| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 93bp |
| duplication rate: | 8.443485% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 5.164313 M |
| total bases: | 624.881873 M |
| Q20 bases: | 612.915927 M (98.085087%) |
| Q30 bases: | 584.250199 M (93.497703%) |
| GC content: | 46.308124% |
| total reads: | 5.081346 M |
| total bases: | 475.849488 M |
| Q20 bases: | 470.530772 M (98.882269%) |
| Q30 bases: | 452.517131 M (95.096694%) |
| GC content: | 44.077655% |
| reads passed filters: | 5.081346 M (98.393455%) |
| reads with low quality: | 22.621000 K (0.438025%) |
| reads with too many N: | 20 (0.000387%) |
| reads too short: | 60.326000 K (1.168132%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 30928 |
| GATCGG | 30703 |
| GATCGGA | 30179 |
| GATCGGAA | 30130 |
| GATCGGAAG | 31073 |
| GATCGGAAGA | 31060 |
| GATCGGAAGAG | 30754 |
| GATCGGAAGAGC | 31126 |
| GATCGGAAGAGCA | 31284 |
| GATCGGAAGAGCAC | 31501 |
| GATCGGAAGAGCACA | 31531 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 31280 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 31500 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 31710 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 31582 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 31530 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 31401 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 31330 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 31017 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 30610 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 30498 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 30167 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 29806 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 29596 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 29389 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 28794 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 28222 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 27853 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 26903 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACA | 26485 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAG | 25697 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGC | 25429 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCG | 23932 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGA | 23721 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGAT | 22469 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATA | 21509 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAG | 20367 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAGA | 19667 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAGAT | 18313 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAGATC | 17452 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAGATCT | 15163 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAGATCTG | 14555 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACAGCGATAGATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 36819 |
| other adapter sequences | 214290 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||