| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 99bp |
| duplication rate: | 44.583571% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 1.283484 M |
| total bases: | 155.301564 M |
| Q20 bases: | 152.606450 M (98.264593%) |
| Q30 bases: | 145.853485 M (93.916301%) |
| GC content: | 66.816516% |
| total reads: | 1.270940 M |
| total bases: | 126.546652 M |
| Q20 bases: | 124.849601 M (98.658952%) |
| Q30 bases: | 119.836960 M (94.697851%) |
| GC content: | 67.344460% |
| reads passed filters: | 1.270940 M (99.022660%) |
| reads with low quality: | 4.472000 K (0.348427%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 8.072000 K (0.628913%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 6569 |
| AGATCG | 6091 |
| AGATCGG | 5704 |
| AGATCGGA | 5027 |
| AGATCGGAA | 4742 |
| AGATCGGAAG | 4511 |
| AGATCGGAAGA | 4132 |
| AGATCGGAAGAG | 4169 |
| AGATCGGAAGAGC | 3850 |
| AGATCGGAAGAGCA | 3416 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 3333 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 3216 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 2761 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 2678 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 2489 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 2282 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 2102 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 1942 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 1925 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 1801 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 1564 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 1436 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 1359 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 1267 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 1081 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 1102 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 3935 |
| other adapter sequences | 20515 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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