| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 99bp |
| duplication rate: | 59.029321% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 3.815907 M |
| total bases: | 461.724747 M |
| Q20 bases: | 449.236671 M (97.295342%) |
| Q30 bases: | 428.954969 M (92.902746%) |
| GC content: | 59.491090% |
| total reads: | 3.669940 M |
| total bases: | 364.774752 M |
| Q20 bases: | 361.314044 M (99.051275%) |
| Q30 bases: | 348.727666 M (95.600823%) |
| GC content: | 59.360911% |
| reads passed filters: | 3.669940 M (96.174776%) |
| reads with low quality: | 126.072000 K (3.303854%) |
| reads with too many N: | 4 (0.000105%) |
| reads too short: | 19.891000 K (0.521265%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 19359 |
| AGATCG | 17068 |
| AGATCGG | 15336 |
| AGATCGGA | 14067 |
| AGGTCGGA | 3846 |
| AGATCGGAA | 13240 |
| AGATCGGAAG | 12471 |
| AGATCGGAAGA | 11490 |
| AGATCGGAAGAG | 11720 |
| AGATCGGAAGAGC | 10849 |
| AGATCGGAAGAGCA | 10591 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 9733 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 9188 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 8661 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 7849 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 7679 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 6765 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 6421 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 6056 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 5747 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 5407 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 4820 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 4623 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 4121 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 4015 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 3656 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 3572 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 3318 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 18342 |
| other adapter sequences | 58188 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||