| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 66.210821% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 10.846150 M |
| total bases: | 1.312384 G |
| Q20 bases: | 1.299494 G (99.017803%) |
| Q30 bases: | 1.252897 G (95.467265%) |
| GC content: | 59.635586% |
| total reads: | 10.804517 M |
| total bases: | 1.084421 G |
| Q20 bases: | 1.075087 G (99.139284%) |
| Q30 bases: | 1.037753 G (95.696506%) |
| GC content: | 59.774067% |
| reads passed filters: | 10.804517 M (99.616150%) |
| reads with low quality: | 13.523000 K (0.124680%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 28.110000 K (0.259170%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 38620 |
| AGATCG | 28710 |
| AGATCGG | 26430 |
| AGATCGGA | 22248 |
| AGGTCGGA | 4878 |
| AGATCGGAA | 20882 |
| AGATCGGAAG | 19149 |
| AGATCGGAAGA | 17710 |
| AGATCGGAAGAG | 17793 |
| AGATCGGAAGAGC | 16000 |
| AGATCGGAAGAGCA | 15137 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 13797 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 12796 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 11385 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 11015 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 9787 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 9151 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 8395 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 7621 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 6829 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 6410 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 5920 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 5321 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 4928 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 4466 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 16764 |
| other adapter sequences | 77562 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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