| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 69.856117% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 8.916250 M |
| total bases: | 1.078866 G |
| Q20 bases: | 1.068597 G (99.048162%) |
| Q30 bases: | 1.031562 G (95.615380%) |
| GC content: | 59.668675% |
| total reads: | 8.881534 M |
| total bases: | 888.799198 M |
| Q20 bases: | 881.505168 M (99.179339%) |
| Q30 bases: | 852.160638 M (95.877746%) |
| GC content: | 59.808952% |
| reads passed filters: | 8.881534 M (99.610643%) |
| reads with low quality: | 10.148000 K (0.113815%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 24.568000 K (0.275542%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 38201 |
| AGATCG | 30801 |
| AGATCGG | 28568 |
| AGATCGGA | 24302 |
| AGATCGGAA | 22984 |
| AGATCGGAAG | 21279 |
| AGATCGGAAGA | 19992 |
| AGATCGGAAGAG | 20328 |
| AGATCGGAAGAGC | 18327 |
| AGATCGGAAGAGCA | 17180 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 16082 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 15370 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 13649 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 13290 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 12230 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 11370 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 10618 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 9761 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 8768 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 8205 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 7578 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 6662 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 6488 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 5848 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCA | 5528 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAG | 5044 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 15702 |
| other adapter sequences | 83209 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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