| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 93bp |
| duplication rate: | 42.002086% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 4.191818 M |
| total bases: | 507.209978 M |
| Q20 bases: | 493.446720 M (97.286477%) |
| Q30 bases: | 462.168455 M (91.119748%) |
| GC content: | 60.559758% |
| total reads: | 3.662843 M |
| total bases: | 341.523004 M |
| Q20 bases: | 337.700240 M (98.880672%) |
| Q30 bases: | 324.428046 M (94.994493%) |
| GC content: | 56.387863% |
| reads passed filters: | 3.662843 M (87.380774%) |
| reads with low quality: | 30.303000 K (0.722908%) |
| reads with too many N: | 8 (0.000191%) |
| reads too short: | 498.664000 K (11.896127%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 23656 |
| GATCGG | 19574 |
| GATCGGA | 17798 |
| GATCGGAA | 17499 |
| GATCGGAAG | 17518 |
| GATCGGAAGA | 16994 |
| GATCGGAAGAG | 17024 |
| GATCGGAAGAGC | 16556 |
| GATCGGAAGAGCA | 16988 |
| GATCGGAAGAGCAC | 16294 |
| GATCGGAAGAGCACA | 15983 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 15629 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 15606 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 15135 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 14981 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 14559 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 15065 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 14591 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 14424 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 14451 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 13744 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 13364 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 13365 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 13043 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 13110 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 13405 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 13010 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 16857 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 33502 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 297689 |
| other adapter sequences | 527106 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||