| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 66.658593% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 6.143463 M |
| total bases: | 743.359023 M |
| Q20 bases: | 735.990381 M (99.008737%) |
| Q30 bases: | 709.657050 M (95.466259%) |
| GC content: | 59.786292% |
| total reads: | 6.123368 M |
| total bases: | 615.624723 M |
| Q20 bases: | 610.277961 M (99.131490%) |
| Q30 bases: | 589.105970 M (95.692383%) |
| GC content: | 59.957261% |
| reads passed filters: | 6.123368 M (99.672904%) |
| reads with low quality: | 8.800000 K (0.143242%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 11.295000 K (0.183854%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 18724 |
| AGATCG | 13663 |
| AGATCGG | 12161 |
| AGATCGGA | 10512 |
| AGATCGGAA | 9940 |
| AGATCGGAAG | 9296 |
| AGATCGGAAGA | 8450 |
| AGATCGGAAGAG | 8118 |
| AGATCGGAAGAGC | 7364 |
| AGATCGGAAGAGCA | 6759 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 6254 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 5745 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 5123 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 4871 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 4320 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 3895 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 3750 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 3191 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 2995 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 2654 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 2465 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 2354 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 2065 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 7495 |
| other adapter sequences | 32242 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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