| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 98bp |
| duplication rate: | 56.641720% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 4.742815 M |
| total bases: | 573.880615 M |
| Q20 bases: | 561.673721 M (97.872921%) |
| Q30 bases: | 537.156665 M (93.600768%) |
| GC content: | 59.401309% |
| total reads: | 4.595263 M |
| total bases: | 451.087351 M |
| Q20 bases: | 446.795938 M (99.048651%) |
| Q30 bases: | 431.043404 M (95.556526%) |
| GC content: | 59.067555% |
| reads passed filters: | 4.595263 M (96.888936%) |
| reads with low quality: | 96.406000 K (2.032675%) |
| reads with too many N: | 10 (0.000211%) |
| reads too short: | 51.136000 K (1.078178%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 27159 |
| GATCGG | 24106 |
| GATCGGA | 20756 |
| GATCGGAA | 19913 |
| GATCGGAAG | 18864 |
| GATCGGAAGA | 17377 |
| GATCGGAAGAG | 17598 |
| GATCGGAAGAGC | 16142 |
| GATCGGAAGAGCA | 16314 |
| GATCGGAAGAGCAC | 15607 |
| GATCGGAAGAGCACA | 14372 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 13813 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 13082 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 12553 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 11415 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 11077 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 10666 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 10157 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 9674 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 9461 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 8800 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 8419 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 8207 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 7804 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 7407 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 6854 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 6788 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 6878 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 5961 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACT | 5874 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 29910 |
| other adapter sequences | 162393 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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