| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 62.343963% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 11.833829 M |
| total bases: | 1.431893 G |
| Q20 bases: | 1.417636 G (99.004306%) |
| Q30 bases: | 1.366980 G (95.466623%) |
| GC content: | 60.650983% |
| total reads: | 11.786940 M |
| total bases: | 1.183107 G |
| Q20 bases: | 1.172856 G (99.133495%) |
| Q30 bases: | 1.132353 G (95.710063%) |
| GC content: | 60.847331% |
| reads passed filters: | 11.786940 M (99.603772%) |
| reads with low quality: | 16.220000 K (0.137065%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 30.669000 K (0.259164%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 42811 |
| AGATCG | 33596 |
| AGATCGG | 30101 |
| AGATCGGA | 25840 |
| AGATCGGAA | 24235 |
| AGATCGGAAG | 22705 |
| AGATCGGAAGA | 20693 |
| AGATCGGAAGAG | 20398 |
| AGATCGGAAGAGC | 18590 |
| AGATCGGAAGAGCA | 17086 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 15450 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 14388 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 12479 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 12103 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 11138 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 10175 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 9228 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 8424 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 7498 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 7001 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 6576 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 5817 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 5297 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 17721 |
| other adapter sequences | 86861 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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