| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 65.474620% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 5.930837 M |
| total bases: | 717.631277 M |
| Q20 bases: | 710.704777 M (99.034811%) |
| Q30 bases: | 685.894628 M (95.577583%) |
| GC content: | 59.435408% |
| total reads: | 5.910677 M |
| total bases: | 593.245183 M |
| Q20 bases: | 588.217847 M (99.152570%) |
| Q30 bases: | 568.302928 M (95.795625%) |
| GC content: | 59.609635% |
| reads passed filters: | 5.910677 M (99.660082%) |
| reads with low quality: | 7.395000 K (0.124687%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 12.765000 K (0.215231%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 23059 |
| AGATCG | 17005 |
| AGATCGG | 15395 |
| AGATCGGA | 13817 |
| AGATCGGAA | 13041 |
| AGATCGGAAG | 12208 |
| AGATCGGAAGA | 11291 |
| AGATCGGAAGAG | 11047 |
| AGATCGGAAGAGC | 10153 |
| AGATCGGAAGAGCA | 9495 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 8281 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 7741 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 6928 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 6858 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 5984 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 5499 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 5178 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 4383 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 3895 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 3607 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 3492 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 3181 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 2922 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 2520 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 7921 |
| other adapter sequences | 36626 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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