| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 70.345511% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 15.621463 M |
| total bases: | 1.890197 G |
| Q20 bases: | 1.871069 G (98.988052%) |
| Q30 bases: | 1.803071 G (95.390649%) |
| GC content: | 59.489701% |
| total reads: | 15.549424 M |
| total bases: | 1.559385 G |
| Q20 bases: | 1.545809 G (99.129424%) |
| Q30 bases: | 1.491771 G (95.664065%) |
| GC content: | 59.657876% |
| reads passed filters: | 15.549424 M (99.538846%) |
| reads with low quality: | 23.937000 K (0.153231%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 48.102000 K (0.307923%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 65529 |
| AGATCG | 50868 |
| AGATCGG | 46604 |
| AGATCGGA | 39470 |
| AGGTCGGA | 9874 |
| AGATCGGAA | 37008 |
| AGATCGGAAG | 33769 |
| AGATCGGAAGA | 31121 |
| AGATCGGAAGAG | 31124 |
| AGATCGGAAGAGC | 28288 |
| AGATCGGAAGAGCA | 26143 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 24301 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 22434 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 19605 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 18851 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 17143 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 15938 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 14679 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 13047 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 11508 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 10581 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 9984 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 9085 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 8133 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 27107 |
| other adapter sequences | 125550 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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