| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 41.720262% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 825.014000 K |
| total bases: | 99.826694 M |
| Q20 bases: | 98.158890 M (98.329301%) |
| Q30 bases: | 93.939568 M (94.102654%) |
| GC content: | 67.035379% |
| total reads: | 818.687000 K |
| total bases: | 81.948463 M |
| Q20 bases: | 80.884333 M (98.701464%) |
| Q30 bases: | 77.704858 M (94.821617%) |
| GC content: | 67.429589% |
| reads passed filters: | 818.687000 K (99.233104%) |
| reads with low quality: | 2.836000 K (0.343752%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 3.491000 K (0.423144%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 3353 |
| AGATCG | 3016 |
| AGATCGG | 2521 |
| AGATCGGA | 2361 |
| AGATCGGAA | 2215 |
| AGATCGGAAG | 1941 |
| AGATCGGAAGA | 1929 |
| AGATCGGAAGAG | 1790 |
| AGATCGGAAGAGC | 1601 |
| AGATCGGAAGAGCA | 1495 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 1448 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 1300 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 1176 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 1126 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 1032 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 888 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 868 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 761 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 758 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 610 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 634 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 525 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 522 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 476 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 1536 |
| other adapter sequences | 9109 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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