EBROOTPROKKA=/data/software/prokka/bin
resultsdir=/data/www/users/harma/20220408_003

cpu=4

name=HK_NZstar
$EBROOTPROKKA/prokka --outdir $resultsdir/prokka --force --prefix $name --locustag $name --strain $name --cpus $cpu $resultsdir/$name.fasta
name=HK_168
#$EBROOTPROKKA/prokka --outdir $resultsdir/prokka --force --prefix $name --locustag $name --strain $name --cpus $cpu $resultsdir/$name.fasta
name=HK_168star
#$EBROOTPROKKA/prokka --outdir $resultsdir/prokka --force --prefix $name --locustag $name --strain $name --cpus $cpu $resultsdir/$name.fasta