| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 70.586936% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 8.069795 M |
| total bases: | 976.445195 M |
| Q20 bases: | 966.523631 M (98.983910%) |
| Q30 bases: | 931.690444 M (95.416563%) |
| GC content: | 62.102213% |
| total reads: | 8.033406 M |
| total bases: | 806.573564 M |
| Q20 bases: | 799.524817 M (99.126088%) |
| Q30 bases: | 771.869426 M (95.697338%) |
| GC content: | 62.353350% |
| reads passed filters: | 8.033406 M (99.549072%) |
| reads with low quality: | 11.355000 K (0.140710%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 25.034000 K (0.310219%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 27435 |
| AGATCG | 20521 |
| AGATCGG | 17931 |
| AGATCGGA | 15188 |
| AGATCGGAA | 14283 |
| AGATCGGAAG | 13097 |
| AGATCGGAAGA | 12337 |
| AGATCGGAAGAG | 11860 |
| AGATCGGAAGAGC | 10709 |
| AGATCGGAAGAGCA | 9991 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 8907 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 8221 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 7535 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 7269 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 6674 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 6194 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 5577 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 5180 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 4766 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 4367 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 4131 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 3479 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 3350 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 3102 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 16231 |
| other adapter sequences | 58230 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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