| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 97bp |
| duplication rate: | 53.150135% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 3.671938 M |
| total bases: | 444.304498 M |
| Q20 bases: | 434.935858 M (97.891392%) |
| Q30 bases: | 417.154806 M (93.889395%) |
| GC content: | 59.467644% |
| total reads: | 3.552936 M |
| total bases: | 346.760019 M |
| Q20 bases: | 343.885518 M (99.171040%) |
| Q30 bases: | 332.910132 M (96.005916%) |
| GC content: | 59.175440% |
| reads passed filters: | 3.552936 M (96.759150%) |
| reads with low quality: | 80.937000 K (2.204204%) |
| reads with too many N: | 10 (0.000272%) |
| reads too short: | 38.055000 K (1.036374%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 21317 |
| AGATCG | 18986 |
| AGATCGG | 17932 |
| AGATCGGA | 16684 |
| AGATCGGAA | 16091 |
| AGATCGGAAG | 15385 |
| AGATCGGAAGA | 14559 |
| AGATCGGAAGAG | 14579 |
| AGATCGGAAGAGC | 13966 |
| AGATCGGAAGAGCA | 14007 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 13158 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 12655 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 12210 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 11446 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 11261 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 10430 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 9947 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 9530 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 9225 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 9048 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 8862 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 8541 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 8345 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 8236 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 7820 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 7568 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 7101 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 35004 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 6503 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 6133 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACT | 5887 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTC | 5537 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCC | 5384 |
| other adapter sequences | 124360 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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