| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 86bp |
| duplication rate: | 54.444787% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 6.538007 M |
| total bases: | 791.098847 M |
| Q20 bases: | 764.768655 M (96.671694%) |
| Q30 bases: | 710.297424 M (89.786179%) |
| GC content: | 57.126669% |
| total reads: | 5.740385 M |
| total bases: | 497.833627 M |
| Q20 bases: | 492.121808 M (98.852665%) |
| Q30 bases: | 472.297503 M (94.870551%) |
| GC content: | 50.847618% |
| reads passed filters: | 5.740385 M (87.800227%) |
| reads with low quality: | 65.638000 K (1.003945%) |
| reads with too many N: | 23 (0.000352%) |
| reads too short: | 731.961000 K (11.195476%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 48492 |
| GATCGG | 47253 |
| GATCGGA | 46760 |
| GATCGGAA | 47413 |
| GATCGGAAG | 46764 |
| GATCGGAAGA | 45572 |
| GATCGGAAGAG | 46208 |
| GATCGGAAGAGC | 45270 |
| GATCGGAAGAGCA | 47618 |
| GATCGGAAGAGCAC | 47405 |
| GATCGGAAGAGCACA | 45590 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 44624 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 43110 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 42550 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 41932 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 41818 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 42483 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 41801 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 40805 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 41880 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 40136 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 41629 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 40493 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 39328 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 40610 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 38526 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 38288 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 43171 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 35991 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACT | 36342 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTC | 34288 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCT | 33297 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTC | 32263 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCG | 33386 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGC | 35347 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCG | 33910 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGC | 32369 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCA | 31508 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCAT | 30800 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 52097 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCTCGCGCATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 431565 |
| other adapter sequences | 935620 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||