| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 94bp |
| duplication rate: | 57.583700% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 5.281472 M |
| total bases: | 639.058112 M |
| Q20 bases: | 624.857093 M (97.777820%) |
| Q30 bases: | 592.362033 M (92.692984%) |
| GC content: | 58.494616% |
| total reads: | 4.952934 M |
| total bases: | 468.217427 M |
| Q20 bases: | 463.739895 M (99.043707%) |
| Q30 bases: | 447.169458 M (95.504659%) |
| GC content: | 56.584490% |
| reads passed filters: | 4.952934 M (93.779424%) |
| reads with low quality: | 46.359000 K (0.877767%) |
| reads with too many N: | 8 (0.000151%) |
| reads too short: | 282.171000 K (5.342658%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 34618 |
| GATCGG | 31839 |
| GATCGGA | 29212 |
| GATCGGAA | 29226 |
| GATCGGAAG | 28106 |
| GATCGGAAGA | 26828 |
| GATCGGAAGAG | 26756 |
| GATCGGAAGAGC | 26319 |
| GATCGGAAGAGCA | 27366 |
| GATCGGAAGAGCAC | 26691 |
| GATCGGAAGAGCACA | 25331 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 24564 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 24196 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 23342 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 22056 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 21267 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 21179 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 20571 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 20015 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 19943 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 19207 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 19209 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 18539 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 17598 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 18483 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 16484 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 16063 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 17737 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 14356 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACA | 13977 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAG | 13302 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGAT | 13402 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAGATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 22034 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAGATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 161859 |
| other adapter sequences | 438274 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||