| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 66.545800% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 6.648923 M |
| total bases: | 804.519683 M |
| Q20 bases: | 796.883980 M (99.050899%) |
| Q30 bases: | 769.237892 M (95.614552%) |
| GC content: | 60.129629% |
| total reads: | 6.626141 M |
| total bases: | 664.796667 M |
| Q20 bases: | 659.258156 M (99.166886%) |
| Q30 bases: | 637.128534 M (95.838106%) |
| GC content: | 60.280879% |
| reads passed filters: | 6.626141 M (99.657358%) |
| reads with low quality: | 7.506000 K (0.112890%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 15.276000 K (0.229751%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 25447 |
| AGATCG | 19441 |
| AGATCGG | 18114 |
| AGATCGGA | 15429 |
| AGATCGGAA | 14134 |
| AGATCGGAAG | 13393 |
| AGATCGGAAGA | 12023 |
| AGATCGGAAGAG | 12241 |
| AGATCGGAAGAGC | 11058 |
| AGATCGGAAGAGCA | 10317 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 9354 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 8753 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 8091 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 7314 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 6888 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 6241 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 5670 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 5360 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 4516 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 4280 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 3936 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 3586 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 3244 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 9232 |
| other adapter sequences | 52061 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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