| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 69.244551% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 14.696911 M |
| total bases: | 1.778326 G |
| Q20 bases: | 1.761363 G (99.046136%) |
| Q30 bases: | 1.699741 G (95.580933%) |
| GC content: | 60.499376% |
| total reads: | 14.654012 M |
| total bases: | 1.469684 G |
| Q20 bases: | 1.457305 G (99.157672%) |
| Q30 bases: | 1.407834 G (95.791567%) |
| GC content: | 60.724094% |
| reads passed filters: | 14.654012 M (99.708109%) |
| reads with low quality: | 15.964000 K (0.108621%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 26.935000 K (0.183270%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 55509 |
| AGATCG | 43443 |
| AGATCGG | 38738 |
| AGATCGGA | 34407 |
| AGATCGGAA | 32171 |
| AGATCGGAAG | 30234 |
| AGATCGGAAGA | 27981 |
| AGATCGGAAGAG | 27654 |
| AGATCGGAAGAGC | 25179 |
| AGATCGGAAGAGCA | 23466 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 21244 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 20076 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 17893 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 17362 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 16068 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 14531 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 13592 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 12468 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 11210 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 10291 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 9774 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 8743 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 8390 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 7479 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 6758 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 18003 |
| other adapter sequences | 104684 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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