| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 63.945909% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 4.692369 M |
| total bases: | 567.776649 M |
| Q20 bases: | 562.369855 M (99.047725%) |
| Q30 bases: | 542.654729 M (95.575387%) |
| GC content: | 59.670891% |
| total reads: | 4.679957 M |
| total bases: | 470.250525 M |
| Q20 bases: | 466.249225 M (99.149113%) |
| Q30 bases: | 450.311735 M (95.759964%) |
| GC content: | 59.853722% |
| reads passed filters: | 4.679957 M (99.735485%) |
| reads with low quality: | 5.117000 K (0.109049%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 7.295000 K (0.155465%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 15208 |
| AGATCG | 11201 |
| AGATCGG | 10101 |
| AGATCGGA | 8895 |
| AGATCGGAA | 8382 |
| AGATCGGAAG | 7578 |
| AGATCGGAAGA | 7218 |
| AGATCGGAAGAG | 6776 |
| AGATCGGAAGAGC | 6205 |
| AGATCGGAAGAGCA | 5830 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 5249 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 5045 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 4410 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 4026 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 3734 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 3507 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 3350 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 2768 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 2547 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 2308 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 2202 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 1985 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 1878 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 1657 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 4740 |
| other adapter sequences | 25239 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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