| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 89bp |
| duplication rate: | 32.705836% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 4.736170 M |
| total bases: | 573.076570 M |
| Q20 bases: | 561.039743 M (97.899613%) |
| Q30 bases: | 529.824519 M (92.452658%) |
| GC content: | 52.942030% |
| total reads: | 4.439956 M |
| total bases: | 399.270681 M |
| Q20 bases: | 394.895512 M (98.904210%) |
| Q30 bases: | 379.433010 M (95.031523%) |
| GC content: | 48.676802% |
| reads passed filters: | 4.439956 M (93.745706%) |
| reads with low quality: | 17.596000 K (0.371524%) |
| reads with too many N: | 8 (0.000169%) |
| reads too short: | 278.610000 K (5.882601%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 32383 |
| GATCGG | 29841 |
| GATCGGA | 29030 |
| GATCGGAA | 29190 |
| GATCGGAAG | 29028 |
| GATCGGAAGA | 28844 |
| GATCGGAAGAG | 28697 |
| GATCGGAAGAGC | 27890 |
| GATCGGAAGAGCA | 27605 |
| GATCGGAAGAGCAC | 27201 |
| GATCGGAAGAGCACA | 27422 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 26330 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 26450 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 26309 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 26425 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 27486 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 28655 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 26509 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 25105 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 24601 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 24510 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 24136 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 23747 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 23745 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 24140 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 25002 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 25595 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 26956 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 22786 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACT | 22579 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTC | 21531 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCC | 21546 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCG | 20858 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGC | 21496 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCG | 22247 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGA | 22555 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAA | 22358 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAA | 22346 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAAT | 20900 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATC | 19393 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCT | 18282 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGG | 17547 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGG | 17706 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGG | 17368 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 28976 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 176129 |
| other adapter sequences | 438626 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||