| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 99bp |
| duplication rate: | 55.066963% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 3.546671 M |
| total bases: | 429.147191 M |
| Q20 bases: | 418.582923 M (97.538311%) |
| Q30 bases: | 400.674142 M (93.365202%) |
| GC content: | 59.804982% |
| total reads: | 3.399174 M |
| total bases: | 336.644683 M |
| Q20 bases: | 333.744412 M (99.138477%) |
| Q30 bases: | 322.961595 M (95.935451%) |
| GC content: | 59.458560% |
| reads passed filters: | 3.399174 M (95.841255%) |
| reads with low quality: | 101.051000 K (2.849179%) |
| reads with too many N: | 7 (0.000197%) |
| reads too short: | 46.439000 K (1.309369%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 21028 |
| GATCGG | 18733 |
| GATCGGA | 16116 |
| GATCGGAA | 15534 |
| GATCGGAAG | 14712 |
| GATCGGAAGA | 13560 |
| GATCGGAAGAG | 13487 |
| GATCGGAAGAGC | 12375 |
| GATCGGAAGAGCA | 12109 |
| GATCGGAAGAGCAC | 11537 |
| GATCGGAAGAGCACA | 10653 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 9882 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 9276 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 8647 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 7736 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 7346 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 7024 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 6697 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 6354 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 5885 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 5288 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 4892 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 4704 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 4301 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 4091 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 3758 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 23722 |
| other adapter sequences | 91212 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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