| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 68.520323% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 6.508866 M |
| total bases: | 787.572786 M |
| Q20 bases: | 779.679522 M (98.997773%) |
| Q30 bases: | 751.701272 M (95.445308%) |
| GC content: | 62.219938% |
| total reads: | 6.483432 M |
| total bases: | 651.063312 M |
| Q20 bases: | 645.382281 M (99.127423%) |
| Q30 bases: | 623.051826 M (95.697579%) |
| GC content: | 62.462971% |
| reads passed filters: | 6.483432 M (99.609241%) |
| reads with low quality: | 8.432000 K (0.129546%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 17.002000 K (0.261213%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 22378 |
| AGATCG | 17125 |
| AGATCGG | 14481 |
| AGATCGGA | 12549 |
| AGATCGGAA | 11815 |
| AGATCGGAAG | 10666 |
| AGATCGGAAGA | 10018 |
| AGATCGGAAGAG | 9485 |
| AGATCGGAAGAGC | 8701 |
| AGATCGGAAGAGCA | 8323 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 7565 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 6722 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 6141 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 5879 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 5335 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 4973 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 4602 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 4138 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 3696 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 3494 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 3259 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 2888 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 2575 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 2440 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 9871 |
| other adapter sequences | 44403 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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