| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 46.233496% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 913.619000 K |
| total bases: | 110.547899 M |
| Q20 bases: | 108.741187 M (98.365675%) |
| Q30 bases: | 104.028718 M (94.102845%) |
| GC content: | 66.519043% |
| total reads: | 907.678000 K |
| total bases: | 91.081570 M |
| Q20 bases: | 89.892353 M (98.694338%) |
| Q30 bases: | 86.285008 M (94.733773%) |
| GC content: | 66.799427% |
| reads passed filters: | 907.678000 K (99.349729%) |
| reads with low quality: | 2.751000 K (0.301110%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 3.190000 K (0.349161%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 2954 |
| AGATCG | 2730 |
| AGATCGG | 2232 |
| AGATCGGA | 1874 |
| AGATCGGAA | 1843 |
| AGATCGGAAG | 1712 |
| AGATCGGAAGA | 1536 |
| AGATCGGAAGAG | 1450 |
| AGATCGGAAGAGC | 1313 |
| AGATCGGAAGAGCA | 1195 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 1191 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 1101 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 1005 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 883 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 784 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 759 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 660 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 595 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 606 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 531 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 481 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 432 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 400 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 723 |
| other adapter sequences | 8212 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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