| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 89bp |
| duplication rate: | 50.822621% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 5.401943 M |
| total bases: | 653.635103 M |
| Q20 bases: | 638.839028 M (97.736340%) |
| Q30 bases: | 599.876869 M (91.775498%) |
| GC content: | 54.800821% |
| total reads: | 4.746920 M |
| total bases: | 423.026192 M |
| Q20 bases: | 418.513772 M (98.933300%) |
| Q30 bases: | 402.446713 M (95.135176%) |
| GC content: | 48.303222% |
| reads passed filters: | 4.746920 M (87.874307%) |
| reads with low quality: | 17.283000 K (0.319940%) |
| reads with too many N: | 9 (0.000167%) |
| reads too short: | 637.731000 K (11.805586%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 33924 |
| GATCGG | 32350 |
| GATCGGA | 30942 |
| GATCGGAA | 31009 |
| GATCGGAAG | 30074 |
| GATCGGAAGA | 29471 |
| GATCGGAAGAG | 28460 |
| GATCGGAAGAGC | 28223 |
| GATCGGAAGAGCA | 28109 |
| GATCGGAAGAGCAC | 27699 |
| GATCGGAAGAGCACA | 27346 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 26325 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 26134 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 25980 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 25808 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 25359 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 26283 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 25725 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 24512 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 23977 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 24046 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 23462 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 23701 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 23316 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 23577 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 23671 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 23183 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 27519 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCG | 22899 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGA | 22011 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 55512 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 422865 |
| other adapter sequences | 890762 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||