fna -queryname NZ_RAYS010000221.934
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001041.935.fna -queryname NZ_RAYS010001041.935
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001041.935.fna -queryname NZ_RAYS010001041.935
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001041.935.fna -queryname NZ_RAYS010001041.935
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000091.936.fna -queryname NZ_RAYS010000091.936
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000091.936.fna -queryname NZ_RAYS010000091.936
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000091.936.fna -queryname NZ_RAYS010000091.936
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000931.937.fna -queryname NZ_RAYS010000931.937
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000931.937.fna -queryname NZ_RAYS010000931.937
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000931.937.fna -queryname NZ_RAYS010000931.937
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001161.938.fna -queryname NZ_RAYS010001161.938
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001161.938.fna -queryname NZ_RAYS010001161.938
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001161.938.fna -queryname NZ_RAYS010001161.938
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000511.93.fna -queryname NZ_BAIW010000511.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000511.93.fna -queryname NZ_BAIW010000511.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000511.93.fna -queryname NZ_BAIW010000511.93
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001231.939.fna -queryname NZ_RAYS010001231.939
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001231.939.fna -queryname NZ_RAYS010001231.939
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001231.939.fna -queryname NZ_RAYS010001231.939
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000491.940.fna -queryname NZ_RAYS010000491.940
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000491.940.fna -queryname NZ_RAYS010000491.940
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000491.940.fna -queryname NZ_RAYS010000491.940
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001661.941.fna -queryname NZ_RAYS010001661.941
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001661.941.fna -queryname NZ_RAYS010001661.941
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001661.941.fna -queryname NZ_RAYS010001661.941
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000801.942.fna -queryname NZ_RAYS010000801.942
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000801.942.fna -queryname NZ_RAYS010000801.942
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000801.942.fna -queryname NZ_RAYS010000801.942
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000381.943.fna -queryname NZ_RAYS010000381.943
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000381.943.fna -queryname NZ_RAYS010000381.943
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000381.943.fna -queryname NZ_RAYS010000381.943
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001181.944.fna -queryname NZ_RAYS010001181.944
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001181.944.fna -queryname NZ_RAYS010001181.944
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001181.944.fna -queryname NZ_RAYS010001181.944
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001291.945.fna -queryname NZ_RAYS010001291.945
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001291.945.fna -queryname NZ_RAYS010001291.945
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001291.945.fna -queryname NZ_RAYS010001291.945
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000921.946.fna -queryname NZ_RAYS010000921.946
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000921.946.fna -queryname NZ_RAYS010000921.946
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000921.946.fna -queryname NZ_RAYS010000921.946
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001631.947.fna -queryname NZ_RAYS010001631.947
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001631.947.fna -queryname NZ_RAYS010001631.947
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001631.947.fna -queryname NZ_RAYS010001631.947
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000061.948.fna -queryname NZ_RAYS010000061.948
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000061.948.fna -queryname NZ_RAYS010000061.948
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000061.948.fna -queryname NZ_RAYS010000061.948
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000931.94.fna -queryname NZ_BAIW010000931.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000931.94.fna -queryname NZ_BAIW010000931.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000931.94.fna -queryname NZ_BAIW010000931.94
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000471.949.fna -queryname NZ_RAYS010000471.949
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000471.949.fna -queryname NZ_RAYS010000471.949
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000471.949.fna -queryname NZ_RAYS010000471.949
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001551.950.fna -queryname NZ_RAYS010001551.950
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001551.950.fna -queryname NZ_RAYS010001551.950
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001551.950.fna -queryname NZ_RAYS010001551.950
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000891.951.fna -queryname NZ_RAYS010000891.951
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000891.951.fna -queryname NZ_RAYS010000891.951
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000891.951.fna -queryname NZ_RAYS010000891.951
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000241.952.fna -queryname NZ_RAYS010000241.952
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000241.952.fna -queryname NZ_RAYS010000241.952
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000241.952.fna -queryname NZ_RAYS010000241.952
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001691.953.fna -queryname NZ_RAYS010001691.953
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001691.953.fna -queryname NZ_RAYS010001691.953
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001691.953.fna -queryname NZ_RAYS010001691.953
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000701.954.fna -queryname NZ_RAYS010000701.954
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000701.954.fna -queryname NZ_RAYS010000701.954
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000701.954.fna -queryname NZ_RAYS010000701.954
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000481.955.fna -queryname NZ_RAYS010000481.955
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000481.955.fna -queryname NZ_RAYS010000481.955
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000481.955.fna -queryname NZ_RAYS010000481.955
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001251.956.fna -queryname NZ_RAYS010001251.956
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001251.956.fna -queryname NZ_RAYS010001251.956
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001251.956.fna -queryname NZ_RAYS010001251.956
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000631.957.fna -queryname NZ_RAYS010000631.957
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000631.957.fna -queryname NZ_RAYS010000631.957
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000631.957.fna -queryname NZ_RAYS010000631.957
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000761.958.fna -queryname NZ_RAYS010000761.958
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000761.958.fna -queryname NZ_RAYS010000761.958
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000761.958.fna -queryname NZ_RAYS010000761.958
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000431.95.fna -queryname NZ_BAIW010000431.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000431.95.fna -queryname NZ_BAIW010000431.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000431.95.fna -queryname NZ_BAIW010000431.95
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001011.959.fna -queryname NZ_RAYS010001011.959
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001011.959.fna -queryname NZ_RAYS010001011.959
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001011.959.fna -queryname NZ_RAYS010001011.959
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001241.960.fna -queryname NZ_RAYS010001241.960
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001241.960.fna -queryname NZ_RAYS010001241.960
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001241.960.fna -queryname NZ_RAYS010001241.960
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001221.961.fna -queryname NZ_RAYS010001221.961
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001221.961.fna -queryname NZ_RAYS010001221.961
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001221.961.fna -queryname NZ_RAYS010001221.961
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001311.962.fna -queryname NZ_RAYS010001311.962
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001311.962.fna -queryname NZ_RAYS010001311.962
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001311.962.fna -queryname NZ_RAYS010001311.962
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001141.963.fna -queryname NZ_RAYS010001141.963
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001141.963.fna -queryname NZ_RAYS010001141.963
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001141.963.fna -queryname NZ_RAYS010001141.963
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000141.964.fna -queryname NZ_RAYS010000141.964
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000141.964.fna -queryname NZ_RAYS010000141.964
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000141.964.fna -queryname NZ_RAYS010000141.964
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000321.965.fna -queryname NZ_RAYS010000321.965
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000321.965.fna -queryname NZ_RAYS010000321.965
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000321.965.fna -queryname NZ_RAYS010000321.965
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_annotation.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -model false -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000321.965.AOI.fna -queryname NZ_RAYS010000321.965
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoterprediction.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000321.965.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_transterm.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000321.965.AOI.fna
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_promoter_term_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -queryname NZ_RAYS010000321.965
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_GeneTable_2_json.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -table NZ_RAYS010000321.965.GeneTables
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000151.966.fna -queryname NZ_RAYS010000151.966
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000151.966.fna -queryname NZ_RAYS010000151.966
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000151.966.fna -queryname NZ_RAYS010000151.966
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000941.967.fna -queryname NZ_RAYS010000941.967
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000941.967.fna -queryname NZ_RAYS010000941.967
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000941.967.fna -queryname NZ_RAYS010000941.967
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000271.968.fna -queryname NZ_RAYS010000271.968
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000271.968.fna -queryname NZ_RAYS010000271.968
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000271.968.fna -queryname NZ_RAYS010000271.968
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000271.96.fna -queryname NZ_BAIW010000271.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000271.96.fna -queryname NZ_BAIW010000271.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000271.96.fna -queryname NZ_BAIW010000271.96
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000341.969.fna -queryname NZ_RAYS010000341.969
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000341.969.fna -queryname NZ_RAYS010000341.969
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000341.969.fna -queryname NZ_RAYS010000341.969
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000611.970.fna -queryname NZ_RAYS010000611.970
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000611.970.fna -queryname NZ_RAYS010000611.970
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000611.970.fna -queryname NZ_RAYS010000611.970
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001091.971.fna -queryname NZ_RAYS010001091.971
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001091.971.fna -queryname NZ_RAYS010001091.971
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001091.971.fna -queryname NZ_RAYS010001091.971
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001351.972.fna -queryname NZ_RAYS010001351.972
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001351.972.fna -queryname NZ_RAYS010001351.972
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001351.972.fna -queryname NZ_RAYS010001351.972
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001101.973.fna -queryname NZ_RAYS010001101.973
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001101.973.fna -queryname NZ_RAYS010001101.973
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001101.973.fna -queryname NZ_RAYS010001101.973
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000111.974.fna -queryname NZ_RAYS010000111.974
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000111.974.fna -queryname NZ_RAYS010000111.974
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000111.974.fna -queryname NZ_RAYS010000111.974
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001471.975.fna -queryname NZ_RAYS010001471.975
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001471.975.fna -queryname NZ_RAYS010001471.975
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001471.975.fna -queryname NZ_RAYS010001471.975
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000571.976.fna -queryname NZ_RAYS010000571.976
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000571.976.fna -queryname NZ_RAYS010000571.976
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010000571.976.fna -queryname NZ_RAYS010000571.976
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001201.977.fna -queryname NZ_RAYS010001201.977
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001201.977.fna -queryname NZ_RAYS010001201.977
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAYS010001201.977.fna -queryname NZ_RAYS010001201.977
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000601.978.fna -queryname NZ_RAZM010000601.978
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000601.978.fna -queryname NZ_RAZM010000601.978
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000601.978.fna -queryname NZ_RAZM010000601.978
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000881.97.fna -queryname NZ_BAIW010000881.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000881.97.fna -queryname NZ_BAIW010000881.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000881.97.fna -queryname NZ_BAIW010000881.97
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000981.979.fna -queryname NZ_RAZM010000981.979
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000981.979.fna -queryname NZ_RAZM010000981.979
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000981.979.fna -queryname NZ_RAZM010000981.979
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000841.980.fna -queryname NZ_RAZM010000841.980
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000841.980.fna -queryname NZ_RAZM010000841.980
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000841.980.fna -queryname NZ_RAZM010000841.980
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000121.981.fna -queryname NZ_RAZM010000121.981
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000121.981.fna -queryname NZ_RAZM010000121.981
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000121.981.fna -queryname NZ_RAZM010000121.981
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001121.982.fna -queryname NZ_RAZM010001121.982
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001121.982.fna -queryname NZ_RAZM010001121.982
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001121.982.fna -queryname NZ_RAZM010001121.982
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000631.983.fna -queryname NZ_RAZM010000631.983
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000631.983.fna -queryname NZ_RAZM010000631.983
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000631.983.fna -queryname NZ_RAZM010000631.983
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000761.984.fna -queryname NZ_RAZM010000761.984
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000761.984.fna -queryname NZ_RAZM010000761.984
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000761.984.fna -queryname NZ_RAZM010000761.984
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000331.985.fna -queryname NZ_RAZM010000331.985
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000331.985.fna -queryname NZ_RAZM010000331.985
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000331.985.fna -queryname NZ_RAZM010000331.985
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000051.986.fna -queryname NZ_RAZM010000051.986
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000051.986.fna -queryname NZ_RAZM010000051.986
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000051.986.fna -queryname NZ_RAZM010000051.986
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001351.987.fna -queryname NZ_RAZM010001351.987
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001351.987.fna -queryname NZ_RAZM010001351.987
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001351.987.fna -queryname NZ_RAZM010001351.987
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001271.988.fna -queryname NZ_RAZM010001271.988
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001271.988.fna -queryname NZ_RAZM010001271.988
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001271.988.fna -queryname NZ_RAZM010001271.988
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000241.98.fna -queryname NZ_BAIW010000241.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000241.98.fna -queryname NZ_BAIW010000241.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_BAIW010000241.98.fna -queryname NZ_BAIW010000241.98
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001021.989.fna -queryname NZ_RAZM010001021.989
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001021.989.fna -queryname NZ_RAZM010001021.989
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001021.989.fna -queryname NZ_RAZM010001021.989
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000551.990.fna -queryname NZ_RAZM010000551.990
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000551.990.fna -queryname NZ_RAZM010000551.990
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000551.990.fna -queryname NZ_RAZM010000551.990
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001191.991.fna -queryname NZ_RAZM010001191.991
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001191.991.fna -queryname NZ_RAZM010001191.991
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001191.991.fna -queryname NZ_RAZM010001191.991
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000611.992.fna -queryname NZ_RAZM010000611.992
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000611.992.fna -queryname NZ_RAZM010000611.992
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000611.992.fna -queryname NZ_RAZM010000611.992
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001031.993.fna -queryname NZ_RAZM010001031.993
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001031.993.fna -queryname NZ_RAZM010001031.993
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001031.993.fna -queryname NZ_RAZM010001031.993
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000321.994.fna -queryname NZ_RAZM010000321.994
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000321.994.fna -queryname NZ_RAZM010000321.994
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000321.994.fna -queryname NZ_RAZM010000321.994
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000141.995.fna -queryname NZ_RAZM010000141.995
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000141.995.fna -queryname NZ_RAZM010000141.995
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000141.995.fna -queryname NZ_RAZM010000141.995
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001221.996.fna -queryname NZ_RAZM010001221.996
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001221.996.fna -queryname NZ_RAZM010001221.996
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010001221.996.fna -queryname NZ_RAZM010001221.996
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000071.997.fna -queryname NZ_RAZM010000071.997
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000071.997.fna -queryname NZ_RAZM010000071.997
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000071.997.fna -queryname NZ_RAZM010000071.997
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_hmm_rules.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000641.998.fna -queryname NZ_RAZM010000641.998
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_identification_blast_bacteriocins.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -translate true -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000641.998.fna -queryname NZ_RAZM010000641.998
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_AOI_merge.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result -dna /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result/NZ_RAZM010000641.998.fna -queryname NZ_RAZM010000641.998
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
/data/pg-molgen/software/bagel4_2022/bagel4_clean_tmpfiles.pl -s /data/pg-molgen/USERS/Vicky/Results_BAGEL4_Peregrine/Results_Bacteroidaceae//Bacteroides_acidifaciens.result
