| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 69.766780% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 15.569992 M |
| total bases: | 1.883969 G |
| Q20 bases: | 1.865658 G (99.028035%) |
| Q30 bases: | 1.799883 G (95.536776%) |
| GC content: | 59.552912% |
| total reads: | 15.517167 M |
| total bases: | 1.557719 G |
| Q20 bases: | 1.544445 G (99.147895%) |
| Q30 bases: | 1.491678 G (95.760405%) |
| GC content: | 59.713653% |
| reads passed filters: | 15.517167 M (99.660726%) |
| reads with low quality: | 20.407000 K (0.131066%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 32.418000 K (0.208208%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 60381 |
| AGATCG | 46796 |
| AGATCGG | 42069 |
| AGATCGGA | 35075 |
| AGGTCGGA | 6577 |
| AGATCGGAA | 33146 |
| AGATCGGAAG | 30450 |
| AGATCGGAAGA | 28022 |
| AGATCGGAAGAG | 27706 |
| AGATCGGAAGAGC | 25099 |
| AGATCGGAAGAGCA | 23200 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 20937 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 19546 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 17481 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 16312 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 14745 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 13469 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 12541 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 11211 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 9891 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 9373 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 8441 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 7496 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 7043 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 20090 |
| other adapter sequences | 99807 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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