| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 98bp |
| duplication rate: | 61.587487% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 3.750192 M |
| total bases: | 453.773232 M |
| Q20 bases: | 443.414334 M (97.717164%) |
| Q30 bases: | 423.727921 M (93.378783%) |
| GC content: | 58.794410% |
| total reads: | 3.635353 M |
| total bases: | 357.592576 M |
| Q20 bases: | 354.204785 M (99.052611%) |
| Q30 bases: | 341.557663 M (95.515871%) |
| GC content: | 58.523740% |
| reads passed filters: | 3.635353 M (96.937783%) |
| reads with low quality: | 86.078000 K (2.295296%) |
| reads with too many N: | 12 (0.000320%) |
| reads too short: | 28.749000 K (0.766601%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 21981 |
| AGATCG | 19439 |
| AGATCGG | 18196 |
| AGATCGGA | 17007 |
| AGGTCGGA | 12915 |
| AGATCGGAA | 16010 |
| AGGTCGGAA | 5412 |
| AGATCGGAAG | 15159 |
| AGATCGGAAGA | 14460 |
| AGATCGGAAGAG | 14190 |
| AGATCGGAAGAGC | 13169 |
| AGATCGGAAGAGCA | 12718 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 12258 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 11523 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 11021 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 9958 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 9748 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 9044 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 8571 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 8472 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 7768 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 7431 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 7038 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 6450 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 5987 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 5862 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 5520 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 5307 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 5258 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 27544 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 4625 |
| other adapter sequences | 103540 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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