| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 62.191822% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 10.915046 M |
| total bases: | 1.320721 G |
| Q20 bases: | 1.307483 G (98.997720%) |
| Q30 bases: | 1.260442 G (95.435909%) |
| GC content: | 60.566894% |
| total reads: | 10.873163 M |
| total bases: | 1.089899 G |
| Q20 bases: | 1.080353 G (99.124113%) |
| Q30 bases: | 1.042783 G (95.677028%) |
| GC content: | 60.803299% |
| reads passed filters: | 10.873163 M (99.616282%) |
| reads with low quality: | 13.417000 K (0.122922%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 28.466000 K (0.260796%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 45990 |
| AGATCG | 36432 |
| AGATCGG | 33274 |
| AGATCGGA | 29028 |
| AGATCGGAA | 27477 |
| AGATCGGAAG | 25548 |
| AGATCGGAAGA | 23780 |
| AGATCGGAAGAG | 23448 |
| AGATCGGAAGAGC | 21113 |
| AGATCGGAAGAGCA | 19608 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 17821 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 16811 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 14721 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 14392 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 12846 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 11738 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 10907 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 9597 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 8885 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 8086 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 7561 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 6724 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 6192 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 5670 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 17506 |
| other adapter sequences | 86008 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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