| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 69.600735% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 5.172000 M |
| total bases: | 625.812000 M |
| Q20 bases: | 620.605212 M (99.167995%) |
| Q30 bases: | 600.694612 M (95.986432%) |
| GC content: | 59.917368% |
| total reads: | 5.153694 M |
| total bases: | 519.130792 M |
| Q20 bases: | 515.299190 M (99.261920%) |
| Q30 bases: | 499.197965 M (96.160346%) |
| GC content: | 59.962134% |
| reads passed filters: | 5.153694 M (99.646056%) |
| reads with low quality: | 4.712000 K (0.091106%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 13.594000 K (0.262838%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 10911 |
| AGATCG | 6936 |
| AGATCGG | 6325 |
| AGATCGGA | 4443 |
| AGGTCGGA | 1402 |
| AGATCGGAA | 4148 |
| AGATCGGAAG | 3879 |
| AGATCGGAAGA | 3697 |
| AGATCGGAAGAG | 3608 |
| AGATCGGAAGAGC | 3165 |
| AGATCGGAAGAGCA | 3020 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 2736 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 2581 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 2279 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 2230 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 1984 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 1845 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 1660 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 1578 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 1331 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 1247 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 1115 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 8687 |
| other adapter sequences | 22310 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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