| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 99bp |
| duplication rate: | 58.324862% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 3.898617 M |
| total bases: | 471.732657 M |
| Q20 bases: | 463.375869 M (98.228491%) |
| Q30 bases: | 444.545526 M (94.236750%) |
| GC content: | 59.475050% |
| total reads: | 3.811595 M |
| total bases: | 379.453434 M |
| Q20 bases: | 375.842946 M (99.048503%) |
| Q30 bases: | 362.644887 M (95.570327%) |
| GC content: | 59.376401% |
| reads passed filters: | 3.811595 M (97.767875%) |
| reads with low quality: | 53.995000 K (1.384978%) |
| reads with too many N: | 7 (0.000180%) |
| reads too short: | 33.020000 K (0.846967%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 17450 |
| AGATCG | 14596 |
| AGATCGG | 13732 |
| AGATCGGA | 12307 |
| AGATCGGAA | 11441 |
| AGATCGGAAG | 10843 |
| AGATCGGAAGA | 9960 |
| AGATCGGAAGAG | 9914 |
| AGATCGGAAGAGC | 8957 |
| AGATCGGAAGAGCA | 9024 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 8388 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 7877 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 7436 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 6884 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 6398 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 5735 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 5334 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 5142 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 4899 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 4462 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 4193 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 3792 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 3581 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 3520 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 3201 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 3118 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 3082 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 27793 |
| other adapter sequences | 63558 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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