| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 99bp |
| duplication rate: | 55.485323% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 3.690585 M |
| total bases: | 446.560785 M |
| Q20 bases: | 440.294071 M (98.596672%) |
| Q30 bases: | 423.412114 M (94.816233%) |
| GC content: | 59.065578% |
| total reads: | 3.623536 M |
| total bases: | 359.276792 M |
| Q20 bases: | 356.003241 M (99.088850%) |
| Q30 bases: | 343.818636 M (95.697424%) |
| GC content: | 58.830266% |
| reads passed filters: | 3.623536 M (98.183242%) |
| reads with low quality: | 27.651000 K (0.749231%) |
| reads with too many N: | 7 (0.000190%) |
| reads too short: | 39.391000 K (1.067338%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 19936 |
| GATCGG | 17247 |
| GATCGGA | 14412 |
| GATCGGAA | 13536 |
| GATCGGAAG | 12386 |
| GATCGGAAGA | 11680 |
| GATCGGAAGAG | 11495 |
| GATCGGAAGAGC | 10807 |
| GATCGGAAGAGCA | 10629 |
| GATCGGAAGAGCAC | 10000 |
| GATCGGAAGAGCACA | 9078 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 8849 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 7933 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 7648 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 6981 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 6322 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 6355 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 5884 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 5502 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 5175 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 4806 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 4440 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 4184 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 3860 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 3776 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 3470 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 3521 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 23141 |
| other adapter sequences | 89408 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||