| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 66.613150% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 13.598339 M |
| total bases: | 1.645399 G |
| Q20 bases: | 1.628528 G (98.974643%) |
| Q30 bases: | 1.569079 G (95.361591%) |
| GC content: | 60.336918% |
| total reads: | 13.538291 M |
| total bases: | 1.357812 G |
| Q20 bases: | 1.345880 G (99.121246%) |
| Q30 bases: | 1.298633 G (95.641596%) |
| GC content: | 60.571501% |
| reads passed filters: | 13.538291 M (99.558417%) |
| reads with low quality: | 22.189000 K (0.163174%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 37.859000 K (0.278409%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 56073 |
| AGATCG | 44213 |
| AGATCGG | 40519 |
| AGATCGGA | 34436 |
| AGGTCGGA | 6536 |
| AGATCGGAA | 32933 |
| AGATCGGAAG | 29890 |
| AGATCGGAAGA | 28353 |
| AGATCGGAAGAG | 27861 |
| AGATCGGAAGAGC | 24950 |
| AGATCGGAAGAGCA | 23241 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 20677 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 19296 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 17067 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 16191 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 14579 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 13732 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 12543 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 11168 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 9973 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 9238 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 8613 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 7889 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 7161 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 6431 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 27403 |
| other adapter sequences | 91978 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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