| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 97bp |
| duplication rate: | 49.068700% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 4.085419 M |
| total bases: | 494.335699 M |
| Q20 bases: | 486.496312 M (98.414157%) |
| Q30 bases: | 466.158684 M (94.300024%) |
| GC content: | 57.963954% |
| total reads: | 3.998346 M |
| total bases: | 389.799865 M |
| Q20 bases: | 385.979071 M (99.019806%) |
| Q30 bases: | 372.076417 M (95.453193%) |
| GC content: | 57.484401% |
| reads passed filters: | 3.998346 M (97.868689%) |
| reads with low quality: | 33.638000 K (0.823367%) |
| reads with too many N: | 22 (0.000539%) |
| reads too short: | 53.413000 K (1.307406%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 28485 |
| GATCGG | 26237 |
| GATCGGA | 22970 |
| GATCGGAA | 22025 |
| GATCGGAAG | 20957 |
| GATCGGAAGA | 20085 |
| GATCGGAAGAG | 19844 |
| GATCGGAAGAGC | 18921 |
| GATCGGAAGAGCA | 18469 |
| GATCGGAAGAGCAC | 17858 |
| GATCGGAAGAGCACA | 16866 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 16145 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 15124 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 14860 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 13717 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 13188 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 12577 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 12159 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 11445 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 10588 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 10028 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 9559 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 9054 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 8680 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 8453 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGT | 8226 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 7838 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA | 7772 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC | 6893 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACT | 6454 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTCCGCGAAATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 29401 |
| other adapter sequences | 167782 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||