| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 62.512534% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 9.897887 M |
| total bases: | 1.197644 G |
| Q20 bases: | 1.186599 G (99.077746%) |
| Q30 bases: | 1.146186 G (95.703349%) |
| GC content: | 60.381527% |
| total reads: | 9.863425 M |
| total bases: | 988.279321 M |
| Q20 bases: | 980.367794 M (99.199464%) |
| Q30 bases: | 948.087001 M (95.933101%) |
| GC content: | 60.614544% |
| reads passed filters: | 9.863425 M (99.651825%) |
| reads with low quality: | 12.051000 K (0.121753%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 22.411000 K (0.226422%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 44010 |
| AGATCG | 34685 |
| AGATCGG | 31274 |
| AGATCGGA | 27515 |
| AGATCGGAA | 26175 |
| AGATCGGAAG | 23967 |
| AGATCGGAAGA | 22483 |
| AGATCGGAAGAG | 21848 |
| AGATCGGAAGAGC | 19880 |
| AGATCGGAAGAGCA | 18901 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 17347 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 16058 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 14272 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 13525 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 12614 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 11303 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 10517 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 9202 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 8487 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 7880 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 7368 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 6587 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 6041 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 5382 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 13542 |
| other adapter sequences | 82161 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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