| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 83bp |
| duplication rate: | 58.545744% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 6.001379 M |
| total bases: | 726.166859 M |
| Q20 bases: | 700.767054 M (96.502208%) |
| Q30 bases: | 648.261652 M (89.271721%) |
| GC content: | 57.743532% |
| total reads: | 5.179501 M |
| total bases: | 433.129232 M |
| Q20 bases: | 428.295145 M (98.883916%) |
| Q30 bases: | 411.082595 M (94.909917%) |
| GC content: | 50.290213% |
| reads passed filters: | 5.179501 M (86.305181%) |
| reads with low quality: | 50.374000 K (0.839374%) |
| reads with too many N: | 5 (0.000083%) |
| reads too short: | 771.499000 K (12.855362%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 51410 |
| GATCGG | 49811 |
| GATCGGA | 51929 |
| GATCGGAA | 52256 |
| GATCGGAAG | 50578 |
| GATCGGAAGA | 51358 |
| GATCGGAAGAG | 51430 |
| GATCGGAAGAGC | 50532 |
| GATCGGAAGAGCA | 52440 |
| GATCGGAAGAGCAC | 52004 |
| GATCGGAAGAGCACA | 51397 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 49649 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 50298 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 49389 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 48843 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 49169 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 49122 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 49107 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 47021 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 48856 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 47440 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 47068 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 48022 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 45902 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 47968 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 45616 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 45490 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 50173 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 43317 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACT | 41110 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTC | 40344 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCT | 38520 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTC | 37739 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCG | 39143 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGC | 41435 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCG | 39563 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGC | 37675 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCA | 37381 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCAT | 35889 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 52139 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 457793 |
| other adapter sequences | 997120 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||