| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 65.990880% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 12.367218 M |
| total bases: | 1.496433 G |
| Q20 bases: | 1.481086 G (98.974392%) |
| Q30 bases: | 1.427424 G (95.388425%) |
| GC content: | 59.641476% |
| total reads: | 12.314361 M |
| total bases: | 1.234551 G |
| Q20 bases: | 1.223810 G (99.129982%) |
| Q30 bases: | 1.181234 G (95.681244%) |
| GC content: | 59.803127% |
| reads passed filters: | 12.314361 M (99.572604%) |
| reads with low quality: | 22.728000 K (0.183776%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 30.129000 K (0.243620%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 49287 |
| AGATCG | 38121 |
| AGATCGG | 34611 |
| AGATCGGA | 29497 |
| AGATCGGAA | 28024 |
| AGATCGGAAG | 25858 |
| AGATCGGAAGA | 23556 |
| AGATCGGAAGAG | 24154 |
| AGATCGGAAGAGC | 21558 |
| AGATCGGAAGAGCA | 20148 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 18324 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 17175 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 15223 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 14771 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 13572 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 12571 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 11659 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 10565 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 9447 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 8650 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 8041 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 7142 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 6868 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 6188 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 17805 |
| other adapter sequences | 106498 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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