| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 68.456613% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC |
| total reads: | 7.562292 M |
| total bases: | 915.037332 M |
| Q20 bases: | 905.941443 M (99.005954%) |
| Q30 bases: | 873.362639 M (95.445575%) |
| GC content: | 60.252416% |
| total reads: | 7.498137 M |
| total bases: | 752.700365 M |
| Q20 bases: | 746.366779 M (99.158551%) |
| Q30 bases: | 720.891380 M (95.774018%) |
| GC content: | 60.270360% |
| reads passed filters: | 7.498137 M (99.151646%) |
| reads with low quality: | 8.864000 K (0.117213%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 55.291000 K (0.731141%) |
| Sequence | Occurrences |
| GATCG | 28931 |
| GATCGG | 24652 |
| GATCGGA | 17122 |
| GATCGGAA | 16181 |
| GATCGGAAG | 14983 |
| GATCGGAAGA | 13528 |
| GATCGGAAGAG | 13841 |
| GATCGGAAGAGC | 12266 |
| GATCGGAAGAGCA | 11442 |
| GATCGGAAGAGCAC | 10693 |
| GATCGGAAGAGCACA | 9814 |
| GATCGGAAGAGCACAC | 8796 |
| GATCGGAAGAGCACACG | 8392 |
| GATCGGAAGAGCACACGT | 7767 |
| GATCGGAAGAGCACACGTC | 7239 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCT | 6446 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTG | 6146 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 5266 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 4837 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 4621 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 3811 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 3642 |
| GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACCTGAAGCTATCTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG | 28837 |
| other adapter sequences | 78701 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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