| fastp version: | 0.26.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (121 cycles) |
| mean length before filtering: | 121bp |
| mean length after filtering: | 100bp |
| duplication rate: | 65.298937% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA |
| total reads: | 5.694255 M |
| total bases: | 689.004855 M |
| Q20 bases: | 682.847935 M (99.106404%) |
| Q30 bases: | 660.043460 M (95.796634%) |
| GC content: | 59.451187% |
| total reads: | 5.673011 M |
| total bases: | 569.247912 M |
| Q20 bases: | 564.786010 M (99.216176%) |
| Q30 bases: | 546.503055 M (96.004402%) |
| GC content: | 59.615864% |
| reads passed filters: | 5.673011 M (99.626922%) |
| reads with low quality: | 5.447000 K (0.095658%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 15.797000 K (0.277420%) |
| Sequence | Occurrences |
| AGATC | 21566 |
| AGATCG | 16079 |
| AGATCGG | 14474 |
| AGATCGGA | 12832 |
| AGATCGGAA | 12313 |
| AGATCGGAAG | 11380 |
| AGATCGGAAGA | 10568 |
| AGATCGGAAGAG | 10353 |
| AGATCGGAAGAGC | 9357 |
| AGATCGGAAGAGCA | 8932 |
| AGATCGGAAGAGCAC | 7848 |
| AGATCGGAAGAGCACA | 7407 |
| AGATCGGAAGAGCACAC | 6373 |
| AGATCGGAAGAGCACACG | 6323 |
| AGATCGGAAGAGCACACGT | 5695 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTC | 5115 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCT | 4826 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTG | 4127 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGA | 3985 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA | 3625 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAAC | 3450 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT | 2991 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC | 2888 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC | 2576 |
| AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTC | 9017 |
| other adapter sequences | 40772 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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