| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 98bp |
| duplication rate: | 53.434531% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 3.737381 M |
| total bases: | 452.223101 M |
| Q20 bases: | 441.845260 M (97.705150%) |
| Q30 bases: | 422.233408 M (93.368385%) |
| GC content: | 59.278866% |
| total reads: | 3.603946 M |
| total bases: | 353.806874 M |
| Q20 bases: | 350.445509 M (99.049944%) |
| Q30 bases: | 338.112366 M (95.564103%) |
| GC content: | 58.892834% |
| reads passed filters: | 3.603946 M (96.429719%) |
| reads with low quality: | 88.521000 K (2.368530%) |
| reads with too many N: | 6 (0.000161%) |
| reads too short: | 44.908000 K (1.201590%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 20137 |
| GATCGG | 17654 |
| GATCGGA | 15625 |
| GATCGGAA | 14741 |
| GATCGGAAG | 13980 |
| GATCGGAAGA | 13297 |
| GATCGGAAGAG | 13382 |
| GATCGGAAGAGC | 12670 |
| GATCGGAAGAGCA | 12565 |
| GATCGGAAGAGCAC | 11907 |
| GATCGGAAGAGCACA | 11500 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 11043 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 10618 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 10087 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 9297 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 9147 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 8717 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 8472 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 8183 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 7895 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 7319 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 7341 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 7061 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 6491 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 6345 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 5881 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 5846 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 6139 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 5444 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACT | 5169 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTC | 4764 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCC | 4787 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 5567 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 26063 |
| other adapter sequences | 114376 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||