| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 45.558076% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 1.012703 M |
| total bases: | 122.537063 M |
| Q20 bases: | 120.479314 M (98.320713%) |
| Q30 bases: | 115.185614 M (94.000632%) |
| GC content: | 66.870754% |
| total reads: | 1.005947 M |
| total bases: | 100.934754 M |
| Q20 bases: | 99.590252 M (98.667949%) |
| Q30 bases: | 95.548775 M (94.663900%) |
| GC content: | 67.179484% |
| reads passed filters: | 1.005947 M (99.332874%) |
| reads with low quality: | 3.236000 K (0.319541%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 3.520000 K (0.347585%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 3289 |
| AGATCG | 2986 |
| AGATCGG | 2559 |
| AGATCGGA | 2246 |
| AGATCGGAA | 2226 |
| AGATCGGAAG | 1937 |
| AGATCGGAAGA | 1668 |
| AGATCGGAAGAG | 1630 |
| AGATCGGAAGAGC | 1538 |
| AGATCGGAAGAGCA | 1432 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 1364 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 1227 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 1077 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 1020 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 940 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 819 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 794 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 713 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 663 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 577 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 529 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 469 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 441 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 1405 |
| other adapter sequences | 8655 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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