| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 65.450784% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 11.928149 M |
| total bases: | 1.443306 G |
| Q20 bases: | 1.429328 G (99.031506%) |
| Q30 bases: | 1.379301 G (95.565358%) |
| GC content: | 60.900179% |
| total reads: | 11.878052 M |
| total bases: | 1.194111 G |
| Q20 bases: | 1.184004 G (99.153591%) |
| Q30 bases: | 1.144004 G (95.803892%) |
| GC content: | 61.047654% |
| reads passed filters: | 11.878052 M (99.580010%) |
| reads with low quality: | 14.167000 K (0.118769%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 35.930000 K (0.301220%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 34426 |
| AGATCG | 24826 |
| AGATCGG | 21853 |
| AGATCGGA | 18904 |
| AGATCGGAA | 17517 |
| AGATCGGAAG | 16196 |
| AGATCGGAAGA | 15156 |
| AGATCGGAAGAG | 14717 |
| AGATCGGAAGAGC | 13182 |
| AGATCGGAAGAGCA | 12330 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 11180 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 10600 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 9076 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 8950 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 8099 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 7173 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 6831 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 6247 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 5504 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 5398 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 4920 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 4523 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 3971 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 23207 |
| other adapter sequences | 71483 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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