| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 98bp |
| duplication rate: | 52.217254% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 3.775865 M |
| total bases: | 456.879665 M |
| Q20 bases: | 449.769358 M (98.443724%) |
| Q30 bases: | 431.173318 M (94.373497%) |
| GC content: | 59.228789% |
| total reads: | 3.605455 M |
| total bases: | 355.483146 M |
| Q20 bases: | 352.266445 M (99.095119%) |
| Q30 bases: | 340.240792 M (95.712215%) |
| GC content: | 58.265735% |
| reads passed filters: | 3.605455 M (95.486862%) |
| reads with low quality: | 31.526000 K (0.834935%) |
| reads with too many N: | 13 (0.000344%) |
| reads too short: | 138.871000 K (3.677859%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 20417 |
| GATCGG | 17616 |
| GATCGGA | 15165 |
| GATCGGAA | 14677 |
| GATCGGAAG | 13372 |
| GATCGGAAGA | 12690 |
| GATCGGAAGAG | 12728 |
| GATCGGAAGAGC | 12132 |
| GATCGGAAGAGCA | 11973 |
| GATCGGAAGAGCAC | 11049 |
| GATCGGAAGAGCACA | 10419 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 9835 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 9272 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 8863 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 8182 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 8015 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 7406 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 7333 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 6616 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 6291 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 5671 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 5527 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 5255 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 5102 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 16972 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 83998 |
| other adapter sequences | 149580 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||